Extracto
Búsqueda de nuevos biomarcadores de péptidos para el cáncer de estómago en suero humano que puede ser implementado en un método de predicción clínicamente viable para el seguimiento de cáncer de estómago. Se estudió la peptidome suero de dos biorepositories diferentes. En primer lugar, empleó un enfoque de cromatografía líquida en fase inversa C8-para la purificación de la muestra, seguido por el análisis de espectrometría de masas. Estos se aplicaron sobre muestras de suero de los controles sin cáncer y pacientes con cáncer de estómago en diferentes etapas clínicas. Entonces creamos un análisis de tuberías bioinformática e identificamos la firma péptido discriminar pacientes con adenocarcinoma de estómago de los controles sin cáncer. Láser asistida por matriz de desorción /ionización-tiempo de vuelo (MALDI-TOF) resultados de 103 muestras reveló 9 péptidos de la firma; con la precisión de la predicción del 89% en el conjunto de entrenamiento y el 88% en el conjunto de validación. Tres de los péptidos que discriminan descubiertas eran fragmentos de apolipoproteínas C-I y C-III (apoC-I y C-III); cuantificamos aún más sus niveles séricos, así como CA19-9 y PCR, empleando ensayos clínicos comercial-cuantitativos en 142 muestras. resultados cuantitativos apoC-I y apoC-III correlacionadas con los resultados de la EM. a continuación, se emplearon normalizado-apoB-100 niveles de PCR apo C-I y apo C-III, CA 19-9 y generar reglas establecidas para la predicción de cáncer de estómago. Para el entrenamiento, se utilizó el suero de un repositorio, y para la validación, se utilizó el suero de la segunda repositorio. precisión de la predicción de 88,4% y 74,4% se obtuvieron en los conjuntos de entrenamiento y validación, respectivamente. Los niveles séricos de la apo C-I y apo C-III combinan con otros parámetros clínicos pueden servir como base para la formulación de una puntuación de diagnóstico para pacientes con cáncer de estómago
Visto:. Cohen M, Yossef R, T Erez, Kugel A, Welt M, Karpasas MM, et al. (2011) Suero apolipoproteínas C-I y C-III se reducen en pacientes con cáncer de estómago: Los resultados de MALDI-Based Peptidome y Ensayos Clínicos Immuno-base. PLoS ONE 6 (1): e14540. doi: 10.1371 /journal.pone.0014540
Editor: Hana Algül, Technische Universität München, Alemania