Crónica enfermedad > Cáncer > artículos del cáncer > PLOS ONE: bayesiano la agrupación jerárquica para estudiar el cáncer de la Expresión Génica de datos con Desconocida estadísticas

PLOS ONE: bayesiano la agrupación jerárquica para estudiar el cáncer de la Expresión Génica de datos con Desconocida estadísticas


Extracto

La agrupación de análisis es una herramienta importante en el estudio de los datos de expresión génica. La agrupación jerárquica (BHC) algoritmo bayesiano puede inferir automáticamente el número de grupos y utiliza la selección del modelo bayesiano para mejorar la calidad de la agrupación. En este trabajo, presentamos una extensión del algoritmo de BHC. Nuestra BHC (GBHC) algoritmo de Gauss representa los datos como una mezcla de distribuciones gaussianas. Utiliza distribución normal-gamma como un conjugado antes en la media y la precisión de cada uno de los componentes gaussianos. Hemos probado GBHC más del 11 por cáncer y 3 conjuntos de datos sintéticos. Los resultados en los conjuntos de datos de cáncer muestran que en la agrupación de la muestra, GBHC en promedio produce una partición de la agrupación que es más concordante con la realidad del terreno que los obtenidos de otros algoritmos de uso común. Por otra parte, con frecuencia GBHC infiere el número de grupos que a menudo cerca de la realidad del terreno. En la agrupación de genes, GBHC también produce una partición de la agrupación que es más biológicamente posible que varios otros métodos del estado de la técnica. Esto sugiere GBHC como una herramienta alternativa para el estudio de la expresión génica datos

La aplicación de GBHC está disponible en https://sites.google.com/site/gaussianbhc/

Visto:. Sirinukunwattana K , Savage RS, Bari MF, Snead DRJ, Rajpoot NM (2013) Bayesiano agrupación jerárquica para estudiar el cáncer de la Expresión génica de datos con Desconocida Estadística. PLoS ONE 8 (10): e75748. doi: 10.1371 /journal.pone.0075748

Editor: Ferdinando Di Cunto, Universidad de Turín, Italia

Enfermedades de sentido común

Enfermedad del corazón | Enfermedades artículos | Enfermedad pulmonar | las preguntas más frecuentes de salud | Salud mental | Diabetes | El sentido común de la Salud | Enfermedades comunes | senior Health | Primeros auxilios
Derechos de autor © Crónica enfermedad[www.enfermedad.cc]