Extracto
Aunque el cáncer de ovario es el más mortal de los cánceres ginecológicos, amplia variación en el resultado después de la terapia convencional sigue existiendo. La presencia de células T reguladoras tumor infiltrante (Treg) tiene un papel en el pronóstico de esta enfermedad, y un cuerpo creciente de datos es compatible con la existencia de factores pronósticos heredados. Sin embargo, el papel de las variantes heredadas en los genes que codifican moléculas inmunes relacionadas con Treg no se ha explorado completamente. Se analizó la expresión de los loci de rasgos cuantitativos (eQTL) y los polimorfismos de un solo nucleótido marcado basados en la secuencia (tagSNPs) de 54 genes asociados a células T reguladoras en 3.662 casos de cáncer de ovario invasivos. Con el ajuste de los factores pronósticos conocidos, se observaron resultados sugestivos entre los subtipos histológicos más raras; una peor supervivencia se asoció con menor alelos de SNPs en RGS1 (células claras, rs10921202, p = 2,7 × 10
-5), LRRC32 y TNFRSF18 /TNFRSF4 (mucinoso, rs3781699, p = 4,5 × 10
-4, y rs3753348, p = 9,0 × 10
-4, respectivamente), y CD80 (endometrioide, rs13071247, p = 8,0 × 10
-4). Fo0r este último, los datos correlativos apoyan una asociación rs13071247 genotipo CD80 con CD80 expresión del ARN del tumor (p = 0,006). Un SNP eQTL adicional en CD80 se asoció con una menor supervivencia (rs7804190, p = 8,1 × 10
-4) entre todos los casos combinados. A medida que se conocen los productos de estos genes para afectar a la inducción, el tráfico, o la función inmunosupresora de células T reguladoras, estos resultados sugieren la necesidad de realizar estudios fenotípicos de seguimiento
Visto:. Goode EL, Derycke M, Kalli KR, Oberg aL, Cunningham JM, Maurer MJ, et al. (2013) heredadas variantes en genes de las células T reguladoras y resultados del cáncer de ovario. PLoS ONE 8 (1): e53903. doi: 10.1371 /journal.pone.0053903
Editor: Michael Scheurer, Baylor College of Medicine, Estados Unidos de América
Recibido: 6 Julio, 2012; Aceptado: 4 de diciembre de 2012; Publicado: 30 Enero 2013
Derechos de Autor © 2013 Goode et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. La científica el desarrollo y la financiación de este proyecto se apoya en parte por la Clínica Mayo cáncer ovárico de esporas (P50-CA136393) a ELG, LCH, y KLK, el Instituto Nacional del cáncer GAME-ON Iniciativa post-GWAS (U19-CA148112), Instituto Nacional del cáncer subvenciones para proyectos de investigación (R01-CA086888, CA122443-R01, R01-CA106414, R01-CA76016, R01-CA114343), la Investigación del cáncer del Reino Unido (A10119, A10124, A8339, A6187, A11306, A7058), el Consejo de Investigación médica (G0801875- 89310), el Fondo de Investigación del cáncer de Ovario, la Fundación Mayo, la Alianza cáncer de ovario Minnesota, la Mayo Foundation, la Fundación Instituto de cáncer Roswell Park Alliance, y el Fred C. y B. Fundación Katherine Andersen. Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer de ovario es la quinta causa principal de muerte por cáncer entre las mujeres en los Estados Unidos [1]. la supervivencia global a los cinco años es de aproximadamente 45%, y, aún con las estrategias quirúrgicas y quimioterápicos modernos, la mayoría de los casos con recaída de la enfermedad avanzada y sucumbir a la enfermedad [2], [3]. BRCA1 o BRCA2 mutaciones en la línea germinal raras confieren una mejor supervivencia [4]. variantes hereditarias comunes podrían también influir en el resultado; Los estudios de asociación de genoma completo (GWAS) están en marcha, pero todavía tienen que encontrar loci asociados a la supervivencia [5]. La consideración de nuevas vías biológicas a partir de un análisis en profundidad de la variación en los genes candidatos es una promesa para la identificación de factores genéticos pronósticos.
Varios estudios demuestran la importancia del sistema inmune en los resultados del cáncer de ovario. Por ejemplo, en un informe, los casos con evidencia de infiltración de tumor de células CD3 T (aproximadamente la mitad de los casos estudiados) mostraron una mejor libre de progresión y la supervivencia general [6]. Estudios posteriores han refinado nuestra comprensión de las células T infiltrantes de tumor, incluyendo uno que muestra que los linfocitos CD8
+ T son la principal subpoblación de células T asociados con una mejor supervivencia [7]. Junto con el hallazgo de que las respuestas de tumor antígeno-específicas de células T se pueden detectar en los casos, estos resultados sugieren que la inmunidad anti-tumor se provoca contra los cánceres ováricos y los impactos el curso clínico de la enfermedad [8]. A pesar de esta generación de una respuesta inmune, sin embargo, la inmunidad anti-tumor es contrarrestada por un microambiente de supresión inmune [9]. De los mecanismos inmunosupresores, CD4
+ células T reguladoras (Tregs) son un medio principal de la evasión inmune en cáncer de ovario; estos son CD4 + células de estirpe T
cuya función principal es la regulación inmune [10]. En colaboración con otros, nos sugirió por primera vez un papel de tumores infiltrantes de células T reguladoras en la patogénesis del cáncer de ovario, reportando mayores niveles de CD4
+ células T reguladoras, medidas con inmunofluorescencia, entre los casos con peor supervivencia [11]. El trabajo posterior apoya la importancia de CD4
+ células T reguladoras en la patogénesis del cáncer de ovario y el resultado [7], [12]. Por ejemplo, la presencia de CD4
+ Tregs parece influir en la actividad anti-tumor de infiltrantes de tumor citotóxicos CD8
+ células T [7]. CD4
+ células T reguladoras bloque ambos efectores inmunes adaptativas e innatas de mecanismos de contacto celular, así como de los mediadores solubles [13], [14]. mediadores solubles de supresión comúnmente asociados con CD4
+ Tregs incluyen IL-10 y TGF-β, ambos de los cuales la proliferación de células T de bloques y mediada por células inmunidad [15], [16], [17]. Otras moléculas de la superficie celular implicados en la supresión de la respuesta inmune incluyen B7-H1 (CD274), GITR (TNFRSF18), LAG-3, CTLA-4, y unido a la superficie TGF-β [18], [19], [20].
Debido a la importancia de CD4
+ células t reguladoras y un papel para los factores heredados en los resultados, se evaluó si la variación hereditaria común relacionado con CD4
+ relacionadas con los genes de Treg se asoció con el resultado del cáncer ovárico después de terapia estándar de atención. En concreto, se evaluó 54 genes clave para la inducción, el tráfico, o inmunosupresores funciones de las células CD4
+ células T reguladoras. Utilizando datos de un novedoso estudio de genes candidatos se combina con los datos existentes, se estudiaron polimorfismos que se ha demostrado que afecta a la expresión de o para etiquetar las variaciones heredadas en estos genes. Variantes asociadas con el resultado de múltiples poblaciones de estudio podría arrojar luz sobre los mecanismos inmunosupresores en el cáncer de ovario.
Materiales y Métodos
Ética Declaración
Los protocolos fueron aprobados por las juntas de revisión institucionales apropiadas (Clínica Mayo Institutional Review Board, Roswell Park Cancer Institute Juntas de Revisión Institucional, Universidad Juntas de Revisión Institucional de Duke, Instituto del cáncer institucionales Juntas nacionales de revisión, Moffitt Cancer Center Juntas de Revisión Institucional) o el panel de ética (Royal Marsden hospital panel de ética de la Universidad de ética Cambridge panel de , University College de Londres panel de ética). Todos los participantes dieron su consentimiento informado por escrito.
Candidato Gene SNP matriz
Cincuenta y cuatro genes que revisten especial importancia para la biología de las células T reguladoras (ACVR2B, AGTR1, CCL11, CCL17, CCL19, CCL2, CCL20, CCL22, CCL3, CCl4, CCL5, CCR4, CCR6, CCR7, CCR8, CD274, CD46, CD80, CD86, CXCL10, CXCL13, CXCR5, DUSP4, EGR2, GPR83, IDO1, IKZF2, IKZF4, IL10RB, IL15RA, IL2RB, IL6ST, IL9, INHBA, INHBB, IRF4, ITGAE, KLF10, LAG3, LRRC32, MDFIC, NRP1, PDCD1, PLAG1, PRNP, RGS1, Rgs16, SH3BGRL2, SLC22A2, SMAD3, Socs2, TNFRSF18, TNFRSF4, y TNFRSF9) fueron elegidos para el estudio ( Tabla S1). La relevancia de estos genes se establece a partir de una búsqueda de base de datos PubMed [21], que reveló que la información publicada sea directamente o mostró sugiere un papel para los productos de los genes respectivos en la inducción, la función de supresión inmune, o el tráfico de células T reguladoras. Ochenta y cinco SNPs asociados (P & lt; 10
-6) con la expresión de ARNm de linfocitos de uno o más genes candidatos (eQTL SNPs) fueron incluidos [22]. Además, dentro de los cinco kb de cada gen, marcado SNPs otros SNPs alelo con menor frecuencia (MAF) ≥0.05 en r
2≥0.9 fueron identificados a partir de los 60 participantes Europea-americanos en el piloto de baja cobertura del Proyecto 1000 Genomas (para 53 genes) [23] o la SeattleSNPs Variación Detección de recursos (por CCL2) [24], lo que era más informativo. tagSNPs seleccionados (N = 1.451) fueron optimizados para incluir SNPs con el diseño apropiado de calificaciones de un BeadArray ensayo Illumina Goldengate, predicho funcionalidad, y para incluir más de un tagSNP para grandes grupos de SNPs correlacionados [25]. SNP información adicional se encuentra en la Tabla S2.
candidatos participantes en el estudio génica y de genotipificación
Los casos con genotipo de la costumbre de Treg SNP gama incluidas las mujeres con patológicamente confirmado-ovárico epitelial invasivo primario, peritoneal o las trompas de Falopio cáncer inscrito en la Clínica y el Roswell Park Cancer Institute Mayo (RPCI). casos de la Clínica Mayo (N = 905) fueron comprobados entre diciembre de 1999 y noviembre de 2010 en el estudio de Mayo Clinic cáncer ovárico de casos y controles (MAYO) o El caso de sólo Clínica Mayo Estudio cáncer de ovario (MAC) e incluyeron mujeres de 20 años o por encima inscrito a través de las divisiones de la cirugía ginecológica y Oncología médica de la Clínica Mayo. Sesenta y ocho por ciento de estos casos fueron incluidos dentro de una semana del diagnóstico (mediana de tiempo desde el diagnóstico hasta el reclutamiento es de cero días). casos RPCI (N = 167) eran residentes de Pennsylvania occidental, el este de Ohio, o el oeste de Nueva York, con edades de 25 años o arriba y comprobado, entre enero de 2004 y mayo de 2009 dentro de los seis meses siguientes al diagnóstico a través de las divisiones de Cirugía Ginecológica y Oncología del Instituto del Cáncer Roswell Park . Estos casos fueron inscritos con una mediana de tiempo desde el diagnóstico hasta la contratación de 80 días. En ambos sitios, se extrajo ADN de 10 a 15 ml de sangre periférica fresca (usando Gentra Autopure LS Purgene precipitación salina metodología en la Clínica Mayo y FlexiGene ADN Kit metodología en RPCI), almacenados a -80 ° C, y con código de barras para asegurar la precisión tratamiento. Un total de 1.072 participantes se genotipo utilizando una costumbre Illumina Goldengate BeadArray ensayo junto con 24 duplicados y 24 repeticiones HapMap CEU (8 tríos). La concordancia entre los duplicados estudio fue 99,998%, no hay SNPs tenían duplicados sin resolver o mendelianos errores, y la tasa de genotipo llamada media fue de 99,88%. Las muestras con genotipo fracaso (N = 22) o la tasa de & lt llamar; 97% (N = 11) fueron excluidos, así como muestras resultaron ser plateado de forma incorrecta (N = 1) o de casos considerados inelegibles debido a una enfermedad no epiteliales (N = 5), el comportamiento del tumor borderline (N = 34), o la inscripción más de un año antes del diagnóstico (N = 5). Se excluyeron 0,0001 y pobres clustering (N = 15); SNPs con insuficiencia genotipado (N = 162), la tasa de & lt llamada; 95% (N = 19), o HWE & lt. Por lo tanto, los análisis se basaron en 994 casos y 1.340 SNPs.
Estudio Asociación
También se analizaron los datos del Seguimiento de asociación genética del cáncer ovárico y estudios de interacción colaboración de genoma completo (focos) que es parte de la iniciativa del Instituto Nacional del cáncer JUEGO EN-post-GWAS y que se describe en otro lugar [26], [27]. En resumen, los participantes fueron 2.167 casos percepción subjetiva de los blancos invasores del cáncer ovárico inscritos en el Carolina del Norte cáncer de ovario Estudio (NCO), el estudio del NCI de ovario de casos y controles en Polonia (POL), el Royal Marsden Estudio del Cáncer (RMH), el Reino Unido estudios de Epidemiología y Factores de riesgo en la herencia Estudio de cáncer de ovario cáncer (SEA), el Estudio de cáncer de Ovario de Tampa Bay (TBO), y el familiar Registro de cáncer de Ovario Reino Unido y el Reino Unido del cáncer ovárico Población de estudio (UKR + UKO). La genotipificación de Illumina utiliza 317 K o 610 Quad-Infinium matrices con imputación a HapMap v 26 usando los valores de dosificación obtenidas a partir del paquete de software MACH [28]. Los datos sobre los 820 SNPs se encuentran disponibles en todos los casos.
Análisis estadístico
Se utilizó regresión de riesgos proporcionales de Cox que representa el truncamiento izquierda para estimar los cocientes de riesgos (CR) y los intervalos de confianza del 95% (IC) para asociación con la supervivencia global. El tiempo de supervivencia se define como el tiempo desde el diagnóstico de cáncer de ovario hasta la muerte por cualquier causa o el último seguimiento. Para cada SNP, se estimaron horas con IC del 95% por alelo (es decir, 0, 1, o 2 copias del alelo menor), análogos a la prueba Armitage para la tendencia para los puntos finales binarios. Log-aditivos Cox modelos de regresión de riesgos proporcionales fueron ajustados por sitio de estudio (MAY + MAC, RPCI, POL, NCO, RMH, MAR, TBO, UKO + UKR), la edad al momento del diagnóstico (& lt; 50 años, 50-69 años, & gt ; 70 años), el estadio del tumor (I o II, III o IV, desconocido), el grado del tumor (baja, alta, desconocido), y la raza (blanco, no blanco, desconocido), modelando genotipo llamadas directas de MAYO + MAC y RPCI y los valores de dosificación de los alelos imputados en su caso para los participantes focos. La heterogeneidad de horas a través de sitio de estudio se examinó formalmente mediante estudio por SNP términos de interacción y la realización de pruebas de coeficiente de riesgo; Se llevó a cabo ninguna corrección de múltiples ensayos.
Expresión tumoral Quantitative Trait Locus (eQTL) Análisis
En 54 casos con genotipo de la Clínica Mayo (33 serosa, nueve de células claras, ocho endometrioide, cuatro mucinoso), también se realizaron análisis de expresión. RNA Tumor fue aislado de las muestras congeladas frescas, utilizando el protocolo Qiagen RNEasy y se cuantificó usando un espectrofotómetro Nanodrop (Agilent Technologies, Santa Clara, CA). El ARN total (750 ng) de alta calidad (RNA integrado número & gt; 8,0) se marcó con cianina 5-CTP o cianina 3-CTP, usando el bajo de ARN de entrada fluorescente lineal Amplificación Kit (Agilent Technologies), se purificó en RNeasy Mini columnas ( Qiagen), y se hibridó a todo Agilent genoma humano 4 × 44 K arrays de expresión (usando una referencia mixta que contiene 106 muestras de tumor). Las láminas fueron escaneados utilizando el escáner de Agilent 2565BA, y los datos se normalizaron utilizando el modelo de error de Agilent y exportadas por el software de extracción de características de Agilent (versión 7.5.1). Los datos de la forma de los ratios de registro de señales de tumores individuales a las señales de la mezcla de referencia se utilizaron para el análisis. Para los genes con los SNP que se asociaron con la supervivencia en p & lt; 0,001, asociación entre el genotipo y sondas de expresión se evaluó mediante pruebas de suma de rangos de Wilcoxon
Resultados
Los cerca de 1.000 casos de cáncer de ovario invasivos genotipo. en una matriz de SNP de encargo Treg y aproximadamente 2.600 casos en la colaboración FOCI demostrado las distribuciones esperadas de la mortalidad, la edad, y las características clínicas (Tabla 1). No se observaron 1.529 muertes durante una mediana de seguimiento de 5,4 años. En los análisis combinados de todos los casos y grupos de casos definidos por la histología, ocho SNPs produjeron p & lt; 0,001 incluyendo seis independiente en r
2 & lt; 0,95 (Tabla 2). Los resultados fueron similares cuando se está restringido a 2.518 casos con datos completos sobre el estadio, grado e histología. En cada SNP, menor alelos se asociaron con la supervivencia del cáncer de ovario más pobre. La asociación estadísticamente más significativa fue entre la supervivencia después del cáncer de células claras de ovario (N = 217) y el menor alelos en un SNP intrónica común en el regulador de la señalización 1 (RGS1) a la proteína G, lo que sugiere un casi tres veces más riesgo de muerte ( p = 2,7 × 10
-5).
Entre 272 cánceres de ovario mucinoso, menor alelos en cuatro SNPs en repeticiones ricas en leucina que contienen 32 (LRRC32) se asociaron con la mayor de dos -fold peor supervivencia. Tres de estos SNPs (rs3781699, rs3197153, rs3781701) se correlacionaron (r
2≥0.97), por lo que sólo una de ellas se presenta en la Tabla 2 (rs3781669 p = 4,5 × 10
-4). Un cuarto SNP, rs7944357 SNP LRRC32, se correlacionó sólo modestamente con este racimo de tres SNP (r
2≤0.26), pero también se asoció con la supervivencia de los casos de cáncer de ovario mucinoso (p = 8,3 × 10
- 4). Otra rs3753348 SNP mostraron asociación con un riesgo más de tres veces con la supervivencia en cáncer de ovario mucinoso (tabla 2); este SNP reside en la región 5 kb entre los miembros de la superfamilia de receptores del factor de necrosis tumoral 4 y 18 (TNFRSF4 y TNFRSF18) en el cromosoma 1.
Entre 570 endometrioid casos de cáncer de ovario, menor alelos en una intrónicas rs13071247 CD80 tagSNP se asociaron con un aumento del riesgo del 73% de la mortalidad (p = 8,0 × 10
-4, Tabla 2). Además, el análisis de todos los casos independientemente de la histología sugirió que un SNP eQTL para CD80 (rs7804190) se asoció con 14% más corto el tiempo de supervivencia (p = 8,0 × 10
-4). El eQTL rs7804190, que reside intrónica a la detención mitótica MAD1 deficiente como 1 (levadura) (mad1l1), es de interés porque genotipo se ha encontrado que se correlaciona con la expresión de CD80 (p = 6,0 × 10
-7), como así como de la polimerasa (dirigida por ADN), beta (POLB), fosfatasa prolina-serina-treonina proteína de interacción 2 (PSTPIP2), y KIAA1128 (p & lt; 10
-6) en líneas celulares linfoblastoides [22]. Es de destacar que no hay SNPs se asociaron con la supervivencia después de cáncer de ovario seroso (p & lt; 0,001), el subtipo histológico más común y más letal. Las pruebas de interacción no revelaron heterogeneidad específica del sitio de asociación para cualquiera de los SNPs en la Tabla 2 (p & gt; 0,05 para cada uno).
Para explorar los mecanismos potenciales de los SNPs observados asociados con la supervivencia del cáncer de ovario, examinamos tumoral los datos de expresión de ARN en 54 casos de la Clínica Mayo y se correlacionó con la expresión del genotipo en los SNPs supervivencia asociada a más sugerentes descritos anteriormente. En CD80 rs13071247, se observó como una asociación que los heterocigotos y homocigotos para el alelo de menor importancia (AC y genotipos CC) ligeramente habían aumentado la expresión tumoral (mediana del cambio veces = 1,04 en la escala de crudo, 0,06 en el registro
2 escala) de los que tienen genotipo AA (p = 0,006; Figura 1). No se observaron otras asociaciones entre el genotipo y el ARN del tumor expresión en p. & lt; 0,05
Entre N = 54 DE MAYO + MAC casos de cáncer de ovario invasivos, toda Agilent genoma humano 4 × 44 K expresión sonda de matriz A_24_P155632; registro CD80
2 ratios de tumor en comparación con la expresión del ARN de referencia (eje y) frente genotipo (eje x); guiones indican la mediana; cada símbolo representa un paciente único; puntos de datos se jitter así son visibles todos los datos.
Discusión
Estudios anteriores apoyan un papel importante para las células T reguladoras en el cáncer de ovario que parecen fomentar un microambiente inmunosupresor. Aquí, se analizaron la supervivencia del cáncer de ovario en relación con genotipos Treg heredados usando una combinación de genotipado y la integración de los genotipos existentes de un GWAS colaborar personalizado. Si bien no hay SNPs dieron resultados sugestivos entre los casos más comunes serosas, peor supervivencia se asoció con menor alelos de SNPs en RGS1 (células claras), y LRRC32 TNFRSF18 /TNFRSF4 (mucinoso), y CD80 (endometrioide). En este último caso, los datos adicionales apoyan una asociación genotipo CD80 con la expresión de CD80 RNA tumor. El análisis combinado de múltiples conjuntos de datos independientes proporciona una mayor potencia estadística de descubrimiento y análisis por separado de replicación [29]; por lo tanto, hemos utilizado este diseño del estudio y examinamos la posibilidad de la heterogeneidad de los resultados entre los estudios. Como se observó heterogeneidad estadísticamente significativa entre los estudios, nuestra inferencia se basa en este enfoque combinado, más potente. Vale la pena señalar que hemos examinado un número relativamente grande de SNPs en 54 genes asociados a Treg ya través de diferentes subtipos histológicos, y por lo tanto reconocer que pueden existir múltiples problemas de pruebas; algunos de nuestros resultados destacados de hecho podría ser asociaciones positivas falsas. El hecho de que los genes examinados fueron escogidos sobre la base de un papel a priori en el cáncer de ovario y que nos concentramos solamente en las asociaciones de SNP con valores de p inferior a 0,001 disminuye, pero no del todo no elimina, esta posibilidad. No obstante, este trabajo pone de relieve particulares relacionadas con los genes de interés Treg.
CD80 ha sido ampliamente estudiado por su papel en la respuesta inmune, todavía no se ha reportado ningún análisis enfocado de SNPs y el resultado del cáncer de ovario, según nuestro conocimiento. Actúa como un ligando para CD28 y CTLA4 tanto, lo que lleva a la proliferación y la anergia en células T ingenuas, respectivamente [30], [31], [32]. CTLA4 se expresa constitutivamente en células T reguladoras, donde es importante en la supresión de la respuesta inmune a través de una variedad de mecanismos propuestos, incluyendo activación de la vía indoleamine-2,3-dioxigenasa en las células dendríticas (DC) y la inhibición de las interacciones entre las células y los DC T activadas [33], [34], [35]. Hemos observado que un intrónica etiquetado CD80 SNP se asoció con una menor supervivencia de los casos endometrioide y con el aumento de la expresión de CD80 tumor y, entre todos los casos, se observó que un SNP eQTL en otro cromosoma, que asocia con la expresión de CD80 de los linfocitos también se asoció con una peor supervivencia . En conjunto, estos datos sugieren que la expresión de CD80 puede ser en parte por factores hereditarios y puede conducir a un aumento de la supresión inmune y el resultado más pobre.
De interés para despejar el cáncer de ovario de células, el producto del gen de RGS1, RGS1 o BL34 , es un miembro de la familia de proteínas RGS cuyos miembros están involucrados en la regulación de la señalización de la proteína G. En concreto, son las proteínas activadoras de GTPasa que limitan la duración de la señalización de la proteína G [36], [37]. la migración de linfocitos a las señales quimiotácticas están mediadas por señales de la proteína G y estudios previos han encontrado que las células T reguladoras no responden tan bien a quimioquinas señalización de las células T ingenuas como [38]). Por otra parte, RGS1 está más altamente expresado en células T reguladoras y la expresión es inversamente correlacionada con la migración [38]. Curiosamente, la expresión de genes RGS1 se incrementa en Tregs activado, y esto está mediado por la unión del factor de transcripción FOXP3 Treg al gen RGS1 [39]. Asociaciones de RGS1 SNPs también se han observado en numerosas enfermedades autoinmunes mediadas por células T, incluyendo la diabetes tipo 1, la enfermedad celíaca, y la esclerosis múltiple [40], [41], [42], [43]. Sobre la base de estos estudios previos, es tentador especular que los niveles RGS1 determinados genéticamente pueden regular Treg infiltración en los cánceres de ovario de células claras y contribuir así al resultado.
A SNP de posible relevancia para la enfermedad mucinoso está en LRRC32 que codifica GARP, una proteína transmembrana expresada específicamente en células T reguladoras que ocurren de forma natural activada, pero no en reposo células T reguladoras [44], [45]. GARP se ha demostrado que es un receptor para el péptido inactivo, latencia asociada (LAP) unido TGF-β [46], [47]. GARP no induce la activación de TGF-β latente; sin embargo, puede funcionar en la tolerancia infecciosa, la conversión de FOXP3
- células para supresora de FOXP3
+ células [46], [48]. Además, GARP es parte de un bucle de realimentación positiva con FOXP3 en Treg, que son conocidos para mantener un microambiente tumoral supresor y evitar una respuesta inmunológica efectiva [45]. Nuestro hallazgo de una menor supervivencia entre los casos mucinosos con menor alelos en una LRRC32 SNP sugiere que estos casos pueden haber aumentado la supresión inmune.
Se presenta una asociación entre el riesgo de muerte por cáncer de ovario mucinoso y un SNP en un gen clúster que contiene TNFRSF18 y TNFRSF4. TNFRSF18 codifica GITR, una molécula co-estimuladora presente constitutivamente en las células Treg y upregulated en las células T vírgenes después de la estimulación. Los informes son contradictorios sobre el papel de GITR, ya que se ha reportado tanto para aumentar [49], [50] y para abolir la función supresora de las células T reguladoras [51], [52]. Si bien el mecanismo de acción específico GITR sigue siendo controvertido, está claro que modula Tregs. TNFRSF4 codifica OX40 (CD134), y la señalización a través OX40 reduce la capacidad de células T reguladoras para actuar como células supresoras por la disminución de la expresión de FOXP3 [53], [54]. FOXP3 resultados en la reducción de la disminución de miR155 y un posterior aumento de SOCS1 (supresor de la señalización de citoquinas 1). SOCS1 es un componente de un bucle de realimentación negativo para IL-2 cascada de señalización; aumento de la expresión de los resultados SOCS1 en una necesidad de aumentar los niveles de IL-2 para la supervivencia de las células T reguladoras [55]. Por lo tanto, OX40 de señalización en Tregs puede modular las funciones supresoras tanto por la disminución de su función efectora y requiriendo cantidades más altas de IL-2 para la supervivencia continuada y la activación. El SNP intergénica asociado con la supervivencia global en los casos con cáncer de ovario mucinoso puede actuar a través de ya sea un GITR o mecanismo OX40. La disección de la función de las variantes de la línea germinal puede ayudar a identificar los mecanismos que podrían explicar por qué el sistema inmunológico no es capaz de montar una respuesta efectiva a los cánceres de ovario.
En conclusión, el análisis de 3.662 casos de cáncer de ovario invasivos sugiere que variantes hereditarias relacionadas con células T reguladoras están asociadas con el resultado del cáncer de ovario de una manera-subtipo específico, incluso después de ajustar por factores pronósticos conocidos. Nuestros resultados ponen de relieve la importancia del subtipo específico de análisis en los estudios clínicos y epidemiológicos de cáncer de ovario, dada la heterogeneidad de la enfermedad establecida, con cada subtipo histológico expresar diferentes patrones de características genéticas, epidemiológicos y clínicos (revisados por Karst y Drapkin [56]). El trabajo futuro debe incluir el examen de las poblaciones de estudio adicionales, los estudios inmunológicos, y la correlación de las variantes hereditarias con otras características tumorales, como los niveles de infiltración de Treg.
Apoyo a la Información sobre Table S1. .
Gen información
doi: 10.1371 /journal.pone.0053903.s001 gratis (XLS)
Tabla S2.
SNP información
doi:. 10.1371 /journal.pone.0053903.s002 gratis (XLSX)
Reconocimientos
Estamos muy agradecidos a la familia y amigos de Kathryn Sladek Smith por su generoso apoyo de la Asociación Consorcio cáncer de ovario a través de sus donaciones al Fondo de Investigación del cáncer de Ovario.