Extracto
El desajuste de reparación del ADN (MMR) enzimas de reparación de errores en el ADN que se producen durante el metabolismo normal del ADN o son inducidos por ciertas exposiciones cáncer-contribuyente. Se evaluó la asociación entre el 10 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) en 5 genes MMR y el riesgo de cáncer de esófago en los sudafricanos. Antes de la determinación del genotipo, SNPs fueron seleccionados de la base de datos HapMap, basado en sus significativamente diferentes distribuciones genotípicas entre las poblaciones de ascendencia europea y cuatro poblaciones HapMap de origen africano. En el grupo de ascendencia mixta, el
MSH3
rs26279 G /G frente a A /A o A /G genotipo se asoció positivamente con el cáncer (OR = 2,71; IC del 95%: 1,34 a 5,50). No se observaron asociaciones similares para
PMS1
rs5742938 (GG en comparación con AA o AG: OR = 1,73; IC del 95%: 1,07 a 2,79) y
rs28756991 MLH3 gratis (AA o AG frente GG: O = 2,07; IC del 95%: 1.4 a 4.12). En los individuos negros, sin embargo, no se observó ninguna asociación entre la MMR polymorhisms y el riesgo de cáncer en el análisis de los SNP. Las interacciones entre los genes MMR se calculan utilizando el enfoque de reducción de dimensionalidad multifactorial-basado en modelos, que mostró una interacción genética significativa entre los SNPs en
MSH2, MSH3
y
PMS1
genes en Negro y de linaje mixto los sujetos, respectivamente. Los datos también implica que la patogénesis de los polimorfismos comunes en los genes MMR está influenciado por la exposición al humo de tabaco. En conclusión, nuestros resultados sugieren que los polimorfismos comunes en los genes MMR y /o sus efectos combinados podrían estar implicados en la etiología del cáncer de esófago
Visto:. Vogelsang M, Wang Y, N Veber, Mwapagha LM, Parker MI (2012) los efectos acumulativos de polimorfismos en los genes de reparación del ADN y de falta de coincidencia del consumo de tabaco en el riesgo de cáncer del esófago. PLoS ONE 7 (5): e36962. doi: 10.1371 /journal.pone.0036962
Editor: Rui Medeiros, IPO, - Inst Puerto Oncología, Portugal
Recibido: 4 Enero, 2012; Aceptado: April 11, 2012; Publicado: 18 de mayo de 2012
Derechos de Autor © 2012 Vogelsang et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este trabajo fue apoyada por la Investigación de Sudáfrica Sillas iniciativa del Departamento de Ciencia y Tecnología y la Fundación Nacional de Investigación, el Centro Internacional de Ingeniería genética y Biotecnología (CIGB), el MRC África del Sur y la Universidad de Ciudad del Cabo. MV es un receptor de una beca postdoctoral ICGEB. Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
de acuerdo con la base de datos GLOBOCAN 2008 (http://globocan.iarc.fr) cáncer de esófago es el 8
º cáncer más común en todo el mundo y la sexta causa más común de muerte por cáncer en el mundo, con más del 95 por ciento de los casos y las muertes ocurren en los países en desarrollo. Las tasas de incidencia más altas se observaron la población Negro en el sur de África y Asia del Este, con 16,3 y 14,2 casos por cada 100.000 habitantes, respectivamente, en contraste con América Central, África Occidental y Central, donde se reportaron 1,4, 1,2 y 1,1 casos por 100.000, respectivamente . El último informe del Registro Nacional del Cáncer de Sudáfrica confirma esta elevadas tasas de incidencia entre los varones ascendencia negros y mujeres con 8,0 y 4,5 casos por 100.000, respectivamente, así como entre los varones ascendencia mixta y hembras con 10,4 y 4,4 casos por 100.000 habitantes, respectivamente [1]. se observan en más de 95% de todos los casos de cáncer de esófago, con OSCC ser el tipo más predominante en África y China [2], [3 - Los principales tipos histológicos de cáncer de esófago - carcinoma de células escamosas (COCE) y adenocarcinoma (OAC) ].
numerosas alteraciones en ciertos genes clave están vinculados con los riesgos alterados para desarrollar cáncer de esófago [4], [5]. Estos genes están involucrados principalmente en el mantenimiento y reparación del ADN, alcohol, ácido fólico y el metabolismo carcinógeno, la regulación del ciclo celular y la apoptosis. Sin embargo, sólo unos pocos genes putativos se han mostrado de forma consistente que se correlaciona con la susceptibilidad a enfermedades, incluyendo
ALDH2
,
CYP1A1
y
MTHFR
(revisado en Hiyama
y col
. [5]). Esto sugiere que hay más probable factores adicionales antecedentes genéticos y las interacciones que contribuyen a la patogénesis del esófago [4]. Curiosamente, de más de 100 estudios de asociación genética llevaron a cabo hasta la fecha, solamente Liu
et al.
[6] estudio se ha centrado en los genes altamente polimórficos que participan en la vía de reparación de apareamientos erróneos del ADN y su papel en la patogénesis de esófago. También se han llevado a cabo varios estudios de asociación de genoma completo (GWAS) en diferentes poblaciones, y el estudio de la población europea informado de la asociación en el gen de reparación del ADN
HEL308
[7], [8], [9]. Por otra parte, se informó de genes MMR y sus polimorfismos de contribuir al riesgo de desarrollar cáncer de pulmón o cáncer de cabeza y cuello; ambos tipos de cáncer comparten etiología similar al cáncer de esófago [10], [11], [12], [13], [14].
Las alteraciones genéticas o epigenéticas en los genes MMR pueden afectar total o parcialmente la eficiencia MMR y por lo tanto conferir un aumento en la acumulación de errores de replicación (RER) en importantes genes del cáncer de regulación, que finalmente llevan a la carcinogénesis [15]. La pérdida de actividad de reparación de genes se manifiesta en un fenotipo de inestabilidad de microsatélites (MSI). Los estudios que investigan las alteraciones de microsatélites generalizados en el cáncer esofágico han detectado bajos niveles de MSI (MSI-L; donde se altera al menos un locus de microsatélites) en el 16-67% de los adenocarcinomas, mientras que 2-60% de los tumores de carcinoma de células escamosas eran MSI-L positiva, con las más altas frecuencias de MSI observado en poblaciones de alta incidencia, lo que indica que la MMR podría estar implicada en la patogénesis del esófago [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22], [23], [24], [25], [26], [27], [28], [29].
Estos informes nos llevó a investigar las variantes comunes en los genes MMR y su papel en la susceptibilidad a la del esófago carcinoma de células escamosas en una población de alto riesgo. Se realizó un estudio de casos y controles en dos grupos étnicos distintos de los africanos del sur, donde hemos examinado las posibles asociaciones entre los 10 polimorfismos en genes MMR 5 (
MLH1
,
MLH3
,
PMS1
,
MSH2
y
MSH3
) y el cáncer de esófago. Por otra parte, las interacciones SNP-SNP, así como las interacciones con el medio SNP fueron investigados para examinar una mayor participación de sistema de MMR en OC.
Resultados
de casos y controles de un solo SNP Análisis
las características de los dos grupos, de linaje mixto Negro y se proporcionan en la Tabla 1. en los africanos negros, los casos y los controles fueron similares en términos de edad (
P = 0,109)
y los antecedentes familiares de cáncer (
P = 0,920
). En el grupo de ascendencia mixta, casos en comparación con los controles eran más propensos a ser varones, humo y beber alcohol (
P Hotel & lt; 0,0001 para todos) y no hubo diferencias significativas en la distribución por edad (
P
= 0,472) entre los casos de cáncer y controles sin cáncer (Tabla 1). Una combinación de los hábitos de fumar y beber aumenta el riesgo de cáncer de esófago 5,46 veces en Negro y 19,06-armario en poblaciones ascendencia mixta (
P Hotel & lt; 0,0001 para cada población; Tabla 2).
Genotipo y frecuencias de alelos menores de SNPs se muestran en la Tabla S1. Para rs26279 polimorfismo (
MSH3
), el menor alelo G se produjeron con una frecuencia de 32% en los casos frente al 38% en los controles en el grupo de linaje mixto (
P = 0,044
). El alelo G del polimorfismo rs5742938 (
PMS1
) tenía una frecuencia de 48% en los casos y el 57% en los controles (
P
= 0,007) en el grupo de ascendencia mixta. El menor alelo A del rs28756991 (
MLH3
) polimorfismo ocurrió en el 4% de linaje mixto controla frente a 9% en los casos de ascendencia mixta (
P
= 0,001). No se observaron diferencias entre los casos y controles para Black polimorfismos analizados. distribuciones alélicas en los controles negros estaban en buena concordancia con los de las poblaciones LWK o HapMap YRI. Se encontró que los polimorfismos estar en equilibrio de Hardy-Weinberg (
P Hotel & gt; 0,05) al examinar los controles de ascendencia mixta Negro y, por separado. Durante diez SNPs en estudio, más del 99% de las muestras se genotipo con éxito. Se utilizó el análisis de regresión logística para examinar la asociación entre los polimorfismos en genes MMR y patogenia del esófago antes y después de ajustar por edad, sexo, lugar de nacimiento, hábitos de vida y la historia familiar de cáncer. Ajustada odds ratios se representan en la Tabla 3. Los modelos dominantes y recesivos de alelos menores se consideraron para cada SNP.
En el grupo mixto ascendencia, el
MSH3
rs26279G /G frente A /A o A /G genotipo se asoció positivamente con el cáncer (OR ajustada = 2,71;
P = 5,71
× 10
-
3). No se observaron asociaciones similares para
PMS1
rs5742938 (GG en comparación con AA o AG: ajdusted OR = 1,73;
P = 0,027
) y
rs28756991 MLH3 gratis (AA o AG frente GG : OR ajustada = 2,07;
P = 0,038
). Se encontró que las tres asociaciones siguieron siendo significativas después de la corrección de la
P-valores
para múltiples pruebas, utilizando el método de Benjamini-Hochberg (rs26279:
P
corregida = 0,027; rs5742938:
P
corregida = 0,036; y rs28756991:
P
corregida = 0,027; [véase Materiales y Métodos para más detalles]). En los sudafricanos negros, se observó una asociación marginal (
P = 0,086
) para
MSH3
rs1428030 polimorfismo (GG o AG contra AA) con un aumento de 1,36 veces en el riesgo de cáncer después de ajustar por otros factores de confusión. También hubo evidencia de lo que implica un riesgo reducido de cáncer, con una significación marginal, por
MLH3
rs2875991 "A" alelo bajo el modelo genético recesivo (OR ajustado: 0,14;
P = 0,078
). Sin embargo, después de corregir las múltiples pruebas, se perdió importancia para ambas asociaciones. Además, las asociaciones de un solo SNP también se investigaron sólo entre los casos de carcinoma de células escamosas, con exclusión de los adenocarcinomas, sin embargo anaysis no proporcionó resultados adicionales o más significativas (Tabla S2).
Análisis de haplotipos
haplotipo se realizó un análisis para evaluar aún más el papel de los genes MMR en la etiología del cáncer. Como se muestra en la Tabla 4, tres SNPs en
MSH3 gratis (rs1805355, rs1428030 y rs26279) y dos SNPs en
PMS1 gratis (rs572938 y rs13404927) se utilizaron para generar haplotipos. La frecuencia de A
rs1805355-G
rs1428030-G
haplotipo rs26279 de
MSH3
se encontró que era significativamente mayor en los controles negros (6,8%) que en los casos de cáncer negro (3,6% ). Sin embargo, la asociación inversa observada fue sólo marginalmente significativa después de la corrección de pruebas múltiples (
P
1000 = 0,049). En el grupo de ascendencia mixta, G
rs5742938-G
haplotipo rs13404927 de
PMS1
se asoció con 1.61- (IC del 95%: 01.22 a 02.13) aumento en el riesgo de OC, en comparación con la referencia A
rs5742938-G
haplotipo rs13404927 y permaneció significativa después de la corrección de pruebas múltiples (
P
1000 = 0,011). Observado
PMS1
haplotipo efecto se debe enteramente a la asociación de los
PMS1
G
alelo rs5742938 observó en el único análisis de SNP, y ningún aumento de significación se logra mediante la inclusión de la variante rs13404927. No hubo asociación entre el haplotipo de tres marcadores de
MSH2 gratis (rs17217772, rs3771280 y rs10188090) y el riesgo de OC en cualquiera de los dos grupos étnicos (datos no mostrados).
Análisis de Interacción gen-gen
los posibles efectos acumulativos de los SNPs se evaluaron con el enfoque MB-MDR (ver material y Métodos), ya que es bien sabido que MMR enzimas funcionan como heterodímeros. Dos, tres y cuatro para modelos de interacción fueron considerados y los resultados se muestran en la Tabla 5. Los datos revelaron mejor interacción genética de SNPs en
MSH2 genes
(rs3771280),
MSH3
genes (rs1428030 ) y
PMS1
gen (rs13404927 y rs5742938), que fue fuertemente asociada con un mayor riesgo de cáncer de esófago en sujetos de raza negra. La frecuencia de los cuatro locus genotipo CC
rs3771280 /AG
rs1428030 /GG
rs13404927 /GG
5742938 fue significativamente mayor en los casos (18,6%) en comparación con los controles (9,3%). En el grupo de ascendencia mixta, se predijo tres interacciones de múltiples genes significativos. Una interacción triple orden
MSH2 gratis (rs3771280) *
PMS1 gratis (rs13404927) *
MSH3 gratis (rs26279) y una interacción de cuarto orden, que incluía el polimorfismo rs13320360 en
MLH1
gen, el polimorfismo rs10188090 en
MSH2
genes y los polimorfismos rs13404927 y rs5742938 en
PMS1
gen, fueron los más significativos y, por tanto, se consideran como los mejores modelos. El genotipo de múltiples locus CT
rs3771280-GG
rs13404927-AG
rs26279 está fuertemente asociada con un menor riesgo para el cáncer (
P = 0,0028
), mientras que el genotipo TT /AA /GG /GG de la interacción
MLH1 gratis (rs13320360) *
MSH2 gratis (rs10188090) *
PMS1 gratis (rs13404927) *
PMS1 gratis (rs5742938) fue de más de 2 veces mayor en pacientes con cáncer que en los individuos sanos (Tabla 5). Los tres interacciones mencionadas anteriormente, siendo significativas después del año 1000 prueba de permutaciones al azar.
Gene-medio ambiente
Para investigar más a fondo el papel de los polimorfismos de MMR en relación con los factores ambientales, los individuos fueron estratificados por el hábito de fumar tabaco. Tres polimorfismos, que mostraron asociación con el riesgo de cáncer de esófago en un análisis de un solo SNP (véase la Tabla 3) fueron investigados en el análisis estratificado basado en fumar. En el grupo de ascendencia mixta, polimorfismos
MSH3
rs26279 y
MLH3
rs28756991 se mantuvo asociado a la enfermedad en los fumadores (
P
rs26279 = 0,004, y
P
rs28756991 = 0,011), en contraste con los no fumadores, donde se observaron asociaciones significativas (Tabla 6). Además, tres interacciones más importantes entre genes eran investigar después de estratificar las poblaciones de la exposición al humo del tabaco. Asociación de los cuatro locus genotipo CC
rs3771280 /AG
rs1428030 /GG
rs13404927 /GG
5742938, identificada en sujetos de raza negra, se asoció con OC en los fumadores de tabaco (
P
= 0,007), mientras que la importancia de la asociación del TT
rs13320360 /AA
rs10188090 /GG
rs13404927 /GG
se perdió el genotipo rs5742938 con OC en sujetos ascendencia mixta (
P
= 0,054). La interacción
MSH2 gratis (rs3771280) *
PMS1 gratis (rs13404927) *
MSH3 gratis (rs26279) sólo fue significativa en los fumadores (
P
= 0,004) en el grupo de linaje mixto (Tabla 6).
Análisis funcional
Para evaluar la naturaleza funcional de SNPs OC-asociado, que fueron identificados en este estudio,
MSH3
y
PMS1
niveles de mRNA fueron examinados en biopsias esofágicas normales de 47 pacientes CCCA en correlación con rs26279 y genotipos rs5742938, respectivamente. No se observaron efectos significativos de los genotipos rs26279 y rs5742938 en
MSH3
y
PMS1
niveles de expresión, respectivamente, fueron observados (
P
rs26279 = 0,340 y
P
rs5742938 = 0,954) (Fig. 1). Además, los efectos funcionales y estructurales de sustituciones de aminoácidos Ala1045Thr (rs26279) en MSH3 y Arg797His (rs28756991) en MLH3 se prevé utilizar algoritmos bioinformáticos SIFT, PolyPhen, y alinear-GVGD. herramientas bioinformáticas predecir si el cambio de aminoácido tendrá un impacto neutral o perjudicial de la proteína, en base a información de la alineación múltiple y características biofísicas de los aminoácidos. conservaciones secuencia evolutiva se preparan a partir de 26 MSH3 y 19 secuencias de proteínas Mlh3 de diferentes especies y sirvieron como insumo para todos los algoritmos.
in silico
algoritmo Alinear-GVGD predijo efecto neutro para la variante Arg797His (rs28756991), mientras que examinan y PolyPhen predicho que para tener un impacto perjudicial sobre las proteínas. Los tres enfoques computacionales fueron consistentes en la predicción de la naturaleza funcional neutro de cambio de aminoácido Ala1045Thr (Tabla S3).
Los niveles de expresión (barras muestran las medianas de grupo) se determinaron en muestras de tejido normal de los pacientes de ascendencia CCCA mixtos. Todos los valores están normalizados a la expresión de GAPDH. Se utilizó la prueba Kurskal-Wallis para evaluar las diferencias en los niveles de expresión entre los grupos. La mediana de los valores de los genotipos rs26279 son: 0,012 (AA), 0,012 (AG) y 0,0081 (GG). La mediana de los valores de los genotipos rs5742938 son:. 0,0074 (AA), 0.0094 (AG) y 0.0071 (GG) guía empresas
Discusión
La carcinogénesis es un proceso de múltiples etapas que implica factores de riesgo genéticos y ambientales. polimorfismos comunes en muchos genes, incluyendo los implicados en la reparación del ADN, se han demostrado para predisponer a los individuos a la enfermedad. alteraciones genéticas en las regiones microsatélites, un sello distintivo de un sistema de reparación de genes de ADN defectuoso, se han reportado en los cánceres esofágicos. A pesar de esto, los polimorfismos comunes en los genes MMR rara vez han sido estudiados en relación con la susceptibilidad COCE.
Para estimar el riesgo conferido por COCE polimorfismos comunes en los genes MMR, se analizaron 10 SNPs dentro de los 5 genes de la vía MMR en la alta incidencia poblaciones de África del Sur. A la luz de la hipótesis de enfermedad común /variante común (CD /CV), se seleccionaron los SNP sobre la base de sus diferentes distribuciones genotípicas entre las poblaciones no africanas y africanos. Estudios recientes también indican que la interacción entre múltiples polimorfismos juega un papel clave en la carcinogénesis; Por lo tanto, hemos analizado SNP-SNP, así como las interacciones SNP-medio ambiente en asociación con OC.
En este estudio, se identificaron tres polimorfismos comunes que se asociaron con COCE en individuos ascendencia mixta. En primer lugar, el genotipo GG-polimorfismo de
MSH3
rs26279 se asoció positivamente con la enfermedad. El polimorfismo
MSH3
rs26279 se ha examinado antes, sin embargo, con resultados parcialmente contradictorios entre los estudios. Conde
et al
. [30] observó ninguna asociación con el riesgo de cáncer de mama a nivel individual-SNP en las mujeres caucásicas. Sin embargo, el análisis de la interacción gen-gen en el mismo estudio mostró que el multi-locus genotipo AA /TC en
MSH3
rs26279 * M
SH6
rs1042821 interacción se asoció con una disminución del riesgo de tumorigénesis, lo que sugiere que los cambios rs26279 afinidad de proteína MSH3 de heterodimerize con MSH6. Por otra parte, Liu
et al.
[6] encontró ninguna asociación entre rs26279 y adenocarcinoma esofágico en la población caucásica, mientras que un estudio realizado por Hirata
et al
. [31] informa de que los genotipos GG o AG de
MSH3
polimorfismo rs26279 podrían ser un factor de riesgo para el cáncer de próstata esporádico. Por otra parte, la baja regulación de MSH3 se encontró para inducir un fenotipo MSI-L en el cáncer colorrectal esporádico (revisado por Boland y Goel, 2010 [32]). Es posible que un mecanismo similar es responsable de observado con frecuencia fenotipo MSI-L en los casos CCCA [23]. En nuestro esfuerzo para evaluar la naturaleza funcional de SNP identificados se realizó un análisis de la expresión de
MSH3 Hoteles en muestras de biopsias de pacientes y no detectó ninguna correlación entre genotipos rs26279 y los niveles de expresión de
MSH3
gen. Por otra parte,
In silico
algoritmos predijeron efecto neutro sobre la función y la estructura de las proteínas.
En segundo lugar, se observó que un genotipo homocigoto para el alelo G-en el
PMS1
rs5742938 polimorfismo se asocia con el cáncer en los sudafricanos mezclados-ascendencia. Este hallazgo fue confirmado por el análisis de haplotipos en sujetos mixtos-ascendencia, donde haplotipo G
rs5742938-G
rs13404927 de
PMS1
aumenta el riesgo de cáncer. El cambio intrónica C-21 + 639G & gt; A (rs5742938) no se ha identificado en asociación con cualquier tipo de cáncer antes; sin embargo, se predijo por un algoritmo computacional UTRScan como funcionalmente no significativa [33]. De acuerdo con nuestro análisis de la expresión de la biopsia, los genotipos de rs5742938 no afectan a la
PMS1
los niveles de expresión de ARNm. En la literatura actual el papel de los complejos de MLH1-PMS1 en reparación de genes sigue siendo enigmática.
Por último, tiene una o dos copias de un alelo A-en
MLH3
polimorfismo rs28756991 se asoció con un mayor riesgo para el desarrollo de CCCA. Este hallazgo también fue apoyada por i
n silico
seleccionar y algoritmos PolyPhen, que predijo que Arg797His cambio de aminoácidos (rs28756991) tiene un impacto potencialmente perjudicial sobre la estructura y función de la proteína MLH3. Este es el primer estudio de informes sobre
MLH3
rs28756991 polimorfismo (Arg797His) y su relación con el riesgo de cáncer; Sin embargo, otros polimorfismos funcionales en el
MLH3
de genes se ha demostrado previamente para confieren susceptibilidad al cáncer. Michiels
et al
. [34] han demostrado que SNP
MLH3
rs175080 (Leu844Pro) se asoció con un mayor riesgo de cáncer de pulmón en los caucásicos europeos. Un hallazgo similar fue reportado por Conde
et al
. [30] donde la interacción entre los
MLH3
rs175080 y
MSH4
rs5745325 se asoció con un mayor riesgo de cáncer de mama en una población portuguesa. Tomados en conjunto, estos informes apoyan nuestra conclusión de que
MLH3
de hecho podrían estar involucrados en el desarrollo de diversos tipos de cánceres esporádicos, incluyendo CCCA. MLH3 es la tercera proteína que se une a MLH1, un jugador clave en el aparato de MMR, montaje, por lo tanto ineficiente de los complejos MLH1-MLH3 podría dar lugar a que penetran eventos oncogénicos bajas
Además., Importancia para las tres asociaciones en el Mixta -ancestry grupo persistió después de la corrección de múltiples ensayos y los poderes para detectar los cambios observados fueron 90,47% (
MSH3
rs26279), 84,88% (
PMS1
rs5742938) y 86.71% (
MLH3
rs28756991).
Pero no hemos podido confirmar asociaciones similares en negros sudafricanos en el único nivel SNP. La razón de la falta de asociaciones significativas en estos individuos probablemente se encuentra en los patrones diferentes de desequilibrio de ligamiento (LD) entre los dos grupos étnicos, en lugar de diferentes etiologías de CCCA. poblaciones africanas son muy probablemente las poblaciones más antiguas del mundo, desde África se cree que es el continente de origen de los humanos modernos. En poblaciones de más edad, los tamaños de bloques de LD son generalmente más pequeños, debido a más eventos de recombinación [35], [36]. Por lo tanto, podemos especular que los alelos del marcador, que se identificaron en el grupo de linaje mixto (esto es una población joven que surge de la mezcla de los no africanos con poblaciones indígenas de África en el siglo 17), están en LD con los alelos causantes de enfermedades de
MSH3
,
PMS1
y
Mlh3
genes, mientras que en los sujetos Negro Ascendientes (es decir, los representantes de la población de edad en África) los alelos investigados podrían no estar en LD con los alelos de la enfermedad. Sin embargo, se necesitan estudios de asociación en otros grupos étnicos en apoyo de esta idea. Por otra parte, las poblaciones de origen africano presentan una oportunidad para identificar los verdaderos enfermedad alelos, que son responsables del fenotipo de la enfermedad, por multa de cartografía de las regiones genéticas que son identificados como en las poblaciones africanas no [37] enfermedades asociadas.
Para investigar más a fondo la participación del mecanismo de MMR en el desarrollo COCE, exploramos posibles interacciones gen-gen por MB-MDR, un método de reducción de la dimensión propuesto por la calle
et al
. [38]. En ambos grupos, análisis de interacción produjo varias interacciones estadísticamente significativas. En los individuos negros, un potencial de interacción de cuatro orden
MSH2 gratis (rs3771280) *
MSH3 gratis (rs1428030) *
PMS1 gratis (rs13404927) *
PMS1
(rs5742938) demostró una fuerte asociación con un mayor riesgo de malignidad, mientras que la interacción
MSH2 gratis (rs3771280) *
PMS1 gratis (rs13404927) *
MSH3 gratis (rs26279) disminuyó significativamente el riesgo para el cáncer en sujetos ascendencia mixta (Tabla 5). Curiosamente, los resultados son consistentes entre los dos grupos, ya que se encontraron interacciones más significativamente enfermedad-asociadas entre los SNPs que se encuentra en
MSH2
,
MSH3 Opiniones y
PMS1
genes. En base a los datos y el conocimiento de que la actividad MMR se consigue por heterodímeros de proteína, se podría argumentar que los SNPs, que afecta a la funcionalidad del complejo ternario entre heterodímeros MSH2, MLH1 y MSH3-PMS1, son un acontecimiento importante en el desarrollo CCCA. También creemos que podría haber muchas interacciones genéticas que afectan el montaje y la funcionalidad de otros MMR-heterodímeros y, por tanto, éstos deben ser identificados.
MLH3 gratis (rs28756991) *
fue encontrado MSH2 gratis (rs17217772) la interacción de reducir el riesgo de CCCA en la población de linaje mixto (Tabla 5). Por otra parte, las interacciones gen-gen similares de genes MMR también han sido reportados por Conde
et al.
[30] en asociación con la susceptibilidad al cáncer de mama.
Nuestros datos también implica que patogénesis de polimorfismos comunes en los genes MMR están influenciados por la exposición ambiental, especialmente el consumo de tabaco. Resultados similares han sido reportados antes en otros tipos de cáncer, que comparten etiología común de cáncer de esófago. Hirao et al. [11] han demostrado asociación entre cáncer de pulmón y la pérdida de heterozigosidad (LOH) a
MLH1
locus, con una mayor prevalencia de LOH en pacientes fumadores. Varios estudios también sugieren que el
MLH1
polimorfismo rs1800734 y el tabaco la exposición al humo tiene un papel en la tumorigénesis del cáncer de pulmón [12], [13]. En nuestro estudio, los polimorfismos rs26279 (
MSH3
) y rs2875661 (
MLH3
) parecen estar implicados en el cáncer relacionado con el tabaquismo, ya que sólo eran patógenos entre los individuos fumadores en contraste con los no fumadores , donde no se observó asociación significativa (Tabla 6). Los poderes para detectar los cambios observados en los casos de tabaco fumadores del grupo de ascendencia mixta se mantuvo suficiente para
MSH3
rs26279 (97,53%) y
MLH3
rs28756991 (85,05%), mientras que el límite de asociación
PMS1
rs5742938 con cáncer careció de los elementos en el 64,06%. Somos conscientes de que sólo tan sólo 16 casos ascendencia mixta de no fumadores estaban presentes en el estudio, lo que reduce considerablemente el poder de detectar los cambios observados en los no fumadores. Por lo tanto, para apoyar aún más los resultados obtenidos del grupo de linaje mixto, el análisis de la estratificación se realizó en el grupo de linaje Negro, donde se inscribieron más de fumar y los no fumadores. La interacción de cuatro identificado por fin MB-MDR está fuertemente asociada con el cáncer en individuos fumadores Negro de la ascendencia, en contraste con los individuos no fumadores de la misma etnia, donde se observó ninguna asociación (Tabla 6). Esta tendencia sugiere que las proteínas MMR defectuosos - su actividad podría estar comprometida por polimorfismos en genes MMR - podrían ser ineficaz en la reparación de una mayor cantidad de aductos de ADN inducida por el tabaco y /o de señalización para la apoptosis en tales eventos de error de ADN. Nuestros resultados apoyan los datos obtenidos por Dodd
et al
. [39], donde se informó de que los genes implicados en el metabolismo de las nitrosaminas y los procesos de reparación del ADN, incluyendo MMR, se dysregulated en el carcinoma nasofaríngeo (NPC). Estos autores propusieron una interacción entre la exposición exógena a las fuentes de nitrosaminas (tales como la dieta, el humo del tabaco y otros), y la capacidad de metabolizar de manera eficiente nitrosaminas o reparar el daño del ADN inducido por subproductos reactivos del metabolismo de nitrosamina en la etiología de la NPC. Nitrosamina 4- (metilnitrosamino) -1- (3-piridil) -1-butanona (NNK) es un potente carcinógeno contenida en el humo del cigarrillo y fue mostrado para inducir daño en el ADN celular [40], [41], [42]. Un estudio realizado por Hou
et al
. [43] informó de que Bcl2 mejora la frecuencia de mutaciones NNK inducida por la eficiencia MMR abajo de la regulación a través de la interrupción del complejo MSH2-MSH6. A pesar de ello, se observan las interacciones genético-ambientales asociados con COCE justifican todavía su confirmación en un estudio independiente más grande.
Además, se confirmó de aditivo (en el grupo Negro) para sinérgica (en el grupo de linaje mixto) Efecto riesgo de tabaco el humo y el alcohol de combinación en la carcinogénesis como se informó anteriormente por otros estudios [44], [45], [46].
en conclusión, este estudio proporciona evidencia de que los polimorfismos comunes en los genes MMR, de hecho están involucrados en el etiología de la CCCA. Los efectos acumulativos de MMR-polimorfismos se muestran más contribuirá en gran medida al desarrollo del cáncer en ambos grupos étnicos. De hecho, nuestros resultados implican que los efectos combinados de los polimorfismos comunes en los genes MMR podrían alterar la susceptibilidad a la CCCA mediante la modulación del efecto de la exposición al humo del tabaco de primera mano.
Materiales y Métodos
Sujetos de estudio
La población de estudio se ha descrito en otra parte [47], [48], [49]. En pocas palabras, un total de 1239 individuos fueron reclutados de la población de linaje mixto y Negro de Sudáfrica. individuos de raza negra (n = 689) eran de habla xhosa sudafricanos (Xhosa que hablan originó a partir de los bantúes que hablan en el sur de África), en su mayoría nacidos en las regiones del Este y Cabo Occidental. Los sujetos que resultan de los matrimonios entre diferentes grupos étnicos, incluyendo los europeos occidentales, los khoisan indígenas, africanos de habla bantú, indonesios y malasios fueron considerados para ser de linaje mixto y eran de Western Cape (n = 471). El estudio consistió en 550 diagnosticado y confirmado histológicamente carcinoma de células escamosas o adenocarcinoma del esófago de los casos, que fueron reclutados entre 2000 y 2010 a partir de Groote Schuur Hospital, Ciudad del Cabo, Western Cape, Sudáfrica. Los casos fueron ya sea de etnia linaje Negro o mixta. No hubo restricciones en los criterios de selección para la edad y el sexo de los casos. Los controles (n = 610) eran individuos sanos sin historia previa de cáncer y fueron reclutados de los mismos grupos de población y áreas geográficas como los casos. Cada sujeto participante fue entrevistado para recoger información sobre las características demográficas (edad, sexo, raza), consumo de tabaco y alcohol y la historia familiar de cáncer. Los sujetos con hábitos actuales o ex fumadores fueron clasificados como fumadores. Los consumidores de alcohol se definen como individuos que consumían más de 40 gramos de alcohol por día. Antecedentes familiares de cáncer se considera positiva para las personas con al menos un familiar de primer grado o dos familiares de segundo grado con cáncer. Se extrajo el ADN de muestras de sangre congeladas usando protocolos estándar. Este estudio fue aprobado por la Universidad de /del Hospital Groote Schuur de Ciudad del Cabo Humano Comité de Ética de la Investigación.