Extracto
Los microARN jugar un papel importante en la iniciación del cáncer y desarrollo. El objetivo de este estudio fue investigar si los polimorfismos en los genes miARN maquinaria están asociados con el desarrollo del cáncer colorrectal (CRC).
RAN
heterocigotos rs14035 CT y los portadores del alelo T (CT + TT) genotipos tuvieron un menor riesgo de CCR, mientras que el
DICER1
rs3742330,
Drosha
rs10719, y
XPO5
polimorfismos rs11077 no se asociaron con CRC en la muestra de estudio completo. En concreto, varón
RAN heterocigotos CT
rs14035 y
XPO5
rs11077 genotipo AA (CT /AA) Las compañías experimentaron una reducción en la susceptibilidad CRC (ambos de colon y rectal). El análisis de subgrupos demostró que la combinación
RAN
CT + rs14035 genotipo TT se asoció con el cáncer de recto, pero no el cáncer de colon. Además, el
DICER1
rs3742330 genotipo AG se asoció con un aumento significativo del riesgo de cáncer de colon. El análisis estratificado reveló la
RAN
rs14035 combinado genotipo CT + TT se asoció con una disminución del riesgo de CCR en pacientes varones sin diabetes mellitus (DM) y en pacientes con cáncer de recto. Además, encontramos el
RAN
genotipo CC rs14035 se relacionó con una disminución del riesgo de CCR en relación con el tamaño del tumor y el metabolismo de la homocisteína y ácido fólico. Por otra parte, los pacientes diagnosticados con hipertensión o DM que lleva a la
Drosha
genotipo CC rs10719 mostraron una mayor riesgo de CCR, mientras que el
XPO5
rs11077 genotipo AC + CC llevó a un aumento de riesgo de CCR en pacientes con hipertensión solamente . Nuestros resultados indican variaciones en
RAN
rs14035,
DICER1
rs3742330,
XPO5
rs11077, y
Drosha
rs10719 de pacientes coreanos están asociados significativamente con el riesgo de CRC
Visto:. Cho SH, Ko JJ, Kim JO, Jeon YJ, Yoo JK, Oh J, et al. (2015) 3'-UTR polimorfismos en los genes miARN genes Maquinaria
Drosha
,
DICER1
,
RAN
, y
XPO5 ¿Cuáles son asociados con el cáncer colorrectal riesgo en una población coreana. PLoS ONE 10 (7): e0131125. doi: 10.1371 /journal.pone.0131125
Editor: Jian-Jun Zhao, Dana-Farber Cancer Institute, Estados Unidos |
Recibido: March 3, 2015; Aceptado: 27-may de 2015; Publicado: 6 Julio 2015
Derechos de Autor © 2015 Cho et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Disponibilidad de datos: Todos los datos relevantes están dentro del apoyo de sus archivos de información en papel y
Financiación:. Fundación Nacional de Investigación de Corea subvenciones financiadas por el Gobierno de Corea (NRF-2012R1A1A2007033 & amp; 2009-0.093.821), República de Corea (www.nrf.re. KR /). Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer colorrectal (CCR) es el tercer cáncer más común en los hombres (746.000 casos por año, un 10,0% del total de casos de cáncer) y el segundo más común en las mujeres (614.000 casos por año, un 9,2% del total del cáncer de los casos) en todo el mundo [1]. La incidencia de CCR geográfica varía, pero los patrones son similares en hombres y mujeres. Casi el 55% de los casos de CCR ocurren en las regiones más desarrolladas [2], a pesar de que pueden surgir esporádicamente.
Hay varios factores intrínsecos [por ejemplo, la edad, el sexo, la diabetes mellitus (DM), la obesidad y la enfermedad inflamatoria intestinal] y factores extrínsecos (por ejemplo, el tabaquismo, la ingesta insuficiente de fibra, alto consumo de alcohol, el consumo de carne roja, y una dieta alta en grasas) están asociados con un mayor riesgo de CCR [3-5]. Por lo tanto, CRC susceptibilidad está influenciado por los dos elementos genéticos y ambientales. Varios informes han demostrado que los microARN (miARN) modulan la expresión génica mediante la orientación de ARNm para la desregulación o la represión de traducción [6, 7]. Estas moléculas llevan a cabo sus funciones biológicas mediante la unión a la región 3 'no traducida (UTR) del ARN mensajero objetivo (mARN), reprimiendo de ese modo su expresión. Una sola miARN puede regular múltiples objetivos y por lo tanto actuar como un control maestro de la expresión génica. bioinformática Anterior análisis sugieren que hasta 30% de los genes humanos puede ser regulado por los genes miARN, a pesar del hecho de que los genes miARN constituye sólo 1-3% del genoma humano [8]. Por lo tanto, los genes miARN parece desempeñar un papel fundamental en ambos mecanismos fisiológicos y patológicos [9]. La expresión de los genes miARN se asocia con varios tipos de cáncer, y se cree que los genes miARN para funcionar como ambos supresores de tumores y oncogenes [10-12].
proteínas maquinaria microARN, como Drosha, relacionadas con ras proteína nuclear (RAN) , DICER1, y exportin 5 (XPO5), debe procesar miRNAs antes de que pueda funcionar. Después de la transcripción, Drosha y su cofactor, DGCR8, proceso primario en miARN precursor-miARN (pre-miARN) mediante la eliminación de "tope, el extremo 3 '5 cola de poli (A), y las secuencias que flanquean la estructura de horquilla. Pre-miARN se exporta a continuación, desde el núcleo hasta el citoplasma por XPO5 y RAN
-
GTP. En el citoplasma, precursor-miARN se procesa adicionalmente por DICER1, una endorribonucleasa, para producir un corto fragmento de ARN de doble cadena (aproximadamente 20 a 25 nucleótidos de largo) que consiste en el miARN maduro y su cadena complementaria [13]. Debido a la termoestabilidad asimétrica, la hebra de miARN madura se incorpora preferentemente en el complejo de silenciamiento inducido por ARN que se dirige a ARNm endógeno para silenciar [14].
Estudios recientes sugieren un 35% de todos los casos de CCR se puede atribuir a genética heredada factores [15]. riesgo hereditario es probablemente debido a polimorfismos de nucleótido único (SNP) y otras anormalidades genéticas dentro de codificación y no codificadora de ADN. Debido a que los miRNAs juegan un papel importante en el cáncer, incluyendo el inicio y desarrollo de CRC, SNPs en los genes miARN maquinaria pueden alterar la estructura de los genes miARN, sitios de unión, o la transformación, alterando de este modo la susceptibilidad de un individuo a CRC por el impacto de miARN funcionalidad [16]. Por ejemplo, problemas de procesamiento miARN puede promover la transformación celular y tumorigénesis [17]. Además, numerosos estudios han demostrado una asociación entre el los casos de cáncer de ovario [18-21] la concentración o la función de los componentes de la vía de miRNA y el pronóstico de un paciente en la piel, pulmón, mama y. Otros estudios han demostrado que los genes miARN expresión juega un papel funcional en la iniciación y progresión de la CRC [22,23].
Sin embargo, hasta la fecha, pocos estudios han investigado la posible relación entre los SNPs específicos en los genes miARN y maquinaria riesgo de CCR [24-26]. Por lo tanto, se investigó si los polimorfismos en
DICER1 gratis (rs3742330),
Drosha gratis (rs10719),
gratis (rs14035), y
XPO5 gratis (rs11077 RAN ) se asociaron con la incidencia de CCR en una población coreana.
Materiales y Métodos
estudio de la población
entre junio de 2005 y enero de 2009, se recogieron 808 muestras de sangre del grupo de estudio , que consiste en 408 pacientes con CCR y 400 sujetos seleccionados al azar no-CRC (control), a raíz de un examen de salud a CHA Bundang Medical Center (Seongnam, Corea del Sur). El grupo CRC incluyó 167 pacientes consecutivos con cáncer rectal y 241 pacientes consecutivos con cáncer de colon. frecuencias de estadificación patológica después de la resección del tumor curativa fueron los siguientes: tumor nodo de metástasis (TNM) en estadio I, n = 43 (10,5%); fase II, n = 173 (42,4%); fase III, n = 153 (37,5%); y estadio IV, n = 39 (9,6%). Los pacientes que sufren de hipertensión arterial inicial (≥ sistólica de 140 mmHg o diastólica de 90 mm Hg) en más de una ocasión o con un historial de uso de medicación antihipertensiva se clasificaron como la hipertensión (HTA). Los pacientes con niveles altos de glucosa plasmática en ayunas (≥ 126 mg /dl), que estaban tomando un agente hipoglucémico oral, o que tenían antecedentes de tratamiento con insulina fueron clasificados como DM. Todos los sujetos del estudio eran de origen coreano y dieron su consentimiento informado por escrito para participar en el estudio. El protocolo de estudio fue aprobado por el Consejo de CHA Bundang Centro Médico de Revisión Institucional.
El análisis de polimorfismos de genes miARN la biogénesis
El ADN genómico fue extraído de muestras de sangre periférica recogidas con un anticoagulante usando un G- kit de extracción de sangre DEX (Intron Biotecnología, Seongnam, Corea del Sur). Los cambios de nucleótidos se determinaron mediante un análisis de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) -restriction fragmento de polimorfismo de longitud (RFLP). la digestión con enzimas de restricción se realizó usando las siguientes enzimas (New England Biolabs, Ipswich, MA):
NLA
III (
Drosha
, rs10719),
Ban
I (
DICER1
, rs3742330),
Bsl
I (
RAN
, rs14035), y
Bsm
I (
XPO5
, rs11077) . La digestión se llevó a cabo a 37 ° C durante 16 h.
genotipos determinados por análisis de RFLP fueron confirmados por dos investigadores independientes y por secuenciación del 10% de las muestras. Para
RAN
rs14035 en el grupo control y
XPO5
rs11077 en pacientes con CRC, se verificaron los genotipos tres veces para descartar posibles errores atribuidos a la violación de Hardy-Weinberg (HWE).
el análisis estadístico
para comparar las características basales entre los casos y controles, se utilizaron las pruebas de chi-cuadrado para analizar los datos categóricos (sexo, HTA y DM) y la prueba t de Student para analizar los datos continuos. Las frecuencias alélicas se calcularon para identificar las desviaciones de HWE. la odds ratio ajustada (AOR) y el 95% intervalos de confianza (IC) se utilizaron para examinar la asociación entre el
DICER1
,
Drosha
,
RAN
,
XPO5
polimorfismos y la aparición de CRC con GraphPad Prism 4.0 (La Jolla, CA, EE.UU.) y MedCalc versión 12.1.4 (Educación Panmun, Seúl, Corea). Se analizaron las interacciones de genes entre los loci SNP mediante la reducción de dimensionalidad multifactorial (MDR) con MDR versión 2.0 (www.epistasis.org) [27-29]. Determinamos las mejores combinaciones multilocus basados en la identificación MDR de los modelos más significativos utilizando los valores de validación cruzada maximizadas. versión HAPSTAT 3,0 (www.bios.unc.edu/~lin/hapstat/) se utilizó para estimar las frecuencias de haplotipos para los polimorfismos determinados por análisis MDR tener fuertes efectos sinérgicos [30]. El descubrimiento tasa de corrección de falsos positivos (FDR) se utilizó para ajustar pruebas de comparación múltiple.
Resultados
características de los sujetos de estudio
Los 408 casos de CCR incluyeron 170 varones y 238 mujeres con una edad media global fue de 61,55 ± 12,26 años (media ± dE; Tabla 1). Entre los casos, 241 (59,1%) tenían cáncer de colon y 167 (40,9%) tenían cáncer de recto. Estadísticamente no se identificaron diferencias significativas en la edad o el sexo entre los casos y controles (
P = 0,772
y 0,847, respectivamente) CRC. Sin embargo, tanto la HTA (60,5%,
P
= 0,004) y DM (34,1%,
P Hotel & lt; 0,0001). Eran significativamente más común entre los casos de CCR que en los controles
las frecuencias genotípicas
Genotipo y frecuencias de los alelos de los genes miARN en maquinaria cuatro casos y controles CRC se muestran en la Tabla 2. Genotipo distribuciones de ambos grupos no mostraron ninguna salida de HWE.
RAN
heterocigotos rs14035 CT tuvieron significativamente disminuido CRC riesgo relativo para los homocigotos de tipo salvaje (AOR = 0,698; IC del 95%, 0,511 a 0,952;
P = 0,023
). Del mismo modo, el genotipo CT + TT combinada se asocia con una disminución de riesgo de CCR (AOR = 0,690; IC del 95%, 0,510 hasta 0,934;
P = 0,016
). Sin embargo, ni asociación siguió siendo estadísticamente significativa después de controlar para comparaciones múltiples utilizando el FDR corrección. No se encontró asociación entre el riesgo de CCR y otros polimorfismos. Además, se observó ninguna relación significativa entre las frecuencias genotípicas de los cuatro genes miARN maquinaria y supervivencia de los pacientes de CRC (Tabla A en S1 Archivo).
En un tipo de cáncer de análisis de subgrupos de orientación, el combinado
RAN
rs14035 CT + genotipo TT se asoció con una disminución del riesgo de cáncer de recto (AOR = 0,640; IC del 95%, 0,430 a 0,954;
P = 0,028
), pero no el cáncer de colon (Tabla 3) . Por el contrario,
heterocigotos DICER1
rs3742330 AG tenían un riesgo significativamente mayor de colon, pero no el cáncer de recto (AOR = 1,506; IC del 95%, 1,020-2,223;
P = 0,040
). Sin embargo, la relación no fue significativa después de la corrección FDR, lo que sugiere una asociación débil (Tabla 3). Combinación de análisis (Tabla 4 & amp; B en la Tabla S1 Archivo) reveló que
RAN heterocigotos CT
rs14035 y
XPO5
rs11077 portadores AA experimentaron una reducción en la susceptibilidad de CRC (AOR = 0,610; IC del 95%, 0,434-0,859;
P
= 0,005) (Tabla 4). Por otra parte, estos mismos genotipos se asociaron con una menor susceptibilidad de ambos tipos de cáncer en los hombres (AOR = 0,283; IC del 95%, 0,139-0,573;
P = 0,001
, AOR = 0,497; IC del 95%, 0,254 a 0,973 ;
P = 0,041
; Tabla 5 & amp; C en la Tabla S1 de archivos), pero no en pacientes de sexo femenino (Tabla D en S1 archivo). Aunque
Drosha
portadores del genotipo CC rs10719 y
RAN heterocigotos CC
rs14035 demostraron una reducción de riesgo de cáncer de recto (Tabla E en Archivo S1), se observó ninguna asociación significativa entre el genotipo frecuencias para la maquinaria cuatro miARN genes y la etapa de supervivencia o TNM de clasificación de pacientes de sus CRC tumores malignos (cuadro F S1 archivo y la tabla G en S1 archivo).
los análisis estratificados indican el
RAN
rs14035 genotipo CT + TT combinada se asocia con una disminución del riesgo de CCR en pacientes del sexo masculino (AOR = 0,493; IC del 95%, 0.308-0.791;
P
= 0,003), los pacientes sin DM (AOR = 0,618; IC del 95%, 0,438-0,874;
P
= 0,006), y los pacientes con cáncer de recto (AOR = 0,640; IC del 95%, ,43-0,954;
P = 0,028
; Tabla 6) . Además, se determinó la
Drosha
genotipo CC rs10719 se asoció con un mayor riesgo de cáncer de colon en sujetos a los 62 años de edad o más (AOR = 3,148; IC del 95%, 1.276-7.766; p = 0,013) y los sujetos menores de 62 años (AOR = 2,940; IC del 95%, 1,169-7,399; p = 0,022, Tabla 6). Por otra parte, el
RAN
genotipo CC rs14035 se relacionó con un menor riesgo de CCR en sujetos con & lt; tumores de 5 cm (AOR = 0,654; IC del 95%, 0,437 a 0,978;
P = 0,039
), los niveles de homocisteína inferiores a 12.97 mmol /l (AOR = 0,637; IC del 95%, 0,453-0,896;
P
= 0,01), y los niveles de folato mayor que 3,72 ng /ml (AOR = 0,630; IC del 95%, 0,447-0,888;
P
= 0,008) (Tabla 7). También encontramos que el
Drosha
genotipo CC rs10719 se asoció con un mayor riesgo de CCR en sujetos con & lt; 5 cm tumores (AOR = 2,159; IC del 95%, 1.057-4.413;
P = 0,035
)
modelos de interacción sugeridas por MDR, con base en una cruz. valor -Validación de 10, se evaluaron utilizando un análisis basado en haplotipo. Sin embargo, no se identificaron las asociaciones entre los polimorfismos de maquinaria cuatro miARN y el riesgo de CCR (Tabla S1 H en Archivo y en la Tabla I S1 Archivo).
asociación genética de los genes miARN maquinaria y las características de genes de pacientes combinados
se examinó la posible relación genética entre la HTA o DM y características de los pacientes de genes /dilucidar la etiología genética de la Convención de desarrollo debido a los factores de riesgo del síndrome metabólico, incluyendo la HTA y DM, son muy relevantes en la aparición de CCR. Se determinó la
Drosha
genotipo CC rs10719 se asoció un mayor riesgo de cáncer de colon en sujetos 62 años o más (AOR = 3,875; IC del 95%, 1,432 a 10,490) y los pacientes con HTA (AOR, 3.292; 95% IC, 1,362-7,958), DM (AOR = 6,764; IC del 95%, 1,424 a 32,126) (Tabla 8). Curiosamente, la combinación de la MS y la
Drosha
genotipo CC rs10719 aumentó CRC riesgo 6.764 veces (Fig 1). También se observó una asociación entre el
XPO5
rs11077 combinado genotipo AC + CC y aumento del riesgo de CCR en pacientes con HTA (AOR, 3.126; IC del 95%, 1,739-5,619) o índice de masa corporal de & lt; 25 kg /m
2 (AOR = 11,765; IC del 95%, 1,011-3,079) (Tabla 8)
eje Y representa cambios entre
Drosha
genotipo TT + TC veces. y
Drosha
genotipo CC. Cada fila representa los pacientes con o sin DM. Cada columna representa
Drosha
genotipo TT + TC y
Drosha
CC genotipo.
Discusión
Los estudios anteriores han demostrado que varios tipos de cáncer están asociados con alteraciones en los genes miARN de maquinaria, como
Drosha
,
DICER1
,
XPO5
, y
AGO2
[31-33 ]. Aunque las modificaciones de estos genes pueden afectar significativamente a la iniciación y progresión del cáncer, el papel de la variación genética en los genes miARN maquinaria durante el desarrollo CRC no se entiende completamente. A lo mejor de nuestro conocimiento, este es el primer informe para evaluar la asociación entre el
RAN
polimorfismos y CRC; encontramos
RAN heterocigotos CT
rs14035 y portadores del alelo T (genotipos CT + TT) tenían un riesgo menor de CRC que los individuos con otros genotipos.
Además, en un tipo de cáncer de análisis de subgrupos de orientación, se determinó el combinado
RAN
CT + rs14035 genotipo TT se asoció con una disminución del riesgo de cáncer de recto. RAN codifica una pequeña proteína G esencial para la translocación de ARN y proteínas a través del complejo de poro nuclear [34]. Cuando RAN-GTP se agota, como resultado de la inhibición de factor de intercambio de nucleótidos guanina RAN, exportación pre-miARN se reduce considerablemente, lo que indica transporte miRNA está mediada por un receptor de exportación RAN-GTP vinculante [35]. Por lo tanto, es posible que
RAN
mutaciones juegan un papel esencial en los cambios relacionados con la patología con el transporte miARN y expresión. La proteína RAN es también un modulador corriente abajo bien conocido de la vía de señalización de PI3K, que media la invasión de células del cáncer y la metástasis [36]. Por otra parte, los tejidos CRC muestran niveles significativamente más altos de
RAN
expresión que las células normales de colon epiteliales, que se han asociado positivamente con la profundidad de la invasión, metástasis en los ganglios linfáticos, metástasis a distancia, la diferenciación del tumor y el estadio del tumor-nódulo-metástasis [37]. Por lo tanto, el polimorfismo rs14035 en
RAN
's 3'-UTR puede influir en su función como un modulador corriente abajo de desarrollo CRC.
Faggad et al. [38] informó de que la reducción de
DICER1
expresión puede contribuir a la progresión del tumor en el CCR. En consonancia con este informe, Dewi y col. [39] determinado que
DICER1
tejidos CRC deficientes tienen un número reducido de células reprogramadas fosfatasa positiva alcalinas relación con las células de tipo salvaje. Sin embargo, otro informe mostró ninguna diferencia significativa en los niveles de expresión de larga 3'-UTR
DICER1
ARNm entre CRC tumores y tejidos normales [40]. Por lo tanto, los efectos de la regulación hacia arriba y hacia abajo de
DICER1
expresión de la susceptibilidad CRC no son claros. Nuestro análisis de subgrupos, que se dirigen tipo específico de cáncer, reveló que
heterocigotos DICER1
rs3742330 AG mostraron un aumento significativo del riesgo de cáncer de colon. Del mismo modo, también se ha descrito una asociación entre este polimorfismo, que se encuentra en el gen de la 3'-UTR, y la supervivencia linfoma de células T, tal vez debido a su extremo 3 'UTR es importante para la estabilidad del mRNA transcrito [41]. Por otra parte, otro SNP localizado en
DICER1 de búsqueda: 's 3'-UTR (rs1057035) pueden contribuir al riesgo de cáncer de boca mediante afecta a la unión a
DICER1
[42] miARN. Aunque el
DICER1
rs3742330 genotipo AG se asoció con un aumento significativo del riesgo de cáncer de colon en nuestros datos, se observó ninguna relación significativa entre las frecuencias genotípicas para el
DICER1
rs3742330 y supervivencia de los pacientes de CRC.
se informó DICER1
rs3742330 que se asocia con aumento de la supervivencia en el linfoma de células T [41]. Estos resultados inconsistentes a través de diferentes tipos de cáncer sugieren que los patrones de expresión anormal de genes de la ruta de miRNA podrían estar asociados con efectos específicos de tejido. El SNP se encuentra en el extremo 3 'UTR, una región que es importante para
DICER1
mRNA estabilidad, de poliadenilación, la eficacia de traducción, y la localización. El 3'-UTR contiene sitios de unión para los microARN. Muchos estudios han informado de las funciones de regulación de miRNAs en las redes genéticas subyacentes diversas vías celulares, lo que indica que los miRNAs oncogénicos podrían estar involucrados en las redes genéticas que regulan la vía funcional desregulado en diferentes células del cáncer [7,43].
DICER1
rs3742330 ha sido identificado como el sitio de destino de dos miRNAs miR-3622a-5p [44] y miR-5582-5p [45]. Sin embargo, la regulación de estos miRNAs de
DICER1
rs3742330 en el CCR y el linfoma de células T no ha sido validada experimentalmente. Los niveles de expresión de
DICER1
tienen efectos globales sobre la biogénesis de miARN. Por ejemplo, un patrón de baja regulación de
DICER1
se asocia con un mal pronóstico en la piel, de pulmón, de mama y ovario, entre otros tipos de cáncer [46]. Sin embargo, el análisis de cáncer de próstata y el CRC muestra la sobreexpresión de
DICER1
y otros genes miARN la biogénesis de las lesiones metastásicas [47]. mucoepidermoide cánceres que surgen en la garganta o el esófago superior exhiben tanto excesiva o insuficiente expresión de
DICER1
en comparación con los tejidos normales de la garganta y el esófago [48]. El miARN-SNP rs3742330 del de
DICER1
ha sido identificado por su asociación con el resultado del cáncer de CRC, linfoma de células T, las lesiones orales premalignas y el carcinoma de células renales [49-51,42] .El alelo AA de rs3742330 situado en el
DICER1
gen exhibió un aumento significativo del riesgo de CCR. Sin embargo, en el linfoma de células T, los pacientes que llevan el genotipo GG tenían una supervivencia global significativamente mayor (OS) en comparación con los que llevan los genotipos GA y AA. En las lesiones premalignas orales, los pacientes portadores de los genotipos GA y AA tenían un riesgo significativamente mayor de OPL, y no había ninguna relación significativa entre las frecuencias genotípicas de los
DICER1
rs3742330 y el carcinoma de células renales. Estos estudios, junto con nuestro estudio, sugieren los polimorfismos genéticos en el cáncer pueden jugar un papel diferente en la regulación de los genes miARN de maquinaria, incluyendo
DICER1
, y por lo tanto influir en el pronóstico del cáncer.
el sistema de procesamiento de miRNA, el complejo XPO5 /RAN-GTP media el transporte nuclear de pre-miRNAs.
XPO5
mutantes mostrar niveles reducidos de procesamiento de miRNA y se dirigen a la inhibición, mientras restaurado XPO5 actúa como un supresor de tumores que invierte la exportación deterioro de la pre-miARN en el cáncer de colon [52]. Estudios previos han informado de la asociación entre el
XPO5
rs11077 SNP (que se encuentra en 3'UTR del gen) y el cáncer de esófago, cáncer de pulmón de células no pequeñas, y mieloma múltiple [53,54]. Además, las asociaciones entre los polimorfismos en el
XPO5
y
Ago1
genes y el riesgo de carcinoma de células renales se han reportado [55]. En particular,
XPO5
rs11077 estaba relacionado con un mayor riesgo de carcinoma de células renales en un modelo recesivo [55]. En apoyo de estos informes anteriores, encontramos que
RAN heterocigotos CT
rs14035 y
XPO5
rs11077 portadores del genotipo AA experimentaron una reducción en la susceptibilidad a la CRC, un enlace que fue especialmente evidente en los pacientes masculinos. Las diferencias de género se han documentado en los pacientes diagnosticados con CRC. Un mayor CRC incidencia ajustada por edad entre los hombres que entre las mujeres se ha mantenido durante los últimos 30 años, pero la causa subyacente sigue siendo poco clara [56]. En nuestro estudio,
RAN
CT rs14035 /
XPO5
rs11077 AA y
RAN
rs14035 CT /
Drosha
genotipos AA rs10719 se asoció con susceptibilidad reducida a CRC en los hombres. Además,
RAN heterocigotos CT
rs14035 y
Drosha
portadores del genotipo AA rs10719 susceptibilidad reducida al subtipo CRC. Los polimorfismos dentro de los 3 'UTRs de los genes miARN de maquinaria pueden ser responsables de las estructuras secundarias de ARNm alterado localmente. Por ejemplo, los polimorfismos 3'-UTR pueden dar lugar a diferentes estructuras de ARNm secundario y diferencias alélicas dependiente distintas en la estabilidad del ARNm [57]. Del mismo modo, varios informes han sugerido que SNPs fuera de la unión resultado sitio miARN en miARN alterado la unión debido a los cambios dependientes de alelo en la estructura de ARNm secundaria [58]. Además, las alteraciones en la estructura secundaria pueden interferir con las proteínas de unión a ARN, que pueden conducir a la alteración de la estabilidad del ARNm [59]. Por lo tanto, los SNPs situados en la 3'-UTR de
RAN
,
DICER1
y
XPO5
puede afectar a la estabilidad del mRNA y la posterior expresión. Sin embargo, los resultados de este estudio requieren validación por parte de otro estudio de casos y controles CRC y por métodos de expresión basados en laboratorio.
La evidencia reciente muestra que componentes del síndrome metabólico (SM), incluyendo el envejecimiento, HTN, y DM, también puede estar asociado con el riesgo de desarrollar CCR [60,61]. La relación entre los componentes individuales del síndrome metabólico y el riesgo de CCR ha sido analizado por varios estudios [62,63]. Sin embargo, un enlace incoherente entre SM y sus componentes en la mortalidad por CCR se observó en otro estudio [64]. Diabetes mellitus tipo 2 se asocia con un 20% -60% más de riesgo de CRC [65], tal como resistencia a la insulina puede promover la carcinogénesis directamente por la estimulación del crecimiento de células de colon [66]. Nuestros datos muestran que el
RAN
rs14035 CT + genotipo TT puede resultar en un menor riesgo de CCR en pacientes sin DM, pero no en pacientes con DM. Sin embargo, un reciente meta-análisis demostró que la DM fue un, aumento del factor de riesgo independiente para la CRC, tanto en hombres y mujeres, incluso después de controlar el tabaquismo, la obesidad y el ejercicio físico de los pacientes [65]. Sin embargo, encontramos el
RAN
rs14035 CT + genotipo TT se asoció con un menor riesgo de CCR en pacientes de sexo masculino y en todos los pacientes con cáncer de recto. Aunque numerosos estudios han demostrado que el tamaño del tumor no es de importancia pronóstica en el CCR [67,68], nuestros datos muestran que
Drosha
CC rs10719 se asoció con un mayor riesgo de CCR en relación con el tamaño del tumor (& lt; 5 cm) y la edad (≥62 años). También se encontró que el
DICER1
rs3742330 y
XPO5
rs11077 genotipos no estaban asociados con el riesgo de la edad, el sexo, la hipertensión, DM, localización tumoral, tamaño tumoral, la invasión de los ganglios linfáticos, y HTN folato, lo que sugiere que estos SNP podrían no modular la susceptibilidad a la CCR en la población coreana
.
Varios estudios han informado de la asociación entre los niveles de homocisteína y el desarrollo del cáncer. Por ejemplo, la homocisteína elevados estudios de cohortes encontrado se correlacionó con un aumento de la recurrencia de adenomas [69,70]. Del mismo modo, se observó que
Drosha
rs10719 y
RAN genotipos CC
rs14035 se asociaron con el CRC con respecto a los tamaños de los tumores de los sujetos. También se encontró que el
RAN
genotipo CC rs14035 se asoció con una disminución del riesgo de CCR en pacientes con & lt; 12,97 mol /l homocisteína. Sin embargo, hasta donde sabemos, no hay otras asociaciones significativas se han encontrado entre la homocisteína y el riesgo de CCR [71].
El folato ofrece unidades de 1-carbono para la síntesis de ADN y metilación, y los resultados de neoplasia de la interrupción en ambos estos procesos. Las modificaciones de la metilación del ADN se producen en un nivel genomic- y de genes específicos en la neoplasia de colon [72], y algunos estudios han demostrado que las concentraciones de folato en plasma bajo se asociaron con una reducción de riesgo de CCR y que las concentraciones de folato en plasma se correlacionan positivamente con el riesgo de CCR [73 , 74]. Sin embargo, nuestros datos muestran que el
RAN
genotipo CC rs14035 se asoció con un menor riesgo de CCR en sujetos con & gt; 3,72 folato ng /ml.
También examinó la interacción entre factores genéticos y características de los pacientes con respecto a la ocurrencia de CRC. Por ejemplo, se determinó la
Drosha
genotipo CC rs10719 se asoció con un mayor riesgo de CCR en pacientes con HTA y DM, mientras que el
XPO5
rs11077 CA + CC genotipo correlacionado con el aumento de riesgo de CCR en pacientes con HTA. Estudios recientes han observado un aumento del riesgo de CCR asociado a la HTA [60,62], y la presencia de HTA, obesidad e hiperglucemia [75]. Sin embargo, un estudio de los fumadores masculinos finlandeses no apoyó estas asociaciones [76]. Además, nuestros datos muestran que el genotipo CC de rs10719 ubicados en el gen
Drosha
tuvo un aumento del riesgo de CCR en pacientes con edad (≥62 años) en comparación con aquellos que llevan los genotipos TT y CC. Una acumulación de evidencia indica SM, con sus efectos sistémicos y hormonales, puede afectar a la susceptibilidad de un paciente a carcinoma y el pronóstico de los pacientes con diagnóstico de diversos tipos de cáncer [77,78]. Nuestro estudio proporciona nueva información sobre la asociación entre el CRC y el síndrome metabólico en el contexto de los polimorfismos en los genes miARN maquinaria. Sin embargo, serán necesarios estudios adicionales de otros genes miARN maquinaria para aclarar la asociación entre estos polimorfismos y CRC.
En resumen, se investigó la relación entre la susceptibilidad CRC y el gen de la maquinaria miARN
Drosha
rs10719,
DICER1
rs3742330,
RAN
rs14035, y los polimorfismos
XPO5
rs11077. Hasta la fecha, pocos estudios han investigado la asociación entre polimorfismos en
RAN
de genes y el riesgo de CCR y no hubo asociaciones entre el
RAN polimorfismos del gen
y el riesgo de CCR [24-26]. Aunque estos resultados proporcionan la primera evidencia de una asociación significativa entre el
RAN
polimorfismos y CRC en pacientes coreanos, nuestros resultados se beneficiarán de los datos adicionales en relación con el efecto del polimorfismo en la estabilidad del mRNA, eficiencia de unión, y la selectividad. Por lo tanto, nuestro estudio, mientras que la novela en sus conclusiones, requiere validación por parte de los estudios funcionales que investigan el efecto del polimorfismo en la maquinaria miARN y actividades celulares aguas abajo.
Apoyo a la Información
S1 Archivo. Tabla A en S1 Archivo.
MiARN la biogénesis de genes frecuencias genotípicas y supervivencia de los pacientes de CRC. Tabla B en S1 Archivo. La combinación de los genes miARN la biogénesis polimorfismos basado en pacientes resistentes a múltiples fármacos y CRC. Tabla C en S1 Archivo. La combinación de los polimorfismos de genes de maquinaria microRNA en pacientes y controles CRC: subgrupo masculino. Tabla D en S1 Archivo. La combinación de los polimorfismos de genes de maquinaria microRNA en pacientes y controles CRC: subgrupo de mujeres. Tabla E en S1 Archivo. La combinación de los polimorfismos de los genes de maquinaria microARN entre el subgrupo de sujetos con cáncer colorrectal y de control. El cuadro F S1 Archivo. Las frecuencias genotípicas de los polimorfismos del gen miARN la biogénesis y CRC supervivencia de los pacientes en estadio TNM I + II. Tabla G en S1 Archivo. Las frecuencias genotípicas de los polimorfismos de los genes miARN biogénesis de los genes y la supervivencia en pacientes con CRC estadio TNM III + IV. Tabla H en S1 Archivo. combinaciones de alelos de genes miARN procesamiento en pacientes y controles usando la reducción de dimensionalidad multifactorial CRC. Tabla I en S1 Archivo. combinación de alelos de genes miARN biogénesis polimorfismos basado en la reducción de dimensionalidad multifactorial y el CRC pacientes la supervivencia
doi:. 10.1371 /journal.pone.0131125.s001 gratis (DOCX)