africana
Extracto
El cáncer de próstata (CaP) es una enfermedad compleja que afecta desproporcionadamente a los afroamericanos y otras personas de ascendencia africana. Un número de regiones de todo el genoma se han asociado con CaP, la mayoría de ellos con efectos moderados. Unos pocos estudios han informado de cambios cromosómicos en 12p y 12q que se producen durante el inicio y el desarrollo del CaP, pero hasta la fecha ninguna asociación consistente de la enfermedad con el cromosoma 12, la variación polimórfica ha sido identificado. Con el fin de desentrañar los factores de riesgo genéticos que subyacen a las disparidades de salud CaP se investigó el cromosoma 12 utilizando marcadores informativos ascendencia (AIMS), que permiten distinguir las regiones genómicas de origen europeo o de África Occidental, y les realizarán las pruebas de asociación con CaP. SNPs se genotipo en aquellas zonas donde se detectaron señales significativas de la asociación. La señal más fuerte fue descubierto en el SNP rs12827748, que se encuentra aguas arriba de la
PAWR
gen, un gen supresor tumoral, que se expresa ampliamente en la próstata. El alelo más frecuente en los europeos fue el alelo de riesgo entre los afroamericanos. También se examinaron los genes relacionados con la vitamina D,
VDR
y
CYP27B1
, y se encontró una asociación significativa de CaP con el polimorfismo Taq I (rs731236) en el primero. Aunque nuestros resultados justifican una mayor investigación hemos descubierto un factor de susceptibilidad genética para CaP en un candidato probable a través de un enfoque que se aprovecha de la contribución diferencial de los grupos parentales a una población mezclada
Visto:. Bonilla C, Hooker S, T Mason, Bock CH, Kittles RA (2011) del cáncer de próstata susceptibilidad loci identificados en el cromosoma 12 en los afroamericanos. PLoS ONE 6 (2): e16044. doi: 10.1371 /journal.pone.0016044
Editor: Amanda Toland, Ohio State University Medical Center, Estados Unidos de América
Recibido: 13 Agosto, 2010; Aceptado: 6 de diciembre de 2010; Publicado: 16 de febrero 2011
Derechos de Autor © 2011 Bonilla et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. CB era un recipiente del Departamento de Defensa por el Congreso-Programa de Investigación médica de Estados Unidos dirigida subvención no. W81XWH-06-1-0066. Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer de próstata (CaP) representa una carga importante para la salud de la población masculina de Estados Unidos. En particular, los afroamericanos están desproporcionadamente afectados por el CP, se presentan con enfermedad más avanzada y peor pronóstico que los estadounidenses de origen europeo [1]. Las razones de las disparidades se compone de un número de factores genéticos y ambientales tales como la raza, la edad, la historia familiar, el estatus socioeconómico y el acceso a la atención médica [2].
A través de los años ha habido una acumulación de evidencias a favor de un componente hereditario significativo en CaP susceptibilidad, sin embargo, la búsqueda de genes CaP ha dado pocos resultados consistentes. Recientemente, vinculación, asociación y cartografía mezcla todo el genoma explora han detectado loci de riesgo en los cromosomas 2p15, 3p12, 6q25, 7q21, 8q24, 10q11, 11q13, 17q12, 17q24, 19q13, 22q13 y Xp11 [3] (véase también el catálogo de GWAS: http://www.genome.gov/gwastudies/), aunque las variantes polimórficas en estas regiones parecen dar cuenta de sólo una pequeña proporción de la predisposición genética observada con CaP.
para determinar si las desigualdades de salud entre África americanos y europeos se explica en parte por las diferencias en los antecedentes genéticos se realizaron búsquedas de alelos con grandes diferencias de frecuencia entre estas poblaciones que también tienen una incidencia en la susceptibilidad a la CP.
en una selección preliminar de 21 marcadores informativos ascendencia ( AIMS) en el cromosoma 12 en 368 africanos casos y controles con CaP americanas encontramos una indicación de la asociación a través de una región extendida (de 23 Mb a 64 Mb). Hemos aumentado el tamaño de la muestra y la cobertura del cromosoma con los objetivos y nuevos SNPs en un intento de reducir la región de interés y, si es posible, identificar la variante causal. Se prestó especial atención al receptor de vitamina D (
VDR
, OMIM * 601769) gen, localizado en el cromosoma 12q13.11, ya que es un candidato probable y los informes anteriores han revelado una asociación entre polimorfismos en este gen y CaP [4].
Materiales y Métodos
los sujetos
quinientos cincuenta no relacionadas casos y controles afroamericanos fueron incluidos en el estudio. El reclutamiento para los pacientes y controles sanos se llevó a cabo en el Hospital de la Universidad de Howard en Washington, DC, a través de la División de programas de cribado de cáncer de próstata y Urología.
Los niveles de PSA y otras evaluaciones clínicas se determinaron para todos los casos de CaP y todos los controles . pacientes con cáncer de próstata no tenían más de un familiar de primer grado con CaP. Todos los controles tenían un tacto rectal normal.
agresividad de la enfermedad se definió con base en el estadio TNM y grado de Gleason. Baja agresividad se determinó mediante una categoría T & lt; T2c y un grado de Gleason & lt; 7. A la inversa, la alta agresividad se caracterizó por una categoría T ≥T2c y un grado de Gleason ≥7. El estudio fue aprobado por la Universidad de Howard y la Universidad de Chicago hospitales Junta de Revisión Institucional y por todos los participantes, que dieron su consentimiento informado por escrito.
El ADN genómico se obtuvo a partir de muestras de sangre periférica utilizando técnicas estándar.
Genotipado
un conjunto de 124 marcadores informativos ascendencia (AIMS) localizado en el cromosoma 12, la mayor parte de los cuales fueron seleccionados a partir de un mapa publicado mezcla adaptada para los afroamericanos [5], se genotipo en los casos y controles y se utilizan para estimar la ascendencia local. Además, las proporciones de mezcla individual se estimaron usando un conjunto de 103 AIMs todo el genoma de pertenecer a un mismo panel. Las personas que pertenecen a cada población parental, es decir HapMap Yoruba (YRI) y CEPH (CEU), también se han escrito para estos marcadores.
Además, genotipo quince SNPs en dos genes que están involucrados en el metabolismo de la vitamina D, once en el receptor de la vitamina D (
VDR
) y cuatro en
CYP27B1 gratis (OMIM * 609506).
Finalmente, los genotipos para un conjunto adicional de 55 SNPs en el cromosoma 12 se recogieron y analizaron en un intento de circunscribir las regiones asociadas a genes específicos.
La plataforma Illumina BeadLab [6] se utilizó para determinar el genotipo de todos los objetivos en este proyecto.
VDR
,
CYP27B1 Opiniones y todos los SNPs utilizados para el mapeo fino se analizaron con la plataforma Sequenom MassArray [7].
Todas las posiciones físicas y detalles SNP reportados en el presente estudio se basaron en NCBI genoma construir 36 y dbSNP construir 130.
análisis de los datos
La estructura del programa v2.2 [8] se ha ejecutado para estimar la ascendencia individual y específica del locus. Para nuestro análisis se estableció el número de poblaciones parentales a las dos. Se ejecuta consistieron básicamente quemaduras 30000-ins y 70000 iteraciones, y de mezcla de quemaduras 5000-ins cuando sea necesario. Para recoger datos sobre la ascendencia, sitio por sitio (local), se utilizó el modelo de vinculación, mientras que un modelo que utiliza la información demográfica de los genotipos de los individuos parentales 'fue seleccionada para obtener proporciones ascendencia individuales.
Desequilibrio de acoplamiento (LD) patrones a lo largo del cromosoma 12 se examinaron con el v4.2 Haploview programa [9]. La selección de tagSNPs también se hizo con Haploview utilizando el riales como población de referencia, marcado por parejas y ar
2 umbral de 0,8.
La regresión logística binaria se utilizó para estimar la odds ratio (OR) y confianza del 95% intervalos (IC) para la asociación de marcadores individuales y haplotipos con CaP con ajuste por edad, ascendencia individual y local, a través de programas SPSS v15 y PLINK 1,07 [10]. Potencia cálculos se realizaron con el programa de cálculo de la potencia genética [11].
Funcional
in silico
análisis de variantes genéticas para identificar cambios en el factor de transcripción sitios, 5'UTR y 3'UTR motivos de unión y la conservación de todas estas especies, se llevó a cabo utilizando los programas incluidos en la caja de herramientas GENEPI [12].
resultados
se ingresaron un total de 669 participantes en el análisis, incluyendo 253 pacientes con CaP afroamericano , 297 controles afroamericanos, 59 africanos del oeste (HapMap YRI) y 60 europeos (HapMap CEU). Las características clínicas y demográficas de la muestra afroamericano se presentan en la Tabla 1.
Después de la eliminación de los marcadores con más de 50% de los desaparecidos genotipos, menos del 5% de frecuencia menor alelo (MAF), de Hardy Weinberg en los controles (p & lt; 0,0005), estrechamente vinculado a los demás (& lt; 0,1 cm intermarker distancia)., 76 cromosoma 12 Objetivos y 88 AIMs en todo el genoma se analizaron (cuadros S1 y S2)
sobre la base de el poder análisis que tuvimos en medio de energía ~ 70% (36-83%) para detectar un riesgo relativo de 1,5 genotipo a un nivel alfa de 0,05 para las variantes con una frecuencia del alelo menor ≥5%, suponiendo que el marcador está en LD completo con la variante causal y una prevalencia de CaP en los afroamericanos de 2,5%. Si se consideraron todas las variantes, la potencia se redujo a ~ 60% (8-83%), debido al hecho de que hay un poder limitado para detectar los efectos de las variantes con frecuencias por debajo de 5% (22% de la potencia en promedio), véase la Tabla S3.
linaje y estructura poblacional
Utilizando el conjunto de los objetivos de todo el genoma, la diferencia de frecuencia alelo (delta) entre las poblaciones parentales significa resultó ser del 74%, que se extiende desde el 55% al 96% ( S2 Tabla). ESTRUCTURA corre establecieron dos como el número más probable de las agrupaciones dentro de los afroamericanos, independientemente de su situación, lo que indica la presencia de estratificación de la población. Media de ascendencia europea individuo (± DE) fue de 22 ± 17% para toda la muestra, similar al informado previamente estimados para esta población [13]. casos de CaP tenían en promedio más alta ascendencia de África Occidental que en los controles (79% vs. 77%), aunque la diferencia no fue significativa (Tabla 1). Los pacientes fueron significativamente mayores que en los controles (p & lt; 0,001, Tabla 1).
asociación con el estado de la enfermedad
Nuestro análisis inicial con 242 casos y 126 controles encontró que tres de cada 21 objetivos se asoció significativamente con el estado de la enfermedad después del ajuste por edad y ascendencia individuo (p & lt; 0,05, Tabla 2)., mientras que otro objetivo era cerca de la significación (rs1963562, p = 0,07) guía empresas
con el fin de investigar más a fondo estas asociaciones señales que ampliaron el cromosoma 12 AIM conjunto con 75 polimorfismos adicionales y aumentó el tamaño de la muestra para un total de 550 individuos. La media de diferencia de frecuencia entre el alelo West africanos y europeos para este conjunto ampliada de objetivos fue del 70% (rango: 24% -95%), y la distancia media entre los marcadores fue de 1,25 Mb (Tabla S1). Cobertura del cromosoma se extendía desde 0,2 Mb a 131,2 Mb. Muy pocos marcadores de este panel AIM están en LD en toda la región, y los que muestran una baja de I
2 valores. Se espera que esto en cierta medida como se seleccionaron variantes para garantizar la ausencia de LD en las poblaciones parentales.
Asociación con CaP fue descubierto durante diez nuevos marcadores en un nivel alfa de 0,05, ajustando por edad y ascendencia individual, aunque ninguno alcanzó una significación estadística si la aplicación de una corrección de Bonferroni para múltiples pruebas (p & lt; 0,0007, el cuadro S1). Curiosamente, para todos los loci, el alelo más frecuente entre los europeos fue también el alelo que confiere riesgo de CaP.
Hemos seleccionado 55 SNPs adicionales dentro de las regiones asociadas y genes candidatos vecinos para tratar de localizar el origen de la señal de asociación . Se dio preferencia a tagSNPs como se define por el programa Haploview en la población riales. Esto se hizo en dos etapas, 20 SNPs se escriben y se analizaron en primer lugar y, sobre la base de estos y los resultados anteriores, se añadieron 35 más variantes, sobre todo en los genes
TMTC1
,
HMGA2 gratis (OMIM * 600.698) y
PAWR gratis (OMIM * 601936), que muestra la asociación más fuerte con PCA (cuadros S1 y S4). Seis SNPs son invariantes en esta población, mientras que tres eran de Hardy-Weinberg (p & lt; 0,002), por lo tanto, 46 polimorfismos fueron incluidos en el análisis final, de los cuales cuatro se asociaron significativamente con CaP (uno en
HMGA2
y tres en
PAWR
). No hemos Perseguimos el
HMGA2
asociación más lejos desde rs17179670 es una variante intrónica, es el único polimorfismo asociado a la enfermedad dentro de este gen y la señal de asociación no es particularmente fuerte (p = 0,03).
la región del gen PAWR
después de todas las rondas de análisis rs12827748, que se encuentra aguas arriba de la
PAWR
gen, siendo la más significativa SNP asociados, incluso después de ajustar por edad y ascendencia individuo (p & lt; 0,01). Este SNP muestra una gran diferencia de frecuencia entre las poblaciones de Europa y África Occidental (alelo C: 0,63 vs 0,01, respectivamente), mientras que la frecuencia del mismo alelo en los casos PCA es 0,18 en comparación con 0,11 en los controles (Tabla S4). Para eliminar la confusión por la ascendencia añadido incluimos estimaciones ascendencia locales en el modelo de regresión.
ascendencia local en rs12827748 se evaluó mediante la AIM rs10778691, que era el más cercano a rs12827748 (distante ~130 kb), y reveló que la probabilidad de que dos cromosomas europeos en este locus fue mayor en los casos que en los controles, aunque el resultado no fue significativo (8,3% vs 7,6%, p = 0,74). ajuste adicional de un ancestro locales no eliminó la importancia de la asociación entre rs12827748 y PCA (OR 1,6; IC del 95%, 1,1-2,4; p = 0,02, Tabla 3).
Dos otro
PAWR
SNPs también fueron significativas (rs8176908, rs8176882, p & lt; 0,05, Tablas 3 y S4), el menor alelos están completamente ausentes en las poblaciones europeas y tienen una frecuencia inferior a 10% entre los africanos occidentales. Sin embargo, cuando los tres marcadores se incluyen en la regresión logística, con la edad, ascendencia individual y local como covariables, solamente rs12827748, muestra una asociación significativa (p = 0,03). El desequilibrio de unión es fuerte entre rs8176908 y rs8176882 pero más débil entre cualquiera de éstos y rs12827748 (datos no mostrados).
Los haplotipos construidos utilizando los tres
PAWR
polimorfismos mostraron un fuerte efecto protector del haplotipo TGG (p = 1,7 × 10
-4), mientras que los haplotipos que incluían todos los alelos europeos (es decir, alelos que tienen una frecuencia mayor en Europa que en las poblaciones del África Occidental, CGG) o todos los alelos de África Occidental (TCT) aumentó significativamente el riesgo de la enfermedad (Tabla 4). Sólo el haplotipo TGG siguió siendo significativa después de la corrección de múltiples ensayos mediante análisis de permutación.
Evaluamos
in silico
el impacto que puede tener rs12827748 en función de los genes y no encontró ninguna interrupción del factor de transcripción sitios u otros efectos reguladores de unión. Este es un SNP intergénica que se encuentra entre
PAWR
y
PPP1R12A Opiniones y puede estar en desequilibrio de ligamiento con variantes funcionales en el gen o bien, a pesar de
PAWR
como un supresor de tumores es un candidato más probable. Sin embargo, los patrones de LD en las poblaciones HapMap CEU y YRI muestran que rs12827748 se puede encontrar dentro de un gran bloque que incluye todos los
PAWR
y su región aguas arriba con una separación tajante desde el bloque que contiene
PPP1R12A
Como era de esperar, hemos observado que los portadores del rs12827748 alelo C se muestra significativamente más alta significan ascendencia europea que los individuos con el genotipo TT (0,30 vs 0,20, p & lt; 0,005)., sin embargo, no hubo diferencias en la ascendencia entre casos y controles dentro de cada grupo de genotipo. Sin embargo, si los individuos se seleccionan basándose en los niveles de ascendencia locales, por ejemplo, mediante la restricción de la muestra a aquellos individuos con una probabilidad superior al 95% de tener dos cromosomas europeos en rs10778691 (N = 32) o a los portadores del genotipo rs12827748 CC (N = 21), los casos muestran una ascendencia africana West mundial significativamente elevada (54-66% vs 32 a 34% en los controles), aunque todavía es baja con respecto a la media de la muestra no seleccionada (78%). A pesar de los tamaños de muestra ser bastante pequeñas las diferencias son significativas (p = 0,03 y 0,01). Esto sugiere que hay probabilidades son factores adicionales heredados del ancestro del África Occidental que predisponen a CaP
Vitamina D: genes relacionados. VDR y CYP27B1
La forma activa de la vitamina D (1,25 ( OH)
2D
3) reduce la proliferación y promueve la diferenciación, y se ha implicado en los cánceres de colon, de mama y de próstata. Al mismo tiempo, se ha informado de que las personas de ascendencia africana occidental tienen aproximadamente dos veces menor niveles de vitamina D en suero (25 (OH) D, el principal metabolito circulante) que las de ascendencia predominantemente europea [14], lo que puede implicar una menor protección de cáncer para el primero. Se ha sugerido que la variación polimórfica dentro de los genes en la vía de la vitamina D, como
VDR
, puede contribuir a las disparidades observadas en las tasas de asociación y cooperación entre poblaciones de diferentes orígenes.
Varios estudios han examinado variación en
VDR Hoteles en búsqueda de una asociación con diferentes tipos de cáncer. Hay seis polimorfismos estudiados comúnmente en
VDR
: variante Cdx2 en el promotor (rs11568820), FokI en el exón 2 (rs2228570), BSMI en el intrón 8 (1544410), ApaI también en el intrón 8 (rs7975232), Taq I en el exón 9 (rs731236), y el poli-a de repetición de mononucleótidos en el 3'UTR del gen. Taq I está en fuerte LD con los otros marcadores de la región (BsmI, ApaI y el poli-A de microsatélites). Los polimorfismos en la región reguladora 5 'se sabe que afectan la actividad transcripcional del gen mientras que polimorfismos en el 3'UTR se han relacionado con la estabilidad de ARNm [15]. Resultados para CaP han sido inconsistentes con algunos estudios que muestran asociaciones positivas y otras postular ningún efecto [16] - [19]. Una asociación con CaP avanzado También se ha informado, es decir, el grado de Gleason ≥7 [20]
.
Dado que dos de los genes en la vía de la vitamina D, es decir,
VDR
y
CYP27B1
, se encuentra en el cromosoma 12, que los examinó más de cerca escribiendo unos SNPs en ellos.
CYP27B1
codifica la enzima 1-α-hidroxilasa que cataliza la conversión de 25 (OH) D en 1,25 (OH)
2D
3. variantes polimórficas en este gen han sido examinados, pero no encontró a asociarse con CaP [21]. Los detalles de los SNPs con tipo se dan en la Tabla 5. La asociación con la enfermedad se observó para dos estrechamente vinculada
VDR
SNPs, rs731236 (Taq I) y rs7975128 (p & lt; 0,05, Tablas 3 y 5), y sus haplotipos ( Tabla 6). Sin embargo, el ajuste por edad y ascendencia individuo retira la importancia de las asociaciones. No hubo efecto de
CYP27B1
variantes sobre el riesgo de CaP fue evidente en este estudio.
Discusión
Hemos proyectado el cromosoma 12 en la búsqueda de alelos que predisponer a los afroamericanos para la aparición y el desarrollo del CaP y que puede explicar en parte por las diferencias en la incidencia y la mortalidad entre los afroamericanos y los europeos. Después de un cuidadoso control de los efectos de ascendencia individual y local hemos identificado un polimorfismo (rs12827748) situado aguas arriba de la
PAWR
gen que aumenta significativamente la susceptibilidad de CaP. El alelo C, lo que confiere un riesgo, es poco frecuente en África Occidental, pero es el alelo mayor en las poblaciones europeas. Dos adicionales
PAWR
SNPs (uno intrónica, un sinónimo) también se asociaron con CaP en el único marcador análisis pero la inclusión de los tres polimorfismos en el modelo de regresión eliminado toda significación a excepción de rs12827748. Sin embargo, puesto que las dos últimas variantes sólo están presentes en las poblaciones de ascendencia africana occidental pueden también representan factores de riesgo de CaP que debido a sus frecuencias más bajas no son detectados como señales significativas de forma independiente. Existe entonces la posibilidad de que esta región alberga factores de susceptibilidad de Europa así como los originarios de África Occidental, y en una población mezclada, como los afroamericanos, tanto de ellos podría estar en el trabajo.
También es interesante observar que todos los SNPs asociados eran, de hecho, las variantes de baja frecuencia con frecuencias de alrededor o por debajo del 10% en los controles. La odds ratio correspondientes a estas variantes fueron de 1,6 a 2,8, por lo general más altos que los reportados en estudios de asociación de genoma completo. Debido al tamaño relativamente pequeño de nuestro estudio no es suficiente para poder detectar el efecto de variantes raras (es decir, aquellos con frecuencias inferiores al 1%) y por lo tanto no se puede prescindir de ellos como posibles factores causantes de PCA. Del mismo modo, la importancia de las variantes con frecuencias por debajo de 5% puede haber sido subestimado debido a la insuficiencia de poder.
El
PAWR
o gen de próstata respuesta de la apoptosis se encuentra en el cromosoma 12q21 y es altamente expresado en el próstata. Se promueve la apoptosis y causa la regresión del tumor, y su regulación a la baja es evidente durante la tumorigénesis [22]. Sin embargo, la pérdida de
PAWR
no es suficiente para causar CaP en
PAWR
nulos ratones, pero no de manera concomitante cuando se combina con
PTEN
heterocigosidad [23]. Nuestros resultados sugieren que
PAWR
puede ser un gen de susceptibilidad al CP de bajo penetrancia y merece un examen más detenido en otras poblaciones y con respecto a otros fenotipos relacionados con CaP. La relevancia de estos hallazgos, sin embargo, sólo se puede determinar su replicación en estudios posteriores ya que no podemos ignorar el hecho de que los estudios con tamaños de muestra pequeños están en un riesgo más alto de informes asociaciones positivas falsas [24].
el número limitado de casos y controles también afectó nuestra capacidad para llevar a cabo un estudio formal mapeo mezcla en el cromosoma 12, ya que se reduce la potencia para detectar un riesgo menor de 2 veces debido a la ascendencia [25].
Hemos detectado una asociación marginalmente significativa del CP con dos SNPs en el
VDR
gen, incluyendo el polimorfismo Taq. Contrariamente a lo que se ha encontrado en un reciente meta-análisis del alelo menor (C = t) en Taq I fue el alelo de riesgo en nuestro estudio, aunque la asociación significativa meta-análisis fue identificado por poner en común europea, africana y las poblaciones de Asia [4 ]. Sin embargo, una mirada más atenta a los datos estratificados según la etnia indica que mientras que el alelo C parece tener un efecto protector en los europeos y los asiáticos parece conferir riesgo en las poblaciones de ascendencia africana [4]. La mayoría de los estudios que analizaban Taq I en los europeos no encontró un efecto significativo o informaron que la principal (T) alelo aumenta la susceptibilidad a la CP [26], [27]. Por otra parte, los estudios de polimorfismos de VDR en los afroamericanos con CaP son bastante limitadas, la mayoría con tamaños de muestra pequeños y por lo tanto no concluyentes con respecto al papel de Taq I [26].
Por último, es importante hacen hincapié en que la evaluación cuidadosa de todo el genoma de los orígenes ancestrales de una población mezclada como los afroamericanos representa un medio valioso para desentrañar los factores de riesgo genéticos que pueden contribuir a la existencia de disparidades en la salud.
Información de Apoyo
Tabla S1. List de ascendencia 76 marcadores informativos (AIMS) distribuye a lo largo del cromosoma 12 se utiliza para estimar la ascendencia local y detectar asociación con el cáncer de próstata
doi:. 10.1371 /journal.pone.0016044.s001 gratis (DOC)
Tabla S2.
en todo el genoma ascendencia marcadores informativos (AIMS) utilizados en la estimación de proporciones ascendencia individuales en los casos de cáncer de próstata afroamericanos y los controles
doi: 10.1371. /journal.pone.0016044.s002 gratis (DOC)
Tabla S3.
Potencia estimada para detectar los efectos del cromosoma 12 SNPs
doi:. 10.1371 /journal.pone.0016044.s003 gratis (XLSX) sobre Table S4.
Cincuenta y cinco SNPs mecanografiadas en 12 regiones cromosómicas asociadas previamente o candidato
doi:. 10.1371 /journal.pone.0016044.s004 gratis (DOC)
Reconocimientos
Estamos en deuda con todos los participantes en el estudio, y para Folasade Akereyeni y Chiledum Ahaghotu por su inestimable ayuda con el reclutamiento de voluntarios.