Extracto
Antecedentes
La inestabilidad genómica con alteraciones en el número de copias de ADN frecuente es una de las características principales de la carcinogénesis. Las regiones cromosómicas con el aumento de número de copias de ADN frecuente y pérdida en el cáncer gástrico humano son aún poco definidos. Todavía no se sabe cómo las variaciones del número de copias de ADN contribuye a los cambios de perfiles de expresión génica, especialmente en el nivel mundial.
Principales conclusiones
Se analizó el ADN alteraciones en el número de copias en 64 muestras de cáncer gástrico humano y 8 líneas celulares de cáncer gástrico utilizando conjuntos de cromosomas artificiales bacterianos (BAC) basado en la hibridación genómica comparada (aCGH). Se aplicó un análisis estadístico para correlacionar los datos de expresión de genes previamente publicados obtenidos a partir de microarrays de ADNc con los datos de la variación del número de copias de ADN correspondientes para identificar los oncogenes candidatos y los genes supresores de tumores. Se encontró que las muestras de cáncer gástrico mostraron variaciones del número de copias de ADN recurrentes, incluyendo las ganancias de 5p, 20p, 8q, 20q, y pérdidas en el 4T, 9p, 18q, 21q. Las regiones más frecuentes de amplificación fueron 20q12 (7/72), 20q12-20q13.1 (12/72), 20q13.1-20q13.2 (11/72) y 20q13.2-20q13.3 (6/72) . La región eliminada más frecuente fue 9p21 (8/72). La correlación de la matriz de datos de expresión génica con aCGH identificaron 321 oncogenes candidatos, que se sobreexpresa y mostraban ganancias número de copias de ADN frecuente; y 12 candidatos genes supresores de tumor que se redujeron reguladas y que mostraron pérdidas número de copias de ADN frecuentes en los cánceres gástricos humanos. Tres redes de genes expresados de manera significativa en las muestras de cáncer gástrico fueron identificados por análisis de vías ingenio.
Conclusiones
Este estudio proporciona información sobre las variaciones del número de copias de ADN y su contribución a los perfiles de expresión de genes alterados durante gástrica humana el desarrollo del cáncer. Se proporciona nuevos oncogenes conductor candidato o genes supresores de tumores para el cáncer gástrico humano, mapas de ruta útiles para el futuro entendimiento de la patogénesis molecular de este tumor maligno, y la construcción de nuevas dianas terapéuticas
Visto:. Ventilador B, Dachrut S, Coral H, Yuen ST, Chu KM, Ley S, et al. (2012) Integración de ADN el número de copias de la transcripción y alteraciones Análisis de expresión en el cáncer gástrico humano. PLoS ONE 7 (4): e29824. doi: 10.1371 /journal.pone.0029824
Editor: Reiner Albert Veitía, Instituto Jacques Monod, Francia