chino
Extracto
Aplicaciones
Xerodermia grupo pigmentsum F (XPF) juega un papel fundamental en el nucleótido de ADN reparación por escisión y se ha relacionado con el desarrollo de diversos tipos de cáncer. Este estudio tiene como objetivo evaluar la asociación de
XPF
variantes genéticas con la susceptibilidad al carcinoma esofágico de células escamosas (CECA) en la población china.
Métodos
Este caso de dos etapas -control estudio se llevó a cabo en un total de 1524 pacientes con CECA y 1524 controles. El genotipo de
XPF
-673C & gt; T y 11985A & gt; G variantes fueron determinados por el polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción basada en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR-RFLP). Se realizó un análisis de regresión logística para estimar odds ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC 95%).
Resultados
Nuestro estudio de casos y controles mostró que
XPF
Beijing conjunto OR = 0,58; IC 95% = 0,34-0,99,
P = 0,040
:: -673TT genotipo se asoció con una disminución del riesgo de CECA en comparación con el genotipo CC en ambos conjuntos de casos y controles (conjunto de Tangshan OR = 0,66; IC del 95% = 0,46-0,95,
P = 0,027
). Los análisis estratificados revelaron que una interacción multiplicativa entre -673C & gt; variante T y la edad, sexo o condición de fumadores era evidente (Gen-edad: P
interacción = 0,002; Gen-sexo: P
interacción = 0,002; Gen-fumar : P
interacción = 0,002). Para
XPF
11985A & gt;. G polimorfismo, no hubo una diferencia significativa de la distribución de genotipos entre CECA casos y controles
Conclusión
Estos resultados indican que las variantes genéticas en
XPF
podría contribuir a la susceptibilidad a la CECA
Visto:. Liu Y, Cao L, J Chang, Lin J, Él B, Rao J, et al. (2014)
XPF
-673C & gt; T polimorfismo Efecto sobre la susceptibilidad al cáncer de esófago en la población china. PLoS ONE 9 (4): e94136. doi: 10.1371 /journal.pone.0094136
Editor: Xiaoping Miao, MOE clave Laboratorio de Medio Ambiente y Salud, Escuela de Salud Pública, Tongji Medical College, Universidad Huazhong de Ciencia y Tecnología, China
Recibido: 7 Enero 2014; Aceptado: March 12, 2014; Publicado: 7 Abril 2014
Derechos de Autor © 2014 Liu et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este estudio fue apoyado por la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (81272613 a X. Zhang), el Fondo de Ciencia para jóvenes Académicos Distinguidos del Comité Científico de Hebei (H2012401022 a X. Zhang) y el plan de Cultivo Líder Talento del equipo de innovación en la provincia de Hebei (LJRC001 a X . Zhang). Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el carcinoma de células escamosas de esófago (CECA), como uno de los tumores malignos más comunes, es una seria amenaza para la salud humana y la salud. Casi el 50% de los casos se producen CECA en China [1] .El desarrollo de la CECA es un proceso complejo, que está relacionada con los múltiples factores de entorno, incluyendo la dieta [2], la infección [3], factores de estilo de vida, particularmente el consumo de tabaco y alcohol [4]. Sin embargo, los individuos, que exponen a los mismos factores de riesgo, tenían diferente susceptibilidad a la CECA, lo que indica el papel esencial del factor genético en el desarrollo de la CECA [5], [6], [7].
escisión de nucleótidos reparación (TNE) fue uno de los sistemas de reparación del ADN más versátiles. Se elimina una amplia gama de lesiones del ADN, tales como dímero incluido UV-pirimidina, DNA reticular y el daño oxidativo para mantener la estabilidad del ADN [8], [9]. Las deficiencias en la capacidad de reparación del ADN se han relacionado con un mayor riesgo de múltiples tipos de cáncer [10].
Xerodermia grupo pigmentsum F (XPF), como una de las proteínas de NER esenciales [10], formó un complejo estrecho con la reparación por escisión complementación cruzada 1 (ERCC1) dar de lado al ADN dañado [11], [12]. Un
in vitro demostraron
estudio que
XPF
-673C & gt; T variante cambió la actividad transcripcional de los genes [13]. Los estudios epidemiológicos también mostraron que
XPF
variantes genéticas contribuyeron a la susceptibilidad a diversos tipos de cáncer, tales como la vejiga, de mama, de pulmón y cáncer gástrico [14], [15], [16], [17].
Teniendo en cuenta el papel fundamental de
XPF Hoteles en NER, que supone que los
XPF
polimorfismos contribuido al riesgo de desarrollar CECA. Para comprobar esta hipótesis, se llevó a cabo este caso-control en una población china.
Materiales y métodos
objeto de estudio y la ética comunicado
En este estudio, dos casos independientes -control se utilizaron conjuntos de la muestra. (A) conjunto de casos y controles de Tangshan: 500 pacientes con CECA reclutados de Tangshan Gongren hospitalaria (Tangshan, China) entre marzo de 2008 y diciembre de 2012 y 500 controles sin cáncer. (B) conjunto de casos y controles Beijing: 1024 pacientes CECA reclutados en el Hospital del Cáncer de la Academia China de Ciencias Médicas (Pekín, China) entre enero de 2009 y diciembre de 2012 y 1024 controles sanos. Todos los participantes eran genéticamente no relacionados chinos Han. Los pacientes elegibles fueron histopatológicamente primaria confirmaron y no tratado previamente por la radioterapia y la quimioterapia. No hubo restricciones de edad, sexo, estadio, o histología. Se excluyeron los pacientes con tumores malignos anterior o metástasis del cáncer de otros órganos. Los controles fueron seleccionados al azar de la población libre de cáncer de la comunidad llevada a cabo en la misma región durante el mismo período en el que se reclutaron pacientes. Los criterios de selección de los controles incluidos sin historia previa de malignidad, y los sujetos de control fueron emparejados frecuencia a los pacientes por edad (± 5 años) y el género. Durante el reclutamiento, el consentimiento informado por escrito se obtuvo de cada tema. Este estudio fue aprobado por la Junta de Revisión Institucional de la Universidad de Hebei Unidas y la Academia China de Ciencias Médicas Instituto de Cáncer
XPF genotipado
Los genotipos de
XPF
-673C & gt;. T (rs3136038) y 11985A & gt; G (rs254942) polimorfismos fueron determinadas por la longitud de fragmentos de restricción polimórficos basados reacción en cadena de la polimerasa (PCR-RFLP).
XPF
fragmentos de PCR que contienen -673 C & gt; T o 11985A & gt; G sitio se amplificaron con los cebadores pares de XPF-673F (5 '- GGG AGG CAA ACA GAG GTC TGA ATT - 3') /XPF-673R (5'-GAT TGC TAC TCC TCC CCA TTC TT 3 ') o
XPF
-11985F (5'-GGA GTC AAG AAA CAG CCA CAC TAG TA-3') /
XPF
-11985R (5'-AAG AGG ACA GGA TGA CAG CCA G-3 '). PCR se realizó en una mezcla de reacción que contiene 25 ul 10 ng de ADN, 0,3 mol de cada cebador, y 2,5 mM MgCl
2, mM dNTPs 1,25, 1,5 DNA Taq ADN polimerasa T. La reacción se lleva a cabo con un perfil que consiste en una etapa de fusión inicial de 2 min a 95 ° C, seguido de 35 ciclos de 30 s a 94 ° C, 30 s a 58 ° C, 45 s a 72 ° C, y una final etapa de elongación de 72 ° C durante 10 min. Los productos de PCR amplificados eran 137 pb y 129 pb para -673C & gt; T y 11985A & gt;. G, respectivamente
Para -673C & gt; T, los productos de PCR fueron digeridos por EcoRI
I
. El producto de restricción fue visualizado en gel de agarosa al 3,5%. El alelo -673C generado 114 pb y 23 pb dos bandas; el alelo -673T produce una sola banda de 137 pb. Para 11985A & gt; G variante, los productos de PCR fueron digeridos por Rsa
I
y luego se separaron en gel de agarosa al 3,5%. El alelo 11985G generado 104 pb y 25 pb dos bandas y el alelo 11985A produce una sola banda de 129 pb.
Los genotipos que se distinguen por PCR-RFLP fueron confirmados por secuenciación directa (Figura 1). La genotipificación se realizó sin conocimiento del estado del caso /control de los sujetos de estudio. Un 10% de las muestras aleatorias enmascarados fueron probados por diferentes personas y todos los resultados fueron concordantes
Figura A y C presentes secuenciación imágenes de genotipos de
XPF
-673 C & gt;. T y 11985A & gt; G ; Figura B presenta los resultados del análisis de PCR-RFLP de -673C & gt; T polimorfismo de casos representativos (M: marcador de ADN, los casos 1, 3 y 5: genotipo CC, y el caso 2 y 6: genotipo CT, y el caso 4 y 7: genotipo TT ); Figura D presenta los resultados del análisis de PCR-RFLP de 11985A & gt; G polimorfismo de casos representativos (M: marcador de ADN; Caso 1, 4 y 6: genotipo GG; Caso 5 y 7: genotipo AG; Caso 2 y 3: genotipo AA) .
el análisis estadístico
Todos los análisis estadísticos se realizaron con el paquete de software estadístico SPSS16.0 (versión 16.0, SPSS Inc., Chicago, IL). Se utilizó la χ
2 prueba para examinar las diferencias en las variables demográficas y la distribución de genotipos entre los casos y controles. La odds ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC) se utilizaron para evaluar la asociación de
XPF
variantes con el riesgo de CECA según el modelo de regresión logística incondicional ajustado por edad, sexo y tabaquismo. Todas las pruebas estadísticas fueron de dos caras pruebas, y un
P
valor de & lt; 0,05 fue considerado significativo
Resultados
Características de los sujetos
El genotipo. distribuciones de características selectas de los participantes en este estudio se muestran en la Tabla 1. No se encontraron diferencias estadísticamente entre los casos y controles para el conjunto de casos y controles de Tangshan y de casos y controles de Pekín fijaron en términos de edad y sexo (todos los
P
& gt; 0,05), lo que indica que la frecuencia de coincidencia era adecuado. Sin embargo, había más fumadores entre los pacientes en comparación con los controles en ambos conjuntos de casos y controles (conjunto de Tangshan: 61,2%
vs
29,2%,
P Hotel & lt; 0,001; Beijing conjunto: 65,5%
vs
32,3%,
P
. & lt; 0,001) guía empresas
XPF
variantes y riesgo de CECA
El genotipo distribuciones de
XPF
-673C & gt; T y 11985A & gt; polimorfismos G en los casos y los controles se resumen en la Tabla 2. La observado frecuencias genotípicas de
XPF
polimorfismo (-673C & gt; T y 11985A & gt; G) en los dos controles fueron consistentes con el equilibrio de Hardy-Weinberg en ambos conjuntos (Tangshan establece:
P
= 0,06 y
P
= 0,50; Beijing conjunto:
P =
0,40 y
P
= 0,97)
análisis de regresión logística
multivariado se utilizaron para calcular la asociación de XPF -673C & gt;. T o 11985A & gt; G genotipos con el riesgo de la CECA (Tabla 2) . Para -673 C & gt; T polimorfismo, el genotipo TT ha demostrado ser un genotipo de protección. En comparación con el genotipo -673CC, -673TT genotipo se relaciona con un riesgo disminución de la CECA en el conjunto de casos y controles de Tangshan (OR = 0,58, IC del 95% = 0,34 a 0,99,
P
= 0,04). Similitud, análisis de regresión logística reveló que los individuos con el genotipo -673TT fueron también tenían un menor riesgo para la CECA con OR (IC del 95%) de 0,66 (0,46-0,95) en el conjunto de casos y controles de Beijing. En los análisis combinados, se encontró que los portadores del genotipo -673TT tenían un 0,64 veces la disminución del riesgo de desarrollar la CECA (IC del 95% = 0,47-0,86). Por 11985 A & gt; G polimorfismo, nuestro estudio no mostró ninguna asociación de genotipos de 11985A & gt;. G polimorfismo con el riesgo de CECA
El riesgo de CECA asociado con el -673C & gt; T polimorfismo se evaluó además por la estratificación por edad, sexo y tabaquismo utilizando los datos combinados de los dos conjuntos de casos y controles (Tabla 3). En los análisis estratificados con la edad, -673TT genotipo se asoció significativamente con la disminución en el riesgo entre los sujetos de 60 años o menos (OR = 0,54, IC del 95% = 0,36 a 0,80,
P
= 0,002), pero no entre los sujetos edad mayor de 60 años (OR = 0,81, IC del 95% = 0,51 a 1,28,
P = 0,359
). Hubo se observó una interacción significativa en edad gen
(P
para la interacción = 0,002). En comparación con el genotipo -673CC, un riesgo significativamente menor de la CECA se asoció con genotipos TT sólo entre varones (OR = 0,67; IC del 95% = 0,48 a 0,93,
P = 0,017
), pero no entre las mujeres ( OR = 0,58, IC del 95% = 0,28 a 1,21,
P = 0,145
). Hubo una interacción gen-sexo significativa (
P
para la interacción = 0,002).
Debido a que fumar tabaco es factor predisponente para la CECA, que luego investigó si existía una interacción entre genes y tabaquismo entre el -673C & gt; T polimorfismo y el tabaquismo (Tabla 3). Entre los no fumadores, en comparación con los portadores -673CC, los individuos con el genotipo TT tenían un 0,61 veces la disminución del riesgo de desarrollar la CECA (IC del 95% = 0,39 a 0,96; p = 0,031). Entre los fumadores, no fue marginalmente disminuyó significativamente el riesgo de la CECA (OR = 0,66 IC 95% = 0,43 a 1,00; p = 0,050) para los individuos con el genotipo TT en comparación con aquellos con el genotipo AA. Una interacción multiplicativo gen fumadores también se encontró con
P Opiniones de interacción que equivale a 0.002.
Discusión
En este estudio, hemos investigado las asociaciones de
XPF
-673C & gt; T y 11985A & gt; G variantes genéticas con el riesgo de CECA de la población china. Se encontró que los sujetos con genotipo -673TT disminuyó el riesgo de CECA en comparación con los portadores del genotipo -673CC en la población china. Para 11985A & gt; G polimorfismo, no hubo diferencia significativa entre CECA casos y controles
La diferencia étnica en los
XPF
polimorfismos podría tener un efecto significativo sobre el fenotipo de la enfermedad.. Los investigadores encontraron una asociación significativa de
XPF
rs1799801 en el exón 11 con un menor riesgo de cáncer de vejiga en población caucásica [18], pero no en la población china [15]. Esta discrepancia puede reflejar la diferencia de los antecedentes genéticos entre las diferentes poblaciones de estudio. En este estudio, las frecuencias genotípicas de los
XPF
-673C & gt; T en los controles son 59,4% para CC, 35,0% para la TC y el 5,6% para el TT, que son consistentes con los de estudios de Yu (55,5% en el caso CC, el 36,7% de la TC, el 7,8% de TT) y los que están en estudio de Shao (57,3% para CC, el 37,4% de la TC, el 5,2% de TT) [13], [16]. Hasta donde sabemos, no informó datos sobre el 11985A & gt; G polimorfismos están disponibles
XPF es una proteína esencial en la vía NER, que es responsable de la eliminación de aductos de ADN inducidas por compuestos basados en platino [19].. Como una estructura de endonucleasa de ADN específico, XPF se ha informado que se unen a ADN de doble cadena [20] y participó además en varias vías de reparación del ADN mediante la combinación con ERCC1 [21], [22]. Como un factor limitante de la velocidad crucial en NER, la baja expresión de XPF actuó como un factor de susceptibilidad genética en el desarrollo de cánceres y un factor de riesgo pronóstico después de la quimioterapia en varios tipos de cáncer, incluyendo cáncer de esófago [15], [23], [ ,,,0],24], [25]. El análisis funcional de
XPF
-673T & gt; C mostró que el alelo -673T tenía una actividad transcripcional significativamente mayor en comparación con el alelo -673C. Los experimentos de epidemiología también mostró que -673TT genotipo tenía un menor riesgo de cáncer de pulmón en comparación con el genotipo -673CC [13], [16]. Estos resultados apoyan aún más nuestros resultados actuales, que mostró los portadores del genotipo con -673TT tenían un riesgo significativamente menor de cáncer de esófago.
Varias evidencias han demostrado estadísticamente significativa interacción entre genes y medio ambiente en diversos tipos de cáncer [26], [27 ], [28]. La mayoría de la CECA se produjo también debido a las interacciones entre los factores ambientales y genéticos [2], [4]. vía NER es el mecanismo principal para el par de aductos de ADN que distorsionan voluminosos y helicoidales generada por cigarrillo [29], [30]. El humo del tabaco contiene muchos de carcinógenos y procarcinógenos, tales como benzo (a) pireno y de nitrosamina. variante genética en el promotor de
XPF
pueden influir en la activación de sustratos en el humo del cigarrillo y luego contribuir a la diferente susceptibilidad al cáncer. Varios estudios han evaluado la relación entre la
XPF
-673C & gt; T polimorfismo y la susceptibilidad al cáncer de pulmón por el consumo de tabaco. Un estudio realizado por Shao mostró que -673 TT o CT genotipo se incrementó significativamente el riesgo de cáncer de pulmón en los no fumadores, pero no en los fumadores [16]. Sin embargo, Yu y sus colegas no encontraron ninguna interacción entre -673C & gt; T polimorfismo y ser fumador [13] .Este es el primer informe para mostrar la interacción entre genes y tabaquismo entre los
XPF
genotipos y ser fumador en riesgo de la CECA. Nuestros resultados sugieren que XPF -673TT genotipo se relaciona con una disminución del riesgo de la CECA entre los no fumadores, pero no entre los fumadores. Como una proteína clave de reparación de daños en el ADN, la baja expresión de XPF puede retrasar la reparación del ADN, y aumentar aún más la inestabilidad del genoma y promover la tumorigénesis. Sin embargo, un gran montaje de la exposición al consumo de tabaco puede abrumar a la diferencia de la capacidad de reparación del ADN mediante diferentes genotipos.
Nuestro estudio tiene sus limitaciones. Este estudio es un estudio de casos y controles de base hospitalaria restringida en la población china Han. El sesgo de selección puede surgir cuando el muestreo no es aleatorio dentro de las subpoblaciones de cáncer y los sujetos sin cáncer. Los controles en nuestro estudio fueron emparejados a los casos por edad y sexo, lo que podría minimizar el sesgo de selección de los sujetos. Además, había varios de
XPF
polimorfismos fueron descubiertos y se han demostrado estar asociados con diversos tipos de cáncer. Más posibles polimorfismos funcionales XPF todavía tienen que ser validado por estudios más grandes con poblaciones diversas
En conclusión,
XPF
-673C & gt;. T polimorfismo se asoció significativamente con un menor riesgo de CECA. Nuestro hallazgo sugiere que
XPF
juegan un papel en la etiología de la CECA.