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PLOS ONE: evaluación integral de un carbono metabolismo de la vía variantes génicas y Riesgo de Cáncer Renal Cell


Extracto

Introducción

El folato y uno metabolismo de carbono están relacionados con el riesgo de cáncer a través de su papel fundamental en la síntesis de ADN y metilación. La variación en los genes del metabolismo de un carbono, en particular
MTHFR
, se ha asociado con el riesgo de varios tipos de cáncer en los estudios epidemiológicos, pero poco se sabe acerca del cáncer renal.

Métodos

polimorfismos de nucleótido único (SNPs) seleccionan para producir la cobertura genómica alta de las 13 regiones de genes del metabolismo de un carbono (
ALDH1L1
,
BHMT
,
CBS
,
FOLR1
,
MTHFR
,
MTR
,
MTRR
,
SHMT1
,
SLC19A1
,
TYMS
) y la vía de síntesis de glutatión estrechamente asociada (
CTH
,
GGH
,
GSS
) se genotipo de 777 carcinoma de células renales (RCC) y 1.035 casos controles en el estudio de casos y controles de cáncer renal Europa central y oriental. Asociaciones de SNPs (n = 163) con riesgo de CCR se calcularon mediante regresión logística no condicional ajustado por edad, sexo y centro de estudios. Mínimo de permutación p-valor se utilizaron pruebas (Min-P) para identificar regiones de genes asociados con el riesgo, y se evaluaron los haplotipos dentro de estos genes.

Resultados

Se observaron las asociaciones más fuertes con riesgo de CCR
SLC19A1 gratis (P
min-P = 0,03) y
MTHFR gratis (P
min-P = 0,13). Un haplotipo que consiste en cuatro SNPs en
SLC19A1 gratis (rs12483553, rs2838950, rs2838951 y rs17004785) se asoció con un aumento del riesgo del 37% (p = 0,02), y el análisis estratificado exploratoria sugirió la asociación fue significativa sólo entre aquellos en el tercil más bajo de la ingesta de vegetales.

Conclusiones

para nuestro conocimiento, este es el primer estudio que examina exhaustivamente la variación en los genes del metabolismo de un carbono en relación con el riesgo de CCR. Hemos identificado un nuevo asociación con
SLC19A1
, lo cual es importante para el transporte de ácido fólico en las células. Se requiere la replicación en otras poblaciones para confirmar estos hallazgos

Visto:. Gibson TM, Brennan P, Han S, S Karami, Zaridze D, Janout V, et al. (2011) Evaluación integral de un carbono metabolismo de la vía variantes génicas y Riesgo de Cáncer Renal Cell. PLoS ONE 6 (10): e26165. doi: 10.1371 /journal.pone.0026165

Editor: Daniel Monleón, Instituto de Investigación Sanitaria INCLIVA, España

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