Extracto
Aplicaciones
Este estudio tuvo como objetivo identificar el patrón de expresión del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) en el cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC) y explorar su potencial correlación con la progresión del NSCLC.
Métodos
perfil de expresión génica GSE39345 ha sido descargado de la base de datos gene Expression Omnibus. Se analizaron veinte controles sanos y 32 muestras de NSCLC antes de la quimioterapia para identificar los genes expresados diferencialmente (DEGs). A continuación, se realizó análisis de la vía de enriquecimiento de los DEGs y se construyeron las redes de interacción proteína-proteína. En particular, se analizaron los genes de VEGF y la vía de señalización de VEGF. La sub-red se construyó seguido por el análisis funcional de enriquecimiento.
Resultados
Total 1.666 up-regulados y se identificaron 1542 DEGs-regulado. Los DEGs reguladas por se enriquecieron principalmente en las vías asociadas con el cáncer.
VEGFA
y
VEGFB
resultaron ser el factor desencadenante de la vía de señalización de VEGF. Además, en el receptor del factor de crecimiento epidérmico (
EGFR
),
VEGFA
y
VEGFB servicios asociados sub-red, el receptor de dominio de inserto quinasa (
KDR
), fibronectina 1 (
FN1
), el factor de crecimiento transformante beta inducida (
TGFBI
) y pcna (
PCNA
) se encontraron para interactuar con al menos dos de los tres genes de cubo. Los DEGs en esta sub-red se enriquecieron principalmente en términos de ontología de genes relacionados con la proliferación celular.
Conclusión
EGFR
,
KDR
,
FN1
,
TGFBI
y
PCNA
pueden interactuar con el
VEGFA
a jugar un papel importante en la tumorigénesis NSCLC. Estos genes y las proteínas correspondientes pueden tener el potencial para ser utilizado como los objetivos para el diagnóstico o el tratamiento de pacientes con CPNM
Visto:. Wang Y, Huang L, S Wu, Jia Y, Yang Y, Luo L , et al. Los análisis (2015) Bioinformática del papel de factor de crecimiento vascular endotelial en pacientes con células no pequeñas de cáncer de pulmón. PLoS ONE 10 (9): e0139285. doi: 10.1371 /journal.pone.0139285
Editor: Selvakumar Subbian, Instituto de Investigación de Salud Pública de la RBHS, Estados Unidos