Un estudio dirigido por investigadores de Cáncer Fred Hutchinson ResearchCenter ha encontrado que una nueva generación de alta velocidad ADN-decodingtechnology llama secuenciación de alto rendimiento puede detectar signos theearliest de potencial recaída en casi dos veces el número de pacientes de leucemia en comparación con la citometría de flujo, el oro actual standardfor detección de la enfermedad residual mínima. Los resultados del estudio, dirigidos por Hutchinson Center computacional biólogo Harlan Robins, Ph.D., Se reportan en Science Translational Medicine. "La capacidad de predecir la recaída de la enfermedad antes con alta throughputsequencing daría hematólogos la opción para tratar la recurrencia del cáncer antes, ofreciendo una mayor probabilidad de supervivencia. A más largo plazo, esta tecnología potencialmente podría utilizarse también para initiallydiagnose la leucemia y el linfoma mucho antes de lo que puede hoy en día ", dijo Robins, un memberof asociado de la División de Ciencias de la Salud Pública autor andcorresponding del Centro Hutchinson del papel. Para el estudio, Robins y colegas compararon la eficacia de la secuenciación del ofhigh rendimiento en comparación con la citometría de flujo para detectar la enfermedad minimalresidual en 43 pacientes con diagnóstico de leucemia aguda Tlymphoblastic, un tipo de cáncer de la sangre que es más hijos menores de commonin 7.
Mediante la secuenciación de genes T-cellreceptor de los pacientes antes y 29 días después de la quimioterapia, theresearchers fueron capaces de medir con precisión su presencia en theblood y proporcionar una predicción más exacta de recaída de la leucemia. "La secuenciación de alto rendimiento detecta una mínima residual diseasein casi el doble del número de pacientes de citometría de flujo - 22versus 12 pacientes, respectivamente," dijo Robins. enfermedad mínima residual, o MRD, un importante factor de predicción de cancerrelapse, es cuando un pequeño número de células de cáncer de sobrevivir treatmentand persisten en los pacientes. Hasta hace poco, MRD era indetectable.
citometría de flujo, el método principal para la detección de MRD en los estados unidos, cuenta el número de células en los withcancer-específica marcadores de proteínas de la sangre en su superficie. Si bien isconsidered el patrón oro, la citometría de flujo viene con un número oflimitations: ha sido difícil de estandarizar a través de diferentes laboratorios becausethere hay un protocolo estándar; los anticuerpos utilizados para etiquetar las células cancerosas son caros; cada tipo de cáncer requiere una prueba diferente, porque eachmalignancy se asocia con un marcador de proteína diferente; y la sensibilidad de la prueba es baja, lo que significa que a veces failsto reconocer la presencia de células cancerosas. Este estudio - el primer uso de la secuenciación de alto rendimiento, o HTS, para la detección de enfermedad mínima residual en un ensayo clínico -found que sea al menos 20 veces más sensible que fluya cytometryin la detección de MRD. "Nuestra investigación indica que HTS ofrece muchas ventajas sobre citometría de flujo", dijo Robins. "Desde HTS pueden detectar cualquier pre-identifiedclone y se lleva a cabo en un laboratorio centralizado, que consistentlygenerates resultados reproducibles y fiables independientemente de CancerTYPE, utilizando el mismo procedimiento para la detección de enfermedades y tracking.Furthermore, HTS es altamente automatizada, rentable y objetiva, mientras que la citometría de flujo está consumiendo más tiempo, se basa en la skillof el operador y por lo tanto está sujeto a error humano ". El Centro Hutchinson tiene patentes pendientes en el núcleo technologiesemployed por Robins y colegas en conjunción withhigh rendimiento de secuenciación de ADN utilizado para este estudio.
Estos coretechnologies han sido licencia exclusiva de AdaptiveBiotechnologies, una compañía biotecnológica de Seattle Robins co-foundedthat ofrece la secuenciación del ADN y análisis comercial. Robins y sus colegas descubrieron la manera de adaptar la tecnología traditionalhigh rendimiento para secuenciar sólo las regiones variables de thehuman código genético: la T y receptores de células B - un criticalcomponent del sistema inmune adaptativo humano. Estos receptores areshort hebras de ADN que reorganizar constantemente para permitir que el immunesystem para combatir los virus, la infección o la enfermedad. "Este descubrimiento fue crucial para nuestra comprensión de las respuestas inmunológicas cómo patientsmount contra el cáncer, enfermedades infecciosas disordersand autoinmunes", dijo Robins, cuya Centerresearch Hutchinson se centra en la genética del sistema inmune -en particular la forma en que responde a los patógenos y el proceso de envejecimiento. Referencias adicionales citas.
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