Extracto
Aplicaciones
ERCC1
y
ERCC2
juegan papeles críticos en el nucleótidos vía de reparación por escisión de que efectivamente repara el daño del ADN inducido por agentes quimioterapéuticos. Por lo tanto, los polimorfismos funcionales de nucleótido único (SNPs) en estos genes podrían tener un impacto en los resultados clínicos en pacientes con cáncer que recibieron quimioterapia. Sin embargo, pocos estudios han investigado simultáneamente las funciones de los
ERCC1
y
ERCC2
SNPs en los resultados clínicos en pacientes con cáncer gástrico.
Diseño Experimental
Estamos genotipo por el ensayo TaqMan tres frecuente y potencialmente funcional
ERCC1 gratis (rs3212986) y
ERCC2
SNPs (rs1799793 y rs13181) en 360 pacientes con cáncer gástrico. Utilizamos las dos pruebas de Kaplan-Meier y Cox modelos de riesgos proporcionales para evaluar los efectos de los
ERCC1
y
ERCC2
genotipos y haplotipos en los resultados clínicos.
Resultados
se encontró que, en comparación con
rs1799793 ERCC2
genotipos GG AG +, el genotipo AA variante homocigótica se asoció con la supervivencia global significativamente más pobre (OS) (AA vs GG + AG, log-rank
P = 0,012
) y significativamente mayor riesgo de muerte (AA vs GG + AG, riesgos ajustados ratio [HR] 2,13; IC del 95%, 1,28 a la 3,56;
P
= 0,004). En los análisis combinados, los pacientes con cualquiera de los tres genotipos desfavorables (es decir,
ERCC1
TT rs3212986,
GG ERCC2
rs13181 y rs1799793 AA) tenían riesgos estadísticamente significativos de mal pronóstico (HR ajustado, 1,54 ; IC del 95%, 01/06 a 02/25;
P
= 0,025), en comparación con los que no tienen ningún genotipos desfavorables. Por otra parte, la AGG haplotipo (rs1799793 /rs13181 /rs3212986) tuvo un impacto significativo en la SG (CRI ajustado, 1,57; IC del 95%, 1.11 a 2.21;
P = 0,011
), en comparación con el haplotipo común GTG.
Conclusión
ERCC1
y
ERCC2
SNPs funcionales pueden afectar de manera conjunta OS en pacientes con cáncer gástrico caucásicas. grandes estudios prospectivos adicionales son esenciales para confirmar nuestros hallazgos
Visto:. Li Y, Z Liu, Liu H, Wang L-E, D Tan, Ajani JA, et al. (2013)
ERCC1
y
ERCC2
variantes predecir la supervivencia en pacientes con cáncer gástrico. PLoS ONE 8 (9): e71994. doi: 10.1371 /journal.pone.0071994
Editor: Xiaoping Miao, Tongji Medical College, Universidad Huazhong de Ciencia y Tecnología, China
Recibido: 23 de mayo de 2013; Aceptado: 12 de julio de 2013; Publicado: 2 Septiembre 2013
Derechos de Autor © 2013 Li et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Esta investigación fue apoyado por fondos de The Texas 4000 Dotada Cátedra Honorífica y los MD Anderson de la hermana Institución fondos de la red. Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer gástrico es la segunda causa principal de muerte por cáncer, ocupando el cuarto tipo de cáncer más común en el mundo, con aproximadamente 989.600 nuevos casos y 738.000 muertes cada año [1]. En los Estados Unidos, se estimaba que había 21.600 casos nuevos y 10990 muertes en 2013 [2]. Para los pacientes con cáncer gástrico, la TNM (tumor /nódulo /metástasis) etapa es la medida más aceptable para efectos de las terapias y el pronóstico evaluar; sin embargo, no es raro que los pacientes con la misma etapa del tumor y el tratamiento pueden tener diversos resultados. Por lo tanto, para los cirujanos y oncólogos, sería de gran ayuda para mejorar la precisión en la predicción del resultado clínico mediante la identificación de los responsables genéticos que podrían facilitar la terapia contra el cáncer individualizado, tratamiento adyuvante post-operativa y estrategias de seguimiento. En las últimas décadas, los estudios han encontrado que las variaciones genéticas desempeñan un papel en el desarrollo y progresión del cáncer gástrico. Las diferencias individuales o variaciones en la respuesta a las quimioterapias o radioterapias son probablemente debido a sus diferentes genéticos maquillajes, dando lugar a diferentes resultados clínicos. Por ejemplo, los polimorfismos de nucleótido único (SNP) son la variación genética más comúnmente investigados que pueden influir en los resultados clínicos de los pacientes [3], [4], [5].
sistema de reparación del ADN juega un papel vital en el mantenimiento la estabilidad de las funciones celulares y la integridad genómica a través de la inversión de la ADN dañado inducida por diversos factores endógenos y /o exógenos, incluyendo agentes terapéuticos; Por lo tanto, la capacidad de reparación del ADN del huésped puede contribuir a la evolución de los pacientes de cáncer [6], [7]. Entre las vías de reparación del ADN bien conocidos, la vía de reparación por escisión de nucleótidos (NER) es un mecanismo importante que mantiene la integridad genómica mediante la eliminación de lesiones voluminosas de ADN o aductos entre hebras inducidas por exógenos y /o factores endógenos [8], [9]. D (ERCC2 /XPD) proteínas grupo de complementación grupo pigmentoso 2 /xeroderma complementario cruzado de la escisión del grupo de reparación de complementación cruzada complementación 1 (ERCC1) y la escisión de reparación son los dos componentes principales del proceso NER. ERCC1, codificada por el gen localizado en el cromosoma 19q13.32, interactúa con XPA /XPF y otras proteínas NER, guiando la actividad 5 'de la incisión en la vía NER [10], mientras que ERCC2, codificada por el gen localizado en el cromosoma 19q13.3 , es una helicasa dependiente de ATP que media la anulación de ADN para la iniciación de NER [11]
.
Hasta la fecha, hay 36 SNPs en
ERCC1
de codificación y 115 SNPs en la codificación
ERCC2
han sido reportados (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/). En los SNPs codificantes, la
ERCC2
rs13181 y rs1799793 son los únicos dos SNPs no sinónimas con menor frecuencia & gt alelo; 5%, y estos dos SNPs han demostrado tener un efecto sobre la reparación del ADN fenotipo capacidad, posiblemente por la alteración de la secuencia de aminoácidos de la proteína [12], [13]. Además, se informó de otro SNP regulador común en la región no traducida 3 'de
ERCC1
rs3212986 que se correlaciona con el fenotipo de la capacidad de reparación del ADN [14] y para tener algún efecto sobre
ERCC1
mRNA expresión [15]. Algunos estudios han sugerido que la baja
ERCC1
expresión se asocia con un aumento de la sensibilidad de quimioterapia y, por tanto, como un marcador predictivo para los pacientes con cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC) tratados con quimioterapia basada en platino [16], mientras que otros Los estudios indican que
ERCC2
SNPs se asociaron con una peor supervivencia en pacientes con CPNM en las poblaciones chinas [17]. Por otra parte,
ERCC2
rs13181 y rs1799793 SNPs han demostrado ser indicadores pronósticos para los pacientes con osteosarcoma [18], el cáncer colorrectal [19], y el cáncer oral [20], pero hasta la fecha, pocos estudios han investigado pronóstica importancia de estos SNPs en pacientes con cáncer gástrico. Por ejemplo, sólo un pequeño estudio mostró que
ERCC2 Lys
751Gln gratis (rs13181) SNP podría ser un fabricante de predicción de resultados en pacientes hispanos con estadio III /IV de cáncer gástrico [21].
Aunque ambos
ERCC1
y
¿Cuáles son ERCC2 localizado en el cromosoma 19 y participe en la actividad NER, pocos estudios han investigado simultáneamente los efectos de
ERCC1
y
ERCC2
variantes en los resultados clínicos gástricos, como se resume en la revisión anterior en un meta-análisis [22]. Por lo tanto, la hipótesis de que los SNPs funcionales y haplotipos de estos dos genes pueden tener un impacto en el pronóstico del cáncer gástrico. En el presente estudio, se evaluaron las asociaciones de
ERCC1
(rs3213986) y
ERCC2
(rs13181) y rs1799793 SNPs con la supervivencia en pacientes con cáncer gástrico.
Materiales y Métodos
Ética declaración
Este protocolo de estudio fue aprobado por la Universidad de Texas MD Anderson Cancer Center de la Junta de Revisión Institucional (IRB), y todos los pacientes siempre que su consentimiento informado mediante el formulario de consentimiento informado aprobado por el IRB .
El reclutamiento de pacientes y seguimiento
Este estudio incluyó a 360 pacientes que se hayan acumulado de los que tienen recién diagnosticado y confirmado histológicamente cáncer gástrico, independientemente de la edad, el sexo o el estadio del tumor, en The Universidad de Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, Texas, entre febrero de 1990 y abril de 2012. Aquellos pacientes que no estaban recién diagnosticada o tratada en otro lugar antes de llegar al Centro de cáncer MD Anderson fueron excluidos de este estudio. Entrevistamos a cada participante elegible para obtener datos sobre el consumo de tabaco y alcohol. Los que habían fumado menos de 100 cigarrillos en su vida eran considerados como "nunca fumadores", y todos los demás fueron considerados como "fumadores cada vez". Del mismo modo, los sujetos que ingirió bebidas alcohólicas al menos una vez a la semana durante más de 1 año previamente se definieron como "nunca" bebedores, y todos los demás se definieron como "nunca" bebedores. Cada paciente donó una sola vez 10 ml de la sangre entera dibujan en un tubo heparinizado para las pruebas genéticas. Todos los pacientes incluidos en este estudio tenían muestras de sangre disponibles para los datos de seguimiento genotipo y para la evaluación de los resultados.
Genotipado
ADN genómico se aisló de la fracción de capa leucocitaria de la muestra de sangre , utilizando un Kit Blood Mini (Qiagen, Valencia, CA) según las instrucciones del fabricante. las concentraciones de ADN se determinaron por medición espectrofotométrica de la absorbancia a 260 nm y las purezas se calcularon por la relación A260 /A280 utilizando espectrofotómetro Nanodrop ND-1000 (Thermo Scientific, Rockford, IL). Los genotipos de los tres SNPs seleccionados (
ERCC1
rs3213986 G & gt; T,
ERCC2
rs13181 T & gt; G y rs1799793 G & gt; A) se realizaron utilizando la metodología TaqMan en placas de 384 pocillos y leer con el software de detección de secuencias en el instrumento ABI Prism 7900 de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Applied Biosystems, Foster City, CA). Los cebadores utilizados para rs3213986 G & gt; T, rs13181 T & gt; G y rs1799793 G & gt; A fueron CACAGGCCGGGACAAGAAGCGGAAG [A /C] AGCAGCAGCAGCAGCCTGTGTAGTC, TGCTGAGCAATCTGCTCTATCCTCT [G /T] CAGCGTCTCCTCTGATTCTAGCTGC, y CGGGGCTCACCCTGCAGCACTTCGT [C /T] GGGCAGCACGGGGTTGGCCAGGTGG, respectivamente. Cada placa de 384 pocillos tenía cuatro controles negativos, un control positivo y ocho muestras repetidas. Las reacciones de PCR se realizaron en las siguientes condiciones: 50 ° C durante 2 min, 95 ° C durante 10 min, y luego 95 ° C durante 15 s y 60 ° C durante 1 min durante 40 ciclos. Para todos los genotipos, la tasa de éxito de ensayo fue & gt; 99% y los resultados de las muestras repetidas fueron 100% concordantes
Análisis estadístico
La bondad del ajuste χ
2 test. se aplicó para calcular el equilibrio de Hardy-Weinberg, de la distribución de genotipos. El método de Kaplan-Meier se utiliza para visualizar la supervivencia global (SG) por tres grupos de genotipos. El tiempo de OS se calculó a partir de la fecha de inscripción en M. D. Anderson a la fecha del último contacto o la muerte, y los pacientes que todavía estaban vivos en el último contacto se consideraron en el análisis censurado. Se calculó el tiempo medio de supervivencia (MST), y se aplicó la prueba de log-rank para comprobar la igualdad de las distribuciones de supervivencia. Se realizaron modelos univariantes y multivariantes riesgos proporcionales de Cox para calcular los coeficientes de riesgos (CR) y los intervalos de confianza del 95% (95% IC) de cada genotipo para estimar su efecto sobre la supervivencia con o sin ajuste por factores de confusión. Haplotipos se infiere utilizando el proceso SAS PROC haplotipo, y asociaciones entre haplotipos y OS fueron determinados por el modelo genético recesivo siguiendo el modelo genético xeroderma pigmentoso (XP), ya que utilizamos anteriormente [23]. Todas las pruebas estadísticas fueron de dos caras, con un
valor de p de 0,05
considerado significativo y todos los análisis se realizaron utilizando el software SAS versión 9.2 (SAS Institute, Cary, NC). También se calculó el informe de probabilidad de falsos positivos (FPRP) para detectar los hallazgos de la asociación de falsos positivos. Para todos los resultados significativos, asignamos una probabilidad previa de 0,1 a detectar una HR de 2,0 para una asociación con los genotipos y alelos de cada SNP. La potencia estadística también se calculó utilizando el software disponible en línea PS versión 3.0 [24], [25]. Sólo los resultados significativos con potencia estadística & gt; 0,8 y el valor eran FPRP. & Lt; 0,2 consideradas asociación destacable
Resultados
Características de los pacientes y las características clínicas
Las características demográficas y clínicas de los pacientes se presentan en la Tabla 1. las edades de los pacientes tenían entre 19 y 89 años al momento del diagnóstico, con una edad media de 60 años y una edad media de 59,6 ± 12,4 años. Entre los 360 pacientes, hubo más hombres (221, 61,39%) que las mujeres (139, 38,61%), que consiste en 224 (62,22%) los blancos no hispanos, 136 (37,78%) otras etnias (hispanos, negros y asiáticos) , 191 (53,06%) fumadores cada vez, y 188 (52,22%) nunca alcohol consumidores. En el último seguimiento (septiembre de 2012), 178 (49,44%) fallecieron, con un MST de 16,02 meses. Del total de pacientes, 136 (37,78%) presentaron con estadios I-II y 224 (62,22%) con estadios III-IV. La distribución de los tipos histológicos un total de 169 (46,94%) carcinomas intestinales, 148 (41,11%) carcinomas en anillo de sello y 43 (11,94%) de otros tipos. La distribución de los grados histológicos incluyó 113 (31,39%) casos de diferenciación moderada /moderada de los pobres y 247 (68,61%) casos de diferenciación pobres. Para la categoría de tratamiento, 136 (37,78%) pacientes tuvieron tratamiento quirúrgico, 293 (81,39%) pacientes tuvieron quimioterapia, y 114 (31,67%) pacientes recibieron radioterapia (112 pacientes tenían tanto la quimioterapia y la radioterapia). Cuando todas estas variables se incluyeron en un modelo de regresión de riesgos proporcionales de Cox para el ajuste de calcular los riesgos proporciones (HRS), sometidos a cirugía (HR, 3,51; IC del 95%, 2,37 a 5,20;
P Hotel & lt; 0,001) , teniendo etapa enfermedades III-IV (HR, 2,54; IC del 95%, 1,74 a la 3.69;
P Hotel & lt; 0,001), y recibiendo radioterapia (HR, 1,57; IC del 95%, 1.11 a 2.21;
P = 0,011
) se mantuvo indicadores de pronóstico estadísticamente significativas (log-rank
P Hotel & lt; 0,05; Tabla 1). Aunque el crudo
P
era 0.004 en el grupo de quimioterapia que recibe, el HR ajustado no fue estadísticamente significativa (
P = 0,902
).
Asociación entre
ERCC1
y
ERCC2
SNPs y OS de prueba
Se utilizó el método de Kaplan-Meier y el modelo de Cox para evaluar los efectos de los
ERCC1
y
ERCC2
SNPs en OS de los pacientes. La Tabla 2 muestra las distribuciones de genotipo de los
ERCC1
rs3213986 y
ERCC2
rs13181 y SNPs rs1799793, así como sus asociaciones con el sistema operativo. Los genotipos observados en los pacientes de acuerdo con los estimados a partir del equilibrio de Hardy-Weinberg (
P = 0,466
para rs1799793,
P = 0,820 para
rs13181, y
P =
0,789 para rs3213986). En todos los pacientes, el
ERCC2
rs1799793 G & gt; A SNP mostró una asociación estadísticamente significativa con el sistema operativo, y el MST para los pacientes con genotipo AA fue más corto que el de aquellos con el genotipo GG común (13,2 meses frente a 15,8 meses; log-rank
P = 0,012
). En el análisis de Cox, los pacientes con la variante genotipos AG /AA exhiben una mayor significativamente los riesgos de muerte en los modelos univariantes, en comparación con los que tenían el genotipo GG (HR, 1,46; IC del 95%, 1,07 a la 2,00 y
P
= 0,017 para AG, y HR, 2,23; IC del 95%, 1,33 a la de 3.75 y
P = 0,002
para AA, respectivamente). Después de ajustar por edad, sexo, tabaquismo, consumo de alcohol, el estadio del tumor, el grado histológico, el tipo histológico y el tratamiento en un modelo de Cox, el genotipo AA permanecido tenido un impacto estadísticamente significativo sobre el sistema operativo, en comparación con el genotipo rs1799793 GG (HR, 2,18; IC del 95%, 1,26 a la 3,78 y
P
= 0,006) o el genotipo GG + AG (HR, 2,13; IC del 95%, 1,28 a la 3,56 y
P
= 0,004) (Figura 1A) . Para los otros dos
ERCC2
rs13181 y
ERCC1
SNP rs3212986, aunque ambos SNPs mostraron asociaciones con una tendencia de aumento de la FC con la variante genotipos, no hubo asociación estadísticamente significativa con el sistema operativo bajo una genética recesiva modelo (Tabla 2).
la supervivencia de pacientes con cáncer gástrico por factores de riesgo genéticos combinados
Para evaluar el efecto conjunto de los tres SNPs en el pronóstico del paciente, que combina tres genotipos homocigotos variantes (es decir,
ERCC1
rs3212986 TT,
ERCC2
rs13181 GG, y rs1799793 AA). Del total de pacientes, 63 pacientes tenían al menos un genotipo homocigoto variante, y estos pacientes tenían estadísticamente significativos riesgos de mal pronóstico (HR ajustado, 1,54; IC del 95%, 01/06 a 02/25;
P
= 0,025), en comparación con los que no tienen ninguna (Tabla 2).
Asociación entre
ERCC1
y
ERCC2
haplotipos y OS de prueba
Debido a que estos tres SNP son todos en el cromosoma 19, seguir explorando sus haplotipos y evaluaron su efecto combinado sobre la supervivencia de cáncer gástrico. En total, hubo ocho haplotipos, de los cuales cinco habían frecuencias & gt; 5%, y otros tres haplotipos menos comunes se combinaron en un solo grupo. Los cinco haplotipos más comunes en estos pacientes fueron rs1799793 /rs13181 /rs3212986 G-T-G, A-G-T, G-T-T, A-G-G, y G-G-G con la frecuencia de 52,2%, 13,9%, 12,6%, 9,4% y 6,8%, respectivamente. En comparación con el haplotipo GTG más común, el haplotipo AGG tuvo un impacto significativo en el sistema operativo (HR ajustado, 1,57; IC del 95%, 1.11 a 2.21;
P = 0,011
) (Tabla 3) (Figura 1B).
análisis de la estratificación entre los genotipos recesivos y la supervivencia global
se realizó un análisis estratificado para investigar si los SNPs y sus genotipos combinados en un modelo recesivo en la supervivencia fueron modificados por algunos factores clínico-patológicos importantes en la Tabla 1. Se encontró que el
ERCC2
genotipo AA rs1799793 tenían un riesgo de mortalidad más alta en los pacientes que eran mayores (≥ 60 años), de sexo masculino, no hispanos blancos, que tiene antecedentes de tabaquismo, tener una mala diferencial, tipo intestinal de los tumores, y que tengan cualquiera de tratamiento (operación, quimioterapia o radioterapia). También observamos mal pronóstico estadísticamente significativo en pacientes de sexo masculino con el
ERCC2
rs13181 genotipo GG, y los pacientes con el
ERCC1
genotipo TT re3212986 (Tabla 4) y no fumadores. Los análisis combinados mostraron que los pacientes con cualquiera de los genotipos homocigotos tres variantes sufrirían un mayor riesgo de muerte, sobre todo en aquellos que eran mayores (≥ 60 años), de sexo masculino, los consumidores de alcohol, los blancos no hispanos, tener una mala diferencial, tipo intestinal de los tumores en estadios I /II, y que tiene la quimioterapia (Tabla 4).
Finalmente, se calcularon los valores FPRP en los diferentes niveles de probabilidad a priori, así como el poder estadístico para todos los hallazgos significativos (Tabla 5) . Para una probabilidad previa de 0,1, suponiendo que el HR para el genotipo específico era 2.0, los valores FPRP fueron 0,044, 0,079, 0,087 y 0,197, con un poder estadístico de 0,930, 0,927, 0,903 y 0,842 (La probabilidad de error Tipo I asociado con esta prueba de esta hipótesis nula es 0,05), respectivamente, de una asociación de la
ERCC2
rs1799793 genotipo AA, haplotipo AGG y 1-3 de
ERCC1
y
ERCC2
genotipos de riesgo, respectivamente, lo que sugiere que estos hallazgos pueden ser notables en todos los individuos, y que sería capaz de rechazar la hipótesis nula de que las curvas de supervivencia de referencia y la variante son iguales con potencia estadística & gt; 0,8. Además, la mayoría de las asociaciones significativas en análisis estratificados se consideraron digno de mención porque la probabilidad de un resultado falso positivo fue & lt; 0,2 y el poder estadístico & gt; 0.8 (Tabla 5). No obstante, algunos valores FPRP mayores (& gt; 0,2) se observaron para algunas otras asociaciones significativas en los análisis estratificados (por ejemplo,
ERCC2
rs13181 y
ERCC1
genotipos variante rs3213986 con OS cáncer gástrico). Para aquellas asociaciones significativas con la fortaleza estadística & lt; 0,8, no pudimos rechazar la hipótesis nula de que las curvas de supervivencia eran iguales entre la variante y los grupos de referencia, y que nos corresponde a los valores FPRP mayores (& gt; 0,2) (Tabla 5) , lo que sugiere una posible sesgo en estos resultados positivos que deben ser validados en estudios más amplios en el futuro.
Discusión
en el presente estudio, se investigó si funcional
ERCC1
rs3213986 G & gt; T y
ERCC2
rs13181 T & gt; G y rs1799793 G & gt; a SNP tienen efectos individuales o conjuntas sobre los resultados clínicos de los pacientes con cáncer gástrico en una población de pacientes de América del Norte. Se encontró que el
ERCC2
genotipo AA rs1799793 contribuyeron a un tiempo de supervivencia significativamente más corto, en comparación con el genotipo AG /GG. Después de ajustar por otros factores clínicos, los efectos de la
ERCC2
genotipo AA rs1799793, los efectos combinados de los tres genotipos homocigotos variante, y el rs1799793 /rs13181 /rs3212986 haplotipo AGG todos permanecieron como predictores significativos de los resultados clínicos pobres en esta población de estudio. Además, estos efectos también se mantuvieron en los análisis de la estratificación. En general, los pacientes con el
ERCC2
genotipo rs1799793 AA tendrían mayor riesgo de muerte, especialmente en aquellos que eran mayores (≥ 60 años), los blancos no hispanos, tener una mala diferencial, tipo intestinal de los tumores, y que tiene la quimioterapia o radioterapia. Por otra parte, los pacientes con cualquiera de las rs1799793 /rs13181 /genotipos homocigotos variante rs3212986 sufrirían un mayor riesgo de muerte, sobre todo en aquellos que eran hombres blancos, no hispanos, tener una mala diferencial y de tipo intestinal de los tumores.
es bien sabido que algunas características clinicopatológicas, tales como el estadio del tumor y el tratamiento, se asocian con el pronóstico de pacientes con cáncer. Sin embargo, estábamos interesados en variantes genéticas funcionales de los genes de reparación del ADN que pueden modular la supervivencia de los pacientes en respuesta a la quimioterapia. El proceso NER es un importante mecanismo de reparación del ADN que mantiene la integridad genómica, tanto en células normales y tumorales, y los cambios en la capacidad NER puede aumentar o reducir las frecuencias de mutación de ADN como resultado de ADN dañado no reparados, lo que puede alterar la respuesta de los pacientes a la terapia, y por lo tanto puede conducir la progresión maligna y metástasis. ERCC1 y ERCC2 son dos enzimas clave que limitan la velocidad que actúan en el proceso de múltiples pasos NER. ERCC1 participa en el reconocimiento daño en el ADN, y ERCC2 es un miembro de un complejo de iniciación de la transcripción factor de TFIIH humano de nueve subunidad con actividad helicasa dependiente de ATP. Por lo tanto, potencialmente funcional
ERCC1
y
ERCC2
SNPs pueden afectar a la capacidad de reparación del ADN celular [26] y por lo tanto pueden estar asociados con diferentes tasas de supervivencia observadas en pacientes con cáncer.
Anterior informes sobre la asociación entre el
ERCC1
rs3212986 y la supervivencia del cáncer han sido motivo de controversia. Por ejemplo, Takenaka et al. demostraron que
ERCC1
rs3213986 SNP podría influir en el pronóstico de NSCLC, independientemente de la
ERCC1
expresión y la sensibilidad de platino en 122 pacientes con CPNM japoneses que fueron sometidos a una resección completa [27]; Sin embargo, el estudio de KimCurran mostró que no había falta de correlación entre los
ERCC1
C8092A SNP (rs3212986) y el sistema operativo o la eficacia /toxicidad de la quimioterapia basada en platino en 300 pacientes con CPNM chino tratados con quimioterapia [28]. Por otra parte, un reciente meta-análisis mostró que no había evidencia para apoyar
ERCC1
C118T (por 1.187 pacientes agrupados) /C8092A (para 625 pacientes agrupados) SNPs como un predictor pronóstico de la quimioterapia basada en platino en pacientes con CPNM [29]. De hecho, en el presente estudio de 360 pacientes con cáncer gástrico, no encontramos ninguna asociación entre el
ERCC1
rs3212986 G & gt; T SNP y OS. El análisis mostró que sólo la estratificación en los no fumadores, el genotipo TT rs3212986 se asoció con una HR significativamente mayor (
P = 0,028
) tras ajustar por factores clínicos. Pero después de calcular FPRP para este hallazgo significativo, se observó un valor FPRP mayor, lo que sugiere un posible sesgo en la estimación puede haber ocurrido debido a un tamaño de muestra relativamente pequeña en el presente estudio. No había ningún valor predictivo de los genotipos rs3212986 para OS en pacientes que recibieron quimioterapia o la radioterapia, especialmente en los blancos no hispanos, que son la mayoría de todos los pacientes.
ERCC2
rs13181 y rs1799793 SNPs también han sido previamente investigados por sus papeles en la supervivencia de los pacientes de cáncer. Wu
et al.
Indica que los pacientes con
XPD Lys
751Gln gratis (rs13181) y
Asp
312Asn gratis (rs1799793) genotipos variantes tenido NSCLC significativamente más pobre la supervivencia en pacientes chinos [17]. Estudios previos han demostrado también que
ERCC2
rs13181 alelo G y rs1799793 alelo podría conducir a una baja capacidad NER, en comparación con los genotipos comunes [30], [31], [32] y por lo tanto puede influir en los resultados del paciente . El presente estudio mostró que el
ERCC2
genotipo AA rs1799793 se asoció con la SG en pacientes con cáncer gástrico. En los análisis de mayor estratificación, se encontró que los CR se incrementaron en el subgrupo de edad avanzada (≥ 60 años), que tiene la historia de sexo masculino de fumar, los pacientes blancos no hispanos, tumor intestinal, tiene la terapia de la cirugía, la quimioterapia y la radioterapia, lo que puede indicar peores resultados. Hemos observado también rs1799793 genotipo AA tuvo un impacto significativo en la SG en pacientes que tenían tumores poco diferenciados, pero no se encontraron diferencias significativas entre los diferentes estadios tumorales. Sin embargo, el FPRP y cálculo de la potencia estadística mostraron posibles asociaciones notables con mala sistema operativo sólo en los subgrupos de edad avanzada, los blancos no hispanos, tumor pobremente diferenciado, tipo intestinal del tumor y que tiene la quimioterapia o la radioterapia. Por lo tanto, algunos de nuestros hallazgos de los análisis estratificados pueden ser por casualidad, debido al tamaño de la muestra reducida en los subgrupos. Estos resultados, una vez validados en estudios más amplios, pueden ser útiles en la evaluación de la estrategia de tratamiento basado en los antecedentes genéticos de los pacientes con diferentes características clinicopatológicas.
Los estudios previos han demostrado también algunos datos contradictorios sobre el papel de
ERCC2
rs13181 T & gt; G SNP en la supervivencia de pacientes con cáncer. Un estudio de 106 casos de cáncer colorrectal en una población de América del Norte encontró que el genotipo rs13181 GG se asoció con un mayor riesgo de muerte [33], y la otra investigación de 72 pacientes españoles con cáncer colorrectal mostró que estos pacientes con el heterocigoto rs13181 muestran mayor riesgo que los portadores de TT o genotipos GG [34]; Por el contrario, Keam y sus colegas no encontraron ninguna influencia de genotipos rs13181 en OS en un estudio de 73 pacientes asiáticos con cáncer gástrico [35], y Liu
et al.
Indicó que
XPD
Lys
751Gln (rs13181) no podría ser determinante genético para el pronóstico de NSCLC avanzado tratados con quimioterapia basada en platino [36]. En el presente estudio de 360 pacientes con cáncer gástrico, no se observó ninguna asociación significativa entre los genotipos rs13181 y la supervivencia global, ni en los análisis de la estratificación. La posible explicación es que la frecuencia del alelo rs13181 SNP puede variar en diferentes grupos étnicos (por ejemplo, el genotipo variante GG rs13181 tiene una frecuencia muy baja en la población asiática), y el número de casos en los estudios anteriores eran demasiado pequeñas (menos de 100 casos en los estudios españoles y asiáticos), que podrían haber introducido un sesgo en sus resultados. A lo mejor de nuestro conocimiento, el presente estudio es el mayor caso de sólo estudio centrado en el SNP en rs13181 OS cáncer gástrico en sentido norte poblaciones americanas con una mayoría de los caucásicos, pero se necesitan estudios más grandes para validar nuestros resultados.
El efecto de un único SNP sobre el riesgo de muerte o los resultados clínicos, en su caso, puede ser limitado, como cabría esperar, y los efectos combinados de varios SNPs en
ERCC1
y
ERCC2
en el mismo cromosoma puede ser más significativa. De hecho, en el presente estudio, se observó que los pacientes que tenían al menos uno de los genotipos tres variantes desfavorables homocigotos (rs1799793 AA, GG rs13181 y TT rs3212986) experimentó un incremento significativo del riesgo de muerte, en comparación con aquellos con ninguno de la variante desfavorable genotipos homocigotos. En un análisis más detallado de estratificación, se encontró que la asociación genotipo-supervivencia se mantuvo significativa en presencia de la mayoría de los factores de riesgo clínico-patológicos. Después FPRP y el cálculo del poder estadístico, las asociaciones significativas se destacaron por los subgrupos de sexo masculino, los blancos no hispanos, pobremente diferenciado del tumor y el tipo intestinal de pacientes con cáncer gástrico, que llevaban al menos un rs1799793 desfavorable /rs13181 /rs3212986 variante homocigoto. Estos hallazgos son biológicamente plausible, porque todos estos genotipos homocigotos variantes desfavorable pueden tener colectivamente un efecto sustancial en la capacidad de reparación del ADN. Por otra parte, una asociación más significativa se encontró con la peor supervivencia en el análisis de haplotipos. Los pacientes con la rs1799793 /rs13181 /rs3212986 haplotipo (A-G-G) tuvieron una supervivencia significativamente más pobre, en comparación con los pacientes con el tipo salvaje G-T-G haplotipo. Este efecto se mantuvo significativa después del ajuste (
P = 0,011
), FPRP y el cálculo del poder estadístico. El efecto acumulativo del haplotipo podría ser el resultado de la sinergia de cada SNP [17]. Sin embargo, el haplotipo A-G-T, que fue compuesta por todos los genotipos rs1799793A /rs13181G variantes /rs3212986T, no se encontró asociación con el sistema operativo en el presente estudio. Una de las posibles explicaciones es que los
ERCC1
rs3212986 genotipo variante de t no está asociado con OS [28], [29], pero el genotipo G podría tener un efecto sinérgico con
ERCC2
rs1799793 /rs13181 en OS, que necesita ser validado en series más amplias.
El presente estudio tiene algunas limitaciones. En primer lugar, no fuimos capaces de explorar el mecanismo exacto por el cual
ERCC1
y
ERCC2
SNPs influyen en la supervivencia del cáncer gástrico. En segundo lugar, aunque el presente estudio incluyó un número relativamente grande de pacientes gástricos, en comparación con los estudios publicados previamente de los caucásicos, el número de casos con variantes genotipos homocigotos todavía era pequeño, lo que puede dar lugar a un sesgo estadístico en los análisis, y estamos planeando confirmar los hallazgos actuales en nuestro estudio en curso de un estudio más amplio de la población, con un tiempo de seguimiento más prolongado. En tercer lugar, hemos utilizado los SNPs funcionales comunes en nuestra investigación, que no incluyeron todos los SNPs de representación en todo el gen. Algunos otros SNPs funcionales raras, que pueden influir en la supervivencia, pueden haberse perdido y necesitan ser investigados en estudios más amplios. En cuarto lugar, debido a la limitación de los datos clínicos no disponibles, no ha sido posible evaluar ni la supervivencia libre de enfermedad ni el papel potencial de los SNPs por diferentes quimioterapia /radioterapias, y el quinto, aunque hemos tenido resultados significativos, no hubo replicación independiente