Extracto
El próximo cuantificación y la automatización en la evaluación histológica del tumor basada biomarcador requerirán métodos computacionales capaces de identificar automáticamente las áreas tumorales y diferenciarlas de la estroma. Como ningún marcador biológico del tumor generalmente aplicable solo está disponible, la patología habitualmente utiliza criterios morfológicos como un sistema de referencia espacial. Nosotros aquí en la presencia y evaluar un método capaz de realizar la clasificación histológica de inmunofluorescencia se desliza usando únicamente una mancha de fondo DAPI. Debido a la restricción a un solo canal de color este es inherentemente difícil. Formamos gráficos celulares basados en la distribución topológica de los núcleos de las células del tejido y se extrajeron las funciones de gráficos correspondientes. Mediante el uso de características topológicas, morfológicas y de intensidad basada podríamos cuantificar de manera sistemática y comparar la capacidad de discriminación características individuales contribuyen al algoritmo general. Nosotros aquí muestran que cuando la clasificación de tejido diapositivas de fluorescencia en el canal de DAPI, las características morfológicas y de intensidad basado superan claramente los topológicas que se han utilizado exclusivamente en los enfoques anteriores relacionados. Hemos reunido los 15 mejores características para formar una máquina de vectores de soporte basado en áreas tumorales teñidas de Queratina. En una prueba de conjunto de TMA con 210 núcleos de los cánceres de mama triples negativos nuestro clasificador fue capaz de distinguir entre el tumor y el tejido estroma con una precisión global total de 88%. Nuestro método produce primeros resultados en la capacidad de discriminación de los grupos de características que es esencial para un diagnóstico de tumores automatizados. Además, se proporciona un sistema de referencia espacial objetiva para el análisis múltiplex de biomarcadores en inmunohistoquímica de fluorescencia
Visto:. Lahrmann B, N Halama, el Sinn HP, Schirmacher P, D Jaeger, Grabe N (2011) a tumores automática Separación estroma de la fluorescencia TMA Activa el Análisis cuantitativo de alto rendimiento de varias biomarcadores de cáncer. PLoS ONE 6 (12): e28048. doi: 10.1371 /journal.pone.0028048
Editor: Pierre Busson, Instituto Gustave Roussy de Cancerología, Francia