Extracto
El cáncer colorrectal (CCR) es uno de los cánceres más comúnmente diagnosticados en el mundo. Una proyección de todo el genoma de la desregulación del transcriptoma entre el cáncer y el tejido normal sería dar una idea de las bases moleculares de la iniciación y progresión de CRC. En comparación con la tecnología de microarrays, que se utiliza comúnmente para identificar los cambios de la transcripción, la técnica de RNA-seq recientemente desarrollado tiene la capacidad de detectar otras regulaciones anormales en el transcriptoma del cáncer, tales como corte y empalme alternativo, nuevas transcripciones o fusión génica. En este estudio, se realizó la secuenciación del transcriptoma de alto rendimiento en ~ 50 × cobertura sobre la CRC, no tumoral adyacente y el tejido normal distante. Los resultados revelaron específica del cáncer, los genes expresados diferencialmente y empalme alternativo diferencial, lo que sugiere que la matriz extracelular y las vías metabólicas se activan y los genes relacionados con la homeostasis celular se suprimen en CRC. Además, una fusión de genes restringido-tumor, PRTEN-NOTCH2, también se ha detectado y confirmado experimentalmente. Este estudio revela algunas características comunes en la invasión tumoral y ofrece un estudio exhaustivo del transcriptoma CRC, lo que proporciona una mejor idea de la complejidad de los cambios regulatorios durante la tumorigénesis
Visto:. Y Wu, Wang X, Wu F, Huang R, Xue F, G Liang, et al. (2012) transcriptoma de perfiles del cáncer, Adyacente no tumorales y tejidos normales distante de un paciente de cáncer colorrectal mediante secuenciación profunda. PLoS ONE 7 (8): e41001. doi: 10.1371 /journal.pone.0041001
Editor: Antonio Moschetta, Universidad de Bari & amp; Consorzio Mario Negri Sud, Italia