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PLOS ONE: Evaluación de un protocolo de predicción para identificar blancos potenciales de la epigenética reprogramación por el virus de Epstein Barr cáncer asociado


Extracto

Antecedentes

virus de Epstein Barr (VEB) infecta a la mayoría de la población humana, que causa enfermedades mortales en una pequeña proporción, en relación con los factores ambientales. Después de la infección primaria, EBV permanece latente en la población de células B de memoria para la vida. reactivación recurrentes del virus se produce, probablemente debido a la activación de la memoria de los linfocitos B, dando como resultado la replicación viral y la re-infección de los linfocitos B. La metilación del ADN viral en motivos CpG conduce al silenciamiento de la expresión génica viral durante la latencia. Ztd, la proteína viral clave que media el equilibrio latencia /reactivación, interactúa con el ADN metilado. Ztd es un factor de transcripción de ambos genes virales y del huésped. Un sub-conjunto de su ADN sitios de unión (ZREs) contiene un motivo CpG, que se reconoce en su forma metilada. El análisis detallado del promotor del gen viral
BRLF1
reveló que la interacción con un CpG metilado ZRE (RpZRE3) es clave para volcar el silenciamiento epigenético del gen.

Metodología y Principales conclusiones

a continuación nos preguntamos si podemos utilizar esta información para identificar qué genes huésped contienen promotores con elementos de respuesta similares. Una búsqueda computacional de los promotores de genes humanos identificó 274 objetivos que contienen el elemento central RpZRE3 7-nucleótido. análisis de unión a ADN de Ztd con 17 de estos objetivos revelado que el contexto de flanqueo del elemento de núcleo no tiene un profundo efecto en la capacidad de Ztd para interactuar con los sitios metilados. Un segundo ZRE yuxtapuestos se observó durante un promotor. Ztd fue capaz de interactuar con este sitio, aunque no se observó co-ocupación con el elemento central RpZRE3.

Conclusiones /Importancia

Esta investigación demuestra 274 promotores humanos tienen el potencial de ser regulada por Ztd para anular el silenciamiento epigenético de la expresión génica durante la reactivación de la latencia viral

Visto:. Flor K, E Hellen, Newport MJ, Jones S, Sinclair AJ (2010) Evaluación de un protocolo de predicción para identificar blancos potenciales de la epigenética la reprogramación por el virus de Epstein Barr cáncer asociado. PLoS ONE 5 (2): e9443. doi: 10.1371 /journal.pone.0009443

Editor: G. Maria Masucci, Karolinska Institutet, Suecia

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