Extracto
La nicotina es un factor de riesgo conocido para el desarrollo del cáncer y se ha demostrado que alteran la expresión génica en las células y tejidos en caso de exposición. Utilizamos la tecnología Illumina® Next Generation Sequencing (NGS) para obtener una perspectiva biológica imparcial en el transcriptoma de las células epiteliales normales (MCF-10A) con la exposición a la nicotina. Hemos generado datos de expresión de 54,699 transcripciones utilizando triplicados de control y la nicotina hicieron hincapié en las células. Como resultado, se identificaron 138 transcripciones expresados diferencialmente, incluyendo 39 genes no caracterizados. Además, 173 transcripciones que se asocian principalmente con la replicación del ADN, la recombinación y reparación mostraron evidencia de splicing alternativo. Descubrimos la mayor respuesta al estrés por la nicotina HPCAL4 (hasta reguladas por 4,71 veces) y npas3 (abajo-regulada por -2.73 veces); ambos son genes que no han sido previamente implicadas en exposición a la nicotina pero están relacionados con el cáncer. También descubrimos significativa regulación a la baja (-2,3 veces) y el splicing alternativo de NEAT1 (lncRNA) que puede tener un importante papel regulador, aún por descubrir. Gene ontología análisis reveló genes de exposición influenciada nicotina que intervienen en los procesos celulares y metabólicos. Este estudio revela consecuencias hasta ahora desconocidas de la tensión de la nicotina en el transcriptoma de las células epiteliales normales de mama y da una idea de la influencia biológica subyacente de la nicotina sobre las células normales, que marca las bases para futuros estudios
Visto:. Bavarva JH, Tae H, Settlage RE, RH Garner (2013) Caracterización de la base genética de la nicotina inducida por el desarrollo del cáncer: Un Estudio del transcriptoma de secuenciación. PLoS ONE 8 (6): e67252. doi: 10.1371 /journal.pone.0067252
Editor: Emmanuel Dias-Neto, Hospital del Cáncer AC Camargo, Brasil