Extracto
Los microARN son los principales reguladores de la expresión génica y se ha demostrado que han alterado la expresión en una variedad de tipos de cáncer, incluyendo el cáncer de ovario epitelial. los genes miARN función es más a menudo logra a través de la unión a la región 3 'no traducida del gen de codificación de la proteína objetivo. Mutación de cribado mediante secuenciación masiva en paralelo de 712 genes miARN en 86 casos de cáncer de ovario identificados sólo 5 genes miARN mutados, cada uno en un caso diferente. Una mutación se encuentra en el miARN maduro, y tres mutaciones se predijeron para alterar la estructura secundaria de la transcripción de los genes miARN. Proyección de la región 3 'no traducida de los genes del cáncer 18 candidatos identificó una mutación en cada uno de los
AKT2
,
EGFR
,
ERRB2
y
CTNNB1
. El efecto funcional de estas mutaciones no es clara, como expresión de datos disponibles para
AKT2
y
EGFR
mostraron ningún aumento en la transcripción de genes. Las mutaciones en los genes miARN y regiones 3 'no traducidas son por lo tanto poco frecuente en el cáncer de ovario
Visto:. Ryland GL, Bearfoot JL, Doyle MA, Boyle SE, Choong DYH, Rowley SM, et al. (2012) Genes microARN y su objetivo Regiones 3 'no traducidas no son muy habituales somáticamente mutado en los cánceres de ovario. PLoS ONE 7 (4): e35805. doi: 10.1371 /journal.pone.0035805
Editor: Austin John Cooney, Baylor College of Medicine, Estados Unidos de América
Recibido: 29 Enero, 2012; Aceptado: March 22, 2012; Publicado: 20 Abril 2012
Derechos de Autor © 2012 Ryland et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el uso ilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acreditan
Financiación:. Este trabajo fue apoyada por la mama de estilo victoriano Consorcio de Investigación del cáncer, Australia, y el australiano Nacional de Salud y Consejo de Investigación médica (NHMRC). GLR es apoyado por un Premio de Australia de Postgrado. El cáncer de ovario Grupo de Estudio de Australia fue apoyada por el Ejército de EE.UU. de Investigación Médica y de Material Command bajo DAMD17-01-1-0729, el Consejo de Cáncer de Tasmania, la Fundación de Cáncer de Australia Occidental y el NHMRC. Los donantes no tenía papel en el diseño del estudio, la recogida y análisis de datos, decisión a publicar, o la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses:.. Los autores han declarado que no existen intereses en competencia
Introducción
Los microARN (miRNA), una clase de pequeñas moléculas de ARN no codificantes, tienen importantes funciones reguladoras en diversas rutas celulares incluyendo la proliferación, la diferenciación, la senescencia y el metabolismo [1]. Esta regulación se logra a través de pelado de base semi-complementario con la región 3 'no traducida (3'-UTR) del ARN mensajero objetivo (mARN) [1] - [3], así como la región 5' no traducida o la codificación regiones del ARNm, que son posteriormente degradados o post-transcripcionalmente silenciados [4] - [6]. La acumulación de pruebas ahora demuestra que la expresión de los genes miARN es aberrante en el cáncer [7], dando lugar a la hipótesis de que las alteraciones en las vías de miARN pueden ser un paso importante en la iniciación y progresión a la malignidad. Consistente con esta hipótesis es la observación de que los genes miARN son frecuentemente localizados en regiones genómicas comúnmente alterado en el cáncer, incluyendo regiones mínimas de deleción, pérdida de heterocigosidad y amplificación así como sitios frágiles [8] - [10]. La mutación es un mecanismo alternativo para la desregulación de los genes miARN en el entorno del cáncer, mediante el cual la mutación puede alterar la transcripción de los genes miARN, tratamiento o interacciones miARN-mRNA. Este mecanismo fue descrito por primera vez por Calin
et al.
[8], que se identificó una variante de la línea germinal en
hsa-miR-16-1
que estaba vinculada con la susceptibilidad a la leucemia linfocítica crónica. Desde entonces, los polimorfismos de la línea germinal en genes miARN se han asociado con la predisposición a otros tipos de cáncer [11]. A pesar de la hipótesis de que los miRNAs pueden funcionar como oncogenes o supresores tumorales convencional, varios estudios han sugerido que la mutación somática dentro de miRNAs son una ocurrencia rara y aquellos que han sido reportados muestran poco efecto sobre la actividad de los genes miARN [10], [12] - [14] . Sin embargo, la mayoría de estos estudios han favorecido un enfoque de genes candidatos y hasta la fecha, se carece de evaluación-un sesgada de la aparición de alteraciones somáticas en los genes miARN en cualquier tipo de cáncer.
De forma análoga a las mutaciones que ocurren dentro de la semilla miARN regiones, las mutaciones que ocurren dentro de la secuencia de ARNm diana pueden alterar la regulación de los genes miARN dependientes de unión y posterior de la expresión génica. Mientras germinal alteraciones en los genes miARN sitios de unión en 3'-UTR puede contribuir a la susceptibilidad al cáncer [11], [15] - [17], los informes de mutaciones somáticas que se producen en un contexto similar se limita a un solo caso [13] y tiene sin embargo, ser a investigado en grandes cohortes tumorales. Si las mutaciones somáticas ocurren en sitios de unión miARN, constituiría un mecanismo genético había sido explorada previamente para la represión o la activación de un mRNA asociado al cáncer
.
actividad aberrante miARN se asocia frecuentemente con la patogénesis y progresión del cáncer de ovario epitelial , la forma más común de malignidad de ovario. MiRNA estudios de perfiles de observar constantemente el silenciamiento global de la expresión de los genes miARN en los tumores ováricos, que se contribuye a en parte por la pérdida genómica y alteraciones epigenéticas [10], [18] - [22]. Del mismo modo, la expresión de muchos genes del cáncer conocidos y putativo se dysregulated en cáncer de ovario, por ejemplo
BRCA2
, para el que sólo una parte de la pérdida observada de expresión se puede atribuir a la mutación, y la metilación del promotor no se observa [ ,,,0],23]. Anteriormente, hemos demostrado que la frecuencia de mutaciones somáticas en 10 miRNAs cáncer implicado es baja en los tumores de ovario [24]. En el presente estudio, extendemos este análisis mediante la caracterización exhaustiva mutaciones somáticas en los genes miARN 712 utilizando masivamente paralelo re-secuenciación de destino. Además, hemos examinado la 3'-UTR de 18 genes del cáncer candidato con el objetivo de identificar las mutaciones somáticas, que alteran predijeron sitios de unión miARN. Aunque estos genes están implicados con frecuencia en el proceso tumorigénico, las mutaciones de codificación, la metilación o el número de copias alteraciones sólo representan un subconjunto de las diferencias de expresión observados en los tumores de ovario.
Resultados y Discusión
Las mutaciones somáticas dirigir genes microARN son eventos poco frecuentes en los tumores de ovario
para investigar si los genes miARN mutaciones en contribuyen a la actividad de los genes miARN alterado en el cáncer de ovario, 86 tumores de ovario epiteliales primarias se evaluaron en busca de mutaciones somáticas en las regiones genómicas correspondientes a los precursores o miARN maduro secuencias. Las características clínicas de estos casos se resumen en la Tabla S1. Targeted secuenciación de próxima generación se utilizó para evaluar los genes miARN 712 anotados en la base de datos Sanger miARN (versión 13.0, marzo de 2009). Después de la alineación de datos, el 95% de las bases específicas dentro de los 712 genes miARN tenía una cobertura mínima secuencia de 10 veces, con una cobertura correspondiente media de 92 veces. Filtrado para eliminar la línea germinal variantes detectadas en el ADN de linfocitos normales emparejados y validación por secuenciación convencional identificado mutaciones somáticas en los genes miARN 5:
hsa-miR-10a
,
hsa-miR-622
,
hsa-miR-767-5p
,
hsa-miR-888
y
HSA-mir-1280 gratis (Figura 1). En general, se detectaron mutaciones somáticas en 6% (5/86) de los tumores y en menos de 1% (5/712) de los genes miARN analizados, sin genes miARN recurrentemente dirigidos por mutación. De acuerdo con informes anteriores, las mutaciones dentro de miRNAs maduros fueron poco frecuentes; una sola mutación se encuentra dentro de la región madura de
hsa-miR-767-5p gratis (pero fuera de la región de la semilla), mientras que los cuatro restantes se produjo dentro de la horquilla de precursores. Este dato está de acuerdo con estudios anteriores de menor escala, lo que sugiere que las mutaciones somáticas en los genes miARN son un acontecimiento poco frecuente en muestras de tumores [8], [12], [14], [24], [25].
mutaciones específicas del tumor se marcan como barras negras en relación con el micro ARN maduro (caja blanca) y precursor de microARN secuencias (caja gris). Las posiciones de las mutaciones se presentan en relación con los siguientes transcripciones microRNA precursores:
hsa-miR-10a
NR_029608.1;
hsa-miR-622
NR_030754.1;
hsa-miR-767-5p
NR_030409.1;
hsa-miR-888
NR_030592.1;
HSA-mir-1280
NR_031703.1.
Mirna biogénesis es un proceso de múltiples pasos iniciado por la transcripción mediada por la ARN polimerasa II, seguido de RNAsa III dependiente del recorte en un intermedio de la horquilla y la escisión subsiguiente en un miARN maduro funcional [1], [26]. Este proceso es dependiente de motivos de secuencias de ARN y elementos de estructura secundaria dentro de las moléculas primarias y precursores miARN [26]. Como tal, las mutaciones que surgen en regiones precursoras pueden alterar la estructura secundaria del RNA y de ese modo bloquear la transformación en miARN maduro. Para determinar si los cambios estructurales del ARN pueden ser resultado de las mutaciones somáticas miARN identificados, se utilizó el programa RNAfold [27] para predecir la estructura secundaria más estable por tanto la de tipo salvaje y secuencias mutantes. cambios conformacionales se prevé para mutante
hsa-miR-622
,
hsa-miR-767-5p
y
HSA-mir-1280 gratis (Figura S1). Sin embargo, los cambios conformacionales predijeron
in silico
rara vez se equiparan a un efecto fisiológico [12] y la implicación funcional de mutaciones identificadas aquí requiere una mayor investigación con
in vitro
ensayos in.
en contraste con la observación frecuente de las variaciones específicas de tumor que contribuyen a la activación o represión de los genes de proteínas en el cáncer de codificación, estos resultados demuestran que las mutaciones somáticas en los genes miARN son un evento infrecuente durante la patogénesis de ovario y suman a la evidencia de acumulación de una serie de tumor tipos que sugieren que miRNAs rara vez se dysregulated por este mecanismo. Dado el gran número de blancos de ARNm predicho para un solo miARN y las diversas funciones de los genes objetivo previsto, cualquier mutación somática en un gen miRNA (y en particular los que se producen dentro de la secuencia de la semilla) son propensos a afectar muchas vías biológicas [2], [3], algunos de los cuales pueden estar involucrados en el mantenimiento de la homeostasis celular. Por consiguiente, incluso si un gen miRNA la expresión de ARNm alterado somáticamente mutado para influir positivamente en la supervivencia del tumor, es probable que no habría un mayor número de cambios de expresión génica que no sería favorable para la supervivencia de células tumorales. Por el contrario, en ciertas situaciones, mRNA represión transcripcional puede resultar de la acción de múltiples miRNAs [28] y, como tal, la actividad alterada de un solo miARN puede ser insuficiente para dar como resultado un efecto biológico. Por último, se está reconociendo cada vez más que las alteraciones de los genes miARN observados en tejidos de cáncer pueden ocurrir como consecuencia de defectos en los componentes de la maquinaria de procesamiento de miRNA, incluyendo factores de transcripción y genes remodelación de la cromatina que regulan los genes miARN transcripción, así como componentes de miARN regulación post-transcripcional [29 ], [30]. En los tumores de ovario,
DICER1
y
EIF2C2 gratis (Argonaute2) Número de copias de ADN ganancias se han observado en el 24,5% y el 51,5% de los tumores, respectivamente [9] y la mediana de supervivencia global se reduce entre las mujeres cuyos Los tumores tienen una menor
DICER1
y
Drosha
la expresión de ARNm [31]. Se necesita más investigación demostrara la importancia de las alteraciones de estos y otros componentes de la vía de la biogénesis miARN en la patogénesis del cáncer de ovario.
Las mutaciones somáticas de orientación 3 'no traducidas regiones son eventos poco frecuentes en los tumores de ovario
para investigar la posibilidad de que las mutaciones somáticas que ocurre dentro de la 3'-UTR de los genes del cáncer altera un sitio de unión miARN existente, y por lo tanto significa un nuevo mecanismo para la expresión génica ARNm aberrante en cáncer, se secuenció la 3'-UTR de 11 oncogenes (
AKT2
,
BRAF
,
CCNE1
,
CTNNB1
,
EGFR
,
erbB2
,
FGF1
,
KRAS
,
MYC
,
PIK3CA
y
Rab25
) dirigida por la re-secuenciación de los 86 tumores de ovario. En el caso de un oncogén, abrogación de un sitio de unión miARN puede permitir la expresión del oncogén regulado. Además, la 3'-UTR de los genes supresores tumorales 7 (ETG) (
BRCA1
,
BRCA2
,
CDKN2A
,
PTEN
,
RB1
,
SPARC Opiniones y
TP53
) también se secuenció para evaluar la prevalencia de mutaciones somáticas, que generaría un
de novo
miARN y el resultado en TSG baja regulación. Estos genes son reconocidos por el gen del cáncer de censo de estar implicados causalmente en el desarrollo de tumores de ovario, ya sea por mutación somática, amplificación o supresión de genes [32].
FGF1
,
Rab25
y
SPARC
fueron elegidos en base a su papel funcional demostrado en el cáncer de ovario [33] - [37]. 3'-UTRs se secuenciaron a 108 veces significar cobertura y mayor que 99% de las bases específicas dentro de estas regiones estaban cubiertos por 10 o más secuencia lee. mutaciones específicos de tumores se identificaron con poca frecuencia en la 3'-UTR de muestras de ovario: 4/86 muestras tumorales fueron identificados cada uno con una mutación en uno de los cuatro diferentes oncogenes (
AKT2
,
CTNNB1
,
EGFR
y
erbB2
) (Tabla 1), sin mutaciones detectadas en los 7 ETG investigados.
in silico
miARN algoritmos de predicción de destino sugieren que los loci mutado en
AKT2
,
CTNNB1
y
ErbB2
puede ocurrir dentro de la zona de un miARN unión predicha sitio, con dos mutaciones, la c * 538T & gt;. a (
CTNNB1
) yc * 460G & gt;. C (
erbB2
) sustituciones, prevé que se produzcan dentro de la secuencia de semillas de
hsa-miR-630
y
hsa-miR-640
unión respectivamente. de perfiles de expresión de ARN estaba disponible para las muestras con mutaciones en
AKT2
y
EGFR
y demostró que los niveles de transcripción de estos genes no se vio alterada en muestras con somática 3'-UTR mutaciones en relación con otro tumor muestras del mismo subtipo de ovario (Figura S2).
a pesar de que se reconoce que los miRNAs también pueden impartir la represión transcripcional a través de la acción en el 5'-UTR de un ARNm objetivo, este estudio proporciona evidencia preliminar de que mutaciones somáticas que alteran los sitios de unión miARN en el 3'-UTR de los genes del cáncer comunes son poco frecuentes en los tumores epiteliales de ovario. silenciamiento de traslación efectiva puede requerir acción sinérgica de miRNAs en múltiples sitios a través de una UTR, ya sea por una sola familia de microRNAs o por una combinación de microRNAs no relacionados, y así las mutaciones somáticas individuales identificados aquí son probablemente suficientes para silenciar la respectiva transcripción [28] , [38]. La prevalencia de la mutación somática en 3'-UTR regiones de los genes del cáncer candidato secuenciados fue 1,43 por Mb mutaciones. En comparación, la prevalencia de la mutación en la proteína regiones de los genes conocidos de cáncer de codificación en esta cohorte tumor es 570,57, 183,60 y 32,63 Mb para mutaciones por
TP53
,
KRAS
y
PIK3CA
respectivamente, mientras que la prevalencia estimada de mutación en el exoma de codificación es de 2,4 mutaciones por Mb en tumores de ovario [23]. Por lo tanto, es probable que la baja tasa de mutación en 3'UTRs en comparación con los exones indica que la mayoría de las mutaciones en las regiones 3 'reguladoras identificadas aquí se producen como eventos espectador en el desarrollo de células tumorales.
En resumen, mutaciones somáticas en los genes miARN se observaron con poca frecuencia en los tumores de ovario y por lo tanto es poco probable que dar cuenta de la actividad de los genes miARN alterado observado en este tipo de tumor. Además, proporcionamos evidencia preliminar de que la selección de mutaciones somáticas en la 3'-UTR de los genes del cáncer candidatos, que se formuló la hipótesis de interferir con la regulación de genes miARN dependientes, es poco probable que represente un mecanismo común para la expresión del ARNm alterado en tumores de ovario.
materiales y Métodos
Ética declaración
Devengo y el uso de materiales de pacientes para este estudio fue aprobado por los Comités de Ética de Investigación siguientes humanos: Comité de Ética del hospital Southampton Investigación humana, Peter Centro MacCallum Comité de Ética de Investigación del cáncer humano, Instituto Queensland de Investigación médica Comité de Ética de Investigación humana, Universidad de Comité de Ética de Investigación Humanos Melbourne, Comité de Ética del hospital Westmead Investigación humana. Todos los individuos dieron su consentimiento informado por escrito para el uso de sus tejidos en la investigación. Este proyecto fue aprobado por el Centro de Cáncer Peter MacCallum Comité de Ética de Investigación Humana (Aprobación#29.9).
cohorte de tumores de ovario
86 muestras de tejido tumoral primario de ovario epiteliales se obtuvieron a través del Peter MacCallum Centro del cáncer Banco de Tejidos, Australia ovario estudio de cáncer o de pacientes que acuden a los hospitales en el sur de Inglaterra [39]. Todas las muestras de ADN tumoral se microdissected para asegurar componente celular epitelial mayor que 80%. Esta cohorte tumor compuesto por una mezcla de serosa (n = 45), endometrioide (n = 28), mucinoso (n = 7) y de células claras (n = 6) subtipos. Correspondientes muestras de sangre periférica también se recogieron de todos los pacientes en el momento de la recogida del tumor y se utilizan como fuente de DNA de la línea germinal.
Candidato identificación de región para objetivo de próxima generación secuenciación
Los 3'-UTRs se seleccionaron 18 de los genes de codificación de proteínas para la detección de mutaciones somáticas. Genoma coordenadas para seleccionados 3'-UTR fueron identificados en base a los que figuran en la base de datos Ensembl (versión 54) para las siguientes transcripciones:
AKT2 gratis (ENST00000392038),
BRAF gratis (ENST00000288602) ,
CCNE1 gratis (ENST00000262643),
CTNNB1 gratis (ENST00000349496),
EGFR gratis (ENST00000275493 y ENST00000344576),
erbB2 gratis (ENST00000269571),
FGF1 gratis (ENST00000359370),
KRAS gratis (ENST00000256078),
MYC gratis (ENST00000259523 y ENST00000377970),
PIK3CA gratis (ENST00000263967),
Rab25
(ENST00000361084),
BRCA1 gratis (ENST00000309486),
BRCA2 gratis (ENST00000380152),
CDKN2A gratis (ENST00000304494),
PTEN gratis (ENST00000371953),
RB1 gratis (ENST00000267163),
SPARC gratis (ENST00000231061) y
TP53 gratis (ENST00000269305). Los genómica coordenadas de los precursores miRNAs humanos se obtuvieron del Instituto Sanger miRBase (versión 13.0, marzo de 2009) [40], [41], que incluye 548 genes miARN individuales, así como 164 miRNAs dentro de 62 grupos de genes miARN. Todos los exones de codificación de
TP53
,
KRAS
y
PIK3CA
fueron incluidos para el análisis de secuencias.
Biblioteca preparación y enriquecimiento de destino
200 ng de ADN de linfocitos tumor o normal correspondiente al azar fue fragmentado de aproximadamente 200 pb (Covaris, Woburn, MA) y la reparación final y a-tizón realizado de acuerdo con el banco de ADN genómico protocolo de preparación de Illumina (Illumina, San Diego, CA). Después de esto, el ADN se ligó con una de las 7 adaptadores de encargo de multiplexación compatibles con Illumina secuenciación de un solo extremo. Las muestras de ADN se agruparon indexadas igualmente antes de enriquecimiento PCR. Todos los reactivos utilizados durante la preparación de la biblioteca se obtuvieron de New England Biolabs (NEB, Ipswich, MA). Una captura de exón Boutique (SureSelect, Agilent Technologies, Santa Clara, CA) fue usado para enriquecer seleccionados específicamente para 3'-UTR, miRNAs y exones de codificación de los genes del cáncer de bibliotecas de ADN genómico antes de la secuenciación de próxima generación. sondas de captura fueron diseñados utilizando los parámetros por defecto mediante la presentación de genómica coordenadas de eArray (Agilent Technologies, Santa Clara, CA). hibridación en solución, lavado, elución y amplificación se realizaron de acuerdo con el protocolo recomendado.
análisis de la mutación somática mediante secuenciación y electroforesis capilar Illumina GAIIx
Target enriquecido bibliotecas de ADN se secuenciaron en un Illumina GAIIx, generando 75 pb secuencia de un solo extremo lee. Análisis de imágenes y llamadas de base se ha realizado mediante el Analizador v1.6 Genoma Pipeline. Secuencia lee fueron alineados a la referencia del genoma humano (montaje /hg19 GRCh37) usando BWA y lee restante sin asignar fueron alineados con el software Novoalign [42]. Esto fue seguido por la realineación local con GATK [43]. Las mutaciones puntuales e inserciones /deleciones (indeles) se identificaron utilizando GATK y Dindel [44], respectivamente, y anotado con información de liberación Ensembl 56. Sólo las mutaciones en las transcripciones de los genes miARN anotados en miRBase se consideraron para su posterior análisis.
Las mutaciones puntuales y indeles fueron identificadas como alteraciones somáticas sólo cuando (
i
) la variante no fue llamado en la muestra normal correspondiente o haya determinado que una alteración de la línea germinal en otro par de tumor /normal (
ii
) del variante no se observó en & gt; 2% de lee en la muestra normal correspondiente siguiente inspección manual de la secuencia de lecturas usando el visor integrado Genómica [45] (
iii
) la variante fue identificado en al menos cuatro de secuencia único lee con al menos dos de asignación en el mapeo hacia adelante y dos en la orientación inversa.
Todas las mutaciones que cumplieron con los criterios anteriores se sometieron a la validación mediante amplificación por PCR convencional y electroforesis capilar bidireccional en el ABI3130 Genetic Analyzer utilizando BigDye Terminator v3 .1 la química de secuenciación (Applied Biosystems, Foster City, CA).
identificación de los sitios de unión de los genes miARN-
El TargetScan (versión 5.2) [46], los objetivos microcosmos (versión 5) [40 ], DIANA-microt (versión 3.0) [47], [48] y Miranda (comunicado de agosto de 2010) [49] se utilizaron algoritmos predictivos para determinar si las mutaciones somáticas detectadas en el ARNm 3'UTRs se produjo dentro de los sitios de unión miARN. Un umbral de puntuación de mirSVR de menos de -0,1 y el mínimo umbral de puntuación de la energía de plegado de menos de o igual a -16 kcal /mol se utilizaron para el algoritmo de Miranda. Los parámetros por defecto se utilizaron para todos los otros algoritmos.
Apoyo a la Información
Figura S1.
las predicciones de cambios de estructura secundaria como resultado de mutaciones somáticas en los genes miARN transcripciones. secuencias maduras están sombreados y la base mutada indicadas por la punta de flecha en (a)
hsa-miR-622
,
HSA-mir-1280
y (c) (b)
HSA -miR-767-5p
. La secuencia de los genes miARN precursor de más 50 pb que flanquean el precursor en los extremos 5 'y 3' se utilizó para predecir la estructura secundaria con la menor energía libre por el programa RNAfold [29] utilizando los parámetros por defecto
doi:. 10.1371 /registro diario. pone.0035805.s001 gratis (PDF)
figura S2.
AKT2
y
EGFR
la expresión de ARNm no se altera en presencia de la región 3 'no traducida mutaciones somáticas en relación con otras muestras de ovario del mismo subtipo. (A)
AKT2
expresión en tumores endometrioides, incluyendo P1768 muestra con un
AKT2
c * 892C & gt;. T mutación somática (indicado en rojo). la expresión de ARNm de perfiles de datos se obtuvo de Tothill
et al.
[50].
AKT2
sonda de expresión establece 225471_s_at y 226156_at se muestran. (B)
EGFR
expresión en tumores endometrioides, incluyendo la muestra IC151 con un
EGFR
c * 101C & gt;. G mutación somática (indicado en rojo). la expresión de ARNm de perfiles de datos se obtuvo de Ramakrishna
et al.
[51]. Las barras de error son representativos de la media ± SD
doi:. 10.1371 /journal.pone.0035805.s002 gratis (PDF) sobre Table S1.
Características clínicas de los tumores de ovario secuenciados para las mutaciones somáticas en los genes de microARN y candidato regiones 3 'no traducidas.
doi: 10.1371 /journal.pone.0035805.s003 gratis (XLS)
Reconocimientos
Agradecemos la colaboración de las instituciones en Australia participaron en el Estudio del Cáncer de Ovario de Australia (AOCS). También reconocemos la contribución de las enfermeras del estudio AOCS, asistentes de investigación y todos los colaboradores clínicos y científicos y nos gustaría dar las gracias a todas las mujeres que participaron en la AOCS. Los miembros del Grupo de Estudio del Cáncer de Ovario de Australia, los colaboradores y los hospitales que participan en AOCS se pueden encontrar en http://www.aocstudy.org
australiana de ovario Cancer Study Group:. Bowtell David (Peter MacCallum Cancer Centre, Este Melbourne, Victoria, Australia), Georgia Chenevix-Trench (Instituto Queensland de Investigación médica, Brisbane, Queensland, Australia), Adele Green (Instituto Queensland de Investigación médica, Brisbane, Queensland, Australia), Penny Webb (Instituto Queensland de Investigación médica, Brisbane, Queensland, Australia), Anna defazio (Instituto para la Investigación del cáncer de Westmead, Westmead Millennium Institute, Westmead, Nueva Gales del Sur, Australia), Dorota Gertig (Victorian citología cervical Registro, Carlton Sur, Victoria, Australia).