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PLOS ONE: Meta-análisis de microarrays de datos públicas revela firmas genéticas de calcio Recinto tensión en pacientes con cáncer clínicos


Extracto

canales de calcio dependientes de voltaje-gated (VGCCs) están bien documentados que juegan un papel en la proliferación celular, la migración y la apoptosis; sin embargo, si VGCCs regulan el inicio y la progresión del cáncer es todavía bajo investigación. La familia VGCC compone de cinco miembros, que son de tipo L, tipo N, tipo T, tipo R y tipo P /Q. Hasta la fecha, ningún enfoque holístico se ha utilizado para detectar genes de la familia VGCC en diferentes tipos de cáncer. Se analizó la expresión del transcrito de VGCCs en muestras de tejido de cáncer clínicos mediante el acceso a Oncomine (www.oncomine.org), una base de datos de microarrays basado en la web, para llevar a cabo un análisis sistemático. Cada miembro de la VGCCs se examinó en 21 diferentes tipos de cáncer mediante la comparación de la expresión del ARNm en el cáncer a que en el tejido normal. Un estudio previo demostró que la expresión alterada de ARNm en el tejido canceroso puede jugar un papel oncogénico y promover el desarrollo de tumores; Por lo tanto, en las presentes conclusiones, nos centramos sólo en la sobreexpresión de VGCCs en diferentes tipos de cáncer. Este análisis reveló que la bioinformática diferentes subtipos de VGCCs (CACNA1C, CACNA1D, CACNA1B, CACNA1G, y CACNA1I) están implicados en el desarrollo y la progresión de diversos tipos de cáncer y muestran dramático sobre regulación en cáncer de mama. CACNA1F sólo mostró una alta expresión en el cáncer de testículo, mientras que CACNA1A, CACNA1C, y CACNA1D fueron altamente expresado en la mayoría de tipos de cáncer. El presente análisis reveló que VGCCs específicos probablemente juegan un papel esencial en tipos específicos de cáncer. Colectivamente, hemos identificado varios objetivos VGCC y se clasificaron de acuerdo con diferentes subtipos de cáncer de estudios prospectivos sobre los mecanismos subyacentes cancerígenos. Los presentes hallazgos sugieren que VGCCs son posibles objetivos de investigación prospectiva en el tratamiento del cáncer

Visto:. Wang CY, Lai MD, Phan NN, Sun Z, Lin YC (2015) Meta-análisis de microarrays de datos públicas Revela Voltaje firmas de genes de calcio -Gated en pacientes clínicos sobre el cáncer. PLoS ONE 10 (7): e0125766. doi: 10.1371 /journal.pone.0125766

Editor: Jörg D. Hoheisel, Deutsches Krebsforschungszentrum, Alemania

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