Extracto
microARN (miARN) reprimir a los ARN mensajeros post-transcripcionalmente mediante la unión a los 3 'UTR del ARNm con la región de semillas miARN. Se ha dado a entender que las regiones de semillas más largos tienen una mayor eficacia en la represión del ARNm. Pusimos a prueba esta hipótesis mediante la evaluación de la expresión diferencial de miRNAs implicados en la regulación de la respuesta inmune, un mecanismo importante en el cáncer colorrectal (CCR), por categoría de longitud de la semilla. Posteriormente, se evaluó la expresión diferencial de los objetivos de estos miRNAs 'en el tejido del colon y el impacto de estos miRNAs en la supervivencia CRC. Se determinó la complementariedad de secuencia entre cada región de semillas miARN y la 3 'UTR de cada gen diana mRNA verificado experimentalmente. Se clasificaron los miRNAs en grupos basados en las regiones de semillas que emparejan perfectamente a un ARNm UTR con seis bases comenzando en la posición dos, siete bases comenzando en la posición uno, siete bases comenzando en la posición dos, u ocho bases que comienza en la posición uno. Se analizaron estos grupos en cuanto a la expresión diferencial de los genes miARN entre el carcinoma colorrectal y mucosa normal y diferencial de la expresión del ARNm diana del colon, y el riesgo de morir de CRC. Después de la corrección para comparaciones múltiples, la proporción de los miRNAs que se asociaron con la expresión diferencial de mRNA fue del 0% para el 6-mer, 13,64% para el grupo 7α-mer, 12,82% para el grupo 7β-mer, y 8,70% para el grupo 8-mer. La proporción de miRNAs asociados con la supervivencia fue del 20% para el grupo 6-mer, 27,27% para el grupo 7α-mer, 10,23% para el grupo 7β-mer, y 21,74% para el grupo 8-mer. No vimos una relación lineal entre la longitud de la semilla y la desregulación de los genes miARN expresión, la expresión del ARNm o la supervivencia. Nuestros resultados no apoyan la hipótesis de la semilla región de longitud por sí solas influencias ARNm represión
Visto:. Mullany LE, Herrick JS, Wolff RK, Slattery ML (2016) MicroARN Semilla Región Longitud de impacto en el blanco ARN mensajero Expresión y Supervivencia en el cáncer colorrectal. PLoS ONE 11 (4): e0154177. doi: 10.1371 /journal.pone.0154177
Editor: Geraldo A. Passos, Universidad de Sao Paulo, Brasil