Extracto
NKX2-1
, que codifica un factor de transcripción homeobox, se amplifica en aproximadamente el 15% de las no pequeñas de cáncer de pulmón no microcítico (CPNM), donde se piensa que conducir el cáncer la proliferación celular y la supervivencia. Sin embargo, sigue siendo en gran medida desconocido su mecanismo de acción. Para identificar dianas transcripcionales descendente de referencia, aquí llevamos a cabo un transcriptoma combinado NKX2-1 (caída NKX2-1 seguido de RNAseq) y cistrome análisis (NKX2-1 sitios de unión ChIPseq) en cuatro
NKX2-1 CD - líneas celulares de cáncer humano amplificado. Mientras NKX2-1 genes regulados diferían entre las cuatro líneas celulares ensayadas, la proliferación celular surgió como un tema común. Por otra parte, en 3 de las 4 líneas celulares, el receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR) se encontraba entre la parte superior NKX2-1 upregulated objetivos, que nos confirma en el nivel de proteínas por Western blot. Curiosamente, el EGFR caída condujo a la regulación positiva de NKX2-1, lo que sugiere un bucle de retroalimentación negativa. Consistente con este hallazgo, caída combinada de NKX2-1 y EGFR en células de cáncer de pulmón NCI-H1819 reducción de la proliferación celular (así como MAP-quinasa y de señalización PI3-quinasa) más de desmontables de ya sea solo. Del mismo modo, NKX2-1 caída aumentó el efecto inhibidor del crecimiento de la erlotinib EGFR-inhibidor. Tomados en conjunto, nuestros resultados implican EGFR como un efector aguas abajo de NKX2-1 en
NKX2-1
amplificó NSCLC, con posibles implicaciones clínicas, y proporcionan un rico conjunto de datos para la investigación de otros mediadores de la oncogénesis NKX2-1 impulsada.
Visto: Clarke N, Biscocho J, Kwei KA, JM Davidson, Sridhar S, X Gong, et al. (2015) Integrativa Genómica implica EGFR como un mediador aguas abajo en
NKX2-1
amplificado de células no pequeñas cáncer de pulmón. PLoS ONE 10 (11): e0142061. doi: 10.1371 /journal.pone.0142061
Editor: Jen-Tsan Ashley Chi, la Universidad de Duke, Estados Unidos