Extracto
Fondo
Se sabe que las mitocondrias desempeñan un papel importante en ciertos tipos de cáncer (próstata, renal, de mama, colorrectal o) y la enfermedad coronaria. Estos orgánulos desempeñan un papel esencial en la apoptosis y la producción de especies reactivas del oxígeno; Además, el ADNmt también revela la historia de las poblaciones y la migración humana antigua. Se cree que todos estos eventos y las variaciones en el genoma mitocondrial de causar algunos tipos de cáncer, incluyendo el cáncer de próstata, y también nos ayudará a agrupar a los individuos en grupos de origen común. El objetivo del presente estudio es analizar los diferentes haplogrupos y las variaciones en la secuencia en el genoma mitocondrial de una población del sur de Europa que consiste en sujetos afectados (n = 239) y no afectados (n = 150) por el cáncer de próstata esporádico.
Metodología y principales conclusiones
Utilizando el análisis de la extensión del cebador y la secuencia de ADN, hemos identificado los nueve principales haplogrupos europeos y polimorfismos CR. Las frecuencias de los haplogrupos no difirió entre los pacientes y cohortes de control, mientras que el polimorfismo T16356C CR fue significativamente mayor en los pacientes con PC en comparación con los controles (p = 0,029). PSA, puesta en escena, y la puntuación de Gleason se asociaron con ninguno de los nueve principales haplogrupos europeos. El CR polimorfismos G16129A (p = 0,007) y T16224C (p = 0,022) se asociaron significativamente con la puntuación de Gleason, mientras que T16311C (p = 0,046) se relacionó con T-etapa.
Conclusiones y Importancia
Nuestros resultados no sugieren que los haplogrupos de ADN mitocondrial podrían estar implicados en la etiología del cáncer de próstata esporádico y la patogénesis ya que estudios previos realizados en población media Europa. Aunque algunas asociaciones significativas han sido obtenidos en el estudio de polimorfismos CR, más estudios deben llevarse a cabo para validar estos resultados
Visto:.-Álvarez Cubero MJ, Saiz Guinaldo M, Martínez-González LJ, Álvarez Merino JC, Cózar Olmo JM, JAL Acosta (2012) mitocondriales haplogrupos y polimorfismos no muestran asociación con el cáncer de próstata esporádico en una población del sur de Europa. PLoS ONE 7 (7): e41201. doi: 10.1371 /journal.pone.0041201
Editor: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Estados Unidos States.of
Recibido: 27 Febrero, 2012; Aceptado: 18 Junio 2012; Publicado: 17 Julio 2012
Derechos de Autor © 2012 Álvarez-Cubero et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Los autores no tienen el apoyo o la financiación para reportar
Conflicto de intereses:. los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer de próstata es uno de los cánceres más prevalentes diagnosticados. en los hombres. la incidencia de cáncer de próstata se caracteriza por una gran variabilidad geográfica, que van desde unos pocos casos (aproximadamente 4-7 por 100.000) en los países asiáticos de 70-100 casos por 100.000 en los países nórdicos de Europa y América del Norte. En Italia y España, las tasas son bastante bajos en comparación con los observados en otros países occidentales y son los más bajos entre los países de la Unión Europea (UE) [1], [2]. Sin embargo, pocos estudios concluyentes se han realizado con respecto a la genética de este cáncer. Algunos estudios de ligamiento [3] atribuyen un papel importante a los genes como ELAC2 (ELAC homólogo 2 (E. coli)) en 17q, RNASEL en 1q24-25 (gen hereditario el cáncer de próstata 1 (HPC1)) [4], y MSR1 ( receptor scavenger macrófago 1) en 8p22, que contienen mutaciones de inactivación en los miembros afectados en al menos una familia cáncer de próstata. Sin embargo, otros estudios no han confirmado las asociaciones observadas con algunos de estos genes. Este es el caso de la falta de asociación entre cáncer de próstata y la RNASEL (2 ', 5'-oligoadenilato dependiente de RNasa L) de genes en una población sueca [5]. La situación es aún más complicada en el cáncer de próstata esporádico donde, debido a su heterogeneidad genética, se ha sugerido que muchos loci de genes, en lugar de un solo gen específico, están involucrados en la predisposición a este tipo de cáncer [6]. Dos tipos diferentes de mutaciones se pueden encontrar en el cáncer. Las mutaciones somáticas se producen en una sola célula en el desarrollo de tejido somático. La generación de especies reactivas de oxígeno (ROS) causa mutaciones en mitocondrial de las células somáticas. En contraste, las mutaciones germinales se producen en la línea germinal y se pueden pasar a la siguiente generación, como en este estudio [7]. Las mutaciones en el ADN mitocondrial (ADN mitocondrial) se ha demostrado que cumplir con todos los criterios requeridos para las mutaciones patógenas que causan el cáncer de próstata [8]. Algunas de las mutaciones están en el COI (citocromo c oxidasa) [8] o COX7A2 (citocromo c oxidasa subunidad VIIa polipéptido 2) [9] gen, y algunas mutaciones están directamente relacionados con haplogrupos conocidos que participan en la asociación entre las variantes de ADN mitocondrial y compleja enfermedades como el cáncer renal y de próstata [10]. Se ha sugerido que las mutaciones de ADNmt pueden ser separados en dos tipos: adaptativas y tumorigénicas (no adaptativo). mutaciones de ADNmt mutaciones adaptativas son más leves observados en diferentes poblaciones [11]. mutantes tumorigenos incluyen mutaciones tales como inserciones y deleciones heteroplasmic [11]. Las mutaciones en varios tipos de cánceres se han observado tanto en la no codificante y regiones de codificación de ADN mitocondrial, pero la mayoría de las mutaciones identificadas se han descrito en la región D-loop (región no codificante). Las deleciones, inserciones en la región D-loop y transiciones se han observado en mama, hepatocelular y cáncer colorrectal deleciones de ADNmt como mtDNA4977 han sido identificados en el cáncer de próstata [12] - [14] e incluso algunas mutaciones de ADNmt están relacionados con el aumento de niveles séricos de PSA [15], [16].
las dificultades específicas en la comprensión de las causas del cáncer de próstata se deben a la naturaleza heterogénea de la enfermedad, su etiología desconocida, y el hecho de que muchos de los genes implicados tienen múltiples variaciones entre las poblaciones, se ven afectados en gran medida por factores ambientales entre las poblaciones, y un gran papel de los efectos ambientales [17] - [19].
el objetivo del presente estudio fue comparar las frecuencias de haplogrupos de ADN mitocondrial y CR ( región de control) polimorfismos en 239 pacientes con cáncer de próstata esporádico a los de 150 controles sanos en el suroeste de Europa, como se hizo anteriormente en Corea [20] y los caucásicos europeos Media [21].
resultados
los nueve principales haplogrupos Europea ADNmt y polimorfismos CR fueron analizados en muestras de sangre total de 239 pacientes con cáncer de próstata esporádico y se compararon con 150 sujetos de control sin ninguna historia clínica familiar de la patología. Además, los controles fueron confirmados por los valores de PSA normales con los niveles en sangre por debajo de 4 ng /ml, así como el tacto rectal normal. Las características clínicas de los pacientes y los controles se muestran en la Tabla 1.
ADNmt haplogrupo Distribución en pacientes con cáncer de próstata esporádico
Las frecuencias de haplogrupos mitocondriales no difirió significativamente entre los pacientes con cáncer de próstata y los sujetos de control (Tabla 2).
Estos nueve haplogrupos principales también se compararon con la distribución haplogrupo mitocondrial español, como puede verse en la Figura 1.
CR Los polimorfismos en pacientes con cáncer de próstata esporádico
El mitocondrial CR fueron secuenciados y analizados entre las posiciones de nucleótidos 16024 y 16365 (Tablas S1 y S2). Ciento veinticuatro polimorfismos homoplasmic y un polimorfismo heteroplasmic (16169Y) se encontraron entre los 389 sujetos en comparación con la secuencia de referencia de Cambridge revisada [22]. De los 125 polimorfismos detectados, 13 no fueron listadas en la base de datos del genoma mitocondrial humano [23], y 1 no fue incluida en MITOMAP [24] ni la base de datos del genoma humano mitocondrial [23].
Dieciocho de los 125 se detectaron polimorfismos CR a una frecuencia ≥4% ya sea en el cáncer de próstata esporádico o el grupo de control (Tabla 3). Estos fueron sometidos a análisis estadístico más. Uno de ellos, se encontró que 16356C (p = 0,029) para tener una frecuencia significativamente mayor en los pacientes con cáncer de próstata esporádico en comparación con los controles. Otro polimorfismo, 16278T tiene un valor de p de 0,051 (Tabla 3). Sin embargo, la significación se perdió después de la corrección para comparaciones múltiples mediante el análisis de Bonferroni, un nivel de significación. & Lt; 0,0004 se requiere
El desequilibrio de ligamiento resultados del análisis muestran que algunos polimorfismos CR estaban fuera de equilibrio (p = 0,05); los valores de desequilibrio normalizados se muestran en la Tabla S3. La sustitución T16356C asociado con los pacientes (p = 0.029) está vinculada a A16183C y T16189C (p & lt; 0,05). El C16278T mutación (p = 0,051) se asocia con C16069T, T16126C, T16172C, T16189C, y C16223T (p & lt; 0,05).
Análisis de los parámetros clínicos
también se analizó la relación entre la parámetros clínicos asociados con la invasión tumoral y la progresión (los niveles de PSA, grado de Gleason y estadio T) y los haplogrupo frecuencias, por lo que CR polimorfismo.
Cuando los cinco haplogrupo frecuencias más prevalentes fueron comparados con las principales variables clínicas parámetros utilizados para diagnosticar el cáncer de próstata (PSA, grado de Gleason y estadio T), no se observaron diferencias de significación entre los pacientes con cáncer de próstata (datos no mostrados). Por otra parte, cuando los parámetros clínicos fueron subdivididos en categorías: los niveles de PSA (≤4.0, 4,1-10, 10.1-20, & gt; 20, & gt; 1,000), la puntuación de Gleason (2-6, 7, 8-10), y T -Etapa (a, B, C, D) significación estadística, ninguno de los haplogrupos alcanzado (tabla 4).
Al analizar los polimorfismos de CR y los parámetros clínicos entre los pacientes, sólo se observaron diferencias significativas en puntuación de Gleason y T-etapa. La variante G16129A se encontró en 8,79% de los pacientes con una puntuación de Gleason entre 2-6, en el 0,42% de los pacientes con una puntuación de Gleason de 7, y en el 0,42% de los pacientes con una puntuación de Gleason de 8-10 (p = 0,007). Además, el T16224C mutación se encontró en 3,76% de los pacientes con una puntuación de Gleason entre 2-6, en el 2,09% de los pacientes con una puntuación de Gleason de 7, y en el 0,41% de los pacientes con una puntuación de Gleason de 8-10 (p = 0,022). La sustitución T16311C alcanzó significación cuando se compara con las cuatro categorías T-etapa: 1,67% de los pacientes de la categoría A, 9,21% en B, 1,67% de C, y 1,67% en D (p = 0,046)
. discusión
ADN mitocondrial humano es ampliamente utilizado como una herramienta en muchos campos, incluyendo la antropología evolutiva y la historia de la población, genética médica, genealogía genética, y la ciencia forense [25]. La función principal de las mitocondrias relacionados con tumor maligno y el cáncer de la biología es probablemente debido a su función esencial en la generación de ATP y la regulación de la apoptosis [8]. Debido a la alta tasa de mutación en la no codificante región 1,1 kb control (16024-576), que es aproximadamente diez veces más alta que la tasa de mutación en los 15,5 kb región de codificación (bases 577-16023) [26], la no región de codificación está relativamente enriquecida en variación de la secuencia, y la información haplogrupo se puede obtener de esta región. Estos haplogrupos se han relacionado con algunas enfermedades oncológicas, como el de mama, colorrectal, de tiroides y [27] el cáncer, así como otras enfermedades, como el SIDA [28].
El haplogrupo más frecuente en esta población es H (45,6% en los pacientes y 42,7% en los controles), que también es el más extendido en Europa Occidental. También hemos distinguido los otros ocho haplogrupos principales que se encuentran en la población europea (I, U, K, J, T, W, X y V) [29] y, en un porcentaje minoritario, los haplogrupos D, M, L, M, N, O, P, y R. Como puede verse a partir de los datos, los haplogrupos H, U, W y fueron más frecuentes en los pacientes que en los controles, mientras que los haplogrupos I, J, y K se observaron en los controles ( Tabla 2). Sin embargo, no hay diferencias significativas en las frecuencias de haplogrupos entre los pacientes con cáncer de próstata y de control de los sujetos esporádicos se podían encontrar, como también lo informado por Mueller et al. [21], que realizó un estudio de casos y controles de 304 pacientes con carcinoma de próstata en el centro de Europa. Sin embargo, un estudio realizado en una población norteamericana del descendiente Europea informó de una presencia elevada del haplogrupo T en pacientes con carcinoma de próstata [10]. Una de las limitaciones de nuestro estudio es el tamaño de la muestra restringida (239 pacientes y 150 controles).
La comparación de los haplogrupos en este estudio con la de la población española [30], los porcentajes de haplogrupos mitocondriales en España eran encontrado para ser muy similares a los datos obtenidos en nuestro análisis (46,53% H, 19,10% de U, 9,03% T, 7,29% J, 5,56% K, y 1,74% I) (Figura 1).
con En cuanto al análisis clínico característico, no se observó ninguna asociación entre el haplogrupo mitocondrial y la edad, los niveles séricos de PSA, la puntuación de Gleason, o T-etapa. Sin embargo, cuando se clasificaron todas las características clínicas, no se encontró asociación con cualquier haplogrupos debido al hecho de que el limitado número de pacientes incluidos no fue suficiente para el análisis estadístico en pequeños subgrupos. Sin embargo, los niveles más altos de PSA (10.1-20, & gt; 1000; 20 y & gt) y se encontraron puntuaciones de Gleason (7 y 8-10), y el aumento de las proporciones de la T-etapa C en pacientes con los haplogrupos H y U ( Tabla 4)
el SNP en la región D-loop se han examinado en otros tipos de tumores (mama, de páncreas o el melanoma, entre otros) [31] - [33]. como factores de predicción de riesgo de cáncer. Por esta razón, también comparamos los polimorfismos germinales CR de ADN mitocondrial en pacientes con cáncer de próstata esporádicos.
La variante T16356C ha sido previamente relacionada con glioblastoma [34] y el cáncer de mama. En el cáncer de mama, se ha incluido como una variación de la secuencia de la línea germinal [35]. Dentro de nuestra cohorte de cáncer de próstata, la mutación T16356C mostró frecuencias significativamente elevados en pacientes con cáncer de próstata en comparación con los controles (p = 0,029). El polimorfismo C16278T también ha sido previamente relacionada con el cáncer, particularmente al cáncer de mama en Tan et al. [35], y a neurofibromatosis de tipo 1 [36], así como para otros trastornos, tales como la enfermedad de Parkinson [37]. Entre nuestros sujetos con cáncer de próstata, también hemos encontrado frecuencias elevadas casi significativas en pacientes con cáncer de próstata en comparación con los controles (p = 0,051). Sin embargo, no está claro si estos polimorfismos pueden estar involucrados en la formación de tumores o la progresión, o el desarrollo de las otras enfermedades mencionadas anteriormente
.
El polimorfismo A16183C ha sido establecido por MITOMAP [24] o la base de datos Human Genome mitocondrial [23] que estar relacionado con la enfermedad de cáncer de próstata [11], [38]. Sin embargo, en nuestra cohorte, no hemos encontrado una asociación significativa entre este polimorfismo y la enfermedad (p = 0,428). . En el análisis realizado por Jerónimo y otros, la posición 16183 se ha descrito como una mutación del ADNmt en cáncer de próstata por el cambio A → G [38]; estudios realizados por Makiko et al. ha asociado este polimorfismo a pacientes con cáncer de pulmón [39].
Asimismo, analizaron los parámetros clínicos para determinar si los polimorfismos de RC en la cohorte de pacientes se correlacionan con la agresividad de la enfermedad. Se encontró que los polimorfismos G16129A y T16224C estar asociados con puntuaciones de Gleason menos agresivos (2-6) [40], con las puntuaciones más cercanos a 2 como el menos agresivo y los junto a 10 como el más agresivo [41]. La sustitución G16129A se ha descrito en el cáncer de tiroides y, en combinación con T16362C, podría tener un efecto sobre la replicación del ADN mitocondrial y /o de la transcripción, así como en el aumento del riesgo de cáncer de tiroides [27]. Por otra parte, la mutación T16224C ha sido descrita en pacientes con cáncer de piel no melanoma, pero ninguna asociación con la enfermedad ha sido establecida [42]. Al analizar los resultados, hay fuerte relación podría establecerse debido a que los porcentajes de puntuación de Gleason de esta variante quedaron por debajo del 5%. La variante T16311C fue encontrado en una frecuencia más alta en pacientes con T-etapa B (también conocida como fase II), que incluye cánceres que no se han propagado fuera de la próstata (cáncer local) [43], [44]. Este polimorfismo fue descrito previamente por Chen et al. [45] como una mutación del ADNmt detectado en la región D-loop en las lesiones neoplásicas disecados a partir de 16 piezas de prostatectomía, pero no hay información acerca de las características clínicas han transmitido; también se ha encontrado para ser asociado de forma significativa con el cáncer colorrectal humano [46].
Debido a que sólo se analizaron CR y haplogrupos mitocondriales, mitocondriales de codificación polimorfismos región no pueden ser excluidas como posibles mutaciones asociadas con el cáncer de próstata [8], [47]. Las mutaciones somáticas en el ADN mitocondrial (ADNmt) se han identificado en varios tumores, incluyendo el cáncer de mama [48], carcinoma de células escamosas [49], y el cáncer de próstata [15], [50]. En el carcinoma de células escamosas, que se asociaron con una mejor supervivencia. Sin embargo, en el cáncer de mama se sugieren mutaciones somáticas para jugar un papel crítico en la progresión del cáncer. Las mutaciones somáticas son eventos frecuentes en el cáncer de próstata. Las mutaciones de mapeo para tRNAs mitocondriales, ARN ribosómicos, y genes de codificación de proteínas podría afectar los procesos que ocurren dentro del compartimento mitocondrial (por ejemplo, la transcripción, el procesamiento del ARN, y traducción) y en última instancia puede afectar a la fosforilación oxidativa [15]. De la línea germinal y mutaciones somáticas también se han descrito en pacientes con fibromas uterinos [51] y el cáncer de próstata [50], pero no hay tanta información sobre estos como para las mutaciones somáticas en el cáncer. En este estudio, las muestras de ADN genómico de sangre solamente estaban disponibles, y ninguna asociación entre las mutaciones somáticas se pudo determinar.
En conclusión, nuestro estudio confirma la falta de asociación entre cualquier haplogrupo mitocondrial y el cáncer de próstata esporádico.
Métodos
Ética Declaración
Este estudio cumplió con la Declaración de Helsinki. El consentimiento informado se obtuvo de todos los sujetos antes de que se introdujeron en el estudio. El estudio y el uso de muestras de archivo para este proyecto fueron aprobados por el Comité de Ética de la Universidad "Hospital Virgen de las Nieves" de Granada, España.
Pacientes y controles
Los pacientes con cáncer de próstata esporádico cáncer fueron seleccionados por un urólogo, que también hizo anotaciones sobre los parámetros importantes para el cáncer de próstata, como el nivel de PSA, T-score, la puntuación de Gleason, y otra información, incluyendo la edad, lugar de nacimiento, y la historia familiar de cáncer de próstata. En resumen, los pacientes elegibles eran machos adultos con un diagnóstico reciente de cáncer de próstata (n = 239). Las características clínicas de los pacientes seleccionados para el estudio fueron confirmados histopatológicamente un adenocarcinoma primario después de hallazgos anormales de PSA sérico y /o síntomas del tracto urinario inferior. Nuestros pacientes eran hombres europeos no relacionadas con una edad media de 67,4 años y una puntuación de Gleason media de 7,0, lo que indica un patrón de crecimiento dominante del tumor [52] - [54]. los hombres europeos sanos no relacionados (n = 150) de la misma área geográfica, sin antecedentes de cáncer de próstata se inscribieron como controles (no se detectaron niveles de PSA y la evolución clínica durante algunos años se siguió para evitar la inclusión de los hombres afectados con cáncer de próstata como controles). Controles pertenecían al mismo grupo de edad de los pacientes; todos ellos eran hombres con problemas de salud como la litiasis renal o problemas andrológicas, por lo que se realizó un análisis de PSA para descartar un posible cáncer de próstata. Todos ellos tienen valores de PSA normales con los niveles en sangre por debajo de 4 ng /ml, así como un tacto rectal normal. El consentimiento informado se obtuvo de todos los sujetos de este estudio, que fue aprobado por el Comité de Ética del hospital. Muestras de sangre periférica se obtuvieron de todos los participantes (n = 389) en tubos que contenían K3-EDTA.
Extracción de ADN y genotipificación
ADN genómico de los pacientes y controles se extrajo a partir de sangre periférica utilizando el estándar procedimiento de extracción orgánica por fenol /cloroformo /alcohol isoamílico y proteinasa K, y purificación con Microcon® 100 filtros (Millipore). la secuenciación del ADN mitocondrial y haplotyping se realizaron usando AmpliTaq Gold® PCR Master Mix (Applied Biosystems), que incluye todos los componentes químicos, excepto los cebadores y la plantilla, necesarios para la PCR en un termociclador 2400 Sistema GeneAmp. Cada reacción de PCR se realizó en un volumen total de 25 l que contienen 1 a 2 ng /l de ADN, 0,5 l de cada cebador que cubre la región HVI (posiciones de nucleótidos 16024 a 16365), y 12,5 l de AmpliTaq Gold® PCR Master Mix ( Applied Biosystems). Las condiciones de amplificación fueron 95 ° C durante 11 min seguido de 32 ciclos a 95 ° C durante 10 seg, a 60 ° C durante 30 seg, y a 72 ° C durante 30 seg. Los amplicones fueron purificados usando Microcon® 100 filtros (Millipore). Las reacciones de secuenciación se realizaron utilizando kits Ready Reaction ABI PRISM BigDye Terminator Cycle Sequencing v.1.1. Cada reacción de secuenciación se realizó en un volumen total de 10 l que contenía 3 l de DNA, 3 l de cada cebador específico, 2 l de kit, y 2 l de tampón del kit ABI PRISM® v.3.1 BigDye Terminator. Las condiciones de ciclado térmico fueron 95 ° C durante 1 min seguido de 25 ciclos a 95 ° C durante 15 seg, a 50 ° C durante 1 seg, y a 60 ° C durante 2 min. El exceso de terminador de colorante se eliminó mediante filtración en gel con cartuchos DTR ® Performa (EdgeBio) y se analizaron utilizando el secuenciador automático de ADN ABI PRISM® 3130 (Applied Biosystems). Los resultados del análisis fueron editadas utilizando el software ABI PRISM v.2.6 SeqScape®.
haplotipo de marcado y análisis estadístico
haplogrupos se definen por los polimorfismos CR y cualquier rango de entrega del genoma mitocondrial se puede utilizar para la clasificación haplogrupo, que se basa en la estabilidad filogenético de polimorfismos de ADNmt. La asignación de haplogrupos a las muestras se realizó utilizando el software en línea para el ADN mitocondrial, como la herramienta de predicción de haplogrupo "El Proyecto Genográfico" [55], Aplo búsqueda haplogrupo [56], y el gerente de ADNmt [57]. Por otra parte, todos los haplogrupos en este estudio fueron confirmados por los programas de Web, como HaploGrep [58] y Phylotree [25]. Los resultados obtenidos fueron analizados y revisados por la experiencia personal en la zona por la presencia o ausencia de algunas posiciones en comparación con la secuencia de referencia y verificados por el uso de la última versión disponible en Phylotree [25].
Uso del paquete de software SPSS versión 15.0 [59], hemos realizado los análisis estadísticos, incluyendo la χ
2 prueba, la prueba exacta de Fisher, la prueba de Monte Carlo, y tablas de contingencia generados. Las frecuencias de todos los haplogrupos mitocondriales y polimorfismos de RC en los pacientes con cáncer de próstata y los controles se realizarán las pruebas de independencia mediante estadística de chi-cuadrado de Pearson y prueba exacta de Fisher, según corresponda. Estos análisis se realizaron para probar la independencia entre los datos haplogrupo y los datos clínicos, como la edad (≤55, 56-60, 61-65, & gt; 65), la puntuación de Gleason (2-6, 7, 8-10) , T-etapa (A, B, C, D), y los niveles de PSA (≤4.0, 4,1-10, 10,1-20, & gt; 20, & gt; 1,000). Todas las pruebas consideradas la significación estadística (valor p) nominal para ser & lt; 0,05. Sólo CR variantes con una frecuencia ≥4% ya sea en el cáncer de próstata o el grupo de control se sometieron a más análisis estadístico. Asociación de T16356C con la enfermedad fue ajustada por edad por análisis de regresión logística. Para se corrigió el análisis del polimorfismo T16356C significativo valor de p para comparaciones múltiples mediante el análisis de Bonferroni que conducen a un nuevo nivel de significación requerido de & lt; 0,0004 (número de comparaciones = 125). Se realizó un análisis desequilibrio de unión entre todos los pares de polimorfismos CR utilizando 10.000 pasos de la cadena de Markov y 1.000 pasos dememorization. D, D ', y r2 coeficientes se calcularon con un nivel de significación de 0,05 usando el software v3.5 Arlequin [60].
Apoyo a la Información sobre Table S1.
control polimorfismos región y la clasificación haplogrupo para 239 pacientes con cáncer de próstata esporádico
doi:. 10.1371 /journal.pone.0041201.s001 gratis (PDF) sobre Table S2.
control polimorfismos región y la clasificación haplogrupo para 150 controles con cáncer de próstata esporádico
doi:. 10.1371 /journal.pone.0041201.s002 gratis (PDF) sobre Table S3.
desequilibrio significativo de vinculación para los polimorfismos CR
doi:. 10.1371 /journal.pone.0041201.s003 gratis (PDF): perfil
Reconocimientos
Agradecemos a todos los donantes y la servicio de Urología de la Universidad "hospital Virgen de las Nieves" (Granada, España) por hacer posible este estudio. También se agradece a la Universidad de Granada para la puesta a disposición de todo el paquete de software utilizado en el análisis.