Extracto
Antecedentes
TP53
gen es uno de los más importantes genes supresores de tumores. Se realizó este meta-análisis para explorar la relación entre la
TP53
Arg72Pro polimorfismo y el riesgo de cáncer de piel, principalmente en los caucásicos.
Métodos
Se realizaron búsquedas en PubMed de casos y controles se utilizaron estudios publicados hasta marzo de 2013. los odds ratios (OR) con intervalos de confianza del 95% (IC) para evaluar la fuerza de asociación.
resultados
Un total de 5276 casos de cáncer de piel y se incluyeron controles de 5315 de 20 estudios. En general, no hay asociación significativa entre el
se observó TP53
Arg72Pro polimorfismo y cáncer de piel en todos los modelos de contraste genética (Pro /Pro frente Arg /Arg, Pro /Arg frente Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg frente Arg /Arg, Pro /Pro frente Arg /Arg + Pro /Arg, Pro alelo frente alelo Arg). Se obtuvieron resultados similares en el análisis estratificado por grupo étnico y tipos histológicos de cáncer de piel, tales como melanoma, carcinoma de células escamosas y carcinoma de células basales. Los cálculos de energía indicaron que algunos estudios eran de poca potencia. Sin sesgo de publicación se encuentra utilizando el gráfico de embudo y la prueba de Egger.
Conclusiones
Este meta-análisis indicó que
TP53
Arg72Pro polimorfismo probablemente tenía poca relación con la susceptibilidad del cáncer de piel principalmente en los caucásicos. Sin embargo, se requieren estudios más grandes de tamaño de muestra para verificar la conclusión tan bajas potencias estadísticos
Visto:. Vosotros J, Li XF, Wang YD, Yuan Y (2013) Arg72Pro polimorfismo de
TP53
gen y el riesgo de cáncer de piel: un meta-análisis. PLoS ONE 8 (11): e79983. doi: 10.1371 /journal.pone.0079983
Editor: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Estados Unidos de América
Recibido: May 4, 2013; Aceptado: 27 de septiembre de 2013; Publicado: 8 Noviembre 2013
Derechos de Autor © 2013 de Ye et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Los autores no tienen el apoyo o la financiación para reportar
Conflicto de intereses:. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
de acuerdo con la epidemiología, cáncer de piel como el melanoma y no. -melanoma es el tipo más común de cáncer en la población blanca [1]. Las estadísticas muestran que la incidencia de cáncer de piel ha ido en aumento en Europa y los EE.UU., especialmente el melanoma, en las últimas dos décadas [2,3]. El cáncer de piel tiene varios subtipos histológicos, incluyendo melanoma, carcinoma de células escamosas (SCC) y el carcinoma de células basales (BCC) [4]. Muchos estudios indican que la radiación ultravioleta (UV) de exposición es un importante factor de riesgo de desarrollo de cáncer de piel [5-7]. Sin embargo, en el nivel molecular, el mecanismo carcinogénico de UV no se ha expuesto todavía.
TP53
gen es un gen supresor tumoral que puede regular la detención del ciclo celular, apoptosis celular y reparación del ADN [8]. Por lo tanto, se llama guardián de genoma. Las mutaciones de
TP53
gen son la anormalidad genética más común que se encuentra en muchos tipos de cánceres humanos, tales como cáncer de pulmón, cáncer de colon, cáncer gástrico, cáncer de piel, et al [9]. Arg72Pro polimorfismo de
TP53
gen es una transversión G-C en el codón 72, que resulta en un cambio de aminoácidos a partir de arginina (Arg) a la prolina (Pro) [10]. Los estudios han demostrado que
TP53
gen desempeña un papel importante en la protección del genoma celular de la exposición UV [11,12]. Sin embargo, el mecanismo molecular detallado no está claro.
Muchos estudios en los últimos años han investigado la asociación entre el
TP53
Arg72Pro polimorfismo y el riesgo de cáncer de piel, pero sus resultados no son concluyentes. Por lo tanto, hemos realizado este meta-análisis de todos los estudios de casos y controles elegibles que se han publicado para ayudarnos a una mejor comprensión de la influencia de
TP53
Arg72Pro polimorfismo.
Métodos
Búsqueda por publicación
se realizaron búsquedas en PubMed para publicaciones hasta marzo de 2013, el uso de los términos "TP53", "polimorfismo", y "el cáncer de piel." La búsqueda se llevó a cabo sin ningún tipo de restricciones en el idioma. Además, se realizaron búsquedas en las listas de referencias de revisiones y artículos recuperados manualmente. Cuando la misma población de pacientes apareció en varios artículos, elegimos el tamaño de la muestra más grande o el más reciente
Criterios de inclusión
Los estudios seleccionados deben haber cumplido con los siguientes criterios principales: (1). bien diseñados estudios de casos y controles para evaluar
TP53
polimorfismo Arg72Pro y el riesgo de cáncer de piel; (2) el cáncer de piel se diagnostica por la patología; (3) que contiene las frecuencias de genotipo útiles; y (4) la distribución de genotipos entre los controles estaban en equilibrio de Hardy-Weinberg
Criterios de exclusión
Los criterios de exclusión fueron:. (1) el genotipo frecuencias o número no presentaron; (2) los estudios en animales, opiniones, informes de casos, los resúmenes y los estudios basados en la familia; (3) la duplicación de una publicación anterior.
Extracción de datos
Dos investigadores extrajeron información de los estudios elegibles de forma independiente, de acuerdo con los criterios de inclusión y exclusión anteriores. Los desacuerdos se resolvieron mediante discusión o un tercer investigador. Se recogió la siguiente información: primeros autores, año de publicación, el origen étnico, las características de los casos y controles (edad media, distribución de género), el tipo histológico de los casos, el método de determinación del genotipo, el número de genotipos y el número total de casos y controles.
En el documento de Rizzato et al la hebra no codificante se ha determinado el genotipo, así que invierte los genotipos en su papel.
Análisis estadístico
La fuerza de la asociación entre
TP53
polimorfismo Arg72Pro y el riesgo de cáncer de piel se evaluó mediante odds ratios agrupados (OR) con intervalos de confianza del 95% (IC). Los OR agrupados de modelo dominante (Arg /Arg + Pro /Arg en comparación con Pro /Pro), modelo recesivo (Arg /Arg frente Arg /Pro + Pro /Pro), modelo codominante (Arg /Arg en comparación con Pro /Pro y Arg /Pro frente a Pro /Pro) y el alelo de contraste (Pro alelo Arg frente a alelo) se calcularon, respectivamente. Los análisis estratificados se realizaron por el origen étnico y el tipo histológico de cáncer de piel. El supuesto heterogeneidad se evaluó mediante la prueba Q basados en Chi-cuadrado. Si P & lt; 0,05 de la prueba Q que indicaba heterogeneidad, se utilizó el modelo de efectos aleatorios para calcular los OR agrupados. De lo contrario, se adoptó el modelo de efectos fijos. Se aplicó la prueba Z para determinar el OR agrupado con la significación establecida en p & lt; 0,05. el sesgo de publicación potencial se estimó mediante el gráfico en embudo de Begg [13] y la prueba de Egger [14]. P & gt; 0,05 significaba ningún sesgo de publicación significativo. Todos por encima de los análisis estadísticos se realizaron con el software STATA, versión 12.0 (StataCorp, College Station, TX, EE.UU.). El análisis del poder se ha realizado mediante el poder y la Muestra cálculo del tamaño de programa (PS) (http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/PowerSampleSize) [15].
Resultados
Características de los Estudios
Un total de 165 documentos fueron obtenidos por la búsqueda publicación editada hasta marzo de 2013, entre los cuales veinte cumplieron los criterios de inclusión [16-35] (Figura S1). La mejor veinte estudios fueron todos en Inglés, con la participación 5276 casos de cáncer de piel y 5315 controles. Las características principales se resumen en la Tabla 1. En primer autor
año
Etnia & Country
Casos
Controls
Pro/Pro
Pro/Arg
Arg/Arg
Pro/Pro
Pro/Arg
Arg/Arg
Dokianakis2000CaucasianGreece351964112Marshall2000CaucasianEngland3183463939Bastiaens2001CaucasianThe Netherlands21131169107275O'Connor2001CaucasianIreland1114342091Cairey-Remonnay2002CaucasianFrance4165056685McGregor2002CaucasianEngland0581245717Gustafsson2004CaucasianSweden5193033162de Oliveira2004OtherBrazil00162916Gwosdz2006CaucasianGermany724181366114Han2006CaucasianUSA5529440945297474Pezeshki2006AsianIran10473486217162Stefanaki2007CaucasianGreece11445266673Bendesky2007OtherMexico25941221894126Queille2007CaucasianFrance2151363939Li2008CaucasianUSA4030046556350432Capasso2010CaucasianItaly308712323122139Almquist2011CaucasianUSA9455185147274446Rizzato2011CaucasianHungary, Rumania, Slovakia4018629246178297Leob2012CaucasianUSA4163551917Pandish2012AsiaIndia196225327890MelanomasBastiaens2001CaucasianThe Netherlands74865107275Gwosdz2006CaucasianGermany724181366114Han2006CaucasianUSA158210445297474Stefanaki2007CaucasianGreece11445266673Li2008CaucasianUSA4030046556350432Capasso2010CaucasianItaly308712323122139SCCDokianakis2000CaucasianGreece01264112Marshall2000CaucasianEngland2141863939Bastiaens2001CaucasianThe Netherlands64041107275Cairey-Remonnay2002CaucasianFrance416505717McGregor2002CaucasianEngland0357456685Gustafsson2004CaucasianSweden5193033162Han2006CaucasianUSA1710415145297474Bendesky2007OtherMexico321181269418Almquist2011CaucasianUSA3722036647274446Leob2012CaucasianUSA4163551917Pandish2012AsiaIndia196225327890BCCDokianakis2000CaucasianGreece331564112Bastiaens2001CaucasianThe Netherlands84363107275McGregor2002CaucasianEngland0236656685Han2006CaucasianUSA2310815445297474Pezeshki2006AsianIran10473486217162Bendesky2007OtherMexico22741081894126Almquist2011CaucasianUSA5729548547274446Rizzato2011CaucasianHungary, Rumania, Slovakia4018629246178297Table 1. Características de los estudios incluidos en el meta-análisis.
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La mayoría de los estudios (16 de 20) se llevaron a cabo en los caucásicos. De los veinte estudios de casos y controles, cuatro sólo se centra en el melanoma [24,29-31], cinco en SCC [17,20,22,34,35] y dos en BCC [26,33]. Cuatro estudios investigaron tanto SCC y BCC [16,21,27,32]. Dos exploraron el melanoma, SCC y BCC [18,25]. Dos estudios investigaron el cáncer de piel no melanoma, sin subtipo especificado [19,28]. Y un cáncer de piel explorado, subtipo histológico no menciona [23]. El año de publicación fue de 2000 a 2012. Los tamaños de las muestras variaron de 43 a 1643. Todos los casos fueron confirmados patológicamente. Los controles eran poblaciones sanas y agrupados por edad, sexo y origen étnico. Todos los polimorfismos en los controles estaban en equilibrio de Hardy-Weinberg.
Resultados de metanálisis
Como se muestra en la Tabla 2, se observó ninguna asociación significativa entre el polimorfismo TP53 Arg72Pro y el riesgo de cáncer de piel en cualquier modelo y el alelo genético contraste (Pro /Pro frente Arg /Arg, odds ratio (OR) = 1,07, 95% intervalo de confianza (IC): 0,81-1,41; Pro /Arg frente Arg /Arg, OR = 0,93, IC del 95% : 0,77 a 1,13; Pro /Pro + Pro /Arg frente Arg /Arg, OR = 0,93, IC del 95%: 0,78 a 1,12; Pro /Pro frente Arg /Arg + Pro /Arg, OR = 1,08, IC del 95%: 0,86 IC Pro alelo frente alelo Arg, OR = 0,96, 95%; -1.35: 0,84 a 1,10) (Figura 1-5). Los cálculos de energía en las frecuencias agrupados indicaron que los poderes estadísticas fueron todas inferiores al 80% para todos los metanálisis anteriores.
modelos comparativos
n
caso /control
OR (IC del 95%)
P
O
me
2 (%)
P
H
Modelo
cálculo del poder
Total205276 /5315Pro alelo Arg vs allele0.96 (0,84 -1.10) 0.58862.46 & lt; 0.001random26.0% Pro /Pro vs Arg /Arg1.07 (0,81-1,41) 0.65440.90.002random20.2% Pro /Arg Arg vs /Arg0.93 (0,77-1,13) 0.46865 0,85 & lt; 0.001random41.2% Pro /Pro + Pro /Arg Arg vs /Arg0.93 (0,78-1,12) 0.45969.52 & lt; 0.001random44.5% Pro /Pro vs Arg /Arg + Pro /Arg1.08 (0,86-1,35) 0.5231.040.04random26.9% Caucasians164822 /4385Pro alelo Arg vs allele0.94 (0,81-1,09) 0.38547.54 & lt; 0.001random44.4% Pro /Pro vs Arg /Arg1.05 (0,77-1,43 ) 0.76832.410.006random11.5% Pro /Arg Arg vs /Arg0.88 (0,72-1,06) 0.17746.99 & lt; 0.001random81.0% Pro /Pro + Pro /Arg Arg vs /Arg0.88 (0,73-1,07 ) 0.20350.61 & lt; 0.001random84.4% Pro /Pro vs Arg /Arg + Pro /Arg1.12 (0,86-1,46) 0.41725.990.038random44.5% para no Caucasians4454 /930Pro alelo Arg vs allele1.06 (0,68 -1.65) 0.79177.20.004random10.8% Pro /Pro vs Arg /Arg1.10 (0,52-2,31) 0.80163.10.043random8.8% Pro /Arg Arg vs /Arg1.22 (0,61-2,42) 0.57779.60.002 random36.5% Pro /Pro + Pro /Arg Arg vs /Arg1.16 (0,59-2,26) 0.67180.50.001random24.4% Pro /Pro vs Arg /Arg + Pro /Arg0.95 (0,66-1,36) 0.76437 .90.185fixed6.0% Melanoma61522 /2433Pro alelo Arg vs allele1.10 (0,87-1,39) 0.43775.40.001random45.2% Pro /Pro vs Arg /Arg1.36 (0,82-2,26) 0.23265.90.012random67.1% Pro /Arg Arg vs /Arg0.99 (0,76-1,28) 0.910630.019random5.2% Pro /Pro + Pro /Arg Arg vs /Arg1.05 (0,079 a 1,39) 0.74571.10.004random11.6% Pro /Pro vs Arg /Arg + Pro /Arg1.33 (0,87-2,03) 0.19154.40.052fixed62.3% SCC111455 /2643Pro alelo Arg vs allele0.76 (0,55-1,06) 0.11085.7 & lt; 0.001random100.0% Pro /Pro vs Arg /Arg0.62 (0,31-1,25) 0.18278.2 & lt; 0.001random98.2% Pro /Arg Arg vs /Arg0.85 (0,61-1,19) 0.34073.8 & lt; 0.001random80.6% Pro /Pro + Pro /Arg Arg vs /Arg0.75 (0,51-1,12) 0.15883.1 & lt; 0.001random99.2% Pro /Pro vs Arg /Arg + Pro /Arg0.72 (0,42-1,22) 0.21964.10.002random83.2% BCC82159 /3179Pro alelo Arg vs allele0.90 (0,75-1,08) 0.24566.30.004random65.5% Pro /Pro vs Arg /Arg1.01 (0,81-1,26) 0.93130.70.183fixed5.1% Pro /Arg Arg vs. /Arg0.83(0.64-1.08)0.16372.50.001random88.1%Pro/Pro+Pro/Arg vs Arg /Arg0.83 (0,64-1,07) 0.14074.1 & lt; 0.001random79.1% Pro /Pro Arg vs. /Arg+Pro/Arg1.03(0.83-1.28)0.78722.90.247fixed5.7%Table 2. principales resultados del meta-análisis para
TP53
Arg72Pro polimorfismo y el riesgo de cáncer de piel
Abreviaturas: O. , odds ratio; IC: intervalo de confianza; n, número de estudios de casos y controles; P
O, P valor de Z-test; P
H, valor de p para el análisis de heterogeneidad; BCC, carcinoma de células basales; SCC, carcinoma de células escamosas. Descargar CSV CSV
En el análisis estratificado por tipos histológicos de cáncer de piel, no hubo evidencia de una asociación significativa entre el polimorfismo del codón 72 del
TP53
gen y el riesgo de melanoma, SCC y BCC. Resultados similares se encontraron en el análisis estratificado por grupo étnico. A diferencia de otros subgrupos, los cálculos de potencia en los modelos de genes SCC eran todos más del 80%, lo que reveló muestras de tamaño adecuado (tabla 2).
Publicación Bias
El sesgo de publicación se evaluó mediante Begg de gráfico de embudo y la prueba de Egger. La forma de los gráficos en embudo se parecía simétrica y los resultados de la prueba de Egger no fueron significativas en todos los modelos genéticos (Pro /Pro frente Arg /Arg, Pro /Arg frente Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg frente Arg /Arg, Pro /Pro frente Arg /Arg + Pro /Arg, Pro alelo frente alelo Arg), que no indicó el sesgo de publicación. La figura 6 muestra el gráfico en embudo de Begg general de Pro /Pro frente Arg /Arg. En los análisis estratificados según su origen étnico y tipos histológicos, ni gráfico en embudo de Begg, ni la prueba de Egger presentó ninguna prueba evidente de sesgo de publicación (datos no mostrados). Estos resultados indicaron que no hubo sesgo de publicación en nuestro meta-análisis.
Discusión
TP53
gen supresor tumoral juega un papel importante en la detención del ciclo celular y la activación de muerte celular programada [8,36]. Las mutaciones de
TP53
gen se han detectado en el 50% de todos los cánceres humanos y en casi todos los carcinomas de la piel [37]. Los estudios han demostrado que la inactivación de
TP53
génica consiste en la inducción de cáncer de piel por la radiación UV [11,12,38]. El polimorfismo más común de
TP53
gen se localiza en el codón 72, que es una transversión G-C, causando un cambio de aminoácidos a partir de arginina (Arg) a la prolina (Pro) [10]. Las funciones de las dos variantes polimórficas de
TP53
gen son diferentes. Según el estudio realizado por Dumont et al, la variante Arg72 induce apoptosis de las células marcadamente mejor que la variante Pro72 hace [39]. Recientemente, muchos estudios han explorado la asociación entre el
TP53
polimorfismo Arg72Pro y la susceptibilidad del cáncer de piel, pero sus conclusiones son contradictorias. Por lo tanto, hemos realizado este meta-análisis para investigar más a fondo la influencia de
TP53
polimorfismo Arg72Pro en el desarrollo de cáncer de piel.
Los resultados sugirieron que ninguna asociación significativa entre la
TP53
polimorfismo Arg72Pro y el riesgo de cáncer de piel en cualquier modelo genético (Pro /Pro frente Arg /Arg, Pro /Arg frente Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg frente Arg /Arg, Pro /Pro frente Arg /Arg + Pro /Arg). En el análisis estratificado por grupo étnico y tipos histológicos de cáncer de piel, no hubo evidencia de una asociación significativa, tampoco. Nuestros resultados fueron similares a los meta-análisis realizado por Jiang en 2011 [40].
Sin embargo, los resultados de nuestro meta-análisis deben interpretarse con precaución. A excepción del subgrupo SCC, la mayor parte de los cálculos de potencia en las frecuencias agrupadas fueron inferiores a 80%, lo que demuestra tamaños de muestra inadecuados.
Este meta-análisis también tiene algunas limitaciones. En primer lugar, dado que sólo se incluyeron veinte estudios, el sesgo de publicación podría potencialmente salida, a pesar de que tratamos de encontrar ya que muchos estudios que pudimos, evaluado cuidadosamente la literatura y se utiliza métodos estadísticos para minimizar el sesgo de publicación, y sin sesgo de publicación estadísticamente significativa fue observado en este meta-análisis. En segundo lugar, en los análisis estratificados según su origen étnico, se llevaron a cabo la mayoría de estudios en los caucásicos, e información sobre otros grupos étnicos, como los de África, fue insuficiente. Por lo tanto, se necesitan más estudios con mayor tamaño de la muestra y de alta calidad, especialmente para las poblaciones de raza no caucásica para demostrar nuestras conclusiones en el futuro. Por último, el estudio de casos y controles retrospectivos pertenece a la investigación que tiene deficiencias metodológicas.
A pesar de las limitaciones, este meta-análisis indicó que
TP53
Arg72Pro polimorfismo probablemente tenía poca relación con el riesgo de la piel cáncer, principalmente en los caucásicos. Sin embargo, todavía es necesario realizar estudios de mayor tamaño y mejor- diseñado para explorar
TP53
Arg72Pro polimorfismo tan bajas potencias estadísticos.
Apoyo a la Información
Figura S1. diagrama de flujo
de la literatura.
doi: 10.1371 /journal.pone.0079983.s001 gratis (DOC)
Lista de verificación S1. Lista de comprobación
PRISMA.
doi: 10.1371 /journal.pone.0079983.s002 gratis (DOC)