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PLOS ONE: LINE-1 Hipometilación en el cáncer es muy variable e inversamente correlacionada con la inestabilidad de microsatélites


Extracto

Antecedentes

Las alteraciones en la metilación del ADN en el cáncer incluyen la hipometilación global y la hipermetilación de genes específicos. No está claro si estos dos errores epigenéticos están mecánicamente vinculados o se producen de forma independiente. Este estudio se realizó para determinar la relación entre la hipometilación del ADN, la hipermetilación y la inestabilidad de microsatélites en el cáncer.

Metodología /Principales conclusiones

Se examinaron 61 líneas celulares de cáncer y 60 carcinomas colorrectales y sus tejidos adyacentes usando LINE-1 bisulfito-PCR como un sustituto para la desmetilación global. carcinomas colorrectales esporádicos con la inestabilidad de microsatélites (MSI), la mayor parte de los cuales se deben a un fenotipo de la isla CpG metilación (CIMP) y asociado metilación del promotor de MLH1, mostraron en promedio hay diferencia en LINE-1 metilación entre los tejidos adyacentes normales y cancerosas. Curiosamente, algunas muestras de tumores de este grupo mostraron aumento de LINE-1 metilación. Por el contrario, MSI-mostró una disminución significativa en LINE-1 metilación entre los tejidos adyacentes y cáncer normales (P & lt; 0,001). el análisis de microarrays de metilación elemento repetitivo confirmó esta observación y mostró un alto grado de variabilidad en la hipometilación entre las muestras. Además, la agrupación jerárquica sin supervisión identificó un grupo de tumores altamente hypomethylated, compuesto en su mayoría de los tumores sin inestabilidad de microsatélites. Hemos ampliado el análisis LINE-1 a las líneas celulares de cáncer de diferentes tejidos y se encontró que 50/61 se hypomethylated en comparación con los linfocitos de sangre periférica y la mucosa del colon normal. Curiosamente, estas líneas celulares de cáncer también mostraron una gran variación en la desmetilación, que era específica de tejido y por lo tanto poco probable que sea resultante de un proceso estocástico.

Conclusión /Importancia

hipometilación global se invierte parcialmente en los cánceres con inestabilidad de microsatélites y también muestra una gran variabilidad en el cáncer, lo que puede reflejar las vías de progresión en cáncer de alternativas

Visto:. Estécio MR, Gharibyan V, Shen L, Ibrahim AE, Doshi K, Él R, et al . (2007) LINE-1 Hipometilación en el cáncer es muy variable e inversamente correlacionada con la inestabilidad de microsatélites. PLoS ONE 2 (5): e399. doi: 10.1371 /journal.pone.0000399

Editor Académico: M. Cristina Cardoso, Centro Max Delbrueck de Medicina Molecular, Alemania

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