Crónica enfermedad > Cáncer > artículos del cáncer > PLOS ONE: Multi-Class La agrupación de los subtipos del cáncer a través de SVM basado en Ensemble de soluciones Pareto óptimas para la identificación de genes marcadores

PLOS ONE: Multi-Class La agrupación de los subtipos del cáncer a través de SVM basado en Ensemble de soluciones Pareto óptimas para la identificación de genes marcadores


Extracto

Con el avance de la tecnología de microarrays, ahora es posible estudiar los perfiles de expresión de miles de genes a través de diferentes condiciones experimentales o muestras de tejido de forma simultánea. conjuntos de datos de microarrays cáncer, organizados como muestras frente a la moda genes, están siendo utilizados para la clasificación de las muestras de tejido en subtipos benignos y malignos o sus. También son útiles para la identificación de posibles marcadores de genes para cada subtipo de cáncer, lo que ayuda en el diagnóstico con éxito de determinados tipos de cáncer. En este artículo, hemos presentado una técnica de clasificación de cáncer sin supervisión basados ​​en la agrupación genética multiobjetivo de las muestras de tejido. En este sentido, una codificación con código real de los centros de los conglomerados se utiliza y la compacidad de clúster y separación están optimizados simultáneamente. El conjunto resultante de soluciones casi óptimas de Pareto contiene una serie de soluciones no dominadas. Un nuevo enfoque para combinar la información de agrupación poseído por las soluciones no dominadas través de la máquina de vectores de soporte se ha propuesto (SVM) clasificador. agrupamiento final se obtiene por consenso entre los agrupamientos producidas por diferentes funciones del kernel. El rendimiento del método de agrupamiento multiobjetivo propuesto ha sido comparada con la de varios otros algoritmos de agrupamiento microarray para tres conjuntos de datos disponibles al público de referencia de cáncer. Por otra parte, se han realizado pruebas de significación estadística para establecer la superioridad estadística de la agrupación método propuesto. Además, los marcadores de genes relevantes han sido identificados utilizando la agrupación resultado producido por el método de agrupamiento propuesto y demostrado visualmente. relaciones biológicas entre los marcadores de genes también se estudian en base a la ontología de genes. Los resultados obtenidos se encontró que prometedor y, posiblemente, pueden tener un impacto importante en la esfera de la clasificación no supervisada de cáncer, así como la identificación de marcadores génicos para múltiples subtipos de cáncer de

Visto:. Mukhopadhyay A, Bandyopadhyay S, T Maulik (2010 ) Multi-Class La agrupación de los subtipos del cáncer a través de SVM basado en Ensemble de soluciones Pareto óptimas para la identificación de genes marcadores. PLoS ONE 5 (11): e13803. doi: 10.1371 /journal.pone.0013803

Editor: Alfons Navarro, Universidad de Barcelona, ​​España

El conocimiento de la salud

¿Por qué yo no la ayuda del cáncer Charities

Youve donó su dinero duramente ganado a una caridad del cánc

Coger el cáncer de piel en sus signos tempranos con un dermatólogo de NYC

La mayoría de las personas son vanos cuando se trata de su p

Los hechos sobre Cancer

Cancer piel se compone de más de 100 enfermedades. Cada tipo

Los hospitales de cáncer, institutos y centros de Bangalore

El cáncer pueden ser tratados con diferentes técnicas de tra

Enfermedades de sentido común

Enfermedad del corazón | Enfermedades artículos | Enfermedad pulmonar | las preguntas más frecuentes de salud | Salud mental | Diabetes | El sentido común de la Salud | Enfermedades comunes | senior Health | Primeros auxilios
Derechos de autor © Crónica enfermedad[www.enfermedad.cc]