Extracto
Antecedentes
El 5p15.33 locus humano contiene dos genes conocidos, la telomerasa transcriptasa inversa (
de TERT) y el labio leporino y el paladar transmembrana 1 reversa -como (
CLPTM1L
), genes que han sido implicados en la carcinogénesis. Una variante de la secuencia común, rs401681, situada en una región intrónica de
CLPTM1L
, se ha informado de que se asocia con el riesgo de cáncer de pulmón basado en el estudio de asociación del genoma. Sin embargo, la repetición de estudios posteriores en diversas poblaciones han arrojado resultados inconsistentes. Además, variantes genéticas en 5p15.33, incluyendo rs401681, se han demostrado estar involucrados en la susceptibilidad a varias enfermedades malignas. Sin embargo, el papel de estos
terc-CLPTM1L
variantes en la etiología del carcinoma esofágico de células escamosas (CECA) sigue siendo desconocido.
Métodos
Estamos genotipo del polimorfismo rs401681 utilizando TaqMan metodología y analizó su asociación con el riesgo de cáncer de pulmón y la CECA en un estudio de casos y controles de 1.479 pacientes con cáncer (726 con cáncer de pulmón y 753 con CECA) y 860 individuos sanos.
resultados
análisis de regresión logística reveló que los genotipos rs401681 T se asocian con un riesgo significativamente menor de cáncer de pulmón (TC vs. CC: OR ajustada = 0,782, 95% CI = 0,625 a 0,978,
P = 0,031
; CT /TT vs CC: OR ajustada = 0,786; IC del 95% = 0,635 hasta 0,972,
P = 0,026
). análisis de la estratificación por tipo histológico indicó que rs401681 genotipos T se asocian con un riesgo significativamente reducido de adenocarcinoma y carcinoma de células escamosas. Por otra parte, no se observó una asociación significativa entre rs401681 y el riesgo de CECA (TC vs. CC: OR ajustado = 0,910; IC del 95% = 0,734 a 1,129,
P = 0,392
; TT vs CC: OR ajustada = 0,897, IC del 95% = 0,624 a 1,290,
P = 0,558
; CT /TT vs CC: OR ajustada = 0,908; IC del 95% = 0,740 a 1,114,
P = 0,355
).
conclusiones
Nuestros resultados proporcionan más evidencia de apoyo rs401681 como una variante genética asociada con el riesgo de cáncer de pulmón. Además, se investigó la correlación entre la variante rs401681 y el riesgo de CECA en una población china Han, y nuestros resultados sugieren que esta variante genética no puede estar involucrado en el riesgo de la CECA
Visto:. Jiang M, Wu H, Qin C (2013) rs401681 variante genética en 5p15.33 Modifica la susceptibilidad al cáncer de pulmón, pero no de esófago carcinoma de células escamosas. PLoS ONE 8 (12): e84277. doi: 10.1371 /journal.pone.0084277
Editor: Swati Palit Deb, Virginia Commonwealth University, Estados Unidos de América
Recibido: 28 Julio, 2013; Aceptado: 13 Noviembre 2013; Publicado: December 30, 2013
Derechos de Autor © 2013 Jiang et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este trabajo fue apoyada por la beca número 2005GG3202192 de la Comisión de Ciencia y Tecnología de Shandong de China (http://www.sdstc.gov.cn/). Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer de pulmón ha sido el tipo de cáncer más común en el mundo desde hace varias décadas, así como la causa más común de muerte por cáncer. Además, el cáncer de esófago es el octavo cáncer más común en todo el mundo, con 482.000 nuevos casos estimados en 2008, y representa la sexta causa más común de muerte por cáncer, siendo responsable de 407.000 muertes [1] - [2]. Las tasas de mortalidad por cáncer de pulmón y la CECA son particularmente altos en China [3] - [4].
Recientemente, los estudios de asociación de genoma completo (Glass) han demostrado que el común
terc-CLPTM1L
variantes en 5p15.33 pueden influir en el riesgo de cáncer de pulmón en desarrollo, así como otros tipos de cáncer [5] - [11]. En particular, mediante la agrupación de los datos de GWAS disponibles en el cáncer de pulmón, Timofeeva et al. [12] identificado loci de susceptibilidad común en 5p15 y demostraron efectos de histología específica de 5p15 loci. Tanto
de TERT
y
CLPTM1L ¿Cuáles son atractivas genes candidatos, ya que ambos han sido implicados en la carcinogénesis.
de TERT
codifica la subunidad catalítica de la telomerasa, una enzima que mantiene los telómeros termina mediante la adición de la TTAGGG telómero de repetición. Los telómeros son las estructuras de repetición de ADN unidas a proteínas en los extremos de los cromosomas y son importantes en el mantenimiento de la estabilidad genómica [13] - [15]. Otro potencial gen candidato causal en la región 5p15.33 es
CLPTM1L
, que ha sido informado a participar en la respuesta celular al estrés genotóxico y la resistencia a cisplatino [16]. Además, la sobreexpresión de
CLPTM1L
se ha observado en varios tipos de cáncer, incluyendo el cáncer de pulmón [17] - [20]
El polimorfismo rs401681, situada en una región intrónica de.
CLPTM1L
, se ha informado que se asocia con el riesgo de cáncer de pulmón basado en el estudio de asociación del genoma [5]. Sin embargo, la repetición de estudios posteriores en diversas poblaciones han arrojado resultados inconsistentes. Myneni et al. [21] y Ke et al. [22] encontró que rs401681 se asoció significativamente con el riesgo de cáncer de pulmón en la población asiática, mientras que otro estudio que examinó 501 casos de cáncer de pulmón y 576 controles sin cáncer detectó ninguna asociación entre esta variante genética y el riesgo de cáncer de pulmón en una población de la misma origen étnico [23]. Además, un estudio realizado en una población de Corea encontró que rs401681 se asoció con un riesgo significativamente menor de cáncer de pulmón en virtud de un modelo dominante para el alelo variante [24]. Sin embargo, no se observó una asociación significativa entre esta variante y el cáncer de pulmón de riesgo genético en la raza blanca de Noruega [25]. Diferentes diseños de estudio y tamaño de las muestras, así como la heterogeneidad histológica pueden contribuir a las discrepancias observadas en estos estudios. Por otra parte, dadas las diferencias en los antecedentes genéticos y los patrones de vinculación desequilibrio entre las poblaciones, se espera que los estudios independientes llevados a cabo en diversas poblaciones van a arrojar más luz sobre el papel de esta variante genética en el riesgo de cáncer.
En la mayoría de los casos, las variantes genéticas comunes que se han asociado con el riesgo de cáncer parecen ser específicas para un tipo de cáncer particular. Sin embargo, los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en posibles asociaciones del
terc-CLPTM1L
región, incluyendo rs401681, han demostrado en múltiples tipos de cáncer [26] - [28]. Recientemente, se informó de rs401681 [C] para estar asociado con un mayor riesgo de carcinoma de células basales y de pulmón, vejiga urinaria, próstata y cánceres de cuello uterino. A la inversa, rs401681 [C] parece conferir protección contra el melanoma cutáneo [6], [7]. Además, un reciente GWAS demostró que rs401681 puede modificar la susceptibilidad individual a cáncer de páncreas [8]. El polimorfismo rs401681 ha sido ampliamente estudiada en diferentes grupos étnicos y tipos de cáncer. Sin embargo, el papel de esta variante genética en CECA susceptibilidad es aún desconocido. Aquí, hemos intentado abordar estas cuestiones mediante la realización de un estudio de casos y controles en una población china Han.
Materiales y Métodos
Sujetos de estudio
Este estudio de casos y controles incluidos 726 pacientes con cáncer de pulmón, 753 pacientes con cáncer de esófago y 860 controles sanos. Todos los sujetos de este estudio eran individuos no emparentados genéticamente étnicos chinos Han de la provincia de Shandong, en el norte de China. Los casos con diagnóstico histológico de pulmón primario o cáncer de esófago fueron reclutados 2011-2013 en Qilu Hospital y la Provincial Hospital Afiliado a la Universidad de Shandong (Jinan, China). El tipo histológico de los tumores se diagnosticó sobre la base de biopsias o muestras resecadas. Los carcinomas esofágicos fueron todos los carcinomas de células escamosas. Se excluyeron los pacientes con cáncer primario fuera de los pulmones y el esófago y el cáncer de origen primario desconocido. Los participantes sanos, que presentaron ninguna historia o el diagnóstico de cáncer o enfermedad genética, fueron reclutados de las personas que visitaron los mismos hospitales para un chequeo de rutina durante el mismo período. Los pacientes o los controles que tenían recientemente (en los últimos 6 meses) recibieron transfusiones de sangre fueron excluidos. Los casos y controles fueron emparejados por edad (± 5 años) y sexo. A todos los participantes se les dio una explicación del estudio, y el consentimiento informado por escrito de cada sujeto. Este estudio fue aprobado por los Comités de Ética del Hospital Provincial afiliado a la Universidad de Shandong.
Recogida de datos
Un cuestionario estructurado se completó para cada caso y control por un entrevistador entrenado para obtener datos demográficos ( por ejemplo, edad, sexo) y la información sobre los factores de riesgo relacionados (incluyendo el tabaquismo y consumo de alcohol). Las personas que habían fumado un cigarrillo al día durante más de 1 año se consideraron fumadores. Los sujetos fueron considerados bebedores de alcohol si bebían al menos una vez por semana durante más de 1 año.
Extracción de ADN y Genotipado
Una muestra de sangre venosa se recogieron de cada sujeto, y se extrajo el ADN genómico dentro 1 semana después del muestreo usando el Sistema DNA Blood RelaxGene (Tiangen Biotech (Beijing) Co., Ltd.) de acuerdo con el protocolo del fabricante. La calidad y cantidad del ADN se comprueba mediante GeneQuant Pro (Amersham Biosciences). El polimorfismo rs401681 se genotipo utilizando la metodología TaqMan en placas de 96 pocillos y se lee con el software de detección de secuencias (SDS, versión 1.4), utilizando el Applied Biosystems (ABI) 7500 Real-Time PCR System. La genotipificación se realizó sin conocimiento de causa o de control de estado de los sujetos. Los ensayos de genotipificación se repitieron al azar el 12% de las muestras, y los resultados fueron 100% concordantes.
Análisis estadístico
χ de Pearson
2 se utilizó la prueba para examinar las diferencias en el distribuciones de las variables de categoría, incluyendo características demográficas, variables seleccionadas, y las frecuencias de genotipo /alelos, entre los casos y controles. Hardy-Weinberg fue probado usando un χ
2 prueba de bondad de ajuste para comparar las frecuencias genotípicas observadas a las frecuencias esperadas entre los sujetos de control. Las asociaciones entre el polimorfismo rs401681 y el riesgo de cáncer se estimaron mediante el cálculo de la odds ratio (OR) y sus intervalos de confianza del 95% (IC) mediante análisis de regresión logística para las RUP crudo y ajustado RUP al ajustar por edad, sexo y tabaquismo y la condición de potable. Los análisis estadísticos se realizaron con el programa SPSS (versión 19) y Stata (versión 12.0), y un
P-valor de
. & lt; 0,05 se estableció como criterio de significación estadística
Resultados
Características de los sujetos
Un total de 1.479 pacientes con cáncer (726 con cáncer de pulmón y 753 con CECA) y 860 controles sanos fueron incluidos en el análisis. Las distribuciones demográficas del cáncer de pulmón y pacientes CECA y controles sanos se muestran en la Tabla 1. La edad y sexo distribuciones no fueron significativamente diferentes entre los casos y controles. Sin embargo, había más nunca fumadores entre el cáncer de pulmón y pacientes CECA (66,4 y 59,1%, respectivamente) que en el grupo control (34,7%;
P
& lt; 0,001 para ambos). Además, la proporción de bebedores de alcohol tanto en el cáncer de pulmón y los grupos de pacientes CECA fue significativamente diferente de la de los controles sanos. Por lo tanto, estas variables se ajustaron aún más en el análisis de regresión logística multivariante posterior. Dentro del grupo de cáncer de pulmón, los pacientes con carcinoma de células escamosas, adenocarcinoma, carcinoma de células pequeñas, y otros carcinomas representaron el 34,6%, 37,7%, 19,4% y 8,3% de los sujetos, respectivamente. Los carcinomas esofágicos fueron todos los carcinomas de células escamosas.
Asociación entre rs401681 y el riesgo de cáncer de pulmón y la CECA
Las frecuencias alélicas y genotípicas del polimorfismo rs401681 en el cáncer de pulmón y la CECA pacientes y controles sanos se presentan en la Tabla 2. entre los 860 sujetos de control, las frecuencias genotípicas fueron 45,9% CC, CT 44,0% y el 10,1% TT, y las frecuencias de los alelos fueron 67,9% y 32,1% C T. El genotipo frecuencias observadas entre los sujetos de control cumplen Hardy-Weinberg. En general, la distribución de los genotipos en el grupo de cáncer de pulmón no fue significativamente diferente de la de los controles sanos (
P
= 0.121). Sin embargo, una diferencia significativa en el genotipo combinado se observó (CT + TT) de frecuencia entre los pacientes con cáncer de pulmón y los sujetos control (
P = 0,040
).
Como se muestra en la tabla 3, análisis de regresión logística reveló que los genotipos rs401681 T se asocian con un riesgo significativamente menor de cáncer de pulmón (TC vs. CC: OR ajustada = 0,782, IC del 95% = 0,625-0,978,
P = 0,031
; CT /TT vs CC: OR ajustada = 0,786; IC del 95% = 0,635 a 0,972,
P = 0,026
). Por otra parte, el alelo T rs401681 estaba en el límite significativamente asociado con un menor riesgo de cáncer de pulmón. Además, evaluó la asociación entre rs401681 y el riesgo de cáncer de pulmón estratificado según la histología. Como se muestra en la Figura 1, el análisis de la estratificación por tipo histológico indicó que los genotipos rs401681 T se asocian con un riesgo significativamente reducido de adenocarcinoma y carcinoma de células escamosas, pero no con el carcinoma de células pequeñas.
análisis de la estratificación por tipo histológico reveló que los genotipos rs401681 T se asocian con un riesgo significativamente reducido de adenocarcinoma y carcinoma de células escamosas.
Para los pacientes con carcinoma de esófago, las frecuencias de genotipo de la variante rs401681 no fueron significativamente diferentes entre los casos y controles. Además, el alelo T rs401681 fue menos frecuente entre los casos que entre los controles, aunque esta diferencia no fue estadísticamente significativa (Tabla 2). Después de ajustar por edad, sexo y estado de fumar y beber en un análisis de regresión logística multivariante, no se observó una asociación significativa entre rs401681 y la susceptibilidad al carcinoma esofágico (TC vs. CC: OR ajustada = 0,910; IC del 95% = 0,734-1,129; TT vs CC: OR ajustada = 0,897; IC del 95% = 0,624-1,290; CT /TT vs CC:. OR ajustada = 0,908, IC del 95% = 0,740-1,114) (Tabla 3)
Discusión
Telomere biología ha sido implicado en la patogénesis de una variedad de enfermedades pulmonares [29]. Un estudio anterior indicaba que la disfunción de los telómeros puede actuar como un supresor tumoral potente y promotor en el compartimiento epitelial de pulmón, dependiendo del estado del telómero disfunción inducida puesto de control [30]. En NSCLC avanzado, un alto nivel de pretratamiento de terc circulantes puede servir como un marcador de mal pronóstico independiente de la supervivencia global [31]. Telomere biología juega un papel crítico y complejo en la iniciación y progresión del cáncer [32], [33]. La relevancia funcional exacta del polimorfismo rs401681 en cuanto a su asociación con el cáncer de pulmón momento clara, pero algunos estudios anteriores proporcionan un enlace a esta asociación [6], [25]. Esta variante puede estar en fuerte desequilibrio de ligamiento (LD) con otros SNPs funcionales o causales potenciales que contribuyen al riesgo de cáncer de pulmón. Por ejemplo,
CLPTM1L
rs402710, que es fuerte en LD con rs401681, se ha informado que se asocia con niveles significativamente más altos de aductos voluminosos aromáticos /hidrófobos de ADN en el tejido pulmonar adyacente a los tumores [25]. Por otra parte, rs401681 [C] se ha demostrado que se asocia con telómeros más cortos [6]. De acuerdo con observaciones anteriores de un análisis conjunto [26], los resultados de nuestro estudio de casos y controles sugirieron que los genotipos rs401681 T se asocian con un riesgo significativamente reducido de adenocarcinoma de pulmón y carcinoma de células escamosas. Una gran análisis combinado realizada por Timofeeva et al. confirmado que dos variantes de susceptibilidad independientes en 5p15.33 (
TERT
rs2736100 y
CLPTM1L
rs401681) actúan como determinantes del riesgo de cáncer de pulmón, que afectan diferencialmente la histología del cáncer de pulmón. El riesgo asociado con rs2736100 se limita en gran medida a adenocarcinoma. Sin embargo, rs401681 influye en el riesgo de todas las histologías de cáncer de pulmón, pero su efecto más fuerte es el carcinoma de células escamosas [12].
Un reciente meta-análisis por tipo de cáncer demostró que rs401681 [T] portadores muestran un modesto aumento riesgo de carcinoma de páncreas y melanoma de la piel. En contraste, se observó una modesta reducción de riesgo de vejiga, de pulmón y el cáncer de próstata, así como de células basales y escamosas de la piel carcinomas de células [26]. En el presente estudio de casos y controles, el alelo T rs401681 fue menos frecuente entre los casos de cáncer de esófago que los controles, aunque esta diferencia no fue estadísticamente significativa. Después de ajustar por edad, sexo y tabaquismo y el estado de la bebida en un análisis de regresión logística multivariante, no se encontró asociación significativa entre rs401681 y la susceptibilidad a la CECA. Varios estudios han informado de una asociación entre los telómeros cortos y un mayor riesgo de cáncer de esófago [34] - [38]. Un estudio de asociación del genoma anterior demostró que cuatro SNPs (rs621559 en 1p34.2, rs398652 en 14q21, rs6028466 en 20q11.22 y rs654128 en 6q22.1) se asociaron con la longitud de los telómeros de leucocitos en poblaciones caucásicas [39]. En un estudio posterior de 1550 pacientes CECA y 1620 controles en China, Shi et al. [40] encontró que tanto rs621559 y rs398652 se asociaron significativamente con el riesgo de la CECA en el aditivo, los modelos genéticos recesivos o dominantes. Sin embargo, en el presente estudio, se detectó ninguna asociación entre rs401681 y el riesgo de CECA, aunque se ha informado rs401681 [C] para asociarse con telómeros más cortos con significación nominal [6].
Varias limitaciones de nuestra estudio debe ser discutido. En primer lugar, el sesgo de selección no puede ser evitable. Sin embargo, los casos y los controles sanos fueron reclutados de la misma área y agrupados por edad y sexo. En segundo lugar, el tamaño de la muestra en este estudio no fue lo suficientemente grande como para llegar a una conclusión firme, y el poder estadístico del estudio puede ser limitada. En tercer lugar, no podemos excluir la posible función de otros SNPs funcionales o SNP marcadores de etiquetas de
terc-CLPTM1L con descuento que no se incluyeron en el presente estudio de riesgo de la CECA. Por último, incorporamos las principales variables de confusión en nuestro análisis. Sin embargo, otros factores de riesgo detallados no se incluyeron en los modelos de regresión logística debido a la información incompleta o faltante.
En resumen, nuestros resultados sugieren que rs401681 puede modificar la susceptibilidad al cáncer de pulmón, pero no CECA. Aunque no se encontró una asociación significativa entre esta variante genética y la susceptibilidad a la CECA, más variantes en el
necesita ser investigado para evaluar mejor el papel de esta región genómica en la tumorigénesis de esófago terc-CLPTM1L
locus.
Reconocimientos
Los autores agradecen a todos los sujetos que participaron en este estudio.