Extracto
ARN HOX transcrito antisentido intergénica (
HOTAIR
) es mucho ARN no codificante (lncRNA) que funciona como una molécula oncogénica en diferentes células cancerosas. Las variantes genéticas de
HOTAIR
pueden afectar a la actividad de ciertos factores de regulación y regular aún más la expresión aberrante de
HOTAIR
, que podrían ser los mecanismos que afectan la susceptibilidad del tumor y el pronóstico subyacente. Recientemente, varios estudios se han realizado para examinar la posible relación entre los polimorfismos en
HOTAIR
y el riesgo de cáncer; Sin embargo, los resultados no han sido concluyentes. Por lo tanto, se realizó un metanálisis para estimar la asociación de
HOTAIR
polimorfismos (rs920778, rs4759314 y rs1899663) y el riesgo de cáncer. Se incluyeron ocho estudios con 7.151 casos y 8.740 controles en nuestro estudio. En general, el
no se observaron asociaciones significativas entre el aire caliente
polimorfismos (rs920778, rs4759314 y rs1899663) y el riesgo de cáncer. Sin embargo, en los análisis más estratificadas, el alelo variante T de rs920778 exhibió un aumento significativo del riesgo de desarrollar cánceres digestivos (modelo dominante: OR = 1,44; IC del 95% = 1,31-1,59). Estos resultados proporcionaron pruebas de que
HOTAIR
rs920778 pueden modificar la susceptibilidad a ciertos tipos de cáncer. Se necesitan más estudios que incorporan los sujetos con diferentes orígenes étnicos combinados con la re-secuenciación de la región marcada y evaluaciones funcionales
Visto:. Tian T, Li C, Xiao J, Shen Y, Lu Y, Jiang L, et Alabama. (2016) Evaluación cuantitativa de los polimorfismos en el
HOTAIR
lncRNA y riesgo de cáncer: Un meta-análisis de 8 estudios de casos y controles. PLoS ONE 11 (3): e0152296. doi: 10.1371 /journal.pone.0152296
Editor: Qing Yi-Wei, el Instituto del Cáncer de Duke, Estados Unidos |
Recibido: 8 de Diciembre, 2015; Aceptado: 12 Marzo de 2016; Publicado: 24 Marzo 2016
Derechos de Autor © 2016 Tian et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Disponibilidad de datos:. Todo relevante los datos están dentro del apoyo de sus archivos de información en papel y
Financiación:. Este trabajo fue financiado por la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (81502876), la Investigación de Ciencias Naturales de instituciones de educación superior de Jiangsu (15KJB330006), la Ciencia y el Programa de Tecnología de la ciudad de Nantong (MS22015088) y la Fundación de Investigación de Doctorado de la Universidad de Ciencia Nantong (14R16). Las fuentes de financiación no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida e interpretación de los datos, redacción del informe, o la decisión de presentar este documento para su publicación
Conflicto de intereses:. Los autores han declarado que no hay existen intereses en competencia.
Introducción
los cánceres son la principal causa de muertes en todo el mundo. Según estimaciones de la OMS, había 14,1 millones de nuevos casos de cáncer en 2012, y se espera que más de 20 millones de nuevos casos de cáncer al año ya en 2025, lo que indica un creciente problema mundial del cáncer [1]. En general, los cánceres se consideran enfermedades multifactoriales, y la aparición de cánceres están relacionados con factores ambientales, genéticos y de estilo de vida. Entre estos factores, los factores genéticos son de particular interés, sobre todo porque los estudios de asociación de genoma recientes (GWAS) y la secuenciación de próxima generación (NGS) se han ampliado en gran medida nuestra comprensión de las variaciones genéticas que confieren riesgos para el cáncer.
ARNs no codificantes largas (lncRNAs) son un tipo de ARN no codificante (ncRNA) que contienen más de 200 nucleótidos y que no codifican proteínas, pero tienen un papel fundamental en numerosas funciones biológicas. Informes recientes sugieren que la expresión aberrante de lncRNAs podría desempeñar un papel importante en el desarrollo y progresión de tumores [2,3,4] que probablemente están mediados a través de cambios en la cromatina, los niveles transcripcionales o post-transcripcionales que influyen en la expresión de genes objetivo [5] . Además, Glass han identificado con éxito varios polimorfismos lncRNA que están asociados con los riesgos de desarrollar diferentes tipos de cáncer. Sin embargo, similar a la otra informó GWAS, la mayoría de la lncRNA SNPs que se han identificado por GWAS se han mapeado en las regiones intergénicas o intrones que no codifican proteínas, y las posibles funciones de estos SNPs en la patogénesis del cáncer permanecen sin definir. Además, debido a los criterios de selección más estrictos de Glass, algunos lncRNAs causales putativo y variantes que están asociados con la carcinogénesis pueden haber sido ser ignorado en gran medida. Por lo tanto, los esfuerzos adicionales dirigidos hacia lncRNAs candidatos que funcionan en el desarrollo del cáncer puede ser conveniente para descubrir parte de la heredabilidad faltante. Uno de estos es la lncRNA HOX transcrito de ARN antisentido intergénica (
HOTAIR
), la función de los cuales se ha demostrado que estar estrechamente relacionada con el desarrollo y progresión de algunos cánceres [6,7,8].
Hasta la fecha, la relación entre la expresión aberrante de
HOTAIR Opiniones y pronóstico del cáncer ha sido explorado por muchos investigadores. Por otra parte, los meta-análisis han demostrado que la expresión aberrante de
HOTAIR
puede servir como un indicador que predice un mal pronóstico tanto en el cáncer en general [9] y en determinados tipos de cánceres (por ejemplo, cánceres del sistema digestivo y con estrógeno tumores dependientes malignas) [10,11,12]. Además, un meta-análisis realizado por Cai et al. puesto de manifiesto que la sobreexpresión de
HOTAIR
se asocia significativamente con la metástasis de los ganglios linfáticos en pacientes con cáncer, lo que podría afectar aún más el pronóstico del cáncer [13].
En 2015, Bayram S et al. demostrado que rs920778 SNP de
HOTAIR
se asocia significativamente con la fase avanzada TNM, metástasis a distancia y pobre grado histológico en pacientes con cáncer de mama, lo que indica que este polimorfismo puede estar asociada con el pronóstico del cáncer de mama [14]. Del mismo modo, se ha informado de que otro SNP en
HOTAIR
(rs12826786) está asociado con las características clinicopatológicas que participan en la progresión gástrico cardia adenocarcinoma [15]. Además, las relaciones de
HOTAIR
polimorfismos (incluyendo rs4759314 y rs920778) con la expresión de
HOTAIR
y diversos riesgos de cáncer se han observado [15,16,17,18]. Además, Zhang et al. informaron que rs920778 SNP en
HOTAIR
pueden alterar la actividad de un intrónica novela
HOTAIR
potenciador [17]. Por lo tanto, es biológicamente concebible que las variantes genéticas de
HOTAIR
pueden afectar a las actividades de determinados factores de regulación y regular aún más la expresión aberrante de
HOTAIR
, que podría ser uno de los mecanismos subyacentes que afectar a la susceptibilidad del tumor y el pronóstico. Como era de esperar, las relaciones
HOTAIR Red de polimorfismos con sensibilidad a los tipos de cáncer han atraído mucho interés [14,15,16,17,18,19,20,21]. Sin embargo, los resultados de los estudios que han explorado esta asociación no son concluyentes. Por ejemplo, un informe del estudio anterior que el genotipo variante rs920778 aumenta significativamente el riesgo de cáncer gástrico en los chinos [16]; Sin embargo, entre los turcos, la misma variante no mostró ninguna asociación significativa, y los valores del efecto fueron aún en la dirección opuesta con respecto a los estudios anteriores de la población china [19]. Por lo tanto, en base a todos los datos publicados actualmente, se realizó un meta-análisis para caracterizar con mayor precisión las asociaciones de
HOTAIR
polimorfismos (rs920778, rs4759314 y rs1899663) con el riesgo de cáncer.
Materiales Métodos y
identificación y la elegibilidad de los estudios pertinentes
Una búsqueda bibliográfica exhaustiva de PubMed y Embase, hasta 30 de noviembre de 2015 representaba realizó usando las siguientes palabras clave: ( "
HOTAIR
"o" HOX transcrito antisentido intergénica ARN ") y (" cáncer "," carcinoma "," tumor "," tumor ", o" neoplasia ") y (" polimorfismo "," variante "," variante ", o" mutación"). Las referencias de los artículos recuperados también fueron revisados para su posible inclusión. Sólo las publicaciones escritas en Inglés con el texto completo de artículos disponibles se incluyeron en este metanálisis. Los estudios se incluyeron si cumplían los siguientes criterios de selección: (1) los estudios de casos y controles se centraron en la relación entre los
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polimorfismos y cualquier tipo de cáncer, (2) más de dos artículos estudiados para cada
HOTAIR
polimorfismo, (3) la información disponible acerca de la frecuencia del genotipo de cada incluido
HOTAIR
SNP (es decir, rs920778, rs4759314 o rs1899663), y (4) publicado como documento completo en Inglés. Las principales razones de la exclusión de los estudios fueron los siguientes: (1) no se centra en el riesgo de cáncer, (2) no estudiar el
HOTAIR
SNP (rs920778, rs4759314 o rs1899663), (3) no informó los datos de frecuencia de genotipo relevante, (4) no publicados en Inglés, y (5) la investigación no humana. En última instancia, se incluyeron un total de 8 artículos incluidos 7.151 casos y 8.740 controles en este meta-análisis (Figura 1).
Datos de extracción
Dos investigadores (TT y LJ) de forma independiente extrajeron los datos y llegaron a un consenso con respecto a todos los artículos. La siguiente información fue solicitada a cada artículo: apellido del primer autor, año de publicación, país de origen, la etnia, el tipo de cáncer, el número de casos y controles, y la plataforma de genotipado de SNPs genotipo. Hemos clasificado los diferentes grupos étnicos como los caucásicos y los asiáticos.
El análisis estadístico
El riesgo de cáncer asociado a cada
HOTAIR
polimorfismo se calcula para cada estudio mediante el odds ratio (OR ) y su intervalo de confianza del 95% (IC del 95%). La heterogeneidad entre los estudios se examinó con un
Q
prueba estadística de chi-base cuadrada, y
P
≤ 0,05 fue considerado estadísticamente significativo. Se agruparon los resultados utilizando modelos de efectos fijos cuando la heterogeneidad entre los estudios estaba ausente. De lo contrario, se seleccionó un modelo de efectos aleatorios. Posteriormente, se evaluaron los riesgos de la heterocigotos y genotipos homocigotos variantes en relación con el genotipo homocigótico de tipo salvaje y luego evaluaron los riesgos de la heterocigoto combinado y la variante de genotipos homocigóticos con respecto al genotipo homocigótico de tipo salvaje, mientras que suponiendo que los efectos dominantes de la variante alelo. Para rs920778, también se realizaron análisis de una estratificación basada en el origen étnico (dividido en los caucásicos y los asiáticos) y los tipos de cáncer. gráficos de embudo y el test de Begg se utilizaron para evaluar el sesgo de publicación. Todos los análisis se realizaron utilizando el software Stata versión 12.0 (Stata Corporation, College Station, TX, EE.UU.).
Anotación funcional basado en bases de datos públicamente disponibles
El SNPs en alto LD (
r
2 ≥ 0,80) con los marcadores SNP rs920778 se identificaron de acuerdo con SNAP 2.2 (http://www.broadinstitute.org/mpg/snap/ldsearch.php/). loci de rasgos cuantitativos análisis de la expresión (eQTL) se realizó sobre la base de la base de datos del proyecto expresión genotipo-tisular (Gtex) (http://www.gtexportal.org/home/). Las influencias de los SNPs en los genes miARN unión se predijo con un servicio en línea (http://www.bioguo.org/miRNASNP2/). Además, otros resultados anotación funcional se derivaron de la base de datos ENCODE (http://genome.ucsc.edu/ENCODE/).
Resultados
Características de los estudios publicados
Después de la aplicación de los criterios de evaluación estrictos, 8 artículos que incluyeron un total de 7.151 casos y 8.740 controles que albergan cáncer gástrico, cáncer de mama, cáncer colorrectal y el carcinoma de células escamosas del esófago (ESCCs) fueron finalmente incluidos en el análisis cuantitativo actual. Las características generales de los estudios incluidos se enumeran en la Tabla 1, y los estudios excluidos se enumeran en la Tabla S1. Entre los estudios incluidos, se llevaron a cabo seis estudios en poblaciones asiáticos (chinos), y se llevaron a cabo dos estudios en poblaciones de raza caucásica (Turquía). Los años de publicación de los estudios incluidos fueron entre 2014 y 2015, y la gama de los tamaños de la muestra fue de 245 a 4.248. Un total de cuatro artículos informó los efectos de
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polimorfismos en el cáncer gástrico, el cáncer de mama en dos, uno en el carcinoma esofágico de células escamosas (CECA), y uno en el cáncer colorrectal. Entre los estudios que exploraron las relaciones de
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SNPs con el riesgo de cáncer, cinco se centraron en el SNP rs920778, seis en el SNP rs4759314 y tres en el SNP rs1899663. La genotipificación se realizó utilizando TaqMan en 4 estudios, PCR-RFLP en 3 estudios y SRC-1 RFLP en estudio. La distribución de los genotipos y alelos del
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polimorfismos (rs920778, rs4759314 y rs1899663) en los estudios individuales se enumeran en las Tablas S2-S4.
Las evaluaciones de calidad de los incluidos los estudios
se evaluó la calidad metodológica de cada estudio incluido mediante la escala de evaluación de la calidad de Newcastle-Ottawa (NOS). Usando este método, cada estudio fue juzgado en criterios estándar y posteriormente se clasifica en base a tres factores: la selección, la comparabilidad y la exposición. las puntuaciones globales que van desde 0 a 9 puntos se calcularon, y las puntuaciones más altas indican un menor riesgo de sesgo (S5 Tabla).
La síntesis cuantitativa
se presentan las evaluaciones de las asociaciones de rs920778 con los riesgos de cáncer en la Tabla 2. en general, la variante alelo T no mostró ninguna asociación significativa con el riesgo de cáncer en cualquiera de los modelos probados (TC frente a CC: OR = 1,11; IC del 95% = 0,86-1,44;
P = 0,014 para
la prueba de heterogeneidad,
I
2
= 67,8%; TT frente a CC: OR = 1,55; IC del 95% = 0,84-2,85;
P = 0,000
para la prueba de heterogeneidad,
I
2
= 85,8%; modelo dominante: OR = 1,20; IC del 95% = 0,92 a 1,57,
P = 0,005
para la prueba de heterogeneidad,
I
2
= 73,2%; figura 2)
Seguidamente, evaluó el efecto de la rs920778. polimorfismo en el riesgo de cáncer entre los subgrupos (Tabla 2). En un análisis estratificado, se observó un aumento significativo del riesgo de cáncer entre los asiáticos (chinos; modelo dominante: OR = 1,46; IC del 95% = 1,32-1,61;
P = 0,953
para la prueba de heterogeneidad,
I
2
= 0.0%). Por el contrario, una disminución significativa se observó el riesgo de cáncer entre los caucásicos (turco; modelo dominante: OR = 0,65; IC del 95% = 0,42-1,00;
P = 0,080
para la prueba de heterogeneidad,
2
= 67,4%). Además, debido a que la mayoría (60%, 3/5) de los estudios incluidos en el meta-análisis que implica cánceres digestivos (cáncer gástrico y CECA), que luego llevaron a cabo un análisis por separado de los cánceres digestivos. Curiosamente, la variante rs920778 mostró una asociación significativa con un mayor riesgo de cánceres digestivos (modelo dominante: OR = 1,44; IC del 95% = 1,31-1,59;
P = 0,339
para la prueba de heterogeneidad,
I
2
= 7,6%;. Tabla 2)
las evaluaciones de las asociaciones entre los otros 2 SNPs (rs4759314 y rs1899663) y el riesgo de cáncer se presentan en las figuras 3 y 4. en general, la variante rs4759314 alelo G de no mostró asociación significativa con el riesgo de cáncer (modelo dominante: OR = 1,05; IC del 95% = 0,86 a 1,27,
P = 0,024
para la prueba de heterogeneidad,
I
2
= 61,5%). La variante del alelo T rs1899663 también mostraron una asociación significativa con el riesgo de cáncer (modelo dominante: OR = 0,77; IC del 95% = 0,51 a 1,15,
P
= 0,000 para la prueba de heterogeneidad,
2
= 89,3%).
Prueba de heterogeneidad
Para rs920778, se observó una heterogeneidad significativa después de que los datos se agruparon ( modelo dominante:
P
para la heterogeneidad = 0,005,
I
2
= 73,2%). (Tabla 2) Cuando los sujetos fueron estratificados basados en el origen étnico, la heterogeneidad, obviamente, desapareció en los asiáticos (modelo dominante:
P
para la heterogeneidad = 0,953,
I
2
= 0,0%); Sin embargo, la heterogeneidad todavía estaba presente entre los caucásicos (modelo dominante:
P
para la heterogeneidad = 0,080,
I
2
= 67,4%), lo que podría tener sido debido a la heterogeneidad genética entre los diferentes grupos étnicos incluidos. Además, en el análisis estratificados sobre la base de los tipos de cáncer, la heterogeneidad se redujo de manera significativa para los cánceres digestivos (modelo dominante:
P
para la heterogeneidad = 0,339,
I
2
= 7,6%).
el análisis de sensibilidad
Para probar la estabilidad de los resultados rs920778, se realizó un análisis de sensibilidad mediante la eliminación secuencial de cada estudio elegible (S6 Tabla). El estudio realizado por Bayram et al. que se centró en el cáncer de mama fue el principal contribuyente de la heterogeneidad en el modelo dominante (
I
2
= 73,2%,
P
para la heterogeneidad = 0,005). Después de la eliminación de este estudio, la heterogeneidad se redujo significativamente (
I
2
= 0,0%,
P
para la heterogeneidad = 0,536). Como se esperaba, se observaron resultados similares en los otros modelos genéticos (es decir, CT frente a CC y TT frente a CC) e indicaron que el estudio de Bayram et al. que se centró en el cáncer de mama marcadamente cambió el OR agrupados.
El sesgo de publicación
Se utilizó gráficos de embudo y el test de Begg para evaluar los posibles sesgos de publicación de la literatura estudiada. Como se ilustra en las figuras S1-S3, las formas de los gráficos en embudo eran simétricos, y la prueba de un Begg proporcionan más evidencia estadística de la ausencia de sesgo de publicación (
P = 0,14 para
rs920778,
P
= 0,85 para rs4759314, y
P
= 0,60 para rs1899663).
Discusión
Recientemente, un número creciente de estudios han investigado las asociaciones de diferente
HOTAIR
niveles de expresión con la supervivencia del cáncer, pero pocos estudios se han centrado la atención específica en las relaciones de
hOTAIR
polimorfismos con la susceptibilidad al cáncer y la supervivencia. Sin embargo, las relaciones de
HOTAIR
polimorfismos con sensibilidades de cáncer han atraído mucho interés; Sin embargo, los resultados son controvertidos. En el presente estudio, se realizó un metanálisis mediante la agrupación de 8 estudios con totales de 7.151 casos y 8.740 controles y demostró que el alelo T del rs920778 se asoció con un aumento significativo del riesgo de cánceres digestivos. Sin embargo, los alelos rs4759314 y rs1899663 variantes mostraron ninguna asociación significativa con el riesgo de cáncer
.
El SNP rs920778 en 12q13.13 se encuentra en el intrón 2 de
HOTAIR
. Sobre la base de los conjuntos de datos y herramientas públicas (ver Métodos; S7 Tabla), se llevaron a cabo otros anotaciones funcionales de los rs920778 marcador SNP y los SNPs que son fuertes en LD con rs920778 (
r
2 & gt; 0,8). Entre los 11 SNPs que se han encontrado para ser fuerte en LD con rs920778, efectos significativos específicos de genotipo de 5 SNPs (es decir, rs10783618, rs11170775, rs4759059, rs4237809 y rs2366150) sobre la expresión del ARNm de
HOTAIR
se observaron (eQTL análisis). Posteriormente, se exploraron los posibles mecanismos por los que estos SNP modulan la expresión de
HOTAIR
. De acuerdo con los datos de chip-Seq de la base de datos ENCODE (http://genome.ucsc.edu/ENCODE/), un total de 10 SNPs se encontraban en los motivos que pueden afectar a las actividades de unión de numerosos factores de transcripción, incluyendo EZH2, CtBP2 , CHD1, ZNF143, SUZ12, TCF7L2, CTCF, RAD21, y YY1. Los factores de transcripción mencionados anteriormente pueden ser conectados íntimamente con la aparición y la progresión de muchos tipos de tumores en humanos. Por ejemplo, potenciador de zeste homólogo 2 (EZH2) se sobreexpresa en varios tumores humanos y es responsable de la agresividad y pronósticos desfavorables de diversos tumores [22,23]. Además, el supresor de la proteína zeste-12 (SUZ12) es de gran importancia en la génesis tumoral de varios cánceres humanos [24,25] y está implicado en la progresión del cáncer de pulmón de células no pequeñas a través de su papel en la promoción de la proliferación celular y la metástasis [26]. Además, según lo predicho por un sitio web de análisis de unión miRNA-(http://www.bioguo.org/miRNASNP2/), el rs7958904 SNP puede afectar a la actividad de unión de hsa-miR-615. Este miRNA es un supresor de tumor recién identificado que pueden regular la proliferación, migración, invasión, y la apoptosis de diversos tipos de células de cáncer [27,28]. Por lo tanto, estas anotaciones funcionales sugieren que los SNPs mencionados anteriormente (incluyendo las rs920778 SNP marcadores y los SNPs etiquetado) podrían influir por separado o conjuntamente las actividades aberrantes de ciertos factores de transcripción o miRNAs y afectar aún más la aparición y la progresión de ciertos tumores a través de diferentes mecanismos . Sin embargo, la evidencia experimental validar esta hipótesis es limitada, y se necesitan futuros estudios funcionales para aclarar los posibles mecanismos.
En este meta-análisis, que no identificó una relación significativa del SNP rs920778 con el riesgo de cáncer. Sin embargo, de acuerdo con los análisis estratificados por el origen étnico de la población, el SNP rs920778 se asoció significativamente con un mayor riesgo de cáncer en los asiáticos (chinos). En contraste, se encontró que el polimorfismo rs920778 exhibió la asociación opuesta con el riesgo de cáncer en los caucásicos (turco). Las posibles razones de los diferentes resultados entre los asiáticos y los blancos son los siguientes. En primer lugar, la diferencia puede ser el resultado de diferencias en las bases genéticas de las poblaciones estudiadas. Por ejemplo, en base a los datos de HapMap (Proyecto Internacional HapMap), las frecuencias de los alelos del SNP rs920778 son diferentes entre las poblaciones asiáticas y caucásicas. En segundo lugar, la diferencia puede deberse a la utilización de diferentes métodos de genotipado, que incluía la PCR-RFLP, CRS-RFLP, TaqMan PCR en tiempo real, etc. En tercer lugar, en comparación con las poblaciones de Asia, los tamaños de muestra de las poblaciones caucásicas no podrían haber sido lo suficientemente grande como para llegar a una conclusión convincente respecto a la asociación del SNP rs920778 con el riesgo de cáncer. Además, los diferentes tipos de cánceres que intervienen y los errores aleatorios también pueden ser posibles razones de las diferencias en los resultados entre los asiáticos y los caucásicos.
En 2014, Deng et al. llevó a cabo un meta-análisis que reveló que
HOTAIR
abundancia podría servir como un factor predictivo novedoso para pobres prognosis del cáncer [9]. Los resultados de este estudio y los resultados de ambos demostraron relaciones significativas entre los
HOTAIR
y el cáncer. Los resultados de nuestro estudio evidencia la condición de que
HOTAIR
polimorfismos podrían modificar la susceptibilidad al cáncer. Por desgracia, en su meta-análisis del valor pronóstico de
HOTAIR
en el cáncer, Deng et al. no explorar las asociaciones de
HOTAIR
polimorfismos con pronóstico de cáncer, y la investigación relevante sobre
HOTAIR
polimorfismos y prognosis del cáncer es limitado. Sin embargo, sobre la base de ambos hallazgos y resultados de anotación funcional, se especula que
HOTAIR
polimorfismos podría regular la expresión de
HOTAIR
y afectar aún más el desarrollo y progresión del cáncer a través de ciertos mecanismos subrayado, que puede abrir nuevas vías para la prevención y tratamiento del cáncer.
la fuerza de este meta-análisis es que nos sistémicamente revisan las relaciones entre los
hOTAIR
polimorfismos y la susceptibilidad del tumor, por primera vez, y hemos identificado diferentes asociaciones de SNP rs920778 con el riesgo de cáncer en diferentes poblaciones étnicas. Además, las anotaciones funcionales bien diseñados que comprobar con más detalle nuestros hallazgos son otro punto fuerte de este estudio. Sin embargo, también hay algunas limitaciones que deben abordarse. En primer lugar, se observó una heterogeneidad significativa entre los estudios. Entre los 8 estudios publicados incluidos en nuestra meta-análisis, algunos de los estudios fueron de poblaciones, mientras que otros eran basado en el hospital. En segundo lugar, los revisores no buscaron bases de datos chinas, lo que resultará en un sesgo de publicación. En tercer lugar, en algunos de los estudios, no se proporcionó información detallada (por ejemplo, edad, sexo, tabaquismo y consumo de alcohol), lo que limita aún más la estratificación del análisis. Además, si hubiéramos sido capaces de adquirir información más detallada, habríamos conseguido estimaciones más precisas mediante el ajuste por otras variables posibles. Por último, para este estudio, se tomaron muestras de 8 informes. La mayoría de los sujetos eran asiáticos, y el número de sujetos de raza blanca incluidos en este estudio fue relativamente pequeño. Por lo tanto, se necesitan estudios con muestras grandes bien realizados para explorar aún más los riesgos de cáncer asociados con
HOTAIR
SNPs, especialmente en los caucásicos.
Conclusiones
Este metanálisis proporcionan evidencia de que
HOTAIR
rs920778 puede modificar la susceptibilidad a ciertos tipos de cáncer. Se necesitan más estudios que incorporan los sujetos con diferentes orígenes étnicos combinados con la re-secuenciación de la región marcada y evaluaciones funcionales.
Apoyo a la Información
S1 Fig. gráfico de embudo para el sesgo de publicación de la
(se utilizó el gráfico en embudo con seudo límites de confianza del 95%) HOTAIR
polimorfismo rs920778 y el riesgo de cáncer bajo modelo dominante
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s001
(TIF)
S2 Fig. gráfico de embudo para el sesgo de publicación de la
(se utilizó el gráfico en embudo con seudo límites de confianza del 95%) HOTAIR
polimorfismo rs4759314 y el riesgo de cáncer bajo modelo dominante
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s002
(TIF)
S3 Fig. gráfico de embudo para el sesgo de publicación de la
(se utilizó el gráfico en embudo con seudo límites de confianza del 95%) HOTAIR
polimorfismo rs1899663 y el riesgo de cáncer bajo modelo dominante
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s003
(TIF)
Tabla S1. Lista de los artículos excluidos y las razones de su exclusión
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s004 gratis (DOCX)
S2 tabla. Las distribuciones de los genotipos y alelos del
HOTAIR
polimorfismo rs920778
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s005 gratis (DOCX)
S3 Tabla. Las distribuciones de los genotipos y alelos del
HOTAIR
polimorfismo rs4759314
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s006 gratis (DOCX)
S4 Tabla. Las distribuciones de los genotipos y alelos del
HOTAIR
polimorfismo rs1899663
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s007 gratis (DOCX)
S5 tabla. baremo de calificación de Newcastle-Ottawa para cada estudio incluido
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s008 gratis (DOCX)
S6 tabla. El análisis de sensibilidad de rs920778 en el modelo dominante
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s009 gratis (DOCX)
S7 Tabla. anotación funcional de los SNP rs920778 marcador y el SNP en desequilibrio fuerte vinculación con el marcador SNP
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s010 gratis (DOCX)