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PLOS ONE: Común variación genética en los genes transporte celular y cáncer ovárico epitelial Riesgo (EOC)


Extracto

Antecedentes

procesos de transporte celulares defectuosos pueden conducir a la acumulación aberrante de oligoelementos, hierro, moléculas pequeñas y hormonas en la célula, lo que a su vez puede promover la formación de oxígeno reactivo especies, la promoción de daño del ADN y la expresión aberrante de los genes del cáncer reguladores clave. A medida que el daño del ADN y la proliferación incontrolada son los rasgos distintivos de cáncer, incluyendo el cáncer de ovario epitelial (EOC), la hipótesis de que las variaciones heredadas en los genes de transporte celular contribuye al riesgo de EOC.

Métodos

En total, las muestras de ADN se obtuvieron de 14.525 pacientes estudiados con EOC invasivo y de 23,447 controles de 43 sitios en la Asociación Consorcio de cáncer de Ovario (OCAC). Doscientos setenta y nueve SNPs, lo que representa 131 genes, se genotipo utilizando un Illumina Infinium iSelect BeadChip como parte de la colaboración de Oncología genes y medio ambiente Estudio (COG). Los análisis de SNP se realizaron mediante regresión logística no condicional bajo un modelo log-aditivo, y el q & lt FDR;. Se aplicaron 0,2 a ajustar para comparaciones múltiples

Resultados

La prueba más significativa de una asociación de todos los cánceres invasivos combinan y para el subtipo seroso se observó para el SNP rs17216603 en el gen transportador de hierro
HEPH gratis (invasiva: OR = 0,85, p = 0,00026; serosa: OR = 0,81, p = 0,00020); este SNP también se asoció con los tumores de bajo potencial limítrofe /maligno (LMP) (P = 0,021). Otros genes asociados significativamente con subtipos histológicos EOC (p & lt; 0,05) incluido el
UGT1A gratis (endometrioide),
SLC25A45 gratis (mucinoso),
SLC39A11 gratis (bajo potencial maligno), y
SERPINA7 gratis (carcinoma de células claras). Además, 1785 SNPs en seis genes (
HEPH
,
MGST1
,
Serpina
,
SLC25A45
,
SLC39A11
y
UGT1A
) se imputaron a partir del Proyecto 1000 Genomas y se examina para la asociación con INV EOC en sujetos blancos Europea. El más significativo fue imputada SNP rs117729793 en
SLC39A11 gratis (por alelo, OR = 2,55, IC del 95% = 1,5 a 4,35, p = 5.66x10
-4).

Conclusión

Estos resultados, generados en una gran cohorte de mujeres, revelaron asociaciones entre variantes genéticas heredadas transporte celular y el riesgo de los subtipos histológicos EOC

Visto:. Chornokur G, Lin HY, Tyrer JP, Lawrenson K , Dennis J, Amankwah EK, et al. (2015) Común variación genética en los genes transporte celular y cáncer ovárico epitelial (EOC) Riesgo. PLoS ONE 10 (6): e0128106. doi: 10.1371 /journal.pone.0128106

Editor: Irina U. Agoulnik, Universidad Internacional de la Florida, Estados Unidos

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