Extracto
Los procesos epigenéticos - incluyendo la metilación del ADN - son vistos cada vez más como tener un papel fundamental en las enfermedades crónicas como el cáncer. Es bien conocido que los niveles de metilación en genes o loci particulares difieren entre el tejido normal y enfermo. Aquí investigamos si el arquitectura metilación intra-gen está dañado en el cáncer y si la variabilidad de los niveles de metilación de CpG individuales dentro de un gen definido es capaz de discriminar canceroso del tejido normal, y se asocia con el fenotipo tumoral heterogénea, tal como se define por el gen expresión. Se analizaron 270985 CpG anotado a los genes 18272, en 3284 canceroso y 681 muestras normales, que corresponden a 14 tipos diferentes de cáncer. Al hacerlo, hemos encontrado nuevos diferencias en patrón de metilación de genes a través de intra-fenotipos, sobre todo en aquellos genes que son cruciales para la biología de células madre; nuestras medidas de la arquitectura metilación intra-gen son una mejor determinante del fenotipo de medidas basadas en el nivel de metilación medio solo (K-S prueba en las 14 enfermedades probado). Estos per-gen medidas de metilación también representan una considerable reducción de la complejidad, comparado con el convencional per-CpG beta-valores. Nuestros resultados apoyan firmemente la idea de que la arquitectura dentro de la metilación de genes tiene un gran potencial clínico para el desarrollo de biomarcadores de cáncer basados en el ADN
Visto:. Bartlett TE, Zaikin A, Olhede SC, West J, Teschendorff AE, Widschwendter M (2013) la corrupción de la metilación del ADN Arquitectura Intra-gen es una característica del cáncer. PLoS ONE 8 (7): e68285. doi: 10.1371 /journal.pone.0068285
Editor: Zoran Culig, Universidad Médica de Innsbruck, Austria