Extracto
Objetivo
El factor de transcripción 7-al igual que 2 (
TCF7L2
) gen se ha sugerido que desempeñar un papel importante en la patogénesis del cáncer. Sin embargo, los resultados han sido inconsistentes. En este estudio, se realizó un metanálisis para aclarar las asociaciones entre los
TCF7L2
polimorfismo y el riesgo de cáncer.
Métodos
La literatura publicada desde PubMed y EMBASE fueron recuperados. Los odds ratios agrupados (OR) con intervalo de confianza del 95% (IC) se calcularon utilizando fijo o modelo de efectos aleatorios.
Resultados
Un total de 19 estudios (14.814 casos y controles 33,856) fueron identificados por el análisis de la asociación entre el
TCF7L2
polimorfismo y el riesgo de cáncer. Los resultados mostraron que
TCF7L2
polimorfismo se asoció con el cáncer de mama (modelo homogéneo: OR = 1,17, IC del 95% = 1,02 a 1,35,
I
2 = 21,8%,
p
para la heterogeneidad = 0,276; modelo heterogéneo: OR = 1,11, 95% IC = 1.3 a 1.20,
I
2 = 0,0%,
p
para la heterogeneidad = 0,543), el cáncer de próstata (modelo homogéneo: OR = 0,89; IC del 95% = 0,84 a 0,96,
I
2 = 0,0%,
p
para la heterogeneidad = 0,640; modelo heterogéneo : OR = 0,89; IC del 95% = 0,84 a 0,95,
I
2 = 0,0%,
p
para la heterogeneidad = 0,871), y el cáncer de colon (modelo heterogéneo: O = 1,15, IC del 95% = 01/01 a 01/31,
I
2 = 0,0%,
p
para la heterogeneidad = 0,658), pero no con el cáncer colorrectal, cáncer de pulmón y cáncer de ovario .
Conclusiones
el presente meta-análisis indicó que había significativamente las asociaciones entre el
TCF7L2
polimorfismo rs7903146 y el riesgo de los cánceres de mama, próstata y colon, en lugar de cáncer colorrectal , cáncer de pulmón y cáncer de ovario
Visto:. Chen J, T Yuan, Liu M, P Chen (2013) Asociación entre el polimorfismo del gen TCF7L2 y riesgo de cáncer: Un meta-análisis. PLoS ONE 8 (8): e71730. doi: 10.1371 /journal.pone.0071730
Editor: Swati Palit Deb, Virginia Commonwealth University, Estados Unidos de América
Recibido: 21 Febrero, 2013; Aceptado: 9 Julio 2013; Publicado: 9 Agosto 2013
Derechos de Autor © 2013 Chen et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Los autores no tienen el apoyo o la financiación para reportar
Conflicto de intereses:. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
El factor de transcripción 7-al igual que 2 (
TCF7L2
gen), informó previamente como
TCF-4
, se ha encontrado para ser asociado con la diabetes tipo 2. variante rs7903146 de
TCF7L2
gen se identificó en primer lugar como un marcador de la susceptibilidad de la diabetes tipo 2 en un estudio de asociación del genoma [1]. Los siguientes estudios confirman aún más la asociación entre el
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variante rs7903146 y la diabetes tipo 2 [2]. Además, los individuos portadores de alelos T de
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variante rs7903146 demostraron un alto riesgo de resistencia a la insulina [3]. Alternativamente,
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puede afectar el cáncer de forma independiente de la diabetes, como el
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producto génico está implicado la vía de señalización /β-catenina vía. TCF7L2 forma un complejo nuclear activa con β-catenina que se une e induce la expresión de genes diana implicados en la proliferación celular, la evasión de la apoptosis, y la invasión tisular y la metástasis.
Hasta la fecha, muchos estudios se han publicado la investigación de la asociación entre
TCF7L2
rs7903146 o rs12255372 (está en desequilibrio de ligamiento con alta rs7903146) y varios tipos de cáncer, incluyendo el cáncer de mama [4] - [8], el cáncer de próstata [5], [9] - [ ,,,0],12], el cáncer colorrectal [5], [13] - [15], cáncer de colon [5], [16], cáncer de pulmón [5] y el cáncer de ovario [6]. Sin embargo, las conclusiones han sido contradictorios. Por lo tanto, se realizó un metanálisis para aclarar la relación entre la
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variante rs7903146 y el riesgo de cáncer.
Materiales y Métodos
Literatura y Estrategia de búsqueda de
Se realizaron búsquedas en las bases de datos bibliográficas PubMed y EMBASE. La estrategia de búsqueda para identificar todos los estudios posibles implicó el uso de las siguientes palabras clave: (
TCF7L2
o factor de transcripción 7-al igual que 2 o
TCF-4
) y (variante o variación o polimorfismo o genotipo) y (cáncer o carcinoma o tumor). Se incluyeron todos los estudios relacionados publicados en idioma Inglés. Las listas de referencias de los artículos recuperados Se realizaron búsquedas manuales. Si más de un artículo se publicaron el uso de la misma serie de casos, sólo se incluyó el estudio con los datos más recientes. La búsqueda bibliográfica se actualizó el 18 de febrero de 2013.
Criterios de inclusión y extracción de datos
Los estudios incluidos en el meta-análisis, debe cumplir los siguientes criterios de inclusión: (1) evalúa las asociaciones de
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polimorfismo con el riesgo de cáncer; (2) los usos de casos y controles o de cohortes de diseño; y (3) proporciona datos suficientes para calcular la odds ratio (OR) con un intervalo de confianza del 95% (IC). La siguiente información se extrajo de cada estudio: (1) el nombre del primer autor; (2) Fecha de publicación; (3) el país de origen; (4) el origen étnico; (5) el tipo de cáncer; (6) tamaño de la muestra de casos y controles; (7) covariables 'OR ajustada con IC del 95% bajo el modelo de co-dominante; (8) alelo menor frecuencia en los casos y controles; (9)
p Opiniones de prueba de Hardy Weinberg en los controles; y (10) estudiaron el polimorfismo. Los dos autores evaluaron de forma independiente los artículos para el cumplimiento de los criterios de inclusión /exclusión, los desacuerdos se resolvieron y llegaron a una decisión coherente.
Análisis estadístico
La asociación de
TCF7L2
polimorfismo con el riesgo de cáncer se estimó mediante el cálculo del IO agrupados e IC 95% bajo un modelo de co-dominante. El significado de OR agrupado se determinó mediante la prueba de Z (P & lt; 0,05 se consideró estadísticamente significativo). Se llevó a cabo la prueba Q para evaluar la heterogeneidad entre los estudios. Un aleatorios (método de DerSimonian-Laird [17] o fijo método de Mantel-Haenszel () se utilizó [18] modelo de efectos para calcular los OR agrupados en presencia (
P
≤0.10) o ausencia (
P Hotel & gt;.. 0.10) de la heterogeneidad, se llevó a cabo, respectivamente, el análisis de subgrupos según el tipo de cáncer para hacer frente a la heterogeneidad entre estudios sesgo de publicación se evaluó mediante la prueba de Begg [19] y la prueba de Egger [20] (
P Hotel & lt; 0,05 se consideró estadísticamente significativo) análisis de los datos se realizó utilizando STATA versión 11 (StataCorp LP, College Station, TX, EE.UU.)
Resultados
Características de los Estudios
en este estudio, hemos seguido la declaración PRISMA (Lista de verificación S1). un diagrama de flujo que describe el proceso de inclusión /exclusión del estudio se presenta en la Fig. 1. la búsqueda en la literatura identificó un total de 128 artículos potencialmente relevantes. de ellos, 112 artículos fueron excluidos debido a la evidente irrelevancia mediante la lectura de los títulos y los resúmenes. Además, dos artículos fueron excluidos porque eran revisiones. Entonces, 14 artículos cumplieron los criterios de inclusión primarias. Sin embargo, un documento fue excluido porque no proporcionó datos suficientes para calcular OR con IC del 95% [21]. Dado que más de un estudio se incluyó en dos artículos de Folsom et [5] Al y Goode et [6] otros, que eran considerados como estudios separados en el meta-análisis. Además, dado que rs7903146 estaba en alto LD con rs12255372, se combinaron todos los estudios incluidos en conjunto. En el último, 19 estudios para la asociación entre el
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polimorfismo y el riesgo de cáncer fueron incluidos en el meta-análisis final. De ellos, cinco fueron en el cáncer de mama, cinco estaban en el cáncer de próstata, cuatro eran sobre el cáncer colorrectal, dos estaban en el cáncer de colon, dos estaban en el cáncer de pulmón, y uno estaba en el cáncer de ovario. Las características de los estudios incluidos se detallan en la Tabla 1. Cabe señalar que debido a que la mayoría de los estudios proporcionaron covariables 'OR ajustada con IC del 95% bajo un modelo de co-dominante, se calculó la estimación agrupada únicamente bajo este modelo.
los resultados del metanálisis
se identificaron un total de 14814 casos y 33856 controles para el análisis de la asociación entre el
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polimorfismo con el riesgo de cáncer. Los resultados indicaron que
TCF7L2
polimorfismo podría no estar asociada con el riesgo de cáncer bajo el modelo de co-dominante (modelo homogéneo: OR = 1,07, IC del 95% = 0,95 a 1,21,
I
2 = 61,4%,
p Opiniones de heterogeneidad & lt; 0,001, Figura 2; modelo heterogéneo: OR = 1,04, 95% CI = 0,97-1,12,
I
2 = 58,1%,
p
para la heterogeneidad = 0,001, Figura 3). Sin embargo, el análisis de subgrupos según el tipo de cáncer sugiere que el tamaño del efecto fue significativo para el cáncer de mama (modelo homogéneo: OR = 1,17, IC del 95% = 1,02 a 1,35,
I
2 = 21,8%,
p
para la heterogeneidad = 0,276; modelo heterogéneo: OR = 1,11; IC del 95% = 01/03 a 01/20,
I
2 = 0,0%,
p Opiniones de heterogeneidad = 0,543), el cáncer de próstata (modelo homogéneo: OR = 0,89; IC del 95% = 0,84 a 0,96,
I
2 = 0,0%,
p
para la heterogeneidad = 0,640; heterogénea modelo: OR = 0,89, 95% CI = 0,84-0,95,
I
2 = 0,0%,
p
para la heterogeneidad = 0,871), y el cáncer de colon (modelo heterogéneo: SI = 1,15; IC del 95% = 01.01 a 01.31,
I
2 = 0,0%,
p
para la heterogeneidad = 0,658), pero no para el cáncer colorrectal, cáncer de pulmón y de ovario cáncer (
p Hotel & gt; 0,05, Tabla 2)
publicación sesgo potencial
Sin sesgo de publicación podría ser detectada bajo homogénea. co-dominante modelo (
p = 0,780
para la prueba de Begg y
p = 0,123
para la prueba de Egger) y co-dominante modelo heterogéneo (
p = 0,889
para la prueba de Begg y
p = 0,274
para la prueba de Egger).
Discusión
a lo mejor de nuestro conocimiento, nuestro meta-análisis representa el primero investigar la asociación entre el
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polimorfismo rs7903146 y el riesgo de cáncer. Los resultados sugieren que
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polimorfismo rs7903146 podrían no estar asociados con el riesgo de cáncer. Sin embargo, un análisis más detallado estratificado demostró la asociación significativa con el cáncer de mama, cáncer de próstata y cáncer de colon, en lugar de cáncer colorrectal, cáncer de pulmón y cáncer de ovario.
Curiosamente, el alelo T del polimorfismo rs7903146, que se ha asociado con un mayor riesgo de diabetes tipo 2, demostró la asociación inversa con el cáncer de próstata basado en nuestra meta-análisis. El hallazgo es consistente con los de los estudios individuales por Folsom et al. [5] y Machiela et al [12]. Sin embargo, los otros tres estudios incluidos no indican ninguna asociación [9] - [11]. Además, se encontró asociación positiva entre el polimorfismo rs7903146 y el riesgo de cáncer de mama. Recientemente, Michailidou K et al. [22] han encontrado rs7904519 en el intrón 4 de
TCF7L2 gratis (r
2 = 0,37 con rs7904519 /rs12255372), que se asocia con el cáncer de mama. son necesarios para examinar los posibles mecanismos diferentes de otros estudios
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polimorfismo en varios tipos de cáncer.
La heterogeneidad entre los estudios es común en los meta-análisis de los estudios de asociación genética. A pesar de la heterogeneidad puede tenerse en cuenta mediante la realización de un modelo de efectos aleatorios, que aumentaría la probabilidad de error de tipo I [23]. Encontramos una heterogeneidad significativa entre los estudios en la asociación de
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polimorfismo rs7903146 con el riesgo de cáncer. Por lo tanto, se realizó un análisis de subgrupos por tipos de cáncer para explorar la fuente de heterogeneidad. Los resultados mostraron que la heterogeneidad entre los estudios desapareció en varios subgrupos, pero se mantuvo en otros subgrupos que sugieren otras variables podrían confundir a la asociación.
El meta-análisis actual tiene varios puntos fuertes. En primer lugar, OR (IC del 95%) después de ajustar las covariables de estudio individual se utilizó para calcular la combinaron la estimación, lo que aumentó la precisión de la estimación del efecto. En segundo lugar, el poder estadístico fue mejorado en gran medida para el estudio de asociación de
TCF7L2
polimorfismo rs7903146 en el análisis agrupado. Sin embargo, varias limitaciones también deben tenerse en cuenta. En primer lugar, el caso - control de diseño del estudio no permite la inferencia de causalidad entre el polimorfismo del gen y el resultado. En segundo lugar, el efecto del gen - gen /gen - interacciones medio ambiente no se abordó en este meta-análisis. En tercer lugar, si bien el origen étnico juega un papel importante en la asociación de
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polimorfismo rs7903146 con el riesgo de cáncer, no se realizó el análisis de subgrupos según la etnia a causa de estudios limitados para cada tipo de cáncer.
en conclusión, los resultados indicaron que no había una asociación significativa entre
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polimorfismo rs7903146 y el riesgo de cáncer de mama, cáncer de próstata y cáncer de colon, en vez de cáncer colorrectal, cáncer de pulmón, y cáncer de ovario. estudios a gran escala bien diseñados con la consideración de gen-gen y gen-medio ambiente deben llevarse a cabo para investigar la asociación en el futuro.
Apoyo a la Información
Lista de verificación S1.
PRISMA Lista de verificación
doi:. 10.1371 /journal.pone.0071730.s001 gratis (DOC)