Extracto
Antecedentes
El Bcl-2 proteína X -asociado (Bax) es un miembro proapoptótico de la familia Bcl-2 conocido para ser activado y upregulated durante la apoptosis. polimorfismos de nucleótido único (SNP) en el promotor Bax pueden participar en el proceso de la carcinogénesis mediante la alteración de su propia expresión y los genes relacionados con el cáncer. Bax-248g & gt; Un polimorfismo se ha implicado para alterar el riesgo de cáncer, pero los resultados mencionados son inconsistentes y no concluyentes. En el presente estudio, se realizó un metanálisis para resumir sistemáticamente la posible asociación de este polimorfismo con el riesgo de cáncer.
Metodología
Se realizó una búsqueda de los estudios de casos y controles en el asociaciones de Bax-248g & gt; Un polimorfismo con la susceptibilidad al cáncer en Pub Med, Science Direct, Wiley Online Library y la búsqueda manual. Los datos de los estudios elegibles sobre la base de unos criterios clave términos de búsqueda, de inclusión y exclusión fueron extraídos de este meta-análisis. Hardy-Weinberg (HWE) en los controles, cálculo de potencia, análisis de heterogeneidad, gráfico de embudo de Begg, pruebas de regresión, diagrama de bosque y la sensibilidad análisis lineal de Egger se llevaron a cabo en el presente estudio.
Resultados
El riesgo de cáncer asociado con Bax-248g & gt; Un polimorfismo se estimó mediante odds-ratios combinados (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC95%). Los OR agrupados se calcularon en contraste alelo, la comparación homocigóticos, heterocigóticos comparación, dominante y modelo recesivo. La significación estadística se controla a través de Z y p-valor en el diagrama de bosque. Un total de siete estudios independientes, incluyendo 1772 casos y 1708 controles se incluyeron en el metanálisis. Nuestros resultados muestran que ni la frecuencia ni de genotipo distribuciones de alelos de este polimorfismo se asoció con el riesgo de cáncer en cualquiera de los modelo genético. Por otra parte, la prueba de Egger no mostró ninguna evidencia sustancial de sesgo de publicación
Conclusiones /Importancia
Este meta-análisis sugiere que el Bax-248g & gt;. Un polimorfismo no es un importante factor de riesgo de cáncer. Sin embargo, se requieren estudios adicionales bien diseñados con mayor tamaño de muestra se centra en diferentes grupos étnicos y tipos de cáncer para validar los resultados
Visto:. Sahu SK, Choudhuri T (2013) La falta de asociación entre Bax Promotor (- 248 g & gt; a) polimorfismo de nucleótido único y la susceptibilidad al cáncer: Evidencia de un meta-análisis. PLoS ONE 8 (10): e77534. doi: 10.1371 /journal.pone.0077534
Editor: Bhaskar Saha, Centro Nacional para la Ciencia de la célula, la India
Recibido: 16 de abril, 2013; Aceptado: 4 Septiembre 2013; Publicado: 17 de octubre, 2013
Derechos de Autor © 2013 Sahu, Choudhuri. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. SKS fue apoyada por el Consejo de Investigación Científica e Industrial, Gobierno de la India. Este trabajo fue apoyado por una beca intramural del Instituto de Ciencias de la Vida, Departamento de Biotecnología del Gobierno de la India. Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
Las causas específicas del cáncer aún no se conocen. Sin embargo, los estudios epidemiológicos contribuyen a sugerir la relación de polimorfismo genético de la susceptibilidad al cáncer. Los estudios de asociación genética con polimorfismos de nucleótido único (SNP) del cáncer de orientación están surgiendo área de investigación. SNP se puede definir como un locus genómico donde se producen dos o más bases alternativas con frecuencia sustancial de mayor que 1% [1]. Un total de alrededor de 10 millones de SNP se ha distribuido por todo el genoma humano a una frecuencia de al menos una de cada 1000 pares de bases y exhiben baja tasa de mutación [2]. Estudios anteriores han demostrado que los SNPs en oncogenes (por ejemplo Ras [3], MDM2 [4] y VEGF [5]), y genes supresores de tumores (por ejemplo p53 [6], Rb, y p16 [7]) puede proteger o aumentar la susceptibilidad hacia el riesgo de cáncer. Por lo tanto, el análisis de SNP puede ser una herramienta para explicar las complejidades genéticos responsables para el desarrollo del cáncer en cierta medida. Promete para ayudar en la identificación de nuevos genes relacionados con el cáncer como un bio-marcador para predecir la probabilidad de un individuo de desarrollar cáncer. El gen Bax es un gen supresor de tumores bien estudiados en diversos tipos de células. Bax es codificada por seis exones y expresa un complejo patrón de corte y empalme de ARN alternativo que forma una membrana 21kd (α) y dos formas de proteína citosólica (β y γ). Pertenece a un miembro proapoptótico de la familia Bcl-2 y se ha implicado en la inducción de la apoptosis [8]. Se mantiene inactiva en el citosol de las células no apoptóticas en condiciones homeostáticas. A una señal de muerte celular, Bax sufre un cambio conformacional que conduce a su inserción, oligomerización y formación de grandes poros a través de la membrana mitocondrial externa [9]. Hay muchos factores que apoptogenic como citocromo c [10,11], Smack /Diablo [12], Omi /HtrA2 [13], la endonucleasa G [14] y [15] se liberan factor inductor de apoptosis a través de este poro y reclutar a varias moléculas de las vías de apoptosis . Numerosos estudios han demostrado que la alternancia de la expresión de Bax desempeña un papel importante en la patogénesis del cáncer [16-21]. El cambio genético del gen Bax puede tener distinguida importancia en la iniciación y progresión del cáncer, ya que tiene una serie de genes diana incluyendo muchos oncogenes y genes supresores de tumores [22-26]. Los estudios sobre la asociación entre los SNPs en Bax y el cáncer humano han proporcionado nuevos conocimientos sobre los mecanismos moleculares del desarrollo del cáncer. Hasta la fecha, al menos 111 Bax SNPs han sido reportados en Enterzdatabase. En el caso de mutaciones de sentido erróneo cáncer gastrointestinal del gen Bax en el codón 169 (Thr & gt; Ala o Thr & gt; Met) causa la inhibición de la actividad proapoptótico de la proteína y mejorar el desarrollo del cáncer [27]. Un adenosina guanina sustitución en la posición 125 (G125A) en el promotor Bax se asocia a etapas superiores de la leucemia linfocítica crónica (CLL) y la falta de respuesta al tratamiento [28]. Una mutación silenciosa punto en Bax codón 184 (TCG & gt; TCA) se ha informado en pacientes con cáncer de pulmón [29]. Aunque Bax polimorfismo del gen ha sido lo que sugiere su implicación potencial en el desarrollo del cáncer, el conocimiento actual de la SNP localizado en la región 5 'no traducida del promotor del gen Bax, 248g & gt; A, en el cáncer es todavía dispersivo y limitado. Bax-248GA polimorfismo se ha asociado con la baja regulación de la expresión del gen Bax, estadio de la enfermedad avanzada, menor respuesta al tratamiento y disminución de la supervivencia en la LLC y el cáncer de pulmón. Además, hay informes contradictorios que muestran falta de asociación entre este polimorfismo con el riesgo de cáncer de mama y la LLC. Por lo tanto, algunos grupo de investigadores informó polimorfismo Bax-248GA podría ser la bio-marcador de susceptibilidad al cáncer o protectibility [30-32], mientras que otros [33-37] muestra una falta de asociación. Sin embargo, con muestras relativamente pequeñas, estos antiguos estudios proporcionaron información limitada y no pudieron llegar a una conclusión convincible. Por lo tanto, se realizó un meta-análisis de todos los estudios disponibles (Lista de verificación S1. PRISMA lista de verificación.) Para proporcionar una conclusión más fiable sobre la relación entre Bax-248GA polimorfismo y el riesgo de cáncer.
Materiales y Métodos
Búsqueda por publicación
una extensa búsqueda se realizó en PubMed, Science Direct, Wiley Online Library y la búsqueda de la mano con una combinación de términos de búsqueda siguientes: Bax, polimorfismo, SNP, mutación y /o cáncer hasta de marzo de 2013. Se evaluaron todas las publicaciones asociadas para identificar la literatura más codiciado. El procedimiento de selección de este estudio se ha demostrado en la Figura 1. Los resultados se limitaron a trabajos publicados en Inglés. Por último, se identificaron siete estudios como artículos elegibles en este meta-análisis de Bax-248GA polimorfismo, incluyendo cuatro estudios sobre la LLC (812 casos y 462 controles), un estudio sobre el carcinoma de células escamosas (814 casos y 934 controles), un estudio sobre cáncer de pulmón (93 casos 230 controles) y un estudio sobre el cáncer de mama (53 casos 82 controles).
Esto se basa en criterios de búsqueda publicación, de inclusión y exclusión.
inclusión y criterios de exclusión
se utilizaron los siguientes criterios para seleccionar los estudios de este meta-análisis (a) publicados en revistas revisadas por pares, (b) artículos sobre Bax-248GA polimorfismo y el riesgo de cánceres y (c) los artículos que contengan útil alelo y genotipo frecuencia. Los criterios de exclusión fueron: (a) los estudios de casos y controles no, (b) control de la población incluyendo a los casos de cánceres, y la duplicación (c) de una publicación anterior.
Extracción de los datos
Dos investigadores (SKS y TC) revisaron y extrajeron la información de todas las publicaciones elegibles independientemente uno de otro de acuerdo con los criterios de inclusión y de exclusión enumerados anteriormente. Las siguientes características se recogieron de cada estudio: primer método de genotipificación para la evaluación de Bax-248GA polimorfismo nombre del autor, año de publicación, país de origen, el tipo de cáncer, el número total de casos y controles con G /G, G /A y a /a genotipos.
Análisis estadístico
primero evaluaron Hardy-Weinberg (HWE) para cada estudio utilizando el software SNPalyze (Dynacom, Japón) para identificar los errores de genotipado sistemáticas. Una potencia de cálculo se lleva a cabo a priori utilizando PD: Poder y Software Tamaño de la muestra de cálculo (http://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize) que demostró que una muestra de cerca de 200 controles y casos proporcionarían una potencia de más de 50%. Genotipo y frecuencias alélicas se calcularon mediante el conteo manual. Todos los análisis estadísticos para el actual meta-análisis fue realizado por el software de metanálisis de la versión 2. La asociación del polimorfismo Bax-248GA con el cáncer se evaluó mediante el cálculo de la odds ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC) en varios modelos: (i) el contraste alelo (A frente a G), (ii) la comparación homocigóticos (AA frente GG), (iii) la comparación heterocigóticos (GA frente GG), (iv) modelo dominante (AA + GA frente GG) y (v) modelo recesivo (AA frente GG + GA) en el estudio I, II, III, IV y V respectivamente. Además, los valores de p se calcularon Z y en diagrama de bosque (Figura 2.) En todos los casos los resultados de la prueba de heterogeneidad fueron P
heterogeneidad & lt; 0,05, por lo que las RUP se agruparon de acuerdo con el modelo de efectos aleatorios (método Der Simonian y Laird). Además, I
2 estadísticas se utilizó para cuantificar la variabilidad inter estudio que se puede atribuir a la heterogeneidad y no al azar. El índice varía entre 0% y 100%, donde un valor de 0% indica que no hay heterogeneidad observada y los valores más altos indican un mayor grado de heterogeneidad (I
2 = 0-25%, sin heterogeneidad; I
2 = 25 -50%, heterogeneidad moderada; I
2 = 50-75%, gran heterogeneidad; I
2 = 75-100%, la heterogeneidad extrema). Se observó heterogeneidad moderada en la mayoría de los modelos que se incluyeron en el análisis (alelo En general, A vs G: P
heterogeneidad & lt; 0,0001, I
2 = 79,42; comparación homocigotos, AA vs GG: P
heterogeneidad = 0,01, I
2 = 69,92; comparación heterocigóticos, GA vs GG: P
heterogeneidad = 0,008, I
2 = 65,72; En general dominante modelo, AA + GG vs GG: P
heterogeneidad & lt; 0,0001, I
2 = 75,54; recesiva global del modelo, AA + GG vs GG: P
heterogeneidad = 0,03, I
2 = 62.07).
Los cuadrados y las líneas horizontales corresponden al estudio razones de posibilidades específicas (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC), respectivamente. El área de los cuadrados refleja el peso específico de estudio (inversa de la varianza). El diamante representa las RUP agrupados e IC del 95%.
Resultados
Estudio Característica
Se identificaron 230 artículos potencialmente relevantes de nuestra búsqueda de la literatura publicada, de los cuales 196 artículos fueron excluidos después de la revisión inicial. De este modo, se identificaron un total de 34 estudios a través de la selección basada en criterios de inclusión. Durante la extracción de los datos de 25 artículos que no eran relevantes para Bax-248GA polimorfismo y se excluyeron los cánceres. Por último, una vez más se excluyeron dos estudios después de la revisión del texto completo, uno por falta de adecuada categorización de los controles /de los casos [33] y el otro no está proporcionando los datos pertinentes [38]. Por lo tanto, siete estudios de casos y controles incluidos 1.772 casos y 1708 controles (actualizado en marzo de 2013) fueron identificados e incluidos en el meta-análisis final (Figura 1.) Las características principales se presentan en la Tabla 1. Tamaño de la muestra de los siete estudios varió de 59 a 1748. los siete estudios incluyen la población de los Estados Unidos de América (EE.UU.), Reino Unido (UK), Alemania, Canadá, Suecia, Rusia, Turquía y Finlandia [30-32,34-37]. La distribución de la frecuencia del polimorfismo Bax-248GA entre los casos y los controles de los siete estudios realizados en diferentes tipos de cáncer (CLL, carcinoma de células escamosas, cáncer de pulmón y cáncer de mama) se enumeran en la Tabla 1. La frecuencia del genotipo en los controles de todos los estudios son que obedecen a la HWE, excepto el estudio de Kuznestova et al [32].
primer autor, año, Ref & Country
tipo de cáncer
método de genotipificación
tamaño de la muestra
Controles Casos
p
valor de HWE
de energía (%) gratis (control /Case) GGGAAAGGGAAAA.Saxena de 2002, [30] Canadá linfocítica crónica leukemiaPCR25 /342410221200.9117J. Starczynski de 2005, [33] UKChronic linfocítica leukemiaPCR135 /2031151911574420.8282A. Skogsberg de 2006, [34] Suecia, Germeny, FinlandChronic linfocítica leukemiaPCR207 /4631634043738460.4099H. Nuckel de 2006, [35] GermanyChronic linfocítica leukemiaPCR95 /11279151872140.7658K. Chen, 2007, [36] celular USASquamous carcinomaPIRA-PCR934 /81472320011627170170.49100Irina A. Kuznetsova, 2012, [32] RussiaLung CancerPCR-RFLP230 /931118039672150.000580Yemilha Yildiz, 2013, [37] TurkeyBreast cancerPCR82 /5363190431300.2339Table 1. Distribución de Bax-248g & gt ; Un genotipo de los casos de cáncer y controles incluye en el metanálisis
NOTA: PCR;. reacción en cadena de la polimerasa, PIRA; análisis de restricción imprimación-introducido, HWE; equilibrio de Hardy-Weinberg. Descargar CSV CSV
Los resultados del metanálisis
En total, se investigaron siete estudios independientes y sus resultados se realizó un metanálisis. diagramas de bosque en la Figura 2, mostró los resultados de detalle del polimorfismo Bax-248GA y el riesgo de cáncer. Se observaron análisis general para todos los modelos genéticos (OR = 1,032, 95% CI = 0,687 a 1.549, Z-valor = 0,151, valor p = 0,880 para A frente a G en el estudio I, OR = 0,903; IC del 95% = 0,308 para 2.646, Z-valor = -0,186, p-valor = 0,852 para AA frente GG en el estudio II, OR = 1,028; IC del 95% = 0,714-1,480, Z-valor = 0,147, p-valor = 0,883 para el GA frente GG en III estudio; OR = 1,031, IC 95% = 0,680-1,561, Z-valor = 0,142, valor p = 0,887 para el modelo dominante de AA + GA frente GG en el estudio IV; OR = 0,932, 95% CI = 0,360 a 2,417, Z-valor = -0,144, p-valor = 0,886 para el modelo recesivo AA frente GG + GA en el estudio V). En todos los casos, los valores de p fueron & gt; 0.05. Por lo que ninguno del modelo mostró asociaciones significativas para Bax-248GA polimorfismo y el riesgo de cáncer.
Análisis de sensibilidad
Los análisis de sensibilidad se realizaron para evaluar la estabilidad de los resultados por omisión secuencial de estudio individual cada vez. Esto refleja la influencia de los datos individuales conjunto de las RUP agrupados. La importancia de las RUP agrupados no fue influenciado en exceso al omitir un solo estudio (figuras complementarias: S1, S2, S3, S4, S5, S6 y S7).
Publicación Bias
gráfico en embudo de Begg y pruebas de regresión lineal de Egger [39] se llevaron a cabo para evaluar el sesgo de publicación en los informes incluidos en el metanálisis. El gráfico de embudo es un gráfico de una medida del tamaño del estudio (por lo general error estándar o precisión) en el eje vertical como una función del tamaño del efecto en el eje horizontal. La forma de gráficos de embudo no reveló ninguna evidencia de asimetría en todos los modelos de comparación: (i) el contraste alelo (A frente a G), (ii) comparación de homocigotos (AA frente a GG), (iii) comparación heterocigotos (GA frente GG), (iv) modelo dominante (AA + GA frente GG) y (v) modelo recesivo (AA frente GG + GA) en el estudio I, II, III, IV y V, respectivamente (Figura 3). A continuación, se utilizó la prueba de Egger para proporcionar evidencia estadística de simetría gráfico en embudo. Esta prueba evalúa el sesgo mediante el uso de precisión para predecir el efecto estandarizado. En los análisis de la presente para su estudio I: intersección = 0,91, 95% CI = -3,51 a 5,35; p-valor = 0,61, SE = 1,72, t-valor = 0,53, df = 5; Para el estudio II: intercepción = 0,45; IC del 95% = -7.13 a la 8.05 Valor P = 0,86, SE = 2,38, t-valor = 0,19, df = 3; Para el estudio III: intercepción = 1,09; IC del 95% = -2,21 a la 4.40, valor de p = 0,43, SE = 1,28, t-valor = 0,85, df = 5; Para el estudio IV: intercepción = 0,97; IC del 95% = -3,06 a la 5.02, valor de p = 0,56, SE = 1,57, t-valor = 0,62, df = 5; Para el estudio V: intercepción = 0,36; IC del 95% = -6,39 a la 7.11 Valor P = 0,87, SE = 2,12, t-valor = 0,17, df = 3. Los resultados no mostraron ninguna evidencia de sesgo de publicación (Tabla 2 .).
Cada punto representa un estudio separado. El OR fue trazada en una escala logarítmica en contra de la precisión (el recíproco de la SE) de cada estudio.
Comparaciones
análisis de regresión de Egger
heterogeneidad análisis
modelo utilizado para el meta -análisis
Intercepción
95% Intervalo de confianza
valor P-
SE
valor t
df
P
heterogeneidad
me
2 (%)
a frente a G0.91-3.51 5.350.611.720.535 & lt; 0.000174.92RandomAA vs GG 0,45 a 7,13 a 8.050.862.380.1930.0169.92RandomGA vs GG1.09-2.21 a 4.400.431.280.8550.00865.72RandomAA + GA vs GG0.97-3.06 a 5.020.561.570.625 & lt; 0.000175.54RandomAA vs GG + GA0.36-6.39 a 7.110.872.120.1730.0362.07RandomTable 2. Estadísticas para probar el sesgo de publicación y la heterogeneidad en el metanálisis de Bax -248G & gt;. un polimorfismo y el riesgo de cáncer
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Discusión
la apoptosis es un evento que conduce a la muerte de la célula sin la liberación de sustancias nocivas en el tejido . En proceso de muerte celular apoptótica mediada por mitocondrias Bax actúa como un controlador de acceso esencial como su activación comete irreversiblemente la mayoría de las células a morir [40,41]. Se ha estudiado ampliamente en su relación con los diferentes tipos de cáncer, como el de páncreas [19,42], la vejiga [21], gástrico [18], colorrectal [43,44], de esófago [16], de pulmón [32,45 , 46], [47] de cuello uterino, de colon [48,49], carcinoma de próstata [50,51], carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello [36], carcinoma nasofaríngeo [52], los carcinomas de mama [32,53], carcinoma de ovario [54], el cáncer de células renales y de transición [55], los gliomas [56], CLL [30,31,33-35,38,57], linfoma de Hodgkin [17], el linfoma no Hodgkin de [58], mieloma [59], leucemia aguda [60], etc. promotor Bax contiene elementos de respuesta para un importante gen supresor tumoral p53 y esto afecta a la expresión de genes [28]. Con respecto a las importantes funciones de Bax en la apoptosis, es biológicamente plausible que su polimorfismo puede modular el riesgo de cáncer. La expresión alterada de la proteína Bax parece relevante para la carcinogénesis, pero las mutaciones que conducen a la desregulación y las correlaciones de estas mutaciones con cáncer han atraído la atención de los investigadores. Varios grupos han investigado las relaciones entre Bax-248GA polimorfismo y cáncer en diferentes estudios realizados hasta ahora. En el informe inicial por Saxena et al. durante el año 2002, en un estudio de 25 controles y 34 pacientes con LLC que han demostrado que un aumento de la frecuencia del genotipo del polimorfismo Bax-248GA en los pacientes en comparación con los controles, sobre todo en la etapa de la enfermedad superior. En este estudio, la frecuencia del genotipo en el grupo de control fue de 5,7% para los genotipos GA, que fue 68,7% para la LLC en la etapa I-IV [30]. Esta conclusión fue apoyada por un estudio de Moshynska et al. en el que han demostrado este SNP como una causa de la reducción de expresión de la proteína Bax [31], que puede ser una razón de resistencia a los fármacos por el paciente CLL. En un estudio reciente realizado por Kuznestova et al. en 2012, mostró un aumento significativo en la frecuencia de alelo -248G (88,33%) y el genotipo -248GG (72,04%) en pacientes con cáncer de pulmón que eran 65,65% y 48,26% respectivamente para los controles sanos. Por lo tanto, han demostrado el papel protector de este polimorfismo.
Sin embargo, los resultados de otros grupos informaron de la falta de asociación de este polimorfismo y el riesgo de cáncer. Starczynski et al. en su estudio encontró 23% de CLL y 15% del control sin frecuencia de los alelos significativa entre los dos grupos [33]. Skosberg et al. en su CLL paciente no encontró diferencias significativas en la supervivencia global, con o sin el polimorfismo Bax [34]. Nuckel et al. mostró la distribución de genotipos entre los pacientes con LLC (87 GG, 21AG, 4 AA) y controles sanos (79 GG, 15 AG, 1 AA) no fueron significativamente diferentes lo que sugiere que este polimorfismo no puede aumentar la susceptibilidad de los pacientes con LLC frecuencia alelo G-CLL ( : 0,87; controles: 0,91) [35]. Chen et al. no encontró ninguna diferencia estadísticamente significativa en la distribución de frecuencias de la Bax-248 G & gt; A SNP entre los casos y controles (p = 0,625). Cuando el genotipo GG Bax se tomó como el grupo de referencia, no se encontró asociación entre la AA y AG genotipos variantes con carcinoma de células escamosas del cuello (CECC) de riesgo [36] y la cabeza. Yildiz et al. mostraron que Bax Bax-248GA genotipo y la frecuencia de alelos entre los controles y los pacientes de cáncer de mama no fueron estadísticamente significativas (p = 0,866, p = 0,856, respectivamente) [37]. En conjunto, los resultados sobre la asociación entre Bax-248GA polimorfismo y el riesgo de cáncer sigue siendo contradictorios y no concluyentes. Los resultados contradictorios son posiblemente debido a un pequeño efecto del polimorfismo Bax-248GA sobre el riesgo de cáncer o el poder estadístico relativamente bajo de los estudios publicados. Por lo tanto, era necesario este meta-análisis para mostrar un enfoque cuantitativo para combinar los diferentes resultados disponibles. El meta-análisis es un método poderoso que puede combinar los resultados de varios estudios independientes similares con resultados inconsistentes para producir una única estimación del efecto principal con una mayor precisión [39]. En el presente meta-análisis, se analizaron un total de siete estudios de casos y controles para proporcionar una evaluación exhaustiva de la asociación entre el polimorfismo Bax-248GA y el riesgo de cáncer en general. Los estudios se realizaron en este meta-análisis fueron relativamente pequeño, pero el número de controles totales y los casos fueron sustanciales, lo que aumenta la potencia estadística del análisis. Los estudios de casos y controles incluidos en este análisis fueron satisfactorios, ya que cumplieron con los criterios de inclusión preestablecidos. No se detectó ningún sesgo de publicación que sugiere que el conjunto de resultados agrupados fueron imparcial.
La odds ratio se utilizan para determinar las probabilidades relativas de la ocurrencia del riesgo de cáncer con Bax-248GA polimorfismo y IC del 95% para estimar la precisión del OR. Una gran IC indica un bajo nivel de precisión de la O, mientras que una pequeña IC indica una mayor precisión de la O. En nuestros resultados como se muestra en la Figura 2, los individuos con el alelo A tenían un mayor riesgo de cáncer en comparación con el tipo salvaje alelo A (OR = 1,032, 95% C I = 0,687-1,549). Los individuos con homocigotos variante AA tenían un riesgo menor de cáncer en comparación con la variante de tipo salvaje GG (OR = 0,903; IC del 95% = 0,308-2,646) y con la variante heterocigota GA tenían un mayor riesgo de cáncer en comparación con la variante GG tipo salvaje (OR = 1,028, IC del 95% = 0,714-1,480). En el modelo dominante, los individuos con el genotipo (AA + GA) tenían un mayor riesgo de cáncer en comparación con la variante de tipo salvaje GG (OR = 1,031; IC del 95% = 0,680-1,561) y en el modelo recesivo, homocigótico variante AA tenían un menor riesgo de cáncer, en comparación con el genotipo (GA + GG) (OR = 0,932; IC del 95% = 0,360-2,417). Sin embargo, en la totalidad por encima de los valores de p modelo de cinco comparación fueron & gt; 0,05 lo que sugiere una falta de asociación significativa hacia el aumento o disminución del riesgo de cáncer debido a Bax-248GA polimorfismo.
La heterogeneidad se observó entre estos estudios a través de I
2 Valor. La heterogeneidad puede deberse a diversos factores, tales como la diversidad en la característica de la población, el diseño del estudio, las diferencias en el número de casos y controles, método genotipo, etc. Algunas publicaciones no publicados elegibles no estaban disponibles para incluir en el presente meta-análisis, que podrían afectar a los resultados. El sesgo de selección podría haber jugado un papel para influir en el resultado debido a que la distribución de los genotipos de este polimorfismo se desvió de HWE en un estudio [32]. Los resultados se basaron en estimaciones no ajustadas, mientras que un análisis estadístico más preciso debe llevarse a cabo si el conjunto de datos individuales estaban disponibles. Esto permitiría que el investigador para el ajuste por otras variables de confusión incluyendo los factores ambientales y de otro estilo de vida.
A lo mejor de nuestro conocimiento, este es el primer meta-análisis con respecto a la evaluación global de la relación entre Bax-248GA polimorfismo y el riesgo de cáncer. Nuestros resultados no apoyan una asociación genética entre este polimorfismo y la susceptibilidad al cáncer corrobora con algunos de los estudios de casos y controles previos [34-37]. Ni las distribuciones de frecuencia de los alelos del genotipo ni se asociaron significativamente con la susceptibilidad al cáncer de qué hipótesis de que Bax-248GA polimorfismo puede tener ningún papel en la vulnerabilidad del cáncer. Además, debido al tamaño relativamente pequeño de la muestra, el resultado necesaria una mayor validación y confirmación con estudios de muestras grandes
Siguiendo las recomendaciones prácticas que constituyen puntos de acción puede ser tener en cuenta en futuros estudios de asociación:.
la asociación falta en este estudio de Bax-248GA polimorfismo y el riesgo de cáncer debe ser replicado con funciones biológicas para motivar mejor el estudio y para permitir la interpretación de los resultados. datos histopatológicos y clínicos pueden sub clasificar el tipo y etapa de muchos casos de cáncer de conseguir población más homogénea para el análisis.
Trate de disminuir los resultados falsos positivos y negativos mediante la realización de los estudios en una muestra grande, con estratificación por edad, sexo, hábito de alimentación, estilo de vida y el origen étnico.
los estudios que examinan los efectos combinados de diferentes polimorfismos Bax o diferentes polimorfismos de genes relacionados Bax (por ejemplo, Bcl2) debe ser investigado.
El papel de los factores ambientales y la interacción epistatic no se consideran en este estudio debido a la falta de información en los artículos publicados originales que necesitan para explorar más a fondo para sacar conclusiones más fiables.
Conclusión
este estudio revela ninguna asociación significativa de Bax -248GA SNP al riesgo de cáncer como se evidencia a partir de todos los modelos genéticos. Por otra parte, sería esclarecedor para ampliar la investigación a una gama más amplia de las poblaciones humanas incluyendo diferentes tipos de cáncer que pueden conducir a una mejor comprensión y completa de la asociación entre este polimorfismo y la susceptibilidad al cáncer. La capacidad de poner en práctica la participación de este SNP hacia la etiología del cáncer y la probabilidad de un individuo de desarrollar cáncer considerando la recomendación propuesta ayudará en el futuro. Esto puede traducirse más en investigación básica o la práctica clínica para salvar las vidas humanas.
Apoyo a la Información
Lista de verificación S1. Lista de comprobación
PRISMA.
doi: 10.1371 /journal.pone.0077534.s001 gratis (DOC)
Figura S1.
Diagrama de bosque (A) y gráfico en embudo (B) de Bax-248g & gt; Un polimorfismo en asociación con el cáncer después de la omisión de A. Saxena et al. estudio (2002). En
diagrama de bosque (A), las plazas y las líneas horizontales corresponden a las proporciones de estudio específicos ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC), respectivamente. El área de los cuadrados refleja el peso específico de estudio (inversa de la varianza). El diamante representa las RUP agrupados e IC del 95%. En el gráfico en embudo (B), cada punto representa un estudio separado. El OR fue trazada en una escala logarítmica en contra de la precisión (el recíproco de la SE) de cada estudio
doi:. 10.1371 /journal.pone.0077534.s002 gratis (TIF)
figura S2.
Diagrama de bosque (A) y gráfico en embudo (B) de Bax-248g & gt; Un polimorfismo en asociación con el cáncer después de la omisión de J. Starczynski et al. estudio (2005). En
diagrama de bosque (A), las plazas y las líneas horizontales corresponden a las proporciones de estudio específicos ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC), respectivamente. El área de los cuadrados refleja el peso específico de estudio (inversa de la varianza). El diamante representa las RUP agrupados e IC del 95%. En el gráfico en embudo (B), cada punto representa un estudio separado. El OR fue trazada en una escala logarítmica en contra de la precisión (el recíproco de la SE) de cada estudio
doi:. 10.1371 /journal.pone.0077534.s003 gratis (TIF)
Figura S3.
Diagrama de bosque (A) y gráfico en embudo (B) de Bax-248g & gt; Un polimorfismo en asociación con el cáncer después de la omisión de A. Skogsberg et al. estudio (2006). En
diagrama de bosque (A), las plazas y las líneas horizontales corresponden a las proporciones de estudio específicos ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC), respectivamente. El área de los cuadrados refleja el peso específico de estudio (inversa de la varianza). El diamante representa las RUP agrupados e IC del 95%. En el gráfico en embudo (B), cada punto representa un estudio separado. El OR fue trazada en una escala logarítmica en contra de la precisión (el recíproco de la SE) de cada estudio
doi:. 10.1371 /journal.pone.0077534.s004 gratis (TIF)
figura S4.
Diagrama de bosque (A) y gráfico en embudo (B) de Bax-248g & gt; Un polimorfismo en asociación con el cáncer después de la omisión de H. Nuckel et al. estudio (2006). En
diagrama de bosque (A), las plazas y las líneas horizontales corresponden a las proporciones de estudio específicos ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC), respectivamente. El área de los cuadrados refleja el peso específico de estudio (inversa de la varianza). El diamante representa las RUP agrupados e IC del 95%. En el gráfico en embudo (B), cada punto representa un estudio separado. El OR fue trazada en una escala logarítmica en contra de la precisión (el recíproco de la SE) de cada estudio
doi:. 10.1371 /journal.pone.0077534.s005 gratis (TIF)
Figura S5.
Diagrama de bosque (A) y gráfico en embudo (B) de Bax-248g & gt; Un polimorfismo en asociación con el cáncer después de la omisión de K. Chen et al. estudio (2007). En
diagrama de bosque (A), las plazas y las líneas horizontales corresponden a las proporciones de estudio específicos ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC), respectivamente. El área de los cuadrados refleja el peso específico de estudio (inversa de la varianza). El diamante representa las RUP agrupados e IC del 95%. En el gráfico en embudo (B), cada punto representa un estudio separado. El OR fue trazada en una escala logarítmica en contra de la precisión (el recíproco de la SE) de cada estudio
doi:. 10.1371 /journal.pone.0077534.s006 gratis (TIF)
Figura S6.