Extracto
El cáncer de esófago es el quinto cáncer más comúnmente diagnosticado y la cuarta causa principal de muerte por cáncer en China en 2009 . los factores genéticos pueden desempeñar un papel importante en la carcinogénesis del carcinoma esofágico de células escamosas (CECA). Se realizó un estudio de casos y controles de base hospitalaria para evaluar diez
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El etiquetado de los polimorfismos de nucleótido único (SNP) en el riesgo de CECA. Se reclutaron seiscientos veintinueve CECA casos y 686 controles. Sus genotipos se determinaron utilizando el método de reacción de detección de ligación. En el análisis de locus único, había un límite de diferencias estadísticamente significativas en las frecuencias genotípicas de
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rs1565684 T & gt; C SNP entre los casos y los controles (
p = 0,057
). El
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genotipo rs1565684 CC se asoció con un límite de aumento significativo del riesgo para la CECA (CC
vs
TT:. OR ajustada = 1,77; IC del 95% = 0,97 a 3,21,
p
= 0,063 y CC
vs
TT /TC:. OR ajustada = 1,68, 95% CI = 0,93-3,04,
p = 0,085
). La asociación fue más evidente entre los pacientes de mayor edad y los pacientes que nunca borracho. Después de la corrección de Bonferroni, en todos los modelos de comparación,
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rs1565684 T & gt; C SNP no se asoció con el riesgo de la CECA (
p Hotel & gt; 0,05). Para los otros nueve
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SNPs, después de la corrección de Bonferroni, en todos los modelos de comparación, los nueve SNPs tampoco se asocian con el riesgo de la CECA (
p Hotel & gt; 0,05). Por lo tanto, nueve
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etiquetado SNPs no se asociaron con riesgo de CECA.
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rs1565684 T & gt; C SNP podría desempeñar un papel ligero en CECA etiología. Se requieren estudios adicionales, más grandes y caracterización biológica específica de tejido para confirmar los hallazgos actuales
Visto:. Wang L, Tang W, S, Chen, Sun Y, Y Fan, Shi Y, et al. (2014)
N-acetiltransferasa 2
polimorfismos y el riesgo de cáncer de esófago en una población china. PLoS ONE 9 (2): e87783. doi: 10.1371 /journal.pone.0087783
Editor: Qing Yi-Wei, el Instituto del Cáncer de Duke, Estados Unidos de América
Recibido: 3 Noviembre 2013; Aceptado: 1 Enero 2014; Publicado: 19 Febrero 2014
Derechos de Autor © 2014 Wang et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este estudio fue apoyado en parte por la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (81370001, 81371927, 81101889, 81000028), Jiangsu Fundación de Ciencias Naturales Provincia (BK2010333, BK2011481), Fundación de Desarrollo Social de Zhenjiang (SH2010017), talentos Changzhou jóvenes y la Fundación de Ciencia-Tecnología de Oficina de salud (QN201102), el hospital Popular de afiliados del fondo de la Universidad de Jiangsu (Y200913) y la medicina clínica fondo de desarrollo de la ciencia y la tecnología de la Universidad de Jiangsu (JLY20120004). Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer de esófago fue la cuarta causa principal de muerte por cáncer y el quinto cáncer más comúnmente diagnosticado en china en 2009 [1]. Los factores genéticos, tales como polimorfismos de nucleótido único (SNP), podrían jugar un papel importante en la carcinogénesis del carcinoma esofágico de células escamosas (CECA) [2].
N-acetiltransferasa 2 (NAT2) es una enzima que juega un papel esencial en el metabolismo de diversos carcinógenos potenciales. NAT2 se expresa principalmente en el hígado humano y en el tracto gastrointestinal. El gen
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se encuentra en 8p21.3-23.1 y codifica una proteína de ácido 290-amino, NAT2 [3].
NAT2
es polimórfico, y se pensó que la alteración NAT2 acetilación estado causado por
NAT
polimorfismos disminución de la actividad enzimática y el resultado en ausencia de la eficiencia de desintoxicación, lo que podría conducir a un aumento en la susceptibilidad al cáncer [ ,,,0],4]. Se ha informado de que
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polimorfismos y /o su interacción con el tabaquismo está asociado con varios tipos de tumores malignos.
La variación genética de
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puede dar lugar a diferencias en el tasa de metabolismo arilamina y en consecuencia aumentar el riesgo de cáncer [5]. Los sustratos para NAT2 que están implicados en la carcinogénesis, están representados principalmente por las aminas heterocíclicas y los anillos de hidrocarburos aromáticos policíclicos presentes en la carne cocida o ahumada [6] y el humo del cigarrillo [7].
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variaciones genéticas pueden contribuir al desarrollo de la CECA. En un estudio de casos y controles basado en el hospital, se realizó un análisis de genotipos de cada diez
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etiquetado SNPs en 629 casos y 686 controles CECA en una población china.
Materiales y Métodos
la aprobación ética del protocolo de estudio
el Consejo de la Universidad de Jiangsu (Zhenjiang, china) Revisión aprobó el estudio de casos y controles de base hospitalaria. Hemos cumplido con la Declaración de la Asociación Médica Mundial de Helsinki respecto a la conducta ética de la investigación con sujetos y /o animales humanos. Todos los temas siempre por escrito, el consentimiento informado para ser incluidos en el estudio.
Pacientes y controles
seiscientos veinte y nueve sujetos con cáncer de esófago fueron reclutados consecutivamente desde el Hospital Popular de la Universidad de Jiangsu Affiliated y el hospital Afiliado de la Universidad de Jiangsu (Zhenjiang, china) entre octubre de 2008 y diciembre de 2010. Todos los casos de cáncer de esófago fueron diagnosticados patológicamente CECA. Los criterios de exclusión fueron los pacientes que anteriormente habían tenido cáncer; cualquier cáncer metástasis; radioterapia o quimioterapia. Los controles fueron 686 pacientes sin cáncer y fueron emparejados a los casos con respecto a la edad (± 5 años) y sexo. Ellos fueron reclutados de los dos hospitales mencionados, durante el mismo período de tiempo. La mayor parte de los controles fueron ingresados en los hospitales para el tratamiento del trauma.
entrevistadores entrenados, utilizando un cuestionario previamente probado, cuestionaron cada sujeto personalmente para obtener información sobre los datos demográficos (edad, sexo) y relacionados factores de riesgo (incluyendo el tabaquismo y consumo de alcohol). Después de la entrevista, se recogieron muestras de 2 ml de sangre venosa de cada sujeto. Los individuos que fumaban un cigarrillo al día durante & gt; 1 año, fueron definidos como "fumadores". Los sujetos que consumían más de tres bebidas alcohólicas a la semana durante & gt; 6 meses fueron considerados como "bebedores de alcohol"
Aislamiento de ADN, la selección de los SNP y genotipado mediante la reacción de detección de ligadura
Las muestras de sangre. se recogieron de pacientes utilizando Vacutainers y se transfirieron a tubos alineados con ácido tetra-acético de etilendiamina (EDTA). ADN genómico se aisló de sangre total con el kit de ADN QIAamp Blood Mini (Qiagen, Berlín, Alemania) [8]. Se utilizó una estrategia de marcado basado en bloques para encontrar etiquetado SNPs utilizando el software Haploview 4.2, de acuerdo con la base de datos HapMap (http://www.hapmap.org/, fase II Nov08, en el conjunto de NCBI B36, B126 dbSNP; población: los chinos Han población); alelo menor frecuencia (MAF) ≥0.05, Hardy-Weinberg (HWE)
p
≥0.05 y llame tasa ≥95%) sobre la base de pares de desequilibrio de unión r
2 umbral de 0,8. Diez
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etiquetado SNPs fueron seleccionados de este modo. Las muestras fueron genotipo utilizando el método de reacción de detección de ligadura (LDR), con el apoyo técnico del Shanghai Biowing Biotecnología Aplicada de la empresa [9], [10]. Para el control de calidad, análisis repetidos fueron realizados por 160 (12,17%) muestras seleccionadas al azar con una alta calidad de ADN.
Análisis estadísticos
Las diferencias en la distribución de las características demográficas, variables seleccionadas, y genotipos de
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variantes entre los casos y los controles fueron evaluados utilizando el
χ
2 test. Las asociaciones entre los diez SNPs y riesgo de CECA se estimaron mediante el cálculo de las odds ratio (OR) y sus intervalos de confianza del 95% (IC) mediante análisis de regresión logística para las RUP crudo y ajustado RUP al ajustar por edad, sexo, tabaquismo y el estado bebiendo . El procedimiento de corrección de Bonferroni se aplicó por el número de comparaciones. El HWE fue probado por una bondad del ajuste
χ
2 prueba para comparar las frecuencias genotípicas observadas a las frecuencias esperadas entre los sujetos de control. Todos los análisis estadísticos se realizaron con SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC, EE.UU.).
Resultados
Características de la población estudiada
Características de los casos y controles incluidos en el estudio se resumen en la Tabla 1. los casos y controles emparejados parecían estar adecuadamente en la edad y el sexo como lo sugieren los
χ
2 pruebas. Como se muestra en la Tabla 1, se detectó una diferencia significativa en el consumo de tabaco entre los casos y los controles, y la tasa de beber fue mayor en los pacientes CECA que en los sujetos de control. La información primaria para ocho genotipo SNP estaba en la Tabla 2. Las tasas de concordancia de análisis repetidos fueron del 100%, excepto
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rs11996129 T & gt; C (157/160, 98,13%), rs1565684 T & gt; C (159/160 , 99,38%) y rs1799930 G & gt; A (159/160, 99,38%). MAF en nuestros controles fue similar al MAF para los chinos en la base de datos para todos los SNPs. Las frecuencias genotípicas observadas para estos diez polimorfismos en los controles estaban todos en HWE excepto
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rs4540438 A & gt;. C (
p = 0,015
) (Tabla 2) guía empresas
Asociaciones entre NAT2 etiquetado polimorfismos y el riesgo de la CECA
las distribuciones de genotipo de
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rs1565684 T & gt; C en los casos y los controles se muestran en la Tabla 3. en el único locus análisis, hubo una diferencia estadísticamente significativa marginal en las frecuencias genotípicas de
NAT2
rs1565684 T & gt; C SNP entre los casos y los controles (
p = 0,057
). Cuando el
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genotipo homocigoto TT rs1565684 se utilizó como grupo de referencia, el genotipo CT no se asoció con el riesgo para la CECA (TC vs TT: OR = 1,14, IC del 95% = 0,90 a 1,44,
p = 0,269
); el genotipo CC se asoció con un aumento significativo del riesgo para la CECA (CC vs TT: O IC = 1,95, 95% = 1,08 a 3,51,
p = 0,026
). En el modelo dominante, el
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TC rs1565684 /variantes CC no se asociaron con el riesgo de CECA, en comparación con el
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genotipo rs1565684 TT (TC /CC vs TT: O = CI 1,20, 95% = 0,96 a 1,51,
p = 0,107
). En el modelo recesivo, cuando el
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TT rs1565684 /genotipos de CT se utilizaron como grupo de referencia, el genotipo CC homocigoto se asoció con un mayor riesgo de CECA (CC vs. TT /TC 86%: OR = CI 1,86, 95% = 1,04 a 3,33,
p
= 0,037) (Tabla 3). Después de ajustar por edad, sexo, tabaquismo y el estado de la bebida, el genotipo CC se asoció con un límite de aumento significativo del riesgo para la CECA (CC vs TT: OR ajustada = 1,77; IC del 95% = 0,97 a 3,21,
p
= 0,063 y CC vs TT /TC: OR ajustada = 1,68; IC del 95% = 0,93 a 3,04,
p = 0,085
). Después de la corrección de Bonferroni, en todos los modelos de comparación,
NAT2
rs1565684 T & gt; C SNP no se asoció con el riesgo de la CECA (
p Hotel & gt; 0,05).
Para los otros nueve SNPs, en los análisis de locus único, no hubo diferencia estadísticamente significativa en las frecuencias de genotipo de estos nueve SNPs entre los casos y los controles (
p
& gt; 0,05). Análisis de regresión logística revelaron que ninguno de estos nueve sitios polimórficos se asoció con la susceptibilidad a la CECA. En todos los modelos de comparación, los nueve SNPs no se asociaron con el riesgo de la CECA (
p Hotel & gt; 0,05) antes y después de la corrección de Bonferroni (Tabla 3)
análisis Estratificación de rs1565684 NAT2 T & gt.; polimorfismos C y riesgo de CECA
para evaluar los efectos de
NAT2
rs1565684 T & gt; C genotipos sobre el riesgo de la CECA función de la edad diferente, el sexo, el tabaquismo y el estado de consumo de alcohol; hemos realizado los análisis de estratificación (Tabla 4). Un aumento significativo del riesgo de CECA asociado con el
NAT2
rs1565684 T & gt;. C polimorfismo fue evidente entre los pacientes de edad avanzada y los pacientes que nunca bebieron (Tabla 4) guía empresas
Discusión
En este estudio de casos y controles basado en el hospital de la CECA, se encontró que diez seleccionados SNPs
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etiquetado no se asociaron con el riesgo de CECA después de la corrección de Bonferroni.
NAT2
genotipo rs1565684 CC se asoció con un límite de aumento significativo del riesgo para la CECA. Un aumento significativo del riesgo de CECA asociado con el
NAT2
rs1565684 T & gt; C polimorfismo fue evidente entre los pacientes de edad avanzada y los pacientes que nunca borracho. A lo mejor de nuestro conocimiento, que es el primer caso positivo de
NAT2
rs1565684 T & gt;. C polimorfismo y el riesgo de la CECA
NAT2 está implicada en el metabolismo de una clase importante de agentes carcinógenos del humo del tabaco ( las aminas aromáticas) y
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alelos variantes producen una depuración lenta de aminas aromáticas. En los seres humanos, la
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gen codifica una enzima de fase II que juega un papel esencial en aminas aromáticas, heterocíclicas y hidrazinas metabolismo [11]. NAT2 influye en la detoxificación de carcinógenos de aminas aromáticas y heterocíclicas (que están presentes en el humo del tabaco) por dos vías: la reacción metabolismo puede resultar en la desintoxicación por N-acetilación, o bioactivación por O-acetilación menudo precedido por CYP450 hidroxilación [11].
anteriores informes de casos y controles han arrojado resultados inconsistentes con respecto a la asociación de
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SNPs con cáncer, posiblemente debido al pequeño número de sujetos, lo que comprometería la potencia de los análisis estadísticos de estos estudios. En el esófago, el lento
NAT2
acetylator genotipo era más susceptibles al cáncer de esófago en Japón [12]. Sin embargo, en otro estudio realizado en Taiwán,
NAT2 polimorfismos
no afectó el riesgo de cáncer de esófago, con independencia de los factores ambientales [13]. En un estudio más reciente en la India,
NAT2 genotipos
acetylator no influyen en la susceptibilidad al cáncer de esófago.
NAT2
polimorfismos no modulan de manera significativa el riesgo de cáncer después de la interacción con los factores ambientales, como el tabaco, el alcohol o la exposición ocupacional [14]. En otro estudio en el valle de Cachemira, se encontró que ninguno de los tres
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alelos polimórficos (rs1799929, rs1799930 y rs1799931) que se asociaron independientemente con el riesgo de cánceres esofágicos y gástricos [15], que también estaba de acuerdo con nuestros resultados. meta-análisis también sugirió que
NAT2 genotipos
no están asociados con el cáncer de pulmón [16], cáncer gástrico [17], el cáncer de mama [18], el cáncer de próstata [19] y el cáncer oral [20].
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rs1565684 T & gt; C está en desequilibrio de ligamiento con otra importante SNP
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rs4345600 A & gt; G (NS 12, -9306 A & gt; G) (r
2 = 0,845) en Han población china de Beijing. Aunque
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rs1565684 T & gt; C SNP es funcional utilizando SNP sitios web de predicción de función (http://snpinfo.niehs.nih.gov/snpinfo/snpfunc.htm y http://www.regulomedb.org/) . La etiología de la
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rs1565684 T & gt; C SNP todavía no es bien conocida y necesita más investigación
Este de casos y controles estudio tiene varias limitaciones.. En primer lugar, los pacientes y los controles se inscribieron en los hospitales; sesgo puede haber dado lugar a resultados falsos. En segundo lugar, el poder estadístico de nuestro estudio estaba limitado debido al tamaño de la muestra moderada y ausencia de una cohorte de validación; se necesitan más estudios de replicación. En tercer lugar, la infecciones virales y los parámetros inmunológicos información no estaban disponibles, lo que limita el poder de nuestros análisis. Por último, no se obtuvieron información detallada sobre la metástasis del cáncer y la supervivencia, lo que limita los análisis adicionales de las funciones de la
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polimorfismos en la progresión de la CECA y el pronóstico.
En conclusión, nuestro estudio proporciona evidencia que
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marcado SNPs pueden no contribuir al riesgo de CECA. Se requieren mayores estudios bien diseñados para confirmar los hallazgos actuales.
Reconocimientos
Agradecemos a todos los pacientes que participaron en este estudio. Deseamos agradecer al Dr. Chen Yiqun (Biowing Biotecnología Aplicada Company, Shanghai, China) para el apoyo técnico.