Extracto
Antecedentes
Un estudio de asociación del genoma recientes han identificado una nueva genética rs7758229 variantes en
SLC22A3 Opiniones de susceptibilidad al cáncer colorrectal en una población japonesa, pero se desconoce si esta variante recientemente identificado está asociado con el cáncer colorrectal en otras poblaciones, incluyendo la población china.
Métodos
Hemos examinado las asociaciones entre rs7758229 y el riesgo de cáncer colorrectal entre los 1.147 casos y 1.203 controles emparejados por edad y sexo. Se utilizó un modelo de regresión logística para evaluar las asociaciones.
Resultados
No se encontró asociación significativa entre rs7758229 y el riesgo de cáncer colorrectal (OR = 0,95, IC del 95% = 0,84 a 1,09,
P = 0,463
). Resultados similares se observaron en la estratificación de la localización del tumor (OR = 0,94, IC del 95% = 0,80 a 1,11,
P = 0,481
para el cáncer de colon, y OR = 0,96, IC del 95% = 0,82 a 1,13,
P = 0,621
para el cáncer de recto).
conclusiones
Nuestros hallazgos no apoyan una asociación entre rs7758229 en 6q26-q27 y el riesgo de cáncer colorrectal en una población china.
Visto: Zhu L, M Du, Gu D, Ma L, H Chu, Tong N, et al. (2013) rs7758229 variante genética en 6q26-q27 no está asociado con riesgo de cáncer colorrectal en una población china. PLoS ONE 8 (3): e59256. doi: 10.1371 /journal.pone.0059256
Editor: Hengyi Rao, Universidad de Pennsylvania, Estados Unidos de América
Recibido: 21 Septiembre, 2012; Aceptado: 12 de febrero de 2013; Publicado: 12 Marzo 2013
Derechos de Autor © 2013 Zhu et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este estudio fue apoyado en parte por la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (81201570, 81102089 y 81230068), la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de la provincia de Jiangsu (BK2010080 y BK2011773), el Programa clave de Investigación básica de Jiangsu Provincial del Departamento de Educación (11KJB330002), los Qing Lan Proyecto de Jiangsu Provincial del Departamento de Educación, y el proyecto financiado por el Programa de Desarrollo Académico prioridad de instituciones de educación superior de Jiangsu (Salud Pública y Medicina Preventiva). Los proveedores de fondos no tiene función alguna en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
el cáncer colorrectal es la causa principal de muerte relacionada con el cáncer en la mayoría de los países, que es causada por una combinación de factores de riesgo genéticos y ambientales [1], [2], [3]. Los estudios con gemelos han demostrado que las cuentas de susceptibilidad genética para el ~ 35% de la etiología de la enfermedad, la mayoría de los cuales todavía no está claro [4]. Reciente disponibilidad generalizada de enfoques genómicos de alto rendimiento han proporcionado la oportunidad de analizar los genomas de un gran número de individuos en los estudios de asociación de genoma completo (GWAS) rápidamente [5]. Varios GWAS se ha completado con el fin de identificar las variantes genéticas que influyen en el riesgo de cáncer colorrectal [6]. Anteriormente, tres de validación [7], [8], [9] Los estudios en China no puede replicar la mayoría de loci identificados-GWAS, lo que sugiere que había heterogeneidad genética entre los caucásicos y los asiáticos.
Recientemente, Cui et al. llevado a cabo un GWAS en una población japonesa (4.809 casos de cáncer colorrectal y 2.973 controles) y identificado un nuevo locus rs7758229 en
SLC22A3
para el cáncer de colon distal [10]. Por otra parte, se encontraron efectos acumulativos de rs7758229, otros factores genéticos y ambientales podrían aumentar el riesgo de cáncer colorrectal. Sin embargo, se sabe poco o nada acerca de si existe o no el efecto de este locus en otras poblaciones de Asia. A continuación, se llevó a cabo un estudio de casos y controles independientes para evaluar la asociación entre rs7758229 identificado por Cui et al. y el riesgo de cáncer colorrectal en una población china.
Materiales y Métodos
Estudio de la población
Los pacientes de cáncer colorrectal fueron reclutados a partir de septiembre de 2010 en el Primer Hospital Afiliado y Nanjing Primera el hospital de la Universidad médica de Nanjing, que se han descrito en detalle anteriormente [11]. Todos los casos fueron confirmados histológicamente de adenocarcinoma colorrectal. El estadio patológico de cáncer colorrectal se clasificó en Dukes A, B, C, y D. grado del tumor se divide en bajo, intermedio y alto. Los sujetos control fueron seleccionados al azar de un grupo de más de 25.000 individuos libres de cáncer sobre la base de exámenes físicos y para los casos en misma edad y sexo de la frecuencia. Los criterios de exclusión incluyeron sin antecedentes de cáncer. Después de haber firmado el consentimiento informado, cada sujeto donó 5 ml de sangre para la extracción de ADN genómico. Este estudio fue aprobado por las juntas de revisión institucional de la Universidad de Medicina de Nanjing.
Genotipado
ADN genómico se aisló de linfocitos de sangre periférica. En este estudio, rs7758229 se genotipo utilizando el ensayo TaqMan (Applied Biosystems). Las secuencias de cebador y sonda para cada SNP están disponibles bajo petición. Se utilizó el ADN genómico de 50 ng y 0,5 × mezcla (Takara Bio, JPN) para cada reacción y la amplificación se realizó bajo las siguientes condiciones: 50 ° C durante 2 min, 95 ° C durante 10 min seguido de 45 ciclos de 95 ° C durante 15 s, y 60 ° C durante 1 min. Se evaluó la calidad de los datos de genotipo escribiendo el 10% de las muestras replicadas cegados; la tasa de concordancia fue 100,0%.
Los análisis estadísticos
Hardy-Weinberg del genotipo distribuciones de los diversos controles se puso a prueba mediante una prueba de chi-cuadrado de bondad de ajuste. Se realizaron análisis de regresión logística univariante y multivariante incondicionales para obtener crudo y odds ratios ajustadas (OR) para el riesgo de cáncer colorrectal y sus intervalos de confianza del 95% (IC). Un
P
valor & lt; 0,05 fue considerado estadísticamente significativo, y todas las pruebas estadísticas fueron de dos caras. Los análisis estadísticos se realizaron utilizando el software SAS, suelte 9.1 (SAS Institute, Cary, NC).
Resultados
Un total de 1.147 casos de cáncer colorrectal y 1.203 sujetos control fueron incluidos en este estudio (Tabla 1). La edad media fue de 60,1 años para los casos y de 59,9 años para los controles. Los casos eran más propensos a tener miembros de la familia con cáncer que en los controles (21,2% frente a 10,6%,
P Hotel & lt; 0,001). Las frecuencias genotípicas observadas rs7758229 entre los sujetos de control estaban de acuerdo con el equilibrio de Hardy-Weinberg (
P = 0,778
). Como se muestra en la Tabla 2, las frecuencias de GG, GT y TT genotipos fueron 58,3%, 35,6% y 6,1%, respectivamente, entre los casos y 56,4%, 37,6% y 6,0%, respectivamente, entre los controles. Por otra parte, la frecuencia rs7758229 alelo T fue 0,248 entre los casos y 0.238 entre los controles, y la diferencia no fue estadísticamente significativa (OR = 0,95, IC del 95% = 0,84 a 1,09,
P = 0,463
). Se realizó un análisis de la estratificación según la localización del tumor (colon y recto) para examinar la asociación entre rs7758229 y el riesgo de cáncer colorrectal. Del mismo modo, rs7758229 alelo T no se asoció con el riesgo de cáncer de colon o cáncer de recto, en comparación con el alelo G (OR = 0,94, IC del 95% = 0,80 a 1,11,
P
= 0,481 para el cáncer de colon, y O IC = 0,96, 95% = 0,82 a 1,13,
P = 0,621
para el cáncer de recto).
Discusión
En el presente estudio, no encontramos asociación estadísticamente significativa entre rs7758229 en
SLC22A3
y el riesgo de cáncer colorrectal, y ninguna asociación con el riesgo de la localización del tumor.
Nuestra incapacidad de replicar los hallazgos de Cui et al. [10] puede ser debido a varias razones. En primer lugar, un poder débil e inadecuada puede explicar nuestros resultados inconsistentes. Sin embargo, este estudio tenía poder razonable (& gt; 75%) para detectar un OR de 1,28 por copia de alelo T, que había sido informado previamente por Cui et al. [10]. En segundo lugar, hemos contratado a casos de cáncer colorrectal a partir de los hospitales y los controles seleccionados de las poblaciones, que bien podrían no representar a toda la población y podría dar lugar a un potencial sesgo de selección. En tercer lugar, es biológicamente concebible que la misma variante de susceptibilidad para el cáncer colorrectal puede estar implicado en diferentes poblaciones. Por lo tanto, los resultados discrepantes pueden estar relacionados con los modificadores genéticos y /o ambientales que varían en frecuencia entre las poblaciones chinas y las poblaciones japonesas. Por último, Cui et al, informó de que rs7758229 tuvo una asociación más significativa con el riesgo de cáncer de colon distal (
P
= 7.92 × 10
-9) que el cáncer colorrectal (
P
= 1,31 × 10
-5) [10], lo que sugiere que sus carcinomas tienen diferentes mecanismos patológicos de la carcinogénesis que implican diferentes defectos genéticos y epigenéticos [12].
en conclusión, nuestro estudio confirma que rs7758229 en 6q26 -q27 no puede contribuir al riesgo de cáncer colorrectal en una población china. Por lo tanto, más otros loci y en gran escala GWAS de cáncer colorrectal en la población china están esperando.